MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 94497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008345	CAA	2	6	155244	155249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561326
3002	NC_008345	GTA	2	6	155273	155278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561326
3003	NC_008345	TTG	2	6	155307	155312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561326
3004	NC_008345	CGTG	2	8	155368	155375	0 %	25 %	50 %	25 %	114561326
3005	NC_008345	CA	3	6	155428	155433	50 %	0 %	0 %	50 %	114561326
3006	NC_008345	GCT	2	6	155450	155455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561326
3007	NC_008345	GCT	2	6	155459	155464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561326
3008	NC_008345	GTT	2	6	155531	155536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561326
3009	NC_008345	GTT	2	6	155561	155566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561326
3010	NC_008345	TAT	2	6	155701	155706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561326
3011	NC_008345	TAC	2	6	155734	155739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561326
3012	NC_008345	GAAA	2	8	155749	155756	75 %	0 %	25 %	0 %	114561326
3013	NC_008345	GAA	2	6	155882	155887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561326
3014	NC_008345	GC	3	6	155905	155910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3015	NC_008345	GC	3	6	155926	155931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_008345	T	7	7	156070	156076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_008345	GTAA	2	8	156094	156101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_008345	TTG	2	6	156204	156209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561327
3019	NC_008345	GTT	2	6	156248	156253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561327
3020	NC_008345	GCT	2	6	156302	156307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561327
3021	NC_008345	GT	3	6	156318	156323	0 %	50 %	50 %	0 %	114561327
3022	NC_008345	GTA	2	6	156332	156337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561327
3023	NC_008345	TCG	2	6	156352	156357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561327
3024	NC_008345	TGC	2	6	156442	156447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561327
3025	NC_008345	GAA	2	6	156569	156574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561327
3026	NC_008345	TGA	3	9	156588	156596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561327
3027	NC_008345	AAG	2	6	156603	156608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561327
3028	NC_008345	CTG	2	6	156612	156617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561327
3029	NC_008345	GTTC	2	8	156622	156629	0 %	50 %	25 %	25 %	114561327
3030	NC_008345	GCC	2	6	156638	156643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561327
3031	NC_008345	CGC	2	6	156664	156669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561327
3032	NC_008345	TAA	2	6	156690	156695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_008345	GCA	2	6	156764	156769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561328
3034	NC_008345	AGT	2	6	156784	156789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561328
3035	NC_008345	CTG	4	12	156828	156839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561328
3036	NC_008345	AGT	2	6	156841	156846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561328
3037	NC_008345	GGC	3	9	156851	156859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561328
3038	NC_008345	TGC	2	6	156868	156873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561328
3039	NC_008345	GTA	2	6	156896	156901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561328
3040	NC_008345	TTA	2	6	156933	156938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561328
3041	NC_008345	AAG	2	6	156972	156977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561328
3042	NC_008345	TCT	2	6	156995	157000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561328
3043	NC_008345	AAG	2	6	157014	157019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561328
3044	NC_008345	AGA	2	6	157030	157035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561328
3045	NC_008345	TAAG	2	8	157087	157094	50 %	25 %	25 %	0 %	114561328
3046	NC_008345	T	6	6	157142	157147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_008345	T	6	6	157159	157164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_008345	T	7	7	157184	157190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008345	CAA	2	6	157248	157253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_008345	TAAT	2	8	157278	157285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_008345	AAG	2	6	157350	157355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
3052	NC_008345	TTAT	2	8	157403	157410	25 %	75 %	0 %	0 %	114561329
3053	NC_008345	AAG	2	6	157434	157439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
3054	NC_008345	CAC	2	6	157609	157614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561329
3055	NC_008345	GTT	2	6	157637	157642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561329
3056	NC_008345	GCT	3	9	157653	157661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3057	NC_008345	AAG	2	6	157687	157692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
3058	NC_008345	ATG	2	6	157713	157718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
3059	NC_008345	TAA	2	6	157721	157726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561329
3060	NC_008345	TTA	2	6	157738	157743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561329
3061	NC_008345	GT	3	6	157789	157794	0 %	50 %	50 %	0 %	114561329
3062	NC_008345	TAT	2	6	157853	157858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561329
3063	NC_008345	TTCG	2	8	157911	157918	0 %	50 %	25 %	25 %	114561329
3064	NC_008345	CGT	2	6	157926	157931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3065	NC_008345	TAT	2	6	157949	157954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561329
3066	NC_008345	TTC	2	6	157998	158003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561329
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3068	NC_008345	GTG	2	6	158068	158073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561329
3069	NC_008345	CTG	2	6	158077	158082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3070	NC_008345	GTC	2	6	158128	158133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3071	NC_008345	A	6	6	158164	158169	100 %	0 %	0 %	0 %	114561329
3072	NC_008345	TAC	2	6	158174	158179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561329
3073	NC_008345	TTG	2	6	158206	158211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561329
3074	NC_008345	TGC	2	6	158219	158224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
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3076	NC_008345	TTTA	2	8	158336	158343	25 %	75 %	0 %	0 %	114561329
