MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008532	CTG	2	6	49221	49226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627008
1002	NC_008532	AGC	2	6	49258	49263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627008
1003	NC_008532	GAAGC	2	10	49319	49328	40 %	0 %	40 %	20 %	116627008
1004	NC_008532	CCA	2	6	49479	49484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_008532	GA	3	6	49500	49505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008532	TC	4	8	49529	49536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_008532	AAAC	2	8	49576	49583	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_008532	ATTTT	2	10	49629	49638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008532	AAG	2	6	49665	49670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008532	A	6	6	49687	49692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008532	TCT	2	6	49716	49721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_008532	CTG	2	6	49794	49799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_008532	CA	3	6	49872	49877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_008532	TGGATT	2	12	49955	49966	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008532	TGA	2	6	50049	50054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008532	TTC	2	6	50059	50064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_008532	TCA	2	6	50079	50084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_008532	A	6	6	50212	50217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008532	TCT	2	6	50265	50270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_008532	TTG	2	6	50272	50277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008532	AGG	2	6	50358	50363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008532	TTG	2	6	50393	50398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008532	CTAT	2	8	50510	50517	25 %	50 %	0 %	25 %	116627010
1024	NC_008532	GTT	2	6	50607	50612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008532	AAG	2	6	50656	50661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008532	AATA	2	8	50710	50717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008532	A	7	7	50721	50727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008532	CTT	2	6	50815	50820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_008532	GAA	2	6	50919	50924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627011
1030	NC_008532	AATA	2	8	50925	50932	75 %	25 %	0 %	0 %	116627011
1031	NC_008532	GCTTG	2	10	50937	50946	0 %	40 %	40 %	20 %	116627011
1032	NC_008532	AGC	2	6	51061	51066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627011
1033	NC_008532	ACAA	2	8	51190	51197	75 %	0 %	0 %	25 %	116627011
1034	NC_008532	ATC	2	6	51240	51245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627011
1035	NC_008532	ATG	2	6	51279	51284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627011
1036	NC_008532	GCT	2	6	51387	51392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627011
1037	NC_008532	CCA	2	6	51444	51449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116627011
1038	NC_008532	TTG	2	6	51451	51456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627011
1039	NC_008532	AAC	2	6	51613	51618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627011
1040	NC_008532	TC	3	6	51781	51786	0 %	50 %	0 %	50 %	116627011
1041	NC_008532	TCA	2	6	51789	51794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627011
1042	NC_008532	ATC	2	6	51804	51809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627011
1043	NC_008532	TTGA	2	8	51828	51835	25 %	50 %	25 %	0 %	116627011
1044	NC_008532	TTGA	2	8	51954	51961	25 %	50 %	25 %	0 %	116627011
1045	NC_008532	CTT	2	6	52047	52052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627011
1046	NC_008532	CTCA	2	8	52080	52087	25 %	25 %	0 %	50 %	116627011
1047	NC_008532	AGA	2	6	52088	52093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627011
1048	NC_008532	CGA	2	6	52097	52102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627011
1049	NC_008532	TAT	2	6	52119	52124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627011
1050	NC_008532	TGA	2	6	52136	52141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627011
1051	NC_008532	T	6	6	52207	52212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008532	T	6	6	52245	52250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008532	AGGA	2	8	52284	52291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008532	ATC	2	6	52368	52373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_008532	ATGA	2	8	52380	52387	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008532	CTT	2	6	52408	52413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_008532	TGA	2	6	52481	52486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008532	AAT	2	6	52492	52497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008532	AT	3	6	52526	52531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008532	AGC	2	6	52549	52554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_008532	T	6	6	52585	52590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008532	T	6	6	52630	52635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008532	CTT	2	6	52636	52641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_008532	TTA	2	6	52651	52656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008532	TA	3	6	52708	52713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008532	CTG	2	6	52795	52800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_008532	T	7	7	52816	52822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008532	TGC	2	6	52824	52829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_008532	AAC	2	6	52932	52937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_008532	CTTTT	2	10	52941	52950	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1071	NC_008532	ATG	2	6	52975	52980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008532	T	7	7	52991	52997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008532	A	6	6	53005	53010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008532	CTT	2	6	53077	53082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627012
