MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 41766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008533	GAG	2	6	195099	195104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116516988
4002	NC_008533	AGA	2	6	195254	195259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516988
4003	NC_008533	ACTTA	2	10	195279	195288	40 %	40 %	0 %	20 %	116516988
4004	NC_008533	AGA	2	6	195294	195299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_008533	AGA	2	6	195305	195310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_008533	AGAA	2	8	195325	195332	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_008533	A	7	7	195357	195363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_008533	A	6	6	195366	195371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_008533	CAA	2	6	195375	195380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_008533	TAT	2	6	195414	195419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_008533	TAT	2	6	195519	195524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_008533	CAAA	2	8	195555	195562	75 %	0 %	0 %	25 %	116516663
4013	NC_008533	A	7	7	195560	195566	100 %	0 %	0 %	0 %	116516663
4014	NC_008533	AC	3	6	195755	195760	50 %	0 %	0 %	50 %	116516663
4015	NC_008533	A	6	6	195792	195797	100 %	0 %	0 %	0 %	116516663
4016	NC_008533	TGA	2	6	195810	195815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516663
4017	NC_008533	GTG	2	6	195831	195836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516663
4018	NC_008533	A	6	6	196018	196023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_008533	A	6	6	196047	196052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_008533	A	6	6	196097	196102	100 %	0 %	0 %	0 %	116516725
4021	NC_008533	GTT	2	6	196175	196180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516725
4022	NC_008533	CAA	2	6	196258	196263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516725
4023	NC_008533	GTT	2	6	196388	196393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516725
4024	NC_008533	TAAAGG	2	12	196411	196422	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116516725
4025	NC_008533	ACC	2	6	196485	196490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116516725
4026	NC_008533	GTC	2	6	196491	196496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516725
4027	NC_008533	GTT	2	6	196604	196609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516725
4028	NC_008533	CAG	2	6	196680	196685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516725
4029	NC_008533	ATA	2	6	196699	196704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516725
4030	NC_008533	ATT	2	6	196741	196746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116515366
4031	NC_008533	AAG	2	6	196761	196766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515366
4032	NC_008533	GTT	2	6	196775	196780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515366
4033	NC_008533	ATC	2	6	196835	196840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515366
4034	NC_008533	AC	3	6	196868	196873	50 %	0 %	0 %	50 %	116515366
4035	NC_008533	GGT	2	6	196901	196906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515366
4036	NC_008533	CAC	2	6	196965	196970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515366
4037	NC_008533	GTG	4	12	196977	196988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515366
4038	NC_008533	TCG	2	6	197041	197046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515366
4039	NC_008533	CTG	2	6	197133	197138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515366
4040	NC_008533	GCA	2	6	197156	197161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515366
4041	NC_008533	GAA	2	6	197195	197200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515366
4042	NC_008533	CTT	2	6	197300	197305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515366
4043	NC_008533	CA	3	6	197308	197313	50 %	0 %	0 %	50 %	116515366
4044	NC_008533	AGC	2	6	197314	197319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515366
4045	NC_008533	GAG	2	6	197333	197338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116515366
4046	NC_008533	ATG	2	6	197360	197365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515830
4047	NC_008533	A	6	6	197371	197376	100 %	0 %	0 %	0 %	116515830
4048	NC_008533	TCA	2	6	197381	197386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515830
4049	NC_008533	CA	3	6	197447	197452	50 %	0 %	0 %	50 %	116515830
4050	NC_008533	CAAG	2	8	197463	197470	50 %	0 %	25 %	25 %	116515830
4051	NC_008533	GCT	2	6	197479	197484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515830
4052	NC_008533	A	6	6	197578	197583	100 %	0 %	0 %	0 %	116515830
4053	NC_008533	ATC	2	6	197587	197592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515830
4054	NC_008533	GTT	2	6	197622	197627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515830
4055	NC_008533	TGC	2	6	197628	197633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515830
4056	NC_008533	AAT	2	6	197642	197647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515830
4057	NC_008533	AGG	2	6	197651	197656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_008533	CAA	3	9	197686	197694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515638
4059	NC_008533	CTT	2	6	197713	197718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515638
