MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 94497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_008345	TGC	2	6	76791	76796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561250
1503	NC_008345	G	6	6	76882	76887	0 %	0 %	100 %	0 %	114561250
1504	NC_008345	GAT	2	6	76901	76906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561250
1505	NC_008345	GCC	2	6	76937	76942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561250
1506	NC_008345	GCT	2	6	76964	76969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561250
1507	NC_008345	A	6	6	76982	76987	100 %	0 %	0 %	0 %	114561250
1508	NC_008345	AGC	2	6	77002	77007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561250
1509	NC_008345	TTA	2	6	77025	77030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561250
1510	NC_008345	AGC	3	9	77071	77079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561250
1511	NC_008345	GGT	2	6	77108	77113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561250
1512	NC_008345	TA	3	6	77191	77196	50 %	50 %	0 %	0 %	114561250
1513	NC_008345	TCAT	2	8	77224	77231	25 %	50 %	0 %	25 %	114561250
1514	NC_008345	TTG	2	6	77277	77282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_008345	AT	3	6	77300	77305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_008345	TAT	2	6	77554	77559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561251
1517	NC_008345	AAG	2	6	77574	77579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561251
1518	NC_008345	TGG	2	6	77606	77611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561251
1519	NC_008345	TAT	2	6	77662	77667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561251
1520	NC_008345	TTAT	2	8	77695	77702	25 %	75 %	0 %	0 %	114561251
1521	NC_008345	TAT	2	6	77704	77709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561251
1522	NC_008345	GTG	2	6	77789	77794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561251
1523	NC_008345	CA	3	6	77815	77820	50 %	0 %	0 %	50 %	114561251
1524	NC_008345	T	6	6	77829	77834	0 %	100 %	0 %	0 %	114561251
1525	NC_008345	TAG	2	6	77862	77867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561251
1526	NC_008345	TTG	2	6	77874	77879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561251
1527	NC_008345	CGG	2	6	77892	77897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561251
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1529	NC_008345	TCC	2	6	77946	77951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114561251
1530	NC_008345	T	6	6	78017	78022	0 %	100 %	0 %	0 %	114561251
1531	NC_008345	TGC	2	6	78042	78047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561251
1532	NC_008345	TGC	2	6	78100	78105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561251
1533	NC_008345	T	6	6	78175	78180	0 %	100 %	0 %	0 %	114561251
1534	NC_008345	CAT	2	6	78194	78199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561251
1535	NC_008345	CAT	2	6	78223	78228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561251
1536	NC_008345	A	6	6	78298	78303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_008345	TGT	2	6	78308	78313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_008345	TGT	2	6	78345	78350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_008345	ATTT	2	8	78360	78367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_008345	GAA	2	6	78383	78388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561252
1541	NC_008345	TTTG	2	8	78391	78398	0 %	75 %	25 %	0 %	114561252
1542	NC_008345	GGT	2	6	78419	78424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561252
1543	NC_008345	TGC	2	6	78437	78442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561252
1544	NC_008345	TAA	2	6	78458	78463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561252
1545	NC_008345	GTT	2	6	78584	78589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561252
1546	NC_008345	TAT	2	6	78612	78617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561252
1547	NC_008345	TCA	2	6	78661	78666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561252
1548	NC_008345	GTT	2	6	78749	78754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561252
1549	NC_008345	A	6	6	78774	78779	100 %	0 %	0 %	0 %	114561252
1550	NC_008345	TGGT	2	8	78787	78794	0 %	50 %	50 %	0 %	114561252
1551	NC_008345	ATT	2	6	78835	78840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561252
1552	NC_008345	TAA	2	6	78851	78856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561252
1553	NC_008345	TAAT	2	8	78865	78872	50 %	50 %	0 %	0 %	114561252
1554	NC_008345	GGA	2	6	78884	78889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114561252
1555	NC_008345	ACT	2	6	78985	78990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561252
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1557	NC_008345	TTA	2	6	79159	79164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561252
1558	NC_008345	GGTT	2	8	79197	79204	0 %	50 %	50 %	0 %	114561252
1559	NC_008345	AAG	2	6	79207	79212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561252
1560	NC_008345	TGGA	2	8	79294	79301	25 %	25 %	50 %	0 %	114561252
1561	NC_008345	ATG	2	6	79330	79335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561252
