MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008532	AAT	2	6	244891	244896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627171
5002	NC_008532	T	7	7	244923	244929	0 %	100 %	0 %	0 %	116627171
5003	NC_008532	GAG	2	6	244930	244935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627171
5004	NC_008532	CTG	2	6	245021	245026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627171
5005	NC_008532	ATTGA	2	10	245071	245080	40 %	40 %	20 %	0 %	116627171
5006	NC_008532	T	6	6	245107	245112	0 %	100 %	0 %	0 %	116627171
5007	NC_008532	AAT	2	6	245113	245118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627171
5008	NC_008532	TAT	2	6	245121	245126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627171
5009	NC_008532	A	6	6	245168	245173	100 %	0 %	0 %	0 %	116627171
5010	NC_008532	TC	3	6	245191	245196	0 %	50 %	0 %	50 %	116627171
5011	NC_008532	AGA	2	6	245238	245243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627171
5012	NC_008532	GCT	2	6	245257	245262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627171
5013	NC_008532	TTTGA	2	10	245344	245353	20 %	60 %	20 %	0 %	116627171
5014	NC_008532	TTTTGA	2	12	245385	245396	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116627171
5015	NC_008532	TGT	2	6	245403	245408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627171
5016	NC_008532	GAT	2	6	245704	245709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627171
5017	NC_008532	TGA	2	6	245790	245795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627171
5018	NC_008532	GCC	2	6	245878	245883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116627171
5019	NC_008532	CT	3	6	245898	245903	0 %	50 %	0 %	50 %	116627171
5020	NC_008532	AGA	2	6	245931	245936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627171
5021	NC_008532	AAGA	2	8	246023	246030	75 %	0 %	25 %	0 %	116627171
5022	NC_008532	TGG	2	6	246069	246074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627171
5023	NC_008532	CGA	2	6	246084	246089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627171
5024	NC_008532	A	6	6	246208	246213	100 %	0 %	0 %	0 %	116627171
5025	NC_008532	CTC	2	6	246218	246223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627171
5026	NC_008532	TGA	2	6	246264	246269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627171
5027	NC_008532	AGA	2	6	246279	246284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627171
5028	NC_008532	ATT	3	9	246292	246300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627171
5029	NC_008532	GAA	2	6	246387	246392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627171
5030	NC_008532	TTG	2	6	246478	246483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627171
5031	NC_008532	A	6	6	246601	246606	100 %	0 %	0 %	0 %	116627171
5032	NC_008532	TTC	2	6	246614	246619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627171
5033	NC_008532	TATT	2	8	246681	246688	25 %	75 %	0 %	0 %	116627171
5034	NC_008532	CAA	2	6	246709	246714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627171
5035	NC_008532	TCG	2	6	246747	246752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627171
5036	NC_008532	T	6	6	246902	246907	0 %	100 %	0 %	0 %	116627171
5037	NC_008532	GTC	2	6	247001	247006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627171
5038	NC_008532	G	7	7	247069	247075	0 %	0 %	100 %	0 %	116627171
5039	NC_008532	TGG	2	6	247123	247128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627171
5040	NC_008532	GAAGA	2	10	247225	247234	60 %	0 %	40 %	0 %	116627171
5041	NC_008532	AAG	2	6	247247	247252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627171
5042	NC_008532	ACA	2	6	247270	247275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627171
5043	NC_008532	ATA	2	6	247422	247427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_008532	CAT	2	6	247479	247484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_008532	GAC	2	6	247522	247527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627172
5046	NC_008532	CGGA	2	8	247543	247550	25 %	0 %	50 %	25 %	116627172
5047	NC_008532	CTTG	2	8	247555	247562	0 %	50 %	25 %	25 %	116627172
5048	NC_008532	TTTC	2	8	247649	247656	0 %	75 %	0 %	25 %	116627172
5049	NC_008532	GAA	2	6	247746	247751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627172
5050	NC_008532	ACGT	2	8	247774	247781	25 %	25 %	25 %	25 %	116627172
5051	NC_008532	AAG	2	6	247807	247812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627172
5052	NC_008532	TCAA	2	8	247814	247821	50 %	25 %	0 %	25 %	116627172
5053	NC_008532	GCT	2	6	247848	247853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627172
5054	NC_008532	TGA	2	6	247930	247935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627172
5055	NC_008532	CAA	2	6	248070	248075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627172
5056	NC_008532	CTT	2	6	248120	248125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627172
5057	NC_008532	AGA	2	6	248210	248215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627172
5058	NC_008532	GGCTTT	2	12	248299	248310	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116627173
5059	NC_008532	TAC	2	6	248360	248365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627173
5060	NC_008532	TCCT	2	8	248403	248410	0 %	50 %	0 %	50 %	116627173
5061	NC_008532	A	7	7	248418	248424	100 %	0 %	0 %	0 %	116627173
5062	NC_008532	ATTG	2	8	248443	248450	25 %	50 %	25 %	0 %	116627173
5063	NC_008532	AAC	2	6	248474	248479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627173
5064	NC_008532	TGA	2	6	248803	248808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627173
5065	NC_008532	GAT	2	6	248825	248830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627173
5066	NC_008532	TAT	3	9	248912	248920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627173
5067	NC_008532	GAA	2	6	248927	248932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627173
