MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 25034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008532	AGA	2	6	151	156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626973
2	NC_008532	ATT	2	6	177	182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626973
3	NC_008532	TCA	2	6	201	206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626973
4	NC_008532	GAA	2	6	239	244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626973
5	NC_008532	TGA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626973
6	NC_008532	AAC	2	6	405	410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626973
7	NC_008532	AGC	2	6	502	507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626973
8	NC_008532	TAA	2	6	607	612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626973
9	NC_008532	TTA	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626973
10	NC_008532	TGA	2	6	751	756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626973
11	NC_008532	ATA	3	9	831	839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626973
12	NC_008532	GGA	2	6	1352	1357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116626973
13	NC_008532	ACT	2	6	1478	1483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008532	CTA	5	15	1576	1590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008532	ATA	2	6	1593	1598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008532	TAA	2	6	1600	1605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008532	TAA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626974
18	NC_008532	AGA	2	6	1802	1807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626974
19	NC_008532	GTA	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626974
20	NC_008532	GTT	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626974
21	NC_008532	GAA	2	6	1908	1913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626974
22	NC_008532	AAG	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626974
23	NC_008532	GCA	2	6	2073	2078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626974
24	NC_008532	GTC	2	6	2092	2097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626974
25	NC_008532	GTA	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626974
26	NC_008532	CAG	2	6	2254	2259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626974
27	NC_008532	TCT	2	6	2293	2298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626974
28	NC_008532	ATC	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626974
29	NC_008532	CAG	2	6	2701	2706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626974
30	NC_008532	TGA	2	6	2875	2880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
31	NC_008532	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
32	NC_008532	TTA	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626975
33	NC_008532	TAG	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
34	NC_008532	TCT	2	6	3178	3183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626975
35	NC_008532	AAC	2	6	3185	3190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626975
36	NC_008532	CTT	2	6	3308	3313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626975
37	NC_008532	GAT	2	6	3371	3376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
38	NC_008532	AGT	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
39	NC_008532	TAG	2	6	3514	3519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
40	NC_008532	GGC	2	6	3523	3528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116626975
41	NC_008532	CAG	2	6	3625	3630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626975
42	NC_008532	TCT	2	6	3704	3709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626975
43	NC_008532	ACG	2	6	3845	3850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626975
44	NC_008532	GTA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
45	NC_008532	ATC	2	6	3930	3935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626975
46	NC_008532	ATG	2	6	3955	3960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626975
47	NC_008532	TTC	2	6	4085	4090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008532	AGT	2	6	4170	4175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008532	AGG	2	6	4214	4219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008532	GAA	2	6	4255	4260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626976
51	NC_008532	ATG	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626976
52	NC_008532	GTC	2	6	4377	4382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626976
53	NC_008532	AAG	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626976
54	NC_008532	CTA	2	6	4441	4446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008532	CAG	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626977
56	NC_008532	GCT	2	6	4714	4719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626977
57	NC_008532	CAA	2	6	4733	4738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626977
58	NC_008532	GAT	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626977
59	NC_008532	TTC	2	6	5135	5140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626977
60	NC_008532	AGA	2	6	5160	5165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626977
61	NC_008532	GAA	2	6	5200	5205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626977
62	NC_008532	ACA	2	6	5236	5241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626977
63	NC_008532	TGA	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626977
64	NC_008532	TGA	2	6	5292	5297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626977
65	NC_008532	AGT	2	6	5349	5354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626977
66	NC_008532	GAA	2	6	5377	5382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626977
67	NC_008532	GAT	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626977
68	NC_008532	GCA	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626977
69	NC_008532	AGC	2	6	5562	5567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626977
70	NC_008532	AAG	2	6	5663	5668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626977
71	NC_008532	GAA	2	6	5683	5688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626977
72	NC_008532	TGT	2	6	5700	5705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626977
73	NC_008532	CAT	2	6	5718	5723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626977
74	NC_008532	AAT	2	6	5814	5819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626978
75	NC_008532	TAG	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626978
76	NC_008532	CAA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626978
77	NC_008532	TTA	2	6	6054	6059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626978
78	NC_008532	GGA	2	6	6072	6077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116626978
79	NC_008532	GAT	2	6	6094	6099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626978
80	NC_008532	CAG	2	6	6143	6148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626978
81	NC_008532	ACT	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626978
82	NC_008532	GAA	2	6	6409	6414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626979
83	NC_008532	TCA	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626979
84	NC_008532	TAG	2	6	6576	6581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626979
85	NC_008532	GAT	2	6	6632	6637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626979
86	NC_008532	GCT	2	6	6644	6649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626979
87	NC_008532	TGT	2	6	7042	7047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626979
88	NC_008532	CGG	2	6	7056	7061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116626979
89	NC_008532	AGA	2	6	7081	7086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626979
90	NC_008532	TGA	2	6	7282	7287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626979
91	NC_008532	TCA	2	6	7357	7362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626979
92	NC_008532	ACT	2	6	7386	7391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626979
93	NC_008532	CTT	2	6	7435	7440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626979
94	NC_008532	TCG	2	6	7552	7557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626979
95	NC_008532	TAG	2	6	7660	7665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626979
96	NC_008532	GTT	2	6	7745	7750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626979
97	NC_008532	CGT	2	6	7790	7795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626979
98	NC_008532	TGT	2	6	7864	7869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626979
99	NC_008532	ACT	2	6	7938	7943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626979
100	NC_008532	TGC	2	6	7963	7968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626979
101	NC_008532	TAA	2	6	8044	8049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626979
102	NC_008532	ATG	2	6	8055	8060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626979
103	NC_008532	GAT	3	9	8174	8182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626979
104	NC_008532	TGC	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626979
105	NC_008532	ATG	2	6	8358	8363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626979
106	NC_008532	ATT	3	9	8534	8542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626979
107	NC_008532	TTG	2	6	8555	8560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626979
108	NC_008532	TGA	2	6	8602	8607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626979
109	NC_008532	AAC	2	6	8610	8615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626979
110	NC_008532	ATT	2	6	8741	8746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626979
111	NC_008532	GTA	2	6	9132	9137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626979
112	NC_008532	ATC	2	6	9165	9170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626979
113	NC_008532	TCG	2	6	9394	9399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626979
114	NC_008532	TGC	2	6	9619	9624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626979
115	NC_008532	ATC	2	6	9659	9664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626979
116	NC_008532	TTC	2	6	9692	9697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626979
117	NC_008532	ATT	2	6	9776	9781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626979
118	NC_008532	AGA	2	6	10037	10042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008532	AAG	2	6	10130	10135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626980
120	NC_008532	GCA	2	6	10285	10290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626980
121	NC_008532	AAG	2	6	10337	10342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626980
122	NC_008532	GTT	2	6	10457	10462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626981
123	NC_008532	GAT	2	6	10610	10615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626981
124	NC_008532	TTA	2	6	10691	10696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626981
125	NC_008532	GAA	2	6	10818	10823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626982
126	NC_008532	CTG	2	6	10855	10860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626983
127	NC_008532	TCT	2	6	10869	10874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626983
128	NC_008532	TGA	2	6	11168	11173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626983
129	NC_008532	TTA	2	6	11336	11341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626983
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262	NC_008532	ATT	2	6	19134	19139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_008532	GGT	2	6	25422	25427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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