MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen chromosome

Total Repeats: 61287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008346	GCA	2	6	237152	237157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565762
5002	NC_008346	AT	3	6	237159	237164	50 %	50 %	0 %	0 %	114565762
5003	NC_008346	GCA	2	6	237173	237178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565762
5004	NC_008346	GCC	2	6	237299	237304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565762
5005	NC_008346	A	6	6	237360	237365	100 %	0 %	0 %	0 %	114565762
5006	NC_008346	TGC	2	6	237411	237416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565762
5007	NC_008346	GGCT	2	8	237534	237541	0 %	25 %	50 %	25 %	114565762
5008	NC_008346	AAC	2	6	237582	237587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565762
5009	NC_008346	TGA	2	6	237591	237596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565762
5010	NC_008346	ACTG	2	8	237609	237616	25 %	25 %	25 %	25 %	114565762
5011	NC_008346	GTA	2	6	237722	237727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565762
5012	NC_008346	GCAG	2	8	237744	237751	25 %	0 %	50 %	25 %	114565762
5013	NC_008346	AAC	2	6	237790	237795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565762
5014	NC_008346	GCA	2	6	237961	237966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565762
5015	NC_008346	AAC	2	6	238006	238011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565762
5016	NC_008346	GCT	2	6	238042	238047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565762
5017	NC_008346	AGG	2	6	238089	238094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565762
5018	NC_008346	CTT	2	6	238112	238117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114565762
5019	NC_008346	GGA	2	6	238150	238155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565762
5020	NC_008346	TTAC	2	8	238199	238206	25 %	50 %	0 %	25 %	114565762
5021	NC_008346	CAG	2	6	238242	238247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565762
5022	NC_008346	AGA	2	6	238296	238301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565762
5023	NC_008346	TAT	2	6	238317	238322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565762
5024	NC_008346	AAC	2	6	238330	238335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565762
5025	NC_008346	ACT	2	6	238357	238362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565762
5026	NC_008346	TAC	2	6	238390	238395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565762
5027	NC_008346	CAG	2	6	238396	238401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565762
5028	NC_008346	GAA	2	6	238426	238431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565762
5029	NC_008346	ATT	2	6	238520	238525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565762
5030	NC_008346	CAA	2	6	238531	238536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565762
5031	NC_008346	TCA	2	6	238590	238595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565762
5032	NC_008346	ATAA	2	8	238678	238685	75 %	25 %	0 %	0 %	114565762
5033	NC_008346	AAT	2	6	238717	238722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565762
5034	NC_008346	C	6	6	238727	238732	0 %	0 %	0 %	100 %	114565762
5035	NC_008346	GGA	2	6	238735	238740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565762
5036	NC_008346	TTTC	2	8	238787	238794	0 %	75 %	0 %	25 %	114565762
5037	NC_008346	AAGG	2	8	238802	238809	50 %	0 %	50 %	0 %	114565762
5038	NC_008346	GCA	3	9	238874	238882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565762
5039	NC_008346	GAA	2	6	238948	238953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565762
5040	NC_008346	TGC	2	6	239001	239006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565762
5041	NC_008346	TTTCCT	2	12	239021	239032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114565762
5042	NC_008346	CGG	2	6	239115	239120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565762
5043	NC_008346	GGA	2	6	239136	239141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565762
5044	NC_008346	CTC	2	6	239146	239151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114565762
5045	NC_008346	GCA	2	6	239193	239198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565762
5046	NC_008346	GCC	2	6	239201	239206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565762
5047	NC_008346	TGCAAC	2	12	239279	239290	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114565762
5048	NC_008346	GGC	2	6	239319	239324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565762
5049	NC_008346	ATT	2	6	239335	239340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565762
5050	NC_008346	CAGCC	2	10	239341	239350	20 %	0 %	20 %	60 %	114565762
5051	NC_008346	TTA	2	6	239399	239404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_008346	CT	4	8	239406	239413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_008346	CGGG	2	8	239437	239444	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5054	NC_008346	TCC	2	6	239454	239459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_008346	AGCA	2	8	239536	239543	50 %	0 %	25 %	25 %	114565763
5056	NC_008346	C	7	7	239595	239601	0 %	0 %	0 %	100 %	114565763
5057	NC_008346	C	6	6	239644	239649	0 %	0 %	0 %	100 %	114565763
5058	NC_008346	GGAG	2	8	239780	239787	25 %	0 %	75 %	0 %	114565763
5059	NC_008346	AG	3	6	239786	239791	50 %	0 %	50 %	0 %	114565763
5060	NC_008346	GGC	2	6	239811	239816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565763
5061	NC_008346	GTA	2	6	239820	239825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565763
5062	NC_008346	AGGCCG	2	12	239848	239859	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114565763
5063	NC_008346	C	6	6	239894	239899	0 %	0 %	0 %	100 %	114565763
5064	NC_008346	CGGGT	2	10	239971	239980	0 %	20 %	60 %	20 %	114565763
5065	NC_008346	CAA	2	6	240021	240026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565763
5066	NC_008346	AGT	2	6	240081	240086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_008346	GTC	2	6	240092	240097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_008346	G	6	6	240109	240114	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_008346	T	7	7	240130	240136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_008346	GGT	2	6	240141	240146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_008346	TTC	2	6	240237	240242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_008346	GGT	2	6	240246	240251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_008346	AAC	2	6	240284	240289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_008346	GAA	2	6	240366	240371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565764
