MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen chromosome

Total Repeats: 61287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008346	A	6	6	213773	213778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_008346	GGCC	2	8	213818	213825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_008346	TA	3	6	213859	213864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_008346	AGA	2	6	213865	213870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_008346	CTG	2	6	213915	213920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_008346	AAC	2	6	214005	214010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_008346	GCA	2	6	214015	214020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_008346	ATG	2	6	214066	214071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_008346	ATT	2	6	214110	214115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_008346	CAG	2	6	214138	214143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_008346	CAA	2	6	214155	214160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_008346	CAG	2	6	214216	214221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565743
4513	NC_008346	TAG	2	6	214241	214246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565743
4514	NC_008346	TAT	2	6	214247	214252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565743
4515	NC_008346	TTG	2	6	214297	214302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114565743
4516	NC_008346	TGA	2	6	214352	214357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565743
4517	NC_008346	TTC	2	6	214460	214465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114565743
4518	NC_008346	ATG	2	6	214501	214506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565743
4519	NC_008346	AAT	2	6	214575	214580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565743
4520	NC_008346	AAC	2	6	214584	214589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565743
4521	NC_008346	CAGT	2	8	214598	214605	25 %	25 %	25 %	25 %	114565743
4522	NC_008346	AAT	2	6	214646	214651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565743
4523	NC_008346	ATA	2	6	214750	214755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565743
4524	NC_008346	CAG	2	6	214836	214841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565743
4525	NC_008346	AAATGA	2	12	214844	214855	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	114565743
4526	NC_008346	AAT	2	6	215031	215036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565743
4527	NC_008346	ATA	2	6	215104	215109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565743
4528	NC_008346	GCA	2	6	215113	215118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565743
4529	NC_008346	TTAA	2	8	215124	215131	50 %	50 %	0 %	0 %	114565743
4530	NC_008346	GAT	2	6	215136	215141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565743
4531	NC_008346	CTG	2	6	215146	215151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565743
4532	NC_008346	GAA	2	6	215175	215180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565743
4533	NC_008346	A	6	6	215179	215184	100 %	0 %	0 %	0 %	114565743
4534	NC_008346	ATT	2	6	215211	215216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565743
4535	NC_008346	TAAT	2	8	215290	215297	50 %	50 %	0 %	0 %	114565743
4536	NC_008346	ATA	2	6	215301	215306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565743
4537	NC_008346	TAA	2	6	215321	215326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565743
4538	NC_008346	GGA	2	6	215352	215357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565743
4539	NC_008346	ATA	2	6	215445	215450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565743
4540	NC_008346	AGTAA	2	10	215476	215485	60 %	20 %	20 %	0 %	114565743
4541	NC_008346	GTT	2	6	215511	215516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_008346	AAC	2	6	215535	215540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_008346	CGGT	3	12	215608	215619	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4544	NC_008346	GGGGA	2	10	215633	215642	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_008346	T	6	6	215673	215678	0 %	100 %	0 %	0 %	114565744
4546	NC_008346	T	7	7	215684	215690	0 %	100 %	0 %	0 %	114565744
4547	NC_008346	AG	3	6	215745	215750	50 %	0 %	50 %	0 %	114565744
4548	NC_008346	CGG	2	6	215774	215779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565744
4549	NC_008346	AGGCGG	2	12	215963	215974	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	114565744
4550	NC_008346	GCG	2	6	215992	215997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565744
4551	NC_008346	TGAGC	2	10	216009	216018	20 %	20 %	40 %	20 %	114565744
4552	NC_008346	CG	3	6	216027	216032	0 %	0 %	50 %	50 %	114565744
4553	NC_008346	GAA	2	6	216033	216038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565744
4554	NC_008346	GAA	2	6	216052	216057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565744
4555	NC_008346	GGC	2	6	216162	216167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565744
4556	NC_008346	CGG	2	6	216278	216283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565744
4557	NC_008346	TA	3	6	216346	216351	50 %	50 %	0 %	0 %	114565744
4558	NC_008346	GTG	2	6	216430	216435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565744
4559	NC_008346	TTA	2	6	216494	216499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565744
4560	NC_008346	A	6	6	216541	216546	100 %	0 %	0 %	0 %	114565744
4561	NC_008346	GTT	2	6	216766	216771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114565744
4562	NC_008346	G	6	6	216775	216780	0 %	0 %	100 %	0 %	114565744
4563	NC_008346	AAT	2	6	216785	216790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565744
4564	NC_008346	TAG	2	6	216796	216801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565745
4565	NC_008346	T	6	6	216864	216869	0 %	100 %	0 %	0 %	114565745
