MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 94497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008345	TAT	2	6	102797	102802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561276
2002	NC_008345	CTT	2	6	102977	102982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_008345	AAT	2	6	103000	103005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_008345	ATA	2	6	103036	103041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_008345	A	6	6	103153	103158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_008345	ATT	2	6	103207	103212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_008345	GCT	2	6	103237	103242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_008345	AGT	2	6	103252	103257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_008345	TA	3	6	103278	103283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_008345	TGC	2	6	103304	103309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561277
2011	NC_008345	TTC	2	6	103322	103327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561277
2012	NC_008345	CAA	2	6	103417	103422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561277
2013	NC_008345	TGATGT	2	12	103446	103457	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	114561277
2014	NC_008345	GAA	2	6	103459	103464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561277
2015	NC_008345	AC	3	6	103504	103509	50 %	0 %	0 %	50 %	114561277
2016	NC_008345	AATA	2	8	103516	103523	75 %	25 %	0 %	0 %	114561277
2017	NC_008345	ATT	2	6	103548	103553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561277
2018	NC_008345	ATC	2	6	103563	103568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561277
2019	NC_008345	TGA	2	6	103581	103586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561277
2020	NC_008345	A	6	6	103608	103613	100 %	0 %	0 %	0 %	114561277
2021	NC_008345	CAA	2	6	103669	103674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561277
2022	NC_008345	TCAA	2	8	103739	103746	50 %	25 %	0 %	25 %	114561277
2023	NC_008345	TAG	2	6	103749	103754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561277
2024	NC_008345	GAT	2	6	103850	103855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561278
2025	NC_008345	CTA	2	6	103857	103862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561278
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2038	NC_008345	TCT	2	6	104542	104547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2039	NC_008345	CAA	2	6	104613	104618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561279
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2042	NC_008345	TGG	2	6	104864	104869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561279
2043	NC_008345	TTA	2	6	104944	104949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561279
2044	NC_008345	CGTTAG	2	12	104989	105000	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114561279
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2046	NC_008345	CAGT	2	8	105094	105101	25 %	25 %	25 %	25 %	114561279
2047	NC_008345	ACGC	2	8	105215	105222	25 %	0 %	25 %	50 %	114561279
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2054	NC_008345	TAT	2	6	105635	105640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561279
2055	NC_008345	GCC	2	6	105691	105696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561279
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2058	NC_008345	GTT	2	6	105841	105846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_008345	TCA	2	6	105893	105898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561280
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2062	NC_008345	GTAT	2	8	106175	106182	25 %	50 %	25 %	0 %	114561280
2063	NC_008345	T	6	6	106222	106227	0 %	100 %	0 %	0 %	114561280
2064	NC_008345	TGA	2	6	106350	106355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561280
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2244	NC_008345	T	7	7	115764	115770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2369	NC_008345	TGA	2	6	121752	121757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561294
2370	NC_008345	TGA	2	6	121884	121889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561294
2371	NC_008345	GGC	2	6	121912	121917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561294
2372	NC_008345	AGA	2	6	122013	122018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561294
2373	NC_008345	GAG	2	6	122038	122043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114561294
2374	NC_008345	GGC	2	6	122052	122057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561295
2375	NC_008345	GCAA	2	8	122087	122094	50 %	0 %	25 %	25 %	114561295
2376	NC_008345	CG	3	6	122121	122126	0 %	0 %	50 %	50 %	114561295
2377	NC_008345	AAG	2	6	122133	122138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561295
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2379	NC_008345	AAG	2	6	122192	122197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561295
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2381	NC_008345	GCA	2	6	122340	122345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561295
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2383	NC_008345	TGA	2	6	122448	122453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561295
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2385	NC_008345	AGT	2	6	122502	122507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561295
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2387	NC_008345	GCT	2	6	122629	122634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561295
2388	NC_008345	GTG	2	6	122635	122640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561295
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2392	NC_008345	TGC	2	6	122760	122765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561295
2393	NC_008345	GCT	2	6	122784	122789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561295
2394	NC_008345	CAGC	2	8	122906	122913	25 %	0 %	25 %	50 %	114561295
2395	NC_008345	GC	3	6	122973	122978	0 %	0 %	50 %	50 %	114561295
2396	NC_008345	TGA	2	6	122985	122990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561295
2397	NC_008345	ATG	2	6	123061	123066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561295
2398	NC_008345	A	6	6	123089	123094	100 %	0 %	0 %	0 %	114561295
2399	NC_008345	GCA	2	6	123124	123129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561295
2400	NC_008345	TAT	2	6	123218	123223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561295
2401	NC_008345	TGG	2	6	123301	123306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2402	NC_008345	AT	3	6	123348	123353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2403	NC_008345	TAAT	2	8	123373	123380	50 %	50 %	0 %	0 %	114561296
2404	NC_008345	ATA	3	9	123386	123394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561296
2405	NC_008345	AAC	2	6	123395	123400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561296
2406	NC_008345	TGG	2	6	123425	123430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561296
2407	NC_008345	CAA	2	6	123502	123507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561296
2408	NC_008345	ACCT	2	8	123615	123622	25 %	25 %	0 %	50 %	114561296
2409	NC_008345	TATT	2	8	123697	123704	25 %	75 %	0 %	0 %	114561296
2410	NC_008345	GAT	2	6	123814	123819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561297
2411	NC_008345	TCA	2	6	123820	123825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561297
2412	NC_008345	TTA	2	6	123845	123850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561297
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2414	NC_008345	TGA	2	6	123982	123987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561297
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2417	NC_008345	A	7	7	124103	124109	100 %	0 %	0 %	0 %	114561297
2418	NC_008345	AAG	2	6	124161	124166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561297
2419	NC_008345	TGA	2	6	124189	124194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561297
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2423	NC_008345	GA	3	6	124269	124274	50 %	0 %	50 %	0 %	114561297
2424	NC_008345	ATG	2	6	124308	124313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561297
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2428	NC_008345	GTCA	2	8	124660	124667	25 %	25 %	25 %	25 %	114561298
2429	NC_008345	AAG	2	6	124699	124704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561298
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2432	NC_008345	GAC	3	9	124755	124763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561298
2433	NC_008345	ATG	2	6	124919	124924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561299
2434	NC_008345	TGG	2	6	125003	125008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561299
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2441	NC_008345	CGT	2	6	125383	125388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561299
2442	NC_008345	T	6	6	125388	125393	0 %	100 %	0 %	0 %	114561299
2443	NC_008345	ATG	2	6	125489	125494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561299
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2445	NC_008345	TAG	2	6	125542	125547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561300
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2463	NC_008345	TCAG	2	8	126234	126241	25 %	25 %	25 %	25 %	114561300
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2471	NC_008345	ATC	2	6	126630	126635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561301
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2478	NC_008345	GCA	2	6	126993	126998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561301
2479	NC_008345	TAATGA	2	12	127109	127120	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	114561301
2480	NC_008345	TAA	2	6	127175	127180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561301
2481	NC_008345	GAT	2	6	127199	127204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561301
2482	NC_008345	CAAT	2	8	127234	127241	50 %	25 %	0 %	25 %	114561301
2483	NC_008345	TGA	2	6	127318	127323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561301
2484	NC_008345	CCAT	2	8	127360	127367	25 %	25 %	0 %	50 %	114561301
2485	NC_008345	AAT	2	6	127374	127379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561301
2486	NC_008345	GCA	2	6	127483	127488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561301
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