MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 94497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008345	CAA	2	6	180459	180464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561356
3502	NC_008345	CA	3	6	180491	180496	50 %	0 %	0 %	50 %	114561356
3503	NC_008345	AAAT	2	8	180508	180515	75 %	25 %	0 %	0 %	114561356
3504	NC_008345	CCA	2	6	180531	180536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561356
3505	NC_008345	ATT	2	6	180552	180557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561356
3506	NC_008345	TGGTT	2	10	180582	180591	0 %	60 %	40 %	0 %	114561356
3507	NC_008345	ATT	2	6	180659	180664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561356
3508	NC_008345	ATC	2	6	180678	180683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561356
3509	NC_008345	TCT	2	6	180694	180699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561356
3510	NC_008345	GTG	2	6	180751	180756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561356
3511	NC_008345	CATT	2	8	180757	180764	25 %	50 %	0 %	25 %	114561356
3512	NC_008345	ACT	2	6	180920	180925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561356
3513	NC_008345	TAT	2	6	180926	180931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561356
3514	NC_008345	AGT	2	6	180932	180937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561356
3515	NC_008345	ATG	2	6	180975	180980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561356
3516	NC_008345	TGA	2	6	181000	181005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561356
3517	NC_008345	TGA	2	6	181072	181077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_008345	AAG	2	6	181100	181105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561357
3519	NC_008345	GTG	2	6	181137	181142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561357
3520	NC_008345	AGAA	2	8	181191	181198	75 %	0 %	25 %	0 %	114561357
3521	NC_008345	AAT	2	6	181212	181217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_008345	TGT	2	6	181246	181251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_008345	CTTTAA	2	12	181287	181298	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3524	NC_008345	GAA	2	6	181480	181485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561358
3525	NC_008345	CGT	2	6	181516	181521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561358
3526	NC_008345	GTT	2	6	181559	181564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561358
3527	NC_008345	TCG	2	6	181581	181586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561358
3528	NC_008345	CGTA	2	8	181718	181725	25 %	25 %	25 %	25 %	114561359
3529	NC_008345	ATGGC	2	10	181738	181747	20 %	20 %	40 %	20 %	114561359
3530	NC_008345	CAA	2	6	181766	181771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561359
3531	NC_008345	GGT	2	6	181827	181832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561359
3532	NC_008345	TGC	2	6	181880	181885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561359
3533	NC_008345	TGC	2	6	181901	181906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561359
3534	NC_008345	GTC	2	6	182047	182052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561359
3535	NC_008345	CGT	2	6	182064	182069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561359
3536	NC_008345	TA	3	6	182083	182088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_008345	CAAGCT	2	12	182128	182139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114561360
3538	NC_008345	ACA	2	6	182224	182229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561360
3539	NC_008345	TCG	2	6	182290	182295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561360
3540	NC_008345	TAC	2	6	182330	182335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561360
3541	NC_008345	AAG	2	6	182337	182342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561360
3542	NC_008345	CGT	2	6	182407	182412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561360
3543	NC_008345	GTT	2	6	182492	182497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561360
3544	NC_008345	ATG	2	6	182526	182531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561360
3545	NC_008345	TCG	2	6	182706	182711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561360
3546	NC_008345	AACA	2	8	182733	182740	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3547	NC_008345	AG	3	6	182741	182746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_008345	GTC	2	6	182896	182901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561361
3549	NC_008345	CAG	2	6	182956	182961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561361
3550	NC_008345	AAGG	2	8	182963	182970	50 %	0 %	50 %	0 %	114561361
3551	NC_008345	AAG	2	6	182976	182981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561361
3552	NC_008345	CAG	3	9	183084	183092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561361
3553	NC_008345	ATG	2	6	183102	183107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561361
3554	NC_008345	CGTGGT	2	12	183191	183202	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114561361
3555	NC_008345	GAT	2	6	183239	183244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561361
3556	NC_008345	CTT	2	6	183273	183278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561361
3557	NC_008345	AGC	2	6	183313	183318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561361
3558	NC_008345	GATA	2	8	183355	183362	50 %	25 %	25 %	0 %	114561361
3559	NC_008345	TCG	2	6	183400	183405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561361
3560	NC_008345	TTG	2	6	183441	183446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561361
3561	NC_008345	TGT	2	6	183472	183477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561361
3562	NC_008345	AGA	2	6	183478	183483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561361
3563	NC_008345	TGC	2	6	183507	183512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561361
3564	NC_008345	CGA	2	6	183520	183525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561361
3565	NC_008345	AGTTG	2	10	183607	183616	20 %	40 %	40 %	0 %	114561361
3566	NC_008345	GAC	2	6	183731	183736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561361
3567	NC_008345	GTC	2	6	183802	183807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561362
3568	NC_008345	CAG	2	6	183821	183826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561362
3569	NC_008345	GTT	2	6	183921	183926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561362
3570	NC_008345	TAA	2	6	183934	183939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561362
3571	NC_008345	TGG	2	6	184055	184060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561362
3572	NC_008345	TAG	2	6	184126	184131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561362
3573	NC_008345	GTC	2	6	184132	184137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561362
3574	NC_008345	GCT	2	6	184143	184148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561362
3575	NC_008345	GTTGAA	2	12	184155	184166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561362
3576	NC_008345	GCT	2	6	184167	184172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561362
3577	NC_008345	TAAT	2	8	184176	184183	50 %	50 %	0 %	0 %	114561362
3578	NC_008345	T	9	9	184214	184222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_008345	CTT	2	6	184223	184228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_008345	T	6	6	184227	184232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_008345	TTTA	2	8	184260	184267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_008345	ATT	2	6	184338	184343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_008345	ATTA	2	8	184410	184417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_008345	GTT	2	6	184502	184507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_008345	TA	3	6	184539	184544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_008345	AT	3	6	184625	184630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_008345	GTT	2	6	184649	184654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_008345	T	7	7	184653	184659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_008345	CAT	2	6	184720	184725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_008345	TGT	2	6	184726	184731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_008345	TCC	2	6	184750	184755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_008345	AAT	2	6	184786	184791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_008345	ATCT	2	8	184838	184845	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3594	NC_008345	GTT	2	6	184855	184860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_008345	TTGG	2	8	184900	184907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_008345	AG	3	6	185077	185082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_008345	TGA	2	6	185097	185102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_008345	AT	3	6	185108	185113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_008345	ATA	2	6	185161	185166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_008345	A	7	7	185204	185210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_008345	TTA	2	6	185228	185233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_008345	TCA	2	6	185332	185337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561363
3603	NC_008345	GTA	2	6	185429	185434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561363
3604	NC_008345	TTA	2	6	185732	185737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561364
3605	NC_008345	TTTC	2	8	185745	185752	0 %	75 %	0 %	25 %	114561364
3606	NC_008345	GTT	2	6	185757	185762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561364
3607	NC_008345	TGAA	2	8	185907	185914	50 %	25 %	25 %	0 %	114561364
3608	NC_008345	ATT	2	6	185924	185929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561364
3609	NC_008345	CCT	2	6	185933	185938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114561365
3610	NC_008345	CTG	2	6	185939	185944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561365
3611	NC_008345	TC	3	6	185953	185958	0 %	50 %	0 %	50 %	114561365
3612	NC_008345	GC	3	6	185979	185984	0 %	0 %	50 %	50 %	114561365
3613	NC_008345	ATC	2	6	186025	186030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561365
3614	NC_008345	ACT	2	6	186126	186131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561365
3615	NC_008345	CCA	2	6	186132	186137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561365
3616	NC_008345	TAA	2	6	186152	186157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561365
3617	NC_008345	ATTA	2	8	186165	186172	50 %	50 %	0 %	0 %	114561365
3618	NC_008345	GCG	2	6	186205	186210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561365
3619	NC_008345	ATG	2	6	186227	186232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561365
3620	NC_008345	CCA	2	6	186303	186308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561365
3621	NC_008345	GCA	2	6	186334	186339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561365
3622	NC_008345	TAA	2	6	186345	186350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561365
3623	NC_008345	TGC	2	6	186387	186392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561365
3624	NC_008345	GCA	2	6	186481	186486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561365
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3653	NC_008345	T	7	7	188238	188244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3654	NC_008345	GTA	2	6	188252	188257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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