MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 94497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008345	ATT	2	6	50287	50292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561226
1002	NC_008345	AATT	2	8	50294	50301	50 %	50 %	0 %	0 %	114561226
1003	NC_008345	TTC	2	6	50600	50605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561227
1004	NC_008345	AGTC	2	8	50645	50652	25 %	25 %	25 %	25 %	114561227
1005	NC_008345	ATT	2	6	50732	50737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561227
1006	NC_008345	TGAG	2	8	50876	50883	25 %	25 %	50 %	0 %	114561227
1007	NC_008345	GAT	2	6	50885	50890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561227
1008	NC_008345	TCA	2	6	50898	50903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561227
1009	NC_008345	TGT	2	6	50907	50912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561227
1010	NC_008345	TAA	2	6	50929	50934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561227
1011	NC_008345	TG	3	6	50994	50999	0 %	50 %	50 %	0 %	114561227
1012	NC_008345	GAT	2	6	51025	51030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561227
1013	NC_008345	TTG	2	6	51053	51058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561227
1014	NC_008345	TA	3	6	51089	51094	50 %	50 %	0 %	0 %	114561227
1015	NC_008345	ATC	2	6	51150	51155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561227
1016	NC_008345	TCA	2	6	51177	51182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561227
1017	NC_008345	TTG	2	6	51206	51211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561227
1018	NC_008345	TTA	2	6	51277	51282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008345	TATC	2	8	51326	51333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_008345	CTTG	2	8	51347	51354	0 %	50 %	25 %	25 %	114561228
1021	NC_008345	CAT	2	6	51441	51446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561228
1022	NC_008345	TGGCC	2	10	51542	51551	0 %	20 %	40 %	40 %	114561228
1023	NC_008345	AGT	2	6	51574	51579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561228
1024	NC_008345	TTG	2	6	51628	51633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561228
1025	NC_008345	TGCