MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008532	AAT	2	6	269488	269493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627198
5502	NC_008532	AAT	2	6	269512	269517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_008532	ATC	2	6	269549	269554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_008532	CAGC	2	8	269560	269567	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_008532	A	6	6	269586	269591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_008532	TGA	2	6	269594	269599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_008532	T	7	7	269615	269621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_008532	CTA	2	6	269622	269627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_008532	AATG	2	8	269710	269717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_008532	GTC	2	6	269729	269734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_008532	T	6	6	269764	269769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_008532	GCA	2	6	269860	269865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627199
5513	NC_008532	CAT	2	6	269883	269888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627199
5514	NC_008532	TGA	2	6	269910	269915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627199
5515	NC_008532	AAG	2	6	269917	269922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627199
5516	NC_008532	GC	3	6	269928	269933	0 %	0 %	50 %	50 %	116627199
5517	NC_008532	TTA	2	6	269967	269972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627199
5518	NC_008532	AGA	2	6	270054	270059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627199
5519	NC_008532	ATGA	2	8	270166	270173	50 %	25 %	25 %	0 %	116627199
5520	NC_008532	CAG	3	9	270238	270246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627199
5521	NC_008532	CAT	2	6	270277	270282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627199
5522	NC_008532	TGT	2	6	270306	270311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_008532	CAA	2	6	270342	270347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_008532	T	7	7	270385	270391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_008532	CGG	2	6	270436	270441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_008532	TGA	2	6	270473	270478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5528	NC_008532	AGA	2	6	270516	270521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_008532	T	7	7	270541	270547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5531	NC_008532	GGA	2	6	270594	270599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_008532	T	7	7	270601	270607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5534	NC_008532	TTG	2	6	270662	270667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627200
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5544	NC_008532	T	6	6	271104	271109	0 %	100 %	0 %	0 %	116627200
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5546	NC_008532	AC	3	6	271181	271186	50 %	0 %	0 %	50 %	116627201
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5555	NC_008532	TAG	2	6	271634	271639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627201
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5558	NC_008532	TTG	2	6	271848	271853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_008532	ATT	2	6	271881	271886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_008532	TTA	2	6	271890	271895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_008532	A	6	6	271934	271939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_008532	TA	3	6	271948	271953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_008532	AT	3	6	271958	271963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_008532	ATA	2	6	271976	271981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5566	NC_008532	TAGA	2	8	272158	272165	50 %	25 %	25 %	0 %	116627202
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5597	NC_008532	TGG	2	6	273353	273358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_008532	ATT	2	6	273367	273372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_008532	ATT	2	6	273377	273382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5605	NC_008532	TAT	2	6	273653	273658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5608	NC_008532	TC	3	6	273705	273710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5610	NC_008532	T	6	6	273748	273753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5612	NC_008532	TCCT	2	8	273804	273811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_008532	CTTT	2	8	273827	273834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5620	NC_008532	TAT	2	6	274117	274122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_008532	TGA	2	6	274123	274128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_008532	AG	3	6	274168	274173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_008532	ACT	2	6	274206	274211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_008532	GAA	2	6	274213	274218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_008532	AGTT	2	8	274275	274282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_008532	TATGG	2	10	274299	274308	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_008532	CTG	2	6	274338	274343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_008532	ATT	2	6	274374	274379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_008532	TAAT	2	8	274392	274399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5999	NC_008532	AGC	2	6	292014	292019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627218
6000	NC_008532	TGT	2	6	292028	292033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627218

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