MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMD-9

Total Repeats: 38104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008532	TTC	2	6	219563	219568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_008532	CAT	2	6	219574	219579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_008532	CAT	2	6	219589	219594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_008532	CTG	2	6	219616	219621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_008532	T	7	7	219692	219698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_008532	GTTT	2	8	219711	219718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_008532	GCT	2	6	219750	219755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627148
4508	NC_008532	A	6	6	219801	219806	100 %	0 %	0 %	0 %	116627148
4509	NC_008532	CAATC	2	10	219808	219817	40 %	20 %	0 %	40 %	116627148
4510	NC_008532	TTG	2	6	219818	219823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627148
4511	NC_008532	GAAAGA	2	12	219959	219970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_008532	AT	3	6	219999	220004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_008532	GTG	2	6	220118	220123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_008532	A	7	7	220182	220188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_008532	TGG	2	6	220192	220197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_008532	ATG	2	6	220281	220286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627149
4517	NC_008532	ACC	2	6	220319	220324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116627149
4518	NC_008532	ACC	2	6	220391	220396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116627149
4519	NC_008532	CAT	2	6	220415	220420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627149
4520	NC_008532	GAGT	2	8	220727	220734	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_008532	GTGA	2	8	220819	220826	25 %	25 %	50 %	0 %	116627150
4522	NC_008532	GAT	2	6	220859	220864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627150
4523	NC_008532	TGA	2	6	220868	220873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627150
4524	NC_008532	CCA	2	6	221034	221039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116627150
4525	NC_008532	ATC	2	6	221141	221146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627150
4526	NC_008532	TCT	2	6	221150	221155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627150
4527	NC_008532	ACG	2	6	221237	221242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627150
4528	NC_008532	AAG	2	6	221278	221283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627150
4529	NC_008532	GAT	2	6	221341	221346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627150
4530	NC_008532	AG	3	6	221361	221366	50 %	0 %	50 %	0 %	116627150
4531	NC_008532	TTA	2	6	221402	221407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627150
4532	NC_008532	CTT	2	6	221448	221453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627150
4533	NC_008532	T	6	6	221500	221505	0 %	100 %	0 %	0 %	116627150
4534	NC_008532	GAG	2	6	221539	221544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627150
4535	NC_008532	GTT	2	6	221570	221575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627150
4536	NC_008532	A	6	6	221699	221704	100 %	0 %	0 %	0 %	116627151
4537	NC_008532	AGA	2	6	221717	221722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627151
4538	NC_008532	CTG	2	6	221752	221757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627151
4539	NC_008532	AAG	2	6	221802	221807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627151
4540	NC_008532	TGA	2	6	221810	221815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627151
4541	NC_008532	GAA	2	6	221832	221837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627151
4542	NC_008532	TCT	2	6	222058	222063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627151
4543	NC_008532	GAC	2	6	222074	222079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627151
4544	NC_008532	CTA	2	6	222112	222117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627151
4545	NC_008532	AAG	2	6	222133	222138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627151
4546	NC_008532	GGA	2	6	222230	222235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627151
4547	NC_008532	TCC	2	6	222277	222282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627151
4548	NC_008532	TGG	3	9	222308	222316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627151
4549	NC_008532	CA	3	6	222326	222331	50 %	0 %	0 %	50 %	116627151
4550	NC_008532	ACAG	2	8	222365	222372	50 %	0 %	25 %	25 %	116627151
4551	NC_008532	TTCT	3	12	222393	222404	0 %	75 %	0 %	25 %	116627151
4552	NC_008532	AGCA	2	8	222426	222433	50 %	0 %	25 %	25 %	116627151
4553	NC_008532	AAT	2	6	222456	222461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627151
4554	NC_008532	GCCA	2	8	222498	222505	25 %	0 %	25 %	50 %	116627151
4555	NC_008532	TGC	2	6	222524	222529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627151
4556	NC_008532	ATA	2	6	222601	222606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627151
4557	NC_008532	CAAC	2	8	222616	222623	50 %	0 %	0 %	50 %	116627151
4558	NC_008532	GAT	2	6	222654	222659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627151
4559	NC_008532	GCTGAT	2	12	222675	222686	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116627151
4560	NC_008532	TGA	2	6	222743	222748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627151
4561	NC_008532	GAA	2	6	222783	222788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627151
