MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 41766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_008533	TGT	2	6	47791	47796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516503
1003	NC_008533	GTGAT	2	10	47817	47826	20 %	40 %	40 %	0 %	116516503
1004	NC_008533	GGT	2	6	47864	47869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516503
1005	NC_008533	CTG	2	6	47913	47918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516503
1006	NC_008533	GAA	2	6	47948	47953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516503
1007	NC_008533	AAG	2	6	48002	48007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516503
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1009	NC_008533	CAA	2	6	48079	48084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116516503
1010	NC_008533	TGT	2	6	48220	48225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516503
1011	NC_008533	CGT	2	6	48296	48301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516503
1012	NC_008533	AGA	2	6	48370	48375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516503
1013	NC_008533	CTG	2	6	48387	48392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516503
1014	NC_008533	TGG	2	6	48508	48513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516503
1015	NC_008533	TGC	2	6	48643	48648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516503
1016	NC_008533	TGG	2	6	48678	48683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516503
1017	NC_008533	CTG	2	6	48684	48689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516503
1018	NC_008533	CAAG	2	8	48745	48752	50 %	0 %	25 %	25 %	116516503
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1020	NC_008533	GAA	2	6	48860	48865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516503
1021	NC_008533	GAC	2	6	48901	48906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516503
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1025	NC_008533	GATT	2	8	48994	49001	25 %	50 %	25 %	0 %	116516503
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1031	NC_008533	ACTG	2	8	49258	49265	25 %	25 %	25 %	25 %	116516503
1032	NC_008533	GAA	2	6	49322	49327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516503
1033	NC_008533	AGA	2	6	49363	49368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516503
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1041	NC_008533	ATG	2	6	49824	49829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516503
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1044	NC_008533	ATC	2	6	50105	50110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516503
1045	NC_008533	ATAG	2	8	50239	50246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008533	TGA	2	6	50282	50287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008533	A	6	6	50309	50314	100 %	0 %	0 %	0 %	116515944
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1053	NC_008533	ATA	2	6	50594	50599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116515944
1054	NC_008533	TGGCT	2	10	50637	50646	0 %	40 %	40 %	20 %	116515944
1055	NC_008533	CT	3	6	50673	50678	0 %	50 %	0 %	50 %	116515944
1056	NC_008533	AAGA	2	8	50680	50687	75 %	0 %	25 %	0 %	116515944
1057	NC_008533	TCG	2	6	50751	50756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116515944
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1102	NC_008533	A	7	7	52815	52821	100 %	0 %	0 %	0 %	116515735
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1106	NC_008533	AGC	2	6	52997	53002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515802
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1110	NC_008533	AGT	2	6	53330	53335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515802
1111	NC_008533	TGA	2	6	53363	53368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008533	TTG	2	6	53407	53412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008533	A	7	7	53453	53459	100 %	0 %	0 %	0 %	116516890
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1115	NC_008533	GTTT	2	8	53663	53670	0 %	75 %	25 %	0 %	116516890
1116	NC_008533	TTACTG	2	12	53921	53932	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116516890
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1118	NC_008533	A	7	7	54040	54046	100 %	0 %	0 %	0 %	116516062
1119	NC_008533	TTGG	2	8	54048	54055	0 %	50 %	50 %	0 %	116516062
1120	NC_008533	CGAT	2	8	54117	54124	25 %	25 %	25 %	25 %	116516062
1121	NC_008533	GAT	2	6	54145	54150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516062
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1123	NC_008533	TCG	2	6	54202	54207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516062
1124	NC_008533	AGC	2	6	54229	54234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516062
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