MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008532	GTG	2	6	146022	146027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_008532	AT	3	6	146180	146185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_008532	A	6	6	146272	146277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_008532	ACC	2	6	146385	146390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_008532	CGT	2	6	146422	146427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_008532	GAG	2	6	146434	146439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_008532	TAA	3	9	146530	146538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_008532	CTC	2	6	146598	146603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_008532	AGA	2	6	146741	146746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_008532	GAC	2	6	146782	146787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_008532	ATT	2	6	146811	146816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_008532	GGC	2	6	146859	146864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_008532	AG	3	6	146894	146899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_008532	CTT	2	6	146909	146914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_008532	ATTT	2	8	147021	147028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_008532	TAG	2	6	147076	147081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_008532	CGA	2	6	147104	147109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_008532	GCA	2	6	147178	147183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_008532	CGC	2	6	147225	147230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_008532	GTGA	2	8	147231	147238	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008532	TGT	2	6	147264	147269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_008532	CAG	2	6	147347	147352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_008532	AGCG	2	8	147402	147409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3024	NC_008532	AT	3	6	147531	147536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_008532	GGA	2	6	147537	147542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_008532	CT	3	6	147562	147567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_008532	GAA	2	6	147801	147806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_008532	GGT	2	6	147875	147880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_008532	GTC	2	6	147889	147894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_008532	TCGTG	2	10	147898	147907	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3031	NC_008532	CAT	2	6	147957	147962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_008532	TAA	2	6	147992	147997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_008532	GGA	2	6	148001	148006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_008532	ATC	2	6	148025	148030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_008532	AC	3	6	148052	148057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_008532	TGGT	2	8	148067	148074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_008532	CGC	2	6	148191	148196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_008532	AC	3	6	148221	148226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_008532	CAC	2	6	148236	148241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_008532	AGCC	2	8	148283	148290	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_008532	GAT	2	6	148306	148311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_008532	CCT	2	6	148362	148367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_008532	AGG	2	6	148464	148469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_008532	GTAA	2	8	148558	148565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_008532	ATAG	2	8	148572	148579	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_008532	GTTAA	2	10	148644	148653	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_008532	ACG	2	6	148707	148712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_008532	TAG	2	6	148878	148883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008532	GCGA	2	8	148886	148893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_008532	AGA	2	6	148965	148970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_008532	AG	3	6	148993	148998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_008532	TCG	2	6	149068	149073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_008532	GGA	2	6	149081	149086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_008532	CT	3	6	149107	149112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_008532	GGGAG	2	10	149162	149171	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_008532	ACA	2	6	149199	149204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_008532	ATG	2	6	149266	149271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_008532	GGA	2	6	149399	149404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_008532	TC	3	6	149485	149490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_008532	ACC	2	6	149664	149669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_008532	AT	3	6	149685	149690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_008532	AGC	2	6	149744	149749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_008532	ATTC	2	8	149751	149758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_008532	GAA	2	6	149878	149883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_008532	GAG	2	6	149894	149899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_008532	GA	3	6	150024	150029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_008532	ACA	2	6	150050	150055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_008532	TA	3	6	150078	150083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_008532	CTAA	2	8	150105	150112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_008532	TAG	2	6	150207	150212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_008532	GA	3	6	150319	150324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_008532	CTGA	2	8	150378	150385	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3073	NC_008532	CT	3	6	150435	150440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3074	NC_008532	GAT	2	6	150453	150458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_008532	CGG	2	6	150544	150549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_008532	GA	3	6	150642	150647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_008532	TAGG	2	8	150760	150767	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_008532	GTT	2	6	150804	150809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_008532	TAC	2	6	150814	150819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_008532	CCT	2	6	150902	150907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_008532	GGT	2	6	151038	151043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_008532	TCG	2	6	151153	151158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_008532	CGT	2	6	151233	151238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_008532	GTT	2	6	151336	151341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_008532	AGGGA	2	10	151371	151380	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_008532	GA	3	6	151457	151462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_008532	GAAGTG	2	12	151482	151493	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_008532	ACTAAT	2	12	151512	151523	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3089	NC_008532	AT	3	6	151557	151562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_008532	TTGAG	2	10	151605	151614	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_008532	GTA	2	6	151765	151770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_008532	ATG	2	6	151788	151793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_008532	T	6	6	151825	151830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_008532	T	7	7	151850	151856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_008532	TGA	2	6	151876	151881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_008532	AG	3	6	151932	151937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_008532	TATG	2	8	151958	151965	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_008532	TGA	2	6	151973	151978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_008532	TAG	2	6	152051	152056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_008532	AAT	2	6	152144	152149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_008532	CT	3	6	152198	152203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_008532	TGAAAA	2	12	152209	152220	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_008532	GAT	2	6	152228	152233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_008532	TAG	2	6	152242	152247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_008532	TTC	2	6	152287	152292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_008532	TCG	2	6	152305	152310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_008532	AGT	2	6	152416	152421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_008532	GAT	2	6	152440	152445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_008532	GAAA	2	8	152446	152453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_008532	TCAC	2	8	152577	152584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_008532	AAT	2	6	152627	152632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_008532	CTTT	2	8	152700	152707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3113	NC_008532	CAT	2	6	152747	152752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_008532	ATT	2	6	152826	152831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_008532	ATTGAA	2	12	153050	153061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116627087
3116	NC_008532	GCA	2	6	153063	153068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627087
3117	NC_008532	ATTG	2	8	153076	153083	25 %	50 %	25 %	0 %	116627087
3118	NC_008532	T	6	6	153109	153114	0 %	100 %	0 %	0 %	116627087
3119	NC_008532	GAAT	2	8	153172	153179	50 %	25 %	25 %	0 %	116627087
3120	NC_008532	AGA	2	6	153184	153189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627087
3121	NC_008532	GGATG	2	10	153277	153286	20 %	20 %	60 %	0 %	116627087
3122	NC_008532	GAA	2	6	153293	153298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627087
3123	NC_008532	AAG	2	6	153353	153358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627087
3124	NC_008532	AGA	2	6	153445	153450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627087
3125	NC_008532	TGG	2	6	153721	153726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627087
3126	NC_008532	CA	4	8	153754	153761	50 %	0 %	0 %	50 %	116627087
3127	NC_008532	TGC	2	6	153925	153930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627087
3128	NC_008532	TGC	2	6	153982	153987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627087
3129	NC_008532	T	6	6	154078	154083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_008532	CAAG	2	8	154155	154162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3131	NC_008532	GTGA	2	8	154205	154212	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_008532	ATG	2	6	154216	154221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_008532	TTA	2	6	154226	154231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_008532	TAT	2	6	154242	154247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3140	NC_008532	GTA	2	6	154543	154548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3260	NC_008532	GCG	2	6	159747	159752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116627092
3261	NC_008532	TGT	2	6	159770	159775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627092
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3263	NC_008532	CA	3	6	159882	159887	50 %	0 %	0 %	50 %	116627092
3264	NC_008532	CTT	2	6	159891	159896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627092
3265	NC_008532	CTG	2	6	160009	160014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627092
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3269	NC_008532	GCTGAT	2	12	160392	160403	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116627092
3270	NC_008532	ATC	2	6	160407	160412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627092
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3279	NC_008532	CACCGT	2	12	160740	160751	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116627092
3280	NC_008532	TTG	2	6	160867	160872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627092
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3286	NC_008532	CTT	2	6	161011	161016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3287	NC_008532	AAT	2	6	161035	161040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3288	NC_008532	AAGA	2	8	161041	161048	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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