5068	NC_008532	ATG	2	6	248934	248939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627173
5069	NC_008532	ATT	2	6	248957	248962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627173
5070	NC_008532	ATG	2	6	248997	249002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627173
5071	NC_008532	GTC	2	6	249039	249044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627173
5072	NC_008532	TGTA	2	8	249081	249088	25 %	50 %	25 %	0 %	116627173
5073	NC_008532	CGT	2	6	249146	249151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627173
5074	NC_008532	ATT	2	6	249164	249169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627173
5075	NC_008532	ATC	2	6	249182	249187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627173
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5077	NC_008532	ATT	2	6	249215	249220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627173
5078	NC_008532	GCA	2	6	249233	249238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627173
5079	NC_008532	TTG	2	6	249264	249269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627173
5080	NC_008532	CTT	2	6	249308	249313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627173
5081	NC_008532	CTAT	2	8	249492	249499	25 %	50 %	0 %	25 %	116627173
5082	NC_008532	AT	3	6	249580	249585	50 %	50 %	0 %	0 %	116627173
5083	NC_008532	GAT	2	6	249640	249645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_008532	TGT	2	6	249679	249684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_008532	GCT	2	6	249720	249725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_008532	AGG	2	6	249884	249889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_008532	TATC	2	8	249910	249917	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5088	NC_008532	CTA	2	6	250034	250039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_008532	GTTAC	2	10	250144	250153	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5090	NC_008532	T	6	6	250188	250193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_008532	AGG	2	6	250221	250226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_008532	CTG	2	6	250264	250269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627174
5093	NC_008532	TTC	2	6	250297	250302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627174
5094	NC_008532	AAG	2	6	250312	250317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627174
5095	NC_008532	GAG	3	9	250341	250349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627174
5096	NC_008532	A	7	7	250353	250359	100 %	0 %	0 %	0 %	116627174
5097	NC_008532	CAC	2	6	250378	250383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116627174
5098	NC_008532	AGTA	2	8	250436	250443	50 %	25 %	25 %	0 %	116627174
5099	NC_008532	TCT	2	6	250539	250544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627174
5100	NC_008532	TTC	2	6	250559	250564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627174
5101	NC_008532	CGT	2	6	250662	250667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627174
5102	NC_008532	AT	3	6	250718	250723	50 %	50 %	0 %	0 %	116627174
5103	NC_008532	AAG	2	6	250765	250770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627174
5104	NC_008532	AAG	2	6	250825	250830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627174
5105	NC_008532	CAT	2	6	250845	250850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627174
5106	NC_008532	AGTA	2	8	250853	250860	50 %	25 %	25 %	0 %	116627174
5107	NC_008532	TCAG	2	8	250883	250890	25 %	25 %	25 %	25 %	116627174
5108	NC_008532	TGA	2	6	250916	250921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627174
5109	NC_008532	AGC	3	9	250934	250942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627174
5110	NC_008532	GAA	3	9	250979	250987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627174
5111	NC_008532	ATC	2	6	251022	251027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627174
5112	NC_008532	GAA	2	6	251031	251036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627174
5113	NC_008532	TCG	2	6	251081	251086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627174
5114	NC_008532	CAT	2	6	251108	251113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627174
5115	NC_008532	TCT	2	6	251116	251121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627174
5116	NC_008532	TCTTA	2	10	251126	251135	20 %	60 %	0 %	20 %	116627174
5117	NC_008532	TTA	2	6	251209	251214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627174
5118	NC_008532	GTT	2	6	251258	251263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627174
5119	NC_008532	ATT	2	6	251382	251387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627174
5120	NC_008532	A	6	6	251400	251405	100 %	0 %	0 %	0 %	116627174
5121	NC_008532	AAG	2	6	251452	251457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627174
5122	NC_008532	TCA	2	6	251499	251504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627174
5123	NC_008532	A	6	6	251508	251513	100 %	0 %	0 %	0 %	116627174
5124	NC_008532	CTT	2	6	251549	251554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627174
5125	NC_008532	GAT	2	6	251568	251573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627174
5126	NC_008532	TTG	2	6	251610	251615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627174
5127	NC_008532	ACG	2	6	251697	251702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627174
5128	NC_008532	CAA	2	6	251764	251769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627174
5129	NC_008532	TCA	2	6	251772	251777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627174
5130	NC_008532	TTG	2	6	251818	251823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627174
5131	NC_008532	TGA	3	9	251840	251848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627174