4562	NC_008532	CTA	2	6	222790	222795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627151
4563	NC_008532	TGAG	2	8	222808	222815	25 %	25 %	50 %	0 %	116627151
4564	NC_008532	GATG	2	8	222854	222861	25 %	25 %	50 %	0 %	116627151
4565	NC_008532	GCA	2	6	222881	222886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627151
4566	NC_008532	GGT	2	6	223005	223010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627151
4567	NC_008532	TGG	2	6	223087	223092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627151
4568	NC_008532	ACCT	2	8	223135	223142	25 %	25 %	0 %	50 %	116627151
4569	NC_008532	CAAC	2	8	223174	223181	50 %	0 %	0 %	50 %	116627151
4570	NC_008532	TGG	2	6	223184	223189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627151
4571	NC_008532	TGA	2	6	223199	223204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627151
4572	NC_008532	AGA	2	6	223331	223336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627151
4573	NC_008532	GGT	3	9	223353	223361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627151
4574	NC_008532	TGG	2	6	223412	223417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627151
4575	NC_008532	GTG	2	6	223462	223467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627151
4576	NC_008532	AAG	2	6	223488	223493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627151
4577	NC_008532	TAT	2	6	223502	223507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627151
4578	NC_008532	ATG	2	6	223539	223544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627151
4579	NC_008532	ACT	2	6	223729	223734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627151
4580	NC_008532	AAT	2	6	223896	223901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116627151
4581	NC_008532	GACA	2	8	223910	223917	50 %	0 %	25 %	25 %	116627151
4582	NC_008532	ATG	2	6	223936	223941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627151
4583	NC_008532	CAAG	2	8	223950	223957	50 %	0 %	25 %	25 %	116627151
4584	NC_008532	A	6	6	224064	224069	100 %	0 %	0 %	0 %	116627152
4585	NC_008532	ACT	2	6	224104	224109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627152
4586	NC_008532	TAG	2	6	224120	224125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627152
4587	NC_008532	A	6	6	224175	224180	100 %	0 %	0 %	0 %	116627152
4588	NC_008532	AAC	2	6	224274	224279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627153
4589	NC_008532	AGTTC	2	10	224294	224303	20 %	40 %	20 %	20 %	116627153
4590	NC_008532	TTC	2	6	224318	224323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116627153
4591	NC_008532	TCA	2	6	224328	224333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627153
4592	NC_008532	TGA	2	6	224344	224349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627153
4593	NC_008532	TTG	2	6	224351	224356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627153
4594	NC_008532	TGCT	2	8	224416	224423	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4595	NC_008532	T	6	6	224425	224430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_008532	TAA	2	6	224435	224440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_008532	T	6	6	224475	224480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_008532	CATT	2	8	224506	224513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4599	NC_008532	AAAG	2	8	224571	224578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_008532	ATTC	2	8	224596	224603	25 %	50 %	0 %	25 %	116627154
4601	NC_008532	GAA	2	6	224769	224774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627154
4602	NC_008532	TTG	2	6	224797	224802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627154
4603	NC_008532	TGT	2	6	224831	224836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627154
4604	NC_008532	GAA	3	9	224907	224915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627154
4605	NC_008532	ATC	2	6	224994	224999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116627154
4606	NC_008532	AAG	2	6	225019	225024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116627154
4607	NC_008532	ACA	2	6	225046	225051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116627154
4608	NC_008532	GCT	2	6	225090	225095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116627154
4609	NC_008532	GA	3	6	225192	225197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_008532	GAT	2	6	225249	225254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116627155
4611	NC_008532	GGA	2	6	225316	225321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116627155
4612	NC_008532	TTTGG	2	10	225375	225384	0 %	60 %	40 %	0 %	116627155
4613	NC_008532	TTA	2	6	225422	225427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627155
4614	NC_008532	T	6	6	225439	225444	0 %	100 %	0 %	0 %	116627155
4615	NC_008532	TTA	2	6	225512	225517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116627155
4616	NC_008532	T	6	6	225557	225562	0 %	100 %	0 %	0 %	116627155
4617	NC_008532	GCA	2	6	225631	225636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116627155
4618	NC_008532	GGT	2	6	225661	225666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116627155
4619	NC_008532	TTG	2	6	225713	225718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116627155
4620	NC_008532	CCT	2	6	225720	225725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116627155
4621	NC_008532	TCT	2	6	225749	225754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_008532	GA	3	6	225757	225762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4624	NC_008532	A	6	6	225781	225786	100 %	0 %	0 %	0 %	116627156
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