4060	NC_008533	CAA	2	6	197737	197742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515638
4061	NC_008533	TTG	2	6	197764	197769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515638
4062	NC_008533	AAC	3	9	197793	197801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515638
4063	NC_008533	GGT	2	6	197826	197831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515638
4064	NC_008533	TAA	2	6	197870	197875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515638
4065	NC_008533	GTT	2	6	197892	197897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515638
4066	NC_008533	TACAC	2	10	197944	197953	40 %	20 %	0 %	40 %	116515638
4067	NC_008533	CAT	2	6	197972	197977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515638
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4069	NC_008533	TGC	2	6	198131	198136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515638
4070	NC_008533	AAC	2	6	198256	198261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515638
4071	NC_008533	GGT	3	9	198360	198368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515638
4072	NC_008533	TCGT	2	8	198472	198479	0 %	50 %	25 %	25 %	116515638
4073	NC_008533	ATA	2	6	198494	198499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515638
4074	NC_008533	ACA	2	6	198574	198579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_008533	A	6	6	198616	198621	100 %	0 %	0 %	0 %	116516112
4076	NC_008533	TCG	2	6	198629	198634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516112
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4079	NC_008533	ACG	2	6	198671	198676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516112
4080	NC_008533	A	6	6	198682	198687	100 %	0 %	0 %	0 %	116516112
4081	NC_008533	TTA	2	6	198689	198694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516112
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4083	NC_008533	GACG	2	8	198757	198764	25 %	0 %	50 %	25 %	116516112
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4088	NC_008533	GCT	2	6	199032	199037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116517196
4089	NC_008533	ATC	2	6	199041	199046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116517196
4090	NC_008533	TTTGG	2	10	199089	199098	0 %	60 %	40 %	0 %	116517196
4091	NC_008533	GTA	2	6	199113	199118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517196
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4097	NC_008533	GGT	2	6	199485	199490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515402
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4102	NC_008533	GAA	2	6	199806	199811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515402
4103	NC_008533	TAC	2	6	199817	199822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515402
4104	NC_008533	GTG	2	6	199858	199863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515402
4105	NC_008533	TTC	2	6	199867	199872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515402
4106	NC_008533	AGG	2	6	199892	199897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116515402
4107	NC_008533	CGT	2	6	199935	199940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515627
4108	NC_008533	AAG	2	6	199981	199986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515627
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4111	NC_008533	CA	3	6	200116	200121	50 %	0 %	0 %	50 %	116515627
4112	NC_008533	AAG	2	6	200383	200388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516938
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4114	NC_008533	GCT	2	6	200445	200450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516938
4115	NC_008533	AACA	2	8	200464	200471	75 %	0 %	0 %	25 %	116516938
4116	NC_008533	A	6	6	200490	200495	100 %	0 %	0 %	0 %	116516938
4117	NC_008533	ATA	2	6	200534	200539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516938
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4121	NC_008533	ACC	2	6	200653	200658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515855
4122	NC_008533	ACT	2	6	200680	200685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515855
4123	NC_008533	A	6	6	200688	200693	100 %	0 %	0 %	0 %	116515855
4124	NC_008533	ATG	2	6	200704	200709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515855
4125	NC_008533	AAG	2	6	200725	200730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515855
4126	NC_008533	CGTA	2	8	200738	200745	25 %	25 %	25 %	25 %	116515855
4127	NC_008533	GTT	2	6	200796	200801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116515855
4128	NC_008533	GAA	2	6	200802	200807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515855
4129	NC_008533	TCA	2	6	200812	200817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515855
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4131	NC_008533	TGG	2	6	200922	200927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116517026
4132	NC_008533	TGG	2	6	200991	200996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116517026
4133	NC_008533	A	6	6	201004	201009	100 %	0 %	0 %	0 %	116517026
4134	NC_008533	GTT	2	6	201016	201021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116517026
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4136	NC_008533	TCG	2	6	201054	201059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116517026