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5136	NC_008532	ACT	2	6	252240	252245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5138	NC_008532	A	7	7	252288	252294	100 %	0 %	0 %	0 %	116627175
5139	NC_008532	A	6	6	252301	252306	100 %	0 %	0 %	0 %	116627175
5140	NC_008532	A	8	8	252328	252335	100 %	0 %	0 %	0 %	116627175
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5143	NC_008532	GGC	2	6	252446	252451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116627175
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5145	NC_008532	TCAAAT	2	12	252479	252490	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116627175
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5150	NC_008532	GTA	2	6	252835	252840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_008532	T	6	6	252892	252897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5152	NC_008532	ATA	2	6	252909	252914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_008532	T	6	6	252961	252966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5154	NC_008532	TAT	2	6	253017	253022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627176
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5156	NC_008532	TTC	2	6	253109	253114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627176
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5161	NC_008532	ATG	2	6	253484	253489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627177
5162	NC_008532	CTT	2	6	253495	253500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627177
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5166	NC_008532	T	8	8	253756	253763	0 %	100 %	0 %	0 %	116627178
5167	NC_008532	T	6	6	253789	253794	0 %	100 %	0 %	0 %	116627178
5168	NC_008532	GGA	2	6	253840	253845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627178
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5189	NC_008532	CCAG	2	8	254535	254542	25 %	0 %	25 %	50 %	116627178
5190	NC_008532	CA	3	6	254568	254573	50 %	0 %	0 %	50 %	116627178
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5193	NC_008532	T	6	6	254688	254693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5194	NC_008532	CAT	2	6	254722	254727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5200	NC_008532	TCAA	2	8	255121	255128	50 %	25 %	0 %	25 %	116627180
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5214	NC_008532	CT	3	6	255651	255656	0 %	50 %	0 %	50 %	116627180
5215	NC_008532	AGAC	2	8	255687	255694	50 %	0 %	25 %	25 %	116627180
5216	NC_008532	GCCAG	2	10	255784	255793	20 %	0 %	40 %	40 %	116627180
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5221	NC_008532	TAT	3	9	255942	255950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627181
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5228	NC_008532	TAT	2	6	256165	256170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627181
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5230	NC_008532	A	6	6	256261	256266	100 %	0 %	0 %	0 %	116627181
5231	NC_008532	ATC	2	6	256276	256281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627181
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5233	NC_008532	TGG	2	6	256346	256351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627181
5234	NC_008532	AAG	2	6	256370	256375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627181
5235	NC_008532	T	6	6	256414	256419	0 %	100 %	0 %	0 %	116627181
5236	NC_008532	AATT	2	8	256448	256455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5237	NC_008532	TTG	2	6	256547	256552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627182
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5239	NC_008532	CT	4	8	256601	256608	0 %	50 %	0 %	50 %	116627182
5240	NC_008532	ATT	2	6	256634	256639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627182
5241	NC_008532	TTG	2	6	256664	256669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627182
5242	NC_008532	T	7	7	256682	256688	0 %	100 %	0 %	0 %	116627182
5243	NC_008532	GTG	2	6	256694	256699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627182
5244	NC_008532	AAG	2	6	256704	256709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627182
5245	NC_008532	ATC	2	6	256777	256782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627182
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5375	NC_008532	GCA	2	6	262952	262957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627190
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5379	NC_008532	TGT	2	6	263403	263408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627191
5380	NC_008532	GAT	2	6	263422	263427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627191
5381	NC_008532	TCCTT	2	10	263466	263475	0 %	60 %	0 %	40 %	116627191
5382	NC_008532	AGT	2	6	263478	263483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627191
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5384	NC_008532	ATC	2	6	263575	263580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627191
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5387	NC_008532	GCTTAT	2	12	263654	263665	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116627192
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5394	NC_008532	GATT	2	8	264117	264124	25 %	50 %	25 %	0 %	116627192
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5495	NC_008532	CTG	2	6	269250	269255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627198
5496	NC_008532	GTT	2	6	269305	269310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627198
5497	NC_008532	TTC	2	6	269407	269412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627198
5498	NC_008532	CGT	2	6	269424	269429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627198
5499	NC_008532	TCA	2	6	269435	269440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627198
5500	NC_008532	AG	3	6	269444	269449	50 %	0 %	50 %	0 %	116627198

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