MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_008532	A	6	6	1224923	1224928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25002	NC_008532	AAC	2	6	1224987	1224992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25003	NC_008532	CTAA	2	8	1225002	1225009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25004	NC_008532	CTT	2	6	1225094	1225099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25005	NC_008532	GAA	2	6	1225129	1225134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25006	NC_008532	GTT	2	6	1225146	1225151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25007	NC_008532	AAT	2	6	1225154	1225159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25008	NC_008532	GTCT	2	8	1225264	1225271	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25009	NC_008532	GA	3	6	1225429	1225434	50 %	0 %	50 %	0 %	116628071
25010	NC_008532	GAT	2	6	1225440	1225445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628071
25011	NC_008532	GAA	2	6	1225517	1225522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628071
25012	NC_008532	AAAGA	2	10	1225594	1225603	80 %	0 %	20 %	0 %	116628071
25013	NC_008532	TGA	2	6	1225608	1225613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628071
25014	NC_008532	GAA	2	6	1225694	1225699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628071
25015	NC_008532	ATAC	2	8	1225753	1225760	50 %	25 %	0 %	25 %	116628071
25016	NC_008532	AC	3	6	1225811	1225816	50 %	0 %	0 %	50 %	116628071
25017	NC_008532	TCG	2	6	1225846	1225851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628071
25018	NC_008532	CGA	2	6	1225916	1225921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628071
25019	NC_008532	GA	3	6	1226025	1226030	50 %	0 %	50 %	0 %	116628071
25020	NC_008532	CCA	2	6	1226056	1226061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628071
25021	NC_008532	ACT	2	6	1226164	1226169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628071
25022	NC_008532	GAGT	2	8	1226172	1226179	25 %	25 %	50 %	0 %	116628071
25023	NC_008532	GAG	2	6	1226208	1226213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628071
25024	NC_008532	AAG	2	6	1226432	1226437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628071
25025	NC_008532	ACC	2	6	1226457	1226462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628071
25026	NC_008532	GGAT	2	8	1226466	1226473	25 %	25 %	50 %	0 %	116628071
25027	NC_008532	CA	3	6	1226514	1226519	50 %	0 %	0 %	50 %	116628071
25028	NC_008532	AAT	2	6	1226541	1226546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628071
25029	NC_008532	TAT	2	6	1226741	1226746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25030	NC_008532	TAA	2	6	1226798	1226803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25031	NC_008532	AAGATT	2	12	1226814	1226825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25032	NC_008532	ATT	2	6	1226901	1226906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25033	NC_008532	TAAT	2	8	1226996	1227003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25034	NC_008532	CTA	2	6	1227004	1227009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25035	NC_008532	A	7	7	1227026	1227032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25036	NC_008532	T	6	6	1227058	1227063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25037	NC_008532	ATT	2	6	1227133	1227138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628072
25038	NC_008532	CTG	2	6	1227187	1227192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628072
25039	NC_008532	TCA	2	6	1227270	1227275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628072
25040	NC_008532	TTC	2	6	1227312	1227317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628072
25041	NC_008532	AGCCAA	2	12	1227320	1227331	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116628072
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25044	NC_008532	CTG	2	6	1227508	1227513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628072
25045	NC_008532	TTC	2	6	1227566	1227571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628072
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25048	NC_008532	TCAA	2	8	1227648	1227655	50 %	25 %	0 %	25 %	116628072
25049	NC_008532	AG	3	6	1227665	1227670	50 %	0 %	50 %	0 %	116628072
25050	NC_008532	TAA	2	6	1227795	1227800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25051	NC_008532	A	6	6	1227858	1227863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25052	NC_008532	TTA	2	6	1227871	1227876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25053	NC_008532	TTTC	2	8	1227880	1227887	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25054	NC_008532	AGA	2	6	1227934	1227939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628073
25055	NC_008532	CCAA	2	8	1227986	1227993	50 %	0 %	0 %	50 %	116628073
25056	NC_008532	GTC	2	6	1227994	1227999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116628073
25057	NC_008532	GTA	2	6	1228021	1228026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628073
25058	NC_008532	T	6	6	1228064	1228069	0 %	100 %	0 %	0 %	116628073
25059	NC_008532	TGG	2	6	1228097	1228102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116628073
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25065	NC_008532	CCGTCT	2	12	1228653	1228664	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	116628073
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25069	NC_008532	ATT	2	6	1228770	1228775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25070	NC_008532	ATT	2	6	1228800	1228805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25071	NC_008532	A	6	6	1228819	1228824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25072	NC_008532	AAT	2	6	1228832	1228837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25074	NC_008532	TTTTC	2	10	1228925	1228934	0 %	80 %	0 %	20 %	116628074
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25081	NC_008532	CAAT	2	8	1229350	1229357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25082	NC_008532	ACA	2	6	1229391	1229396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25083	NC_008532	A	7	7	1229420	1229426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25085	NC_008532	TAT	2	6	1229491	1229496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25091	NC_008532	GATA	2	8	1229659	1229666	50 %	25 %	25 %	0 %	116628075
25092	NC_008532	AC	3	6	1229680	1229685	50 %	0 %	0 %	50 %	116628075
25093	NC_008532	AGC	2	6	1229771	1229776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628075
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25105	NC_008532	AG	3	6	1230316	1230321	50 %	0 %	50 %	0 %	116628075
25106	NC_008532	CAA	2	6	1230322	1230327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628075
25107	NC_008532	T	7	7	1230346	1230352	0 %	100 %	0 %	0 %	116628075
25108	NC_008532	TCCT	2	8	1230372	1230379	0 %	50 %	0 %	50 %	116628076
25109	NC_008532	TTA	2	6	1230400	1230405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628076
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25119	NC_008532	ATG	2	6	1230846	1230851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628076
25120	NC_008532	ATT	2	6	1230921	1230926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628076
25121	NC_008532	CAT	2	6	1230960	1230965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628076
25122	NC_008532	ACA	2	6	1230974	1230979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628076
25123	NC_008532	GAT	2	6	1230980	1230985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628076
25124	NC_008532	AAG	3	9	1231056	1231064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628076
25125	NC_008532	A	7	7	1231093	1231099	100 %	0 %	0 %	0 %	116628076
25126	NC_008532	ATC	2	6	1231149	1231154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628076
25127	NC_008532	ATA	2	6	1231213	1231218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628076
25128	NC_008532	TTGA	2	8	1231219	1231226	25 %	50 %	25 %	0 %	116628076
25129	NC_008532	CCA	2	6	1231402	1231407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116628076
25130	NC_008532	ATT	2	6	1231422	1231427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628076
25131	NC_008532	TGAT	2	8	1231483	1231490	25 %	50 %	25 %	0 %	116628076
25132	NC_008532	A	6	6	1231505	1231510	100 %	0 %	0 %	0 %	116628076
25133	NC_008532	AAT	2	6	1231530	1231535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628076
25134	NC_008532	A	6	6	1231548	1231553	100 %	0 %	0 %	0 %	116628076
25135	NC_008532	AAAG	2	8	1231707	1231714	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25136	NC_008532	A	7	7	1231786	1231792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25137	NC_008532	ATT	2	6	1231824	1231829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25138	NC_008532	AGT	2	6	1231841	1231846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628077
25139	NC_008532	CTT	2	6	1231882	1231887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628077
25140	NC_008532	AAT	2	6	1231907	1231912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628077
25141	NC_008532	TCA	2	6	1231935	1231940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628077
25142	NC_008532	T	6	6	1231967	1231972	0 %	100 %	0 %	0 %	116628077
25143	NC_008532	GTATC	2	10	1231992	1232001	20 %	40 %	20 %	20 %	116628077
25144	NC_008532	AGC	2	6	1232033	1232038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628077
25145	NC_008532	TCAT	2	8	1232064	1232071	25 %	50 %	0 %	25 %	116628077
25146	NC_008532	GTT	2	6	1232116	1232121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116628077
25147	NC_008532	TCT	2	6	1232175	1232180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628077
25148	NC_008532	CTT	2	6	1232284	1232289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628077
25149	NC_008532	ACA	2	6	1232301	1232306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628077
25150	NC_008532	TGA	2	6	1232330	1232335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628077
25151	NC_008532	TTC	2	6	1232372	1232377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628077
25152	NC_008532	ACG	2	6	1232417	1232422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116628077
25153	NC_008532	TA	3	6	1232425	1232430	50 %	50 %	0 %	0 %	116628077
25154	NC_008532	TTAC	2	8	1232448	1232455	25 %	50 %	0 %	25 %	116628077
25155	NC_008532	TAC	2	6	1232543	1232548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25156	NC_008532	ATG	2	6	1232612	1232617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116628078
25157	NC_008532	ACA	2	6	1232684	1232689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116628078
25158	NC_008532	T	6	6	1232746	1232751	0 %	100 %	0 %	0 %	116628078
25159	NC_008532	ATA	2	6	1232776	1232781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628078
25160	NC_008532	ACT	2	6	1232851	1232856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628078
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25163	NC_008532	TCA	2	6	1232946	1232951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628078
25164	NC_008532	CA	3	6	1232950	1232955	50 %	0 %	0 %	50 %	116628078
25165	NC_008532	AGAAT	2	10	1233039	1233048	60 %	20 %	20 %	0 %	116628078
25166	NC_008532	CTA	3	9	1233080	1233088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628078
25167	NC_008532	C	6	6	1233176	1233181	0 %	0 %	0 %	100 %	116628078
25168	NC_008532	CAT	2	6	1233202	1233207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628078
25169	NC_008532	TAAA	2	8	1233261	1233268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25170	NC_008532	A	7	7	1233266	1233272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25171	NC_008532	TAT	2	6	1233282	1233287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25172	NC_008532	AC	3	6	1233303	1233308	50 %	0 %	0 %	50 %	116628079
25173	NC_008532	TCAAAG	2	12	1233390	1233401	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116628079
25174	NC_008532	T	6	6	1233423	1233428	0 %	100 %	0 %	0 %	116628079
25175	NC_008532	TAC	2	6	1233547	1233552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628079
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25181	NC_008532	GCAC	2	8	1233726	1233733	25 %	0 %	25 %	50 %	116628079
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25190	NC_008532	GGT	2	6	1234260	1234265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25191	NC_008532	ATGCC	2	10	1234319	1234328	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25192	NC_008532	GAT	2	6	1234340	1234345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25193	NC_008532	T	6	6	1234345	1234350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25194	NC_008532	CAAT	2	8	1234408	1234415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25195	NC_008532	GAC	3	9	1234432	1234440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25196	NC_008532	GCT	2	6	1234482	1234487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25198	NC_008532	AAT	2	6	1234697	1234702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25199	NC_008532	TCA	2	6	1234834	1234839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25200	NC_008532	CTG	2	6	1234974	1234979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25201	NC_008532	ATC	2	6	1235014	1235019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628080
25202	NC_008532	AAG	2	6	1235057	1235062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116628080
25203	NC_008532	TTC	2	6	1235161	1235166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628081
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25207	NC_008532	TTTGG	2	10	1235391	1235400	0 %	60 %	40 %	0 %	116628081
25208	NC_008532	AACT	2	8	1235449	1235456	50 %	25 %	0 %	25 %	116628081
25209	NC_008532	AT	3	6	1235481	1235486	50 %	50 %	0 %	0 %	116628081
25210	NC_008532	TAA	2	6	1235517	1235522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116628081
25211	NC_008532	ATTT	2	8	1235631	1235638	25 %	75 %	0 %	0 %	116628081
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25221	NC_008532	TATCAT	2	12	1236395	1236406	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116628082
25222	NC_008532	TCT	2	6	1236412	1236417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628082
25223	NC_008532	TC	3	6	1236456	1236461	0 %	50 %	0 %	50 %	116628082
25224	NC_008532	TTTC	2	8	1236517	1236524	0 %	75 %	0 %	25 %	116628082
25225	NC_008532	CTA	2	6	1236553	1236558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628082
25226	NC_008532	AAATCT	2	12	1236571	1236582	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116628082
25227	NC_008532	CTA	2	6	1236611	1236616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628082
25228	NC_008532	T	6	6	1236625	1236630	0 %	100 %	0 %	0 %	116628082
25229	NC_008532	GTAT	2	8	1236640	1236647	25 %	50 %	25 %	0 %	116628082
25230	NC_008532	TAT	2	6	1236659	1236664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628082
25231	NC_008532	CAAA	2	8	1236679	1236686	75 %	0 %	0 %	25 %	116628082
25232	NC_008532	CTC	3	9	1236695	1236703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628082
25233	NC_008532	CAT	2	6	1236725	1236730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116628082
25234	NC_008532	TCT	2	6	1236783	1236788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628082
25235	NC_008532	TCCC	2	8	1236806	1236813	0 %	25 %	0 %	75 %	116628082
25236	NC_008532	TAT	2	6	1236920	1236925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628082
25237	NC_008532	CCT	2	6	1236983	1236988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116628082
25238	NC_008532	T	6	6	1236996	1237001	0 %	100 %	0 %	0 %	116628082
25239	NC_008532	CTT	2	6	1237004	1237009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116628082
25240	NC_008532	TTCT	2	8	1237088	1237095	0 %	75 %	0 %	25 %	116628082
25241	NC_008532	ATT	2	6	1237137	1237142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628082
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25243	NC_008532	ATT	2	6	1237191	1237196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116628082
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25354	NC_008532	GGA	2	6	1242601	1242606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116628084
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