3077	NC_008345	CAA	2	6	158395	158400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561329
3078	NC_008345	ATG	2	6	158436	158441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
3079	NC_008345	CCA	2	6	158454	158459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561329
3080	NC_008345	TTC	2	6	158496	158501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561329
3081	NC_008345	CGT	2	6	158550	158555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3082	NC_008345	GT	3	6	158584	158589	0 %	50 %	50 %	0 %	114561329
3083	NC_008345	AGA	2	6	158597	158602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
3084	NC_008345	GAA	2	6	158618	158623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
3085	NC_008345	ATC	2	6	158625	158630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561329
3086	NC_008345	ATG	2	6	158647	158652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
3087	NC_008345	CGA	2	6	158657	158662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3088	NC_008345	CGT	2	6	158682	158687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3089	NC_008345	TTAA	2	8	158805	158812	50 %	50 %	0 %	0 %	114561329
3090	NC_008345	TTC	2	6	158852	158857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561329
3091	NC_008345	AAC	2	6	158883	158888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561329
3092	NC_008345	CGT	2	6	158913	158918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3093	NC_008345	GGT	2	6	158937	158942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561329
3094	NC_008345	TGA	2	6	159131	159136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
3095	NC_008345	GAA	2	6	159159	159164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
3096	NC_008345	CGTTA	2	10	159168	159177	20 %	40 %	20 %	20 %	114561329
3097	NC_008345	AGA	2	6	159221	159226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
3098	NC_008345	GC	3	6	159266	159271	0 %	0 %	50 %	50 %	114561329
3099	NC_008345	ATT	2	6	159309	159314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561329
3100	NC_008345	GCA	2	6	159321	159326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3101	NC_008345	GAT	2	6	159351	159356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
3102	NC_008345	GCT	2	6	159480	159485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3103	NC_008345	TCGTA	2	10	159521	159530	20 %	40 %	20 %	20 %	114561329
3104	NC_008345	CTAA	2	8	159588	159595	50 %	25 %	0 %	25 %	114561329
3105	NC_008345	TTG	2	6	159638	159643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561329
3106	NC_008345	GTG	2	6	159667	159672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561329
3107	NC_008345	AAG	2	6	159802	159807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
3108	NC_008345	ACT	2	6	159816	159821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561329
3109	NC_008345	GAA	2	6	159873	159878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
3110	NC_008345	CTG	2	6	159883	159888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3111	NC_008345	ACT	2	6	160031	160036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561329
3112	NC_008345	CAT	2	6	160112	160117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561329
3113	NC_008345	GAA	2	6	160233	160238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
3114	NC_008345	CTGT	2	8	160269	160276	0 %	50 %	25 %	25 %	114561329
3115	NC_008345	CGA	3	9	160337	160345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3116	NC_008345	AAAC	2	8	160350	160357	75 %	0 %	0 %	25 %	114561329
3117	NC_008345	CGT	2	6	160428	160433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3118	NC_008345	TGA	2	6	160448	160453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
3119	NC_008345	GTC	2	6	160534	160539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3120	NC_008345	ACG	2	6	160591	160596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3121	NC_008345	AAG	2	6	160597	160602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561329
3122	NC_008345	GCA	2	6	160686	160691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561329
3123	NC_008345	TAA	2	6	160706	160711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561329
3124	NC_008345	AGC	2	6	160732	160737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561329
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3126	NC_008345	TGA	2	6	160787	160792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
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3131	NC_008345	TGA	2	6	161048	161053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561329
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3135	NC_008345	TGC	2	6	161177	161182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561329
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3139	NC_008345	GA	3	6	161434	161439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3214	NC_008345	A	7	7	165684	165690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3215	NC_008345	T	6	6	165706	165711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3216	NC_008345	CCA	2	6	165780	165785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3217	NC_008345	TTG	2	6	165814	165819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3218	NC_008345	CACG	2	8	165878	165885	25 %	0 %	25 %	50 %	114561331
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3223	NC_008345	CTAA	2	8	166015	166022	50 %	25 %	0 %	25 %	114561331
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3226	NC_008345	TAAG	2	8	166233	166240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3227	NC_008345	TATT	2	8	166251	166258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3228	NC_008345	GTT	2	6	166366	166371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561332
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3231	NC_008345	TGT	2	6	166447	166452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561332
3232	NC_008345	GAAAA	2	10	166457	166466	80 %	0 %	20 %	0 %	114561332
3233	NC_008345	TCG	2	6	166534	166539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561332
3234	NC_008345	TGG	2	6	166543	166548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561332
3235	NC_008345	CGT	2	6	166586	166591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561332
3236	NC_008345	GCT	2	6	166622	166627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561332
3237	NC_008345	GTG	2	6	166635	166640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561332
3238	NC_008345	AAG	2	6	166709	166714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561332
3239	NC_008345	ATG	2	6	166776	166781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_008345	TTG	2	6	166806	166811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_008345	GTTCT	2	10	166940	166949	0 %	60 %	20 %	20 %	114561333