1562	NC_008345	TAA	2	6	79371	79376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561252
1563	NC_008345	ATT	2	6	79433	79438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_008345	ACA	2	6	79467	79472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_008345	TGC	2	6	79507	79512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561253
1566	NC_008345	TTGC	2	8	79533	79540	0 %	50 %	25 %	25 %	114561253
1567	NC_008345	ATT	2	6	79649	79654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561253
1568	NC_008345	CTG	2	6	79657	79662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561253
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1570	NC_008345	TGC	2	6	79799	79804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561253
1571	NC_008345	GGC	2	6	79883	79888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561253
1572	NC_008345	A	6	6	79966	79971	100 %	0 %	0 %	0 %	114561253
1573	NC_008345	TTA	2	6	79972	79977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561253
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1575	NC_008345	TG	3	6	80020	80025	0 %	50 %	50 %	0 %	114561253
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1580	NC_008345	AG	3	6	80264	80269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_008345	A	6	6	80271	80276	100 %	0 %	0 %	0 %	114561254
1582	NC_008345	CTTAT	2	10	80290	80299	20 %	60 %	0 %	20 %	114561254
1583	NC_008345	GTC	2	6	80315	80320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561254
1584	NC_008345	TTG	2	6	80349	80354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561254
1585	NC_008345	TGT	2	6	80409	80414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561254
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1587	NC_008345	TCT	2	6	80497	80502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561254
1588	NC_008345	CTG	2	6	80520	80525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561254
1589	NC_008345	A	6	6	80540	80545	100 %	0 %	0 %	0 %	114561254
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1592	NC_008345	ATT	2	6	80635	80640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561254
1593	NC_008345	TTGA	2	8	80667	80674	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_008345	TAT	2	6	80696	80701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_008345	CA	3	6	80762	80767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_008345	TGG	2	6	80768	80773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_008345	GGT	2	6	80988	80993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561255
1598	NC_008345	TTA	2	6	81196	81201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561255
1599	NC_008345	AGC	2	6	81234	81239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_008345	TTA	2	6	81252	81257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_008345	GCCT	2	8	81269	81276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_008345	TG	3	6	81308	81313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_008345	TTA	2	6	81314	81319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_008345	ATG	2	6	81407	81412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_008345	TAA	2	6	81414	81419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_008345	TGC	2	6	81421	81426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_008345	T	7	7	81472	81478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_008345	AT	3	6	81481	81486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_008345	AATC	2	8	81497	81504	50 %	25 %	0 %	25 %	114561256
1610	NC_008345	CTT	2	6	81565	81570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561256
1611	NC_008345	AGCAA	2	10	81572	81581	60 %	0 %	20 %	20 %	114561256
1612	NC_008345	TTGG	2	8	81591	81598	0 %	50 %	50 %	0 %	114561256
1613	NC_008345	TAT	3	9	81701	81709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561256
1614	NC_008345	TTTA	2	8	81745	81752	25 %	75 %	0 %	0 %	114561256
1615	NC_008345	CTT	2	6	81882	81887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561256
1616	NC_008345	TGC	2	6	82040	82045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561256
1617	NC_008345	GTG	2	6	82047	82052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561256
1618	NC_008345	TTGG	2	8	82122	82129	0 %	50 %	50 %	0 %	114561256
1619	NC_008345	CGC	2	6	82229	82234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561256
1620	NC_008345	TGC	2	6	82273	82278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561256
1621	NC_008345	ATT	2	6	82302	82307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561256
1622	NC_008345	AGT	2	6	82320	82325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561256
1623	NC_008345	TCGTT	2	10	82372	82381	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1624	NC_008345	TTTA	2	8	82388	82395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_008345	TAT	2	6	82405	82410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_008345	AG	3	6	82420	82425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_008345	GCT	2	6	82463	82468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561257
1628	NC_008345	TTTCA	2	10	82476	82485	20 %	60 %	0 %	20 %	114561257
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