MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 41766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_008533	ATG	2	6	290307	290312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516452
6003	NC_008533	AGT	2	6	290314	290319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516452
6004	NC_008533	TTC	2	6	290406	290411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516452
6005	NC_008533	TCA	2	6	290446	290451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516452
6006	NC_008533	CTT	2	6	290492	290497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516452
6007	NC_008533	TCA	2	6	290569	290574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516452
6008	NC_008533	ATC	2	6	290656	290661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516452
6009	NC_008533	CTT	2	6	290711	290716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516452
6010	NC_008533	AAAATG	2	12	290775	290786	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116516452
6011	NC_008533	AG	3	6	290801	290806	50 %	0 %	50 %	0 %	116516452
6012	NC_008533	GAC	2	6	290879	290884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516452
6013	NC_008533	TAG	2	6	290905	290910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516452
6014	NC_008533	TGG	2	6	291113	291118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516452
6015	NC_008533	CTT	2	6	291218	291223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515351
6016	NC_008533	AGC	2	6	291231	291236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515351
6017	NC_008533	TCA	2	6	291241	291246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515351
6018	NC_008533	AAG	2	6	291262	291267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515351
6019	NC_008533	TCA	2	6	291335	291340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116515351
6020	NC_008533	GCGTT	2	10	291382	291391	0 %	40 %	40 %	20 %	116515351
6021	NC_008533	TTC	2	6	291432	291437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515351
6022	NC_008533	C	6	6	291479	291484	0 %	0 %	0 %	100 %	116515351
6023	NC_008533	ACC	2	6	291522	291527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116515351
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6025	NC_008533	AGCA	2	8	291603	291610	50 %	0 %	25 %	25 %	116515351
6026	NC_008533	AAC	2	6	291639	291644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116515351
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6029	NC_008533	T	6	6	291759	291764	0 %	100 %	0 %	0 %	116515351
6030	NC_008533	CTT	2	6	291773	291778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515351
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6032	NC_008533	TCT	2	6	291850	291855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_008533	GTT	2	6	291872	291877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516839
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6039	NC_008533	AGC	3	9	292179	292187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516839
6040	NC_008533	TCA	2	6	292220	292225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516839
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6042	NC_008533	GCG	2	6	292339	292344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116516839
6043	NC_008533	CGG	2	6	292366	292371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116516839
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6045	NC_008533	TTA	2	6	292384	292389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516839
6046	NC_008533	GTCAC	2	10	292459	292468	20 %	20 %	20 %	40 %	116516839
6047	NC_008533	TTGA	2	8	292533	292540	25 %	50 %	25 %	0 %	116516839
6048	NC_008533	TAG	2	6	292556	292561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516839
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6050	NC_008533	TGA	2	6	292619	292624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516839
6051	NC_008533	ATG	2	6	292664	292669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516839
6052	NC_008533	AATA	3	12	292750	292761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_008533	TTTA	2	8	292764	292771	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_008533	ATTT	2	8	292779	292786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_008533	T	7	7	292857	292863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_008533	A	7	7	292864	292870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_008533	ATTG	2	8	293009	293016	25 %	50 %	25 %	0 %	116515558
6058	NC_008533	GGAA	2	8	293054	293061	50 %	0 %	50 %	0 %	116515558
6059	NC_008533	CAG	2	6	293065	293070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116515558
6060	NC_008533	A	6	6	293083	293088	100 %	0 %	0 %	0 %	116515558
6061	NC_008533	GAA	3	9	293109	293117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116515558
6062	NC_008533	GGA	2	6	293142	293147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116515558
6063	NC_008533	TCT	2	6	293163	293168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116515558
6064	NC_008533	AATG	2	8	293198	293205	50 %	25 %	25 %	0 %	116515558
6065	NC_008533	TC	3	6	293207	293212	0 %	50 %	0 %	50 %	116515558
6066	NC_008533	TGA	2	6	293270	293275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116515558
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6073	NC_008533	A	6	6	293418	293423	100 %	0 %	0 %	0 %	116517086
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6088	NC_008533	TGA	2	6	294109	294114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116517086
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6093	NC_008533	TTC	2	6	294301	294306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116517086
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6095	NC_008533	TGG	2	6	294451	294456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116517086
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6112	NC_008533	AGTC	2	8	295375	295382	25 %	25 %	25 %	25 %	116515404
6113	NC_008533	CT	3	6	295400	295405	0 %	50 %	0 %	50 %	116515404
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6497	NC_008533	AGC	2	6	315156	315161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516963
6498	NC_008533	AG	3	6	315245	315250	50 %	0 %	50 %	0 %	116516159
6499	NC_008533	CT	3	6	315261	315266	0 %	50 %	0 %	50 %	116516159
6500	NC_008533	CAGG	2	8	315280	315287	25 %	0 %	50 %	25 %	116516159

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