3242	NC_008345	GCC	2	6	166991	166996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561333
3243	NC_008345	CAAGAG	2	12	167015	167026	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	114561333
3244	NC_008345	ATC	2	6	167108	167113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561333
3245	NC_008345	GTA	2	6	167180	167185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561333
3246	NC_008345	TCT	2	6	167187	167192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561333
3247	NC_008345	TAA	2	6	167275	167280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561333
3248	NC_008345	GTGCAG	2	12	167289	167300	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114561333
3249	NC_008345	TAA	2	6	167313	167318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561333
3250	NC_008345	TG	3	6	167348	167353	0 %	50 %	50 %	0 %	114561333
3251	NC_008345	CAATT	2	10	167355	167364	40 %	40 %	0 %	20 %	114561333
3252	NC_008345	AGA	2	6	167377	167382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561333
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3257	NC_008345	TGA	2	6	167550	167555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561333
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3280	NC_008345	AAC	2	6	169093	169098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561334
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3307	NC_008345	T	7	7	170246	170252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3308	NC_008345	TAG	2	6	170275	170280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3309	NC_008345	AAG	2	6	170323	170328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3310	NC_008345	AGA	2	6	170335	170340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3311	NC_008345	AGAA	2	8	170366	170373	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3312	NC_008345	ATC	2	6	170480	170485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3314	NC_008345	T	6	6	170524	170529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3315	NC_008345	ATC	2	6	170597	170602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561335
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3320	NC_008345	GA	3	6	170891	170896	50 %	0 %	50 %	0 %	114561336
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3332	NC_008345	GAG	2	6	171540	171545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3333	NC_008345	TCA	2	6	171635	171640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561337
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3336	NC_008345	TGGCG	2	10	171783	171792	0 %	20 %	60 %	20 %	114561337
3337	NC_008345	GCT	2	6	171807	171812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561337
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3345	NC_008345	CTG	2	6	172117	172122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561337
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3348	NC_008345	TGCT	2	8	172218	172225	0 %	50 %	25 %	25 %	114561338
3349	NC_008345	ACA	2	6	172233	172238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561338
3350	NC_008345	TGAAGT	2	12	172306	172317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561338
3351	NC_008345	TAA	2	6	172339	172344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561338
3352	NC_008345	GTC	2	6	172377	172382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561338
3353	NC_008345	A	6	6	172394	172399	100 %	0 %	0 %	0 %	114561338
3354	NC_008345	GCT	2	6	172415	172420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561338
3355	NC_008345	TCG	2	6	172437	172442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561338
3356	NC_008345	GCG	2	6	172443	172448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561338
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3358	NC_008345	GTC	2	6	172507	172512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561339
3359	NC_008345	GTG	2	6	172527	172532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561339
3360	NC_008345	A	7	7	172578	172584	100 %	0 %	0 %	0 %	114561339
3361	NC_008345	GTG	2	6	172591	172596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561339
3362	NC_008345	TAA	2	6	172601	172606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561339
3363	NC_008345	GGT	2	6	172635	172640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561339
3364	NC_008345	AGC	2	6	172648	172653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561339
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3366	NC_008345	CAA	2	6	172679	172684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561339
3367	NC_008345	CGT	2	6	172773	172778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561339
3368	NC_008345	TGC	2	6	172787	172792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561339
3369	NC_008345	CAATC	2	10	172816	172825	40 %	20 %	0 %	40 %	114561339
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3371	NC_008345	TGT	2	6	172889	172894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561339
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3375	NC_008345	TGG	2	6	173192	173197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561339
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3379	NC_008345	TC	3	6	173321	173326	0 %	50 %	0 %	50 %	114561340
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3387	NC_008345	GCC	2	6	173732	173737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561341
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3392	NC_008345	AAT	2	6	174041	174046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561342
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3434	NC_008345	A	6	6	176327	176332	100 %	0 %	0 %	0 %	114561347
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3479	NC_008345	AGC	2	6	179121	179126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561354
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3482	NC_008345	TAC	2	6	179241	179246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561354
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3484	NC_008345	CAG	3	9	179295	179303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561355
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3486	NC_008345	GGT	2	6	179426	179431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561355
3487	NC_008345	TCGCG	2	10	179474	179483	0 %	20 %	40 %	40 %	114561355
3488	NC_008345	TGT	2	6	179536	179541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561355
3489	NC_008345	TTA	2	6	179571	179576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561355
3490	NC_008345	AAT	2	6	179703	179708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561355
3491	NC_008345	CTGAA	2	10	179761	179770	40 %	20 %	20 %	20 %	114561356
3492	NC_008345	TCT	2	6	179777	179782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561356
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