1075	NC_008532	CTGTTG	2	12	53089	53100	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116627012
1076	NC_008532	GT	3	6	53152	53157	0 %	50 %	50 %	0 %	116627012
1077	NC_008532	TGA	2	6	53242	53247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627012
1078	NC_008532	TGA	2	6	53272	53277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627012
1079	NC_008532	CGT	2	6	53293	53298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627012
1080	NC_008532	TGTA	2	8	53305	53312	25 %	50 %	25 %	0 %	116627012
1081	NC_008532	AGAT	2	8	53347	53354	50 %	25 %	25 %	0 %	116627012
1082	NC_008532	CCAACA	2	12	53478	53489	50 %	0 %	0 %	50 %	116627012
1083	NC_008532	CAAG	2	8	53581	53588	50 %	0 %	25 %	25 %	116627012
1084	NC_008532	GTC	2	6	53660	53665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627012
1085	NC_008532	GCA	2	6	53784	53789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627012
1086	NC_008532	T	6	6	53828	53833	0 %	100 %	0 %	0 %	116627012
1087	NC_008532	CATC	2	8	53935	53942	25 %	25 %	0 %	50 %	116627012
1088	NC_008532	TCA	2	6	54027	54032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627012
1089	NC_008532	TCA	2	6	54063	54068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627012
1090	NC_008532	CTT	2	6	54100	54105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627012
1091	NC_008532	TCT	2	6	54120	54125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627012
1092	NC_008532	CAA	2	6	54217	54222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627012
1093	NC_008532	TGAT	2	8	54258	54265	25 %	50 %	25 %	0 %	116627012
1094	NC_008532	T	6	6	54538	54543	0 %	100 %	0 %	0 %	116627012
1095	NC_008532	CTG	2	6	54553	54558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627012
1096	NC_008532	GAG	2	6	54568	54573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627012
1097	NC_008532	AAC	2	6	54683	54688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627012
1098	NC_008532	CTG	2	6	54700	54705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627012
1099	NC_008532	ATT	2	6	54770	54775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_008532	AAG	2	6	54811	54816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008532	A	6	6	54826	54831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008532	AG	3	6	54889	54894	50 %	0 %	50 %	0 %	116627013
1103	NC_008532	GAT	2	6	54917	54922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627013
1104	NC_008532	TGA	2	6	55043	55048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627013
1105	NC_008532	TGA	2	6	55205	55210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627013
1106	NC_008532	TGA	2	6	55308	55313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627013
1107	NC_008532	CTC	2	6	55317	55322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627014
1108	NC_008532	AGA	2	6	55345	55350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627014
1109	NC_008532	CCT	2	6	55360	55365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627014
1110	NC_008532	CTGG	2	8	55439	55446	0 %	25 %	50 %	25 %	116627014
1111	NC_008532	CAA	2	6	55463	55468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627014
1112	NC_008532	AAC	2	6	55497	55502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627014
1113	NC_008532	GAG	2	6	55511	55516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627014
1114	NC_008532	GCAG	2	8	55525	55532	25 %	0 %	50 %	25 %	116627014
1115	NC_008532	GAA	2	6	55634	55639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627014
1116	NC_008532	GAG	2	6	55649	55654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627014
1117	NC_008532	A	6	6	55672	55677	100 %	0 %	0 %	0 %	116627015
1118	NC_008532	GCA	2	6	55691	55696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627015
1119	NC_008532	T	6	6	55730	55735	0 %	100 %	0 %	0 %	116627015
1120	NC_008532	ATT	2	6	55763	55768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627015
1121	NC_008532	GAT	2	6	55773	55778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627015
1122	NC_008532	TAA	2	6	55823	55828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627015
1123	NC_008532	GGA	2	6	55937	55942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627015
1124	NC_008532	GTT	2	6	55977	55982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627015
1125	NC_008532	CAA	2	6	56033	56038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627015
1126	NC_008532	TGG	2	6	56044	56049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627015
1127	NC_008532	T	6	6	56109	56114	0 %	100 %	0 %	0 %	116627015
1128	NC_008532	GAT	2	6	56127	56132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627015
1129	NC_008532	AGT	2	6	56177	56182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627015
1130	NC_008532	TC	3	6	56243	56248	0 %	50 %	0 %	50 %	116627015
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1132	NC_008532	CAT	2	6	56573	56578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627015
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