MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae D39 chromosome

Total Repeats: 41766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008533	TGA	2	6	267238	267243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_008533	TTG	2	6	267267	267272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516578
5503	NC_008533	AAG	2	6	267358	267363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516578
5504	NC_008533	TATT	2	8	267421	267428	25 %	75 %	0 %	0 %	116516578
5505	NC_008533	T	7	7	267470	267476	0 %	100 %	0 %	0 %	116516578
5506	NC_008533	TTG	2	6	267549	267554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516578
5507	NC_008533	GAC	2	6	267569	267574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516578
5508	NC_008533	TCT	2	6	267634	267639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516578
5509	NC_008533	CTTG	2	8	267647	267654	0 %	50 %	25 %	25 %	116516578
5510	NC_008533	ATT	2	6	267687	267692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516578
5511	NC_008533	CTT	2	6	267781	267786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516578
5512	NC_008533	TGTT	2	8	267894	267901	0 %	75 %	25 %	0 %	116516578
5513	NC_008533	CTA	2	6	267976	267981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_008533	TCTTTT	2	12	268008	268019	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5515	NC_008533	ATA	2	6	268037	268042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116516653
5516	NC_008533	TGA	2	6	268043	268048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516653
5517	NC_008533	GGT	2	6	268147	268152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516653
5518	NC_008533	T	6	6	268156	268161	0 %	100 %	0 %	0 %	116516653
5519	NC_008533	CAG	2	6	268180	268185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116516653
5520	NC_008533	CGG	2	6	268227	268232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116516653
5521	NC_008533	AGA	2	6	268269	268274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516653
5522	NC_008533	GTT	2	6	268288	268293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516653
5523	NC_008533	GCT	2	6	268369	268374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516653
5524	NC_008533	GCT	2	6	268378	268383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116516653
5525	NC_008533	TGA	2	6	268422	268427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516653
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5528	NC_008533	TTTTGG	2	12	268530	268541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516653
5529	NC_008533	GAA	2	6	268591	268596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516653
5530	NC_008533	CTTT	2	8	268607	268614	0 %	75 %	0 %	25 %	116516653
5531	NC_008533	AAGA	2	8	268699	268706	75 %	0 %	25 %	0 %	116516653
5532	NC_008533	CTT	2	6	268714	268719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116516653
5533	NC_008533	TCA	2	6	268790	268795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516653
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5535	NC_008533	TGA	2	6	268977	268982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516653
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5537	NC_008533	GAAA	2	8	269020	269027	75 %	0 %	25 %	0 %	116516745
5538	NC_008533	CAAT	2	8	269035	269042	50 %	25 %	0 %	25 %	116516745
5539	NC_008533	CGGA	2	8	269057	269064	25 %	0 %	50 %	25 %	116516745
5540	NC_008533	TGG	2	6	269091	269096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516745
5541	NC_008533	TCC	2	6	269139	269144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116516745
5542	NC_008533	GGA	2	6	269150	269155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116516745
5543	NC_008533	T	6	6	269182	269187	0 %	100 %	0 %	0 %	116516745
5544	NC_008533	TCAT	2	8	269244	269251	25 %	50 %	0 %	25 %	116516745
5545	NC_008533	GGAG	2	8	269335	269342	25 %	0 %	75 %	0 %	116516745
5546	NC_008533	ACT	2	6	269403	269408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516745
5547	NC_008533	CAT	2	6	269434	269439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516745
5548	NC_008533	TGTC	2	8	269476	269483	0 %	50 %	25 %	25 %	116516745
5549	NC_008533	AGCAG	2	10	269557	269566	40 %	0 %	40 %	20 %	116516745
5550	NC_008533	TAT	2	6	269575	269580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116516745
5551	NC_008533	TCA	2	6	269701	269706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516745
5552	NC_008533	GTG	2	6	269714	269719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116516745
5553	NC_008533	AAG	2	6	269841	269846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516745
5554	NC_008533	AGCA	2	8	269860	269867	50 %	0 %	25 %	25 %	116516745
5555	NC_008533	GAA	2	6	269891	269896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516745
5556	NC_008533	TGA	2	6	269940	269945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516745
5557	NC_008533	TGGA	2	8	269949	269956	25 %	25 %	50 %	0 %	116516745
5558	NC_008533	TTG	2	6	269984	269989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116516745
5559	NC_008533	GGA	2	6	270061	270066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116516745
5560	NC_008533	A	6	6	270227	270232	100 %	0 %	0 %	0 %	116516745
5561	NC_008533	AAAC	2	8	270239	270246	75 %	0 %	0 %	25 %	116516745
5562	NC_008533	GAA	2	6	270310	270315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116516745
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5565	NC_008533	T	6	6	270439	270444	0 %	100 %	0 %	0 %	116515945
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5602	NC_008533	T	6	6	272157	272162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_008533	A	7	7	272195	272201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_008533	TA	3	6	272252	272257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_008533	TAG	2	6	272334	272339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_008533	GGAA	2	8	272396	272403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_008533	TA	4	8	272432	272439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_008533	AACAA	2	10	272452	272461	80 %	0 %	0 %	20 %	116516171
5609	NC_008533	AGT	2	6	272544	272549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116516171
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5613	NC_008533	CTA	2	6	272673	272678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116516171
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