MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008532	T	6	6	25646	25651	0 %	100 %	0 %	0 %	116626990
502	NC_008532	TCT	2	6	25703	25708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626990
503	NC_008532	ATG	2	6	25779	25784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626990
504	NC_008532	T	6	6	25795	25800	0 %	100 %	0 %	0 %	116626990
505	NC_008532	CTG	2	6	25860	25865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626990
506	NC_008532	AAG	2	6	25881	25886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626990
507	NC_008532	CTT	2	6	25905	25910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626990
508	NC_008532	CTG	2	6	25950	25955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626990
509	NC_008532	TGG	2	6	26053	26058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116626990
510	NC_008532	ATA	2	6	26199	26204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626990
511	NC_008532	AAG	2	6	26207	26212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626990
512	NC_008532	TCT	2	6	26240	26245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626990
513	NC_008532	GGTT	2	8	26254	26261	0 %	50 %	50 %	0 %	116626990
514	NC_008532	TGAT	2	8	26331	26338	25 %	50 %	25 %	0 %	116626990
515	NC_008532	TTG	2	6	26406	26411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626990
516	NC_008532	ATA	2	6	26422	26427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626990
517	NC_008532	TAT	2	6	26468	26473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626991
518	NC_008532	TAT	2	6	26514	26519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626991
519	NC_008532	ATT	2	6	26531	26536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626991
520	NC_008532	TAT	2	6	26555	26560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626991
521	NC_008532	TTGT	2	8	26614	26621	0 %	75 %	25 %	0 %	116626991
522	NC_008532	ATT	2	6	26644	26649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626991
523	NC_008532	T	6	6	26756	26761	0 %	100 %	0 %	0 %	116626991
524	NC_008532	TAT	2	6	26805	26810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626991
525	NC_008532	TAT	2	6	26840	26845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626991
526	NC_008532	CTAGT	2	10	26860	26869	20 %	40 %	20 %	20 %	116626991
527	NC_008532	ATT	2	6	26915	26920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626991
528	NC_008532	TAAA	2	8	26945	26952	75 %	25 %	0 %	0 %	116626991
529	NC_008532	T	6	6	26985	26990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008532	AGT	2	6	27020	27025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008532	TAT	2	6	27032	27037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626992
532	NC_008532	A	6	6	27039	27044	100 %	0 %	0 %	0 %	116626992
533	NC_008532	CAG	2	6	27055	27060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626992
534	NC_008532	GTG	2	6	27070	27075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116626992
535	NC_008532	CAG	2	6	27085	27090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626992
536	NC_008532	GCT	2	6	27129	27134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626992
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538	NC_008532	CAATC	2	10	27196	27205	40 %	20 %	0 %	40 %	116626992
539	NC_008532	A	6	6	27229	27234	100 %	0 %	0 %	0 %	116626992
540	NC_008532	CAA	2	6	27360	27365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626992
541	NC_008532	CTA	2	6	27376	27381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626992
542	NC_008532	GTT	2	6	27453	27458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626992
543	NC_008532	TAA	2	6	27464	27469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626992
544	NC_008532	TGC	2	6	27509	27514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626992
545	NC_008532	TAA	2	6	27557	27562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626992
546	NC_008532	ACA	2	6	27576	27581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626992
547	NC_008532	CAA	2	6	27600	27605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626992
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550	NC_008532	CTG	2	6	27694	27699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626992
551	NC_008532	TTC	2	6	27782	27787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626992
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553	NC_008532	CTT	2	6	27808	27813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116626992
554	NC_008532	GCT	2	6	27822	27827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626992
555	NC_008532	TCA	2	6	27909	27914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626992
556	NC_008532	GCT	2	6	28008	28013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626992
557	NC_008532	GCT	2	6	28032	28037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626992
558	NC_008532	CAG	2	6	28054	28059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626992
559	NC_008532	TAA	2	6	28130	28135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626992
560	NC_008532	AGC	2	6	28172	28177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626992
561	NC_008532	ATG	2	6	28231	28236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626992
562	NC_008532	GTG	2	6	28237	28242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116626992
563	NC_008532	CATCAG	2	12	28267	28278	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116626992
564	NC_008532	ATTCA	2	10	28285	28294	40 %	40 %	0 %	20 %	116626992
565	NC_008532	CAT	2	6	28360	28365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626992
566	NC_008532	TGG	2	6	28373	28378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116626992
567	NC_008532	TTTTA	2	10	28442	28451	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008532	ATA	2	6	28457	28462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008532	AAT	2	6	28478	28483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_008532	A	7	7	28492	28498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008532	ATTT	2	8	28549	28556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_008532	A	6	6	28575	28580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008532	TAG	2	6	28594	28599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008532	GGA	2	6	28607	28612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008532	GTC	2	6	28649	28654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626993
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581	NC_008532	TTA	2	6	28892	28897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116626993
582	NC_008532	GTTG	2	8	28952	28959	0 %	50 %	50 %	0 %	116626993
583	NC_008532	CTC	2	6	29014	29019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116626993
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589	NC_008532	TTGA	2	8	29280	29287	25 %	50 %	25 %	0 %	116626993
590	NC_008532	TGAT	2	8	29293	29300	25 %	50 %	25 %	0 %	116626993
591	NC_008532	CAT	2	6	29365	29370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116626993
592	NC_008532	ATA	2	6	29404	29409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626993
593	NC_008532	TTG	2	6	29434	29439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626993
594	NC_008532	AGA	2	6	29462	29467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116626993
595	NC_008532	TGAT	2	8	29473	29480	25 %	50 %	25 %	0 %	116626993
596	NC_008532	TGATT	2	10	29504	29513	20 %	60 %	20 %	0 %	116626993
597	NC_008532	AG	3	6	29633	29638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_008532	TCT	2	6	29650	29655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_008532	TGA	2	6	29674	29679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_008532	TAA	2	6	29698	29703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008532	TAA	2	6	29847	29852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008532	A	6	6	29885	29890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008532	TAA	2	6	29943	29948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008532	TCT	2	6	29977	29982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_008532	CTT	2	6	30093	30098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_008532	GCT	2	6	30149	30154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_008532	GAT	2	6	30156	30161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_008532	AAT	2	6	30174	30179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008532	ACCTT	2	10	30248	30257	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
610	NC_008532	TGG	2	6	30280	30285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_008532	TTC	2	6	30352	30357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_008532	CGT	2	6	30361	30366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_008532	ATG	2	6	30432	30437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008532	TTC	2	6	30481	30486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_008532	ATG	2	6	30490	30495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_008532	T	6	6	30620	30625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008532	AAT	2	6	30665	30670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008532	TAA	2	6	30709	30714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116626994
619	NC_008532	CAAT	2	8	30758	30765	50 %	25 %	0 %	25 %	116626994
620	NC_008532	AGC	2	6	30838	30843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116626994
621	NC_008532	GCT	2	6	30911	30916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116626994
622	NC_008532	TTG	2	6	31104	31109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626994
623	NC_008532	ACA	2	6	31118	31123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116626994
624	NC_008532	TTTTG	2	10	31132	31141	0 %	80 %	20 %	0 %	116626994
625	NC_008532	CAAC	2	8	31212	31219	50 %	0 %	0 %	50 %	116626994
626	NC_008532	A	6	6	31274	31279	100 %	0 %	0 %	0 %	116626994
627	NC_008532	TGT	2	6	31291	31296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116626994
628	NC_008532	TGA	2	6	31300	31305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116626994
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