4566	NC_008346	GCG	2	6	216921	216926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565745
4567	NC_008346	TCAATC	2	12	217028	217039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565745
4568	NC_008346	TCA	2	6	217063	217068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565745
4569	NC_008346	AGTGG	2	10	217149	217158	20 %	20 %	60 %	0 %	114565745
4570	NC_008346	ATG	2	6	217191	217196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565745
4571	NC_008346	TAT	2	6	217199	217204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565745
4572	NC_008346	G	7	7	217221	217227	0 %	0 %	100 %	0 %	114565745
4573	NC_008346	GCCTC	2	10	217277	217286	0 %	20 %	20 %	60 %	114565745
4574	NC_008346	GTA	2	6	217311	217316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565745
4575	NC_008346	GGA	2	6	217370	217375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114565745
4576	NC_008346	TC	3	6	217430	217435	0 %	50 %	0 %	50 %	114565745
4577	NC_008346	CGG	2	6	217436	217441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565745
4578	NC_008346	GCA	2	6	217484	217489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565745
4579	NC_008346	GCG	2	6	217680	217685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565745
4580	NC_008346	AGA	2	6	217691	217696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565745
4581	NC_008346	GAA	2	6	217701	217706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565745
4582	NC_008346	GTC	2	6	217757	217762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565745
4583	NC_008346	ATG	2	6	217797	217802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565745
4584	NC_008346	ACT	2	6	217814	217819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114565745
4585	NC_008346	TCTT	2	8	217834	217841	0 %	75 %	0 %	25 %	114565745
4586	NC_008346	TATG	2	8	217916	217923	25 %	50 %	25 %	0 %	114565745
4587	NC_008346	CAA	2	6	217925	217930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565745
4588	NC_008346	TTA	2	6	217945	217950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114565745
4589	NC_008346	G	6	6	217955	217960	0 %	0 %	100 %	0 %	114565745
4590	NC_008346	TGG	2	6	217984	217989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565745
4591	NC_008346	GCC	2	6	218042	218047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565745
4592	NC_008346	GCC	2	6	218055	218060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114565745
4593	NC_008346	CTACCA	2	12	218101	218112	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	114565745
4594	NC_008346	TTC	2	6	218124	218129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114565745
4595	NC_008346	GTCT	2	8	218156	218163	0 %	50 %	25 %	25 %	114565745
4596	NC_008346	AGGG	2	8	218294	218301	25 %	0 %	75 %	0 %	114565745
4597	NC_008346	GGT	2	6	218309	218314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565745
4598	NC_008346	CTGG	2	8	218330	218337	0 %	25 %	50 %	25 %	114565745
4599	NC_008346	ATA	2	6	218361	218366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565745
4600	NC_008346	TGG	2	6	218398	218403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565745
4601	NC_008346	TTG	2	6	218415	218420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114565745
4602	NC_008346	GCCCTG	2	12	218430	218441	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114565745
4603	NC_008346	GATG	2	8	218474	218481	25 %	25 %	50 %	0 %	114565745
4604	NC_008346	GCT	2	6	218522	218527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565745
4605	NC_008346	AACG	2	8	218688	218695	50 %	0 %	25 %	25 %	114565745
4606	NC_008346	GCA	2	6	218731	218736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565745
4607	NC_008346	ATG	2	6	218775	218780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565745
4608	NC_008346	GCG	3	9	218803	218811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114565745
4609	NC_008346	GCT	2	6	218976	218981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565745
4610	NC_008346	TGA	2	6	219065	219070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565745
4611	NC_008346	TC	3	6	219272	219277	0 %	50 %	0 %	50 %	114565745
4612	NC_008346	ATG	2	6	219366	219371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565745
4613	NC_008346	TCTT	2	8	219450	219457	0 %	75 %	0 %	25 %	114565745
4614	NC_008346	CAA	2	6	219527	219532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114565745
4615	NC_008346	TAA	2	6	219562	219567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565745
4616	NC_008346	TGG	2	6	219571	219576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565745
4617	NC_008346	TGG	2	6	219583	219588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565745
4618	NC_008346	TGG	2	6	219604	219609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114565745
4619	NC_008346	TGA	2	6	219647	219652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114565745
4620	NC_008346	CGGG	2	8	219668	219675	0 %	0 %	75 %	25 %	114565745
4621	NC_008346	CCA	2	6	219709	219714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114565745
4622	NC_008346	AGCCGA	2	12	219755	219766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565745
4623	NC_008346	TAA	2	6	219784	219789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114565745
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4996	NC_008346	CCA	3	9	236855	236863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114565762
4997	NC_008346	CGA	2	6	236883	236888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114565762
4998	NC_008346	CCGG	2	8	236890	236897	0 %	0 %	50 %	50 %	114565762
4999	NC_008346	TGC	2	6	236994	236999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114565762
5000	NC_008346	AAG	2	6	237097	237102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114565762

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