5075	NC_008346	A	6	6	240415	240420	100 %	0 %	0 %	0 %	114565764
5076	NC_008346	CTG	2	6	240426	240431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565764
5077	NC_008346	TTA	2	6	240458	240463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565764
5078	NC_008346	GTA	2	6	240498	240503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565764
5079	NC_008346	T	6	6	240518	240523	0 %	100 %	0 %	0 %	114565764
5080	NC_008346	AGG	2	6	240550	240555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565764
5081	NC_008346	CAGC	2	8	240575	240582	25 %	0 %	25 %	50 %	114565764
5082	NC_008346	GAA	2	6	240585	240590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565764
5083	NC_008346	ACTG	2	8	240608	240615	25 %	25 %	25 %	25 %	114565764
5084	NC_008346	TGG	2	6	240649	240654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565764
5085	NC_008346	A	6	6	240681	240686	100 %	0 %	0 %	0 %	114565764
5086	NC_008346	TAC	2	6	240719	240724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565764
5087	NC_008346	GAG	2	6	240783	240788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565764
5088	NC_008346	GGA	2	6	240814	240819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565765
5089	NC_008346	TGA	2	6	240842	240847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565765
5090	NC_008346	C	6	6	240904	240909	0 %	0 %	0 %	100 %	114565765
5091	NC_008346	GAG	2	6	240954	240959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565765
5092	NC_008346	AGC	2	6	240968	240973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565765
5093	NC_008346	ACT	2	6	240998	241003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565765
5094	NC_008346	GAA	2	6	241005	241010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565765
5095	NC_008346	GAA	2	6	241013	241018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565765
5096	NC_008346	TA	3	6	241022	241027	50 %	50 %	0 %	0 %	114565765
5097	NC_008346	CCG	2	6	241031	241036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_008346	GAGG	2	8	241037	241044	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_008346	GGC	2	6	241070	241075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565766
5100	NC_008346	ATA	2	6	241103	241108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565766
5101	NC_008346	GCA	2	6	241131	241136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565766
5102	NC_008346	A	6	6	241158	241163	100 %	0 %	0 %	0 %	114565766
5103	NC_008346	TGGAA	2	10	241170	241179	40 %	20 %	40 %	0 %	114565766
5104	NC_008346	GAT	2	6	241184	241189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565766
5105	NC_008346	GCC	2	6	241274	241279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565766
5106	NC_008346	ATG	2	6	241338	241343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565766
5107	NC_008346	CCAG	2	8	241380	241387	25 %	0 %	25 %	50 %	114565766
5108	NC_008346	GCC	2	6	241424	241429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565766
5109	NC_008346	CGG	2	6	241506	241511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565766
5110	NC_008346	ATT	2	6	241541	241546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565766
5111	NC_008346	ATG	2	6	241548	241553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565766
5112	NC_008346	TAT	2	6	241574	241579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565766
5113	NC_008346	TCT	2	6	241678	241683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114565766
5114	NC_008346	AAACG	2	10	241756	241765	60 %	0 %	20 %	20 %	114565766
5115	NC_008346	ATT	2	6	241808	241813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565766
5116	NC_008346	GCT	2	6	241823	241828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565766
5117	NC_008346	CAA	2	6	241960	241965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565766
5118	NC_008346	ACT	2	6	241976	241981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565766
5119	NC_008346	CAG	3	9	242002	242010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565766
5120	NC_008346	G	6	6	242033	242038	0 %	0 %	100 %	0 %	114565766
5121	NC_008346	CAGC	2	8	242101	242108	25 %	0 %	25 %	50 %	114565766
5122	NC_008346	AGC	2	6	242120	242125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565766
5123	NC_008346	CGG	2	6	242130	242135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565766
5124	NC_008346	ATG	2	6	242145	242150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565766
5125	NC_008346	AGG	2	6	242209	242214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565766
5126	NC_008346	GGA	2	6	242298	242303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565766
5127	NC_008346	TAC	2	6	242305	242310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565766
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5133	NC_008346	GCA	2	6	242559	242564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565766
5134	NC_008346	GCA	2	6	242576	242581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565766
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5143	NC_008346	TTG	2	6	242976	242981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114565766
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5156	NC_008346	GAG	2	6	243898	243903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_008346	GCA	2	6	243990	243995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5159	NC_008346	GGT	2	6	244029	244034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5162	NC_008346	ATG	2	6	244122	244127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5245	NC_008346	AGA	2	6	248611	248616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565768
5246	NC_008346	AGA	3	9	248623	248631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565768
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5250	NC_008346	A	6	6	248783	248788	100 %	0 %	0 %	0 %	114565768
5251	NC_008346	GCA	2	6	248832	248837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565768
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5253	NC_008346	GAC	2	6	248933	248938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565768
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5258	NC_008346	GTTA	2	8	249165	249172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_008346	GGA	2	6	249183	249188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5278	NC_008346	GCT	2	6	250009	250014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565770
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