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4141	NC_008533	TGT	2	6	201356	201361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516050
4142	NC_008533	GGT	2	6	201453	201458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516050
4143	NC_008533	ATC	2	6	201459	201464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516050
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4146	NC_008533	ACA	2	6	201568	201573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516050
4147	NC_008533	A	6	6	201573	201578	100 %	0 %	0 %	0 %	116516050
4148	NC_008533	AAGGA	2	10	201605	201614	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_008533	AGT	2	6	201658	201663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515434
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4153	NC_008533	A	6	6	201836	201841	100 %	0 %	0 %	0 %	116515434
4154	NC_008533	GTG	2	6	201900	201905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116515434
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4159	NC_008533	AGG	2	6	202169	202174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4160	NC_008533	A	6	6	202189	202194	100 %	0 %	0 %	0 %	116516311
4161	NC_008533	AG	3	6	202207	202212	50 %	0 %	50 %	0 %	116516311
4162	NC_008533	A	6	6	202223	202228	100 %	0 %	0 %	0 %	116516311
4163	NC_008533	TTG	2	6	202229	202234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516311
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4166	NC_008533	GAA	2	6	202503	202508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_008533	CA	3	6	202539	202544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4168	NC_008533	A	6	6	202602	202607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4169	NC_008533	ACT	2	6	202711	202716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4171	NC_008533	A	6	6	202833	202838	100 %	0 %	0 %	0 %	116515705
4172	NC_008533	A	6	6	202874	202879	100 %	0 %	0 %	0 %	116515705
4173	NC_008533	ACAA	2	8	202900	202907	75 %	0 %	0 %	25 %	116515705
4174	NC_008533	A	6	6	203001	203006	100 %	0 %	0 %	0 %	116515705
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4178	NC_008533	ACAA	2	8	203196	203203	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4179	NC_008533	GTTCA	2	10	203239	203248	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4186	NC_008533	GGTT	2	8	203599	203606	0 %	50 %	50 %	0 %	116516940
4187	NC_008533	CAA	3	9	203709	203717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516940
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4197	NC_008533	ACC	2	6	203884	203889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4198	NC_008533	AAAC	2	8	203967	203974	75 %	0 %	0 %	25 %	116515871
4199	NC_008533	CT	3	6	204010	204015	0 %	50 %	0 %	50 %	116515871
4200	NC_008533	CTG	2	6	204020	204025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515871
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4204	NC_008533	AGG	2	6	204305	204310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4233	NC_008533	T	6	6	205612	205617	0 %	100 %	0 %	0 %	116516915
4234	NC_008533	ATT	2	6	205620	205625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516915
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4236	NC_008533	CTT	2	6	205764	205769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516915
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4243	NC_008533	GAT	2	6	206193	206198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516915
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4246	NC_008533	TTG	2	6	206290	206295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516915
4247	NC_008533	ATT	2	6	206296	206301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516915
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4279	NC_008533	ATCGA	2	10	207794	207803	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4360	NC_008533	TGG	2	6	211217	211222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4361	NC_008533	GAGAT	2	10	211258	211267	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4362	NC_008533	TCA	2	6	211270	211275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4363	NC_008533	ATTCC	2	10	211276	211285	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4364	NC_008533	GTCA	2	8	211319	211326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4365	NC_008533	GTTG	2	8	211427	211434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4366	NC_008533	ATC	2	6	211506	211511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4367	NC_008533	TGGTG	2	10	211532	211541	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4373	NC_008533	TGC	2	6	211896	211901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4495	NC_008533	TAA	2	6	217896	217901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116517186
4496	NC_008533	T	6	6	217927	217932	0 %	100 %	0 %	0 %	116517186
4497	NC_008533	CAA	2	6	218013	218018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116517186
4498	NC_008533	AGT	2	6	218023	218028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517186
4499	NC_008533	GT	3	6	218039	218044	0 %	50 %	50 %	0 %	116517186
4500	NC_008533	CCT	2	6	218108	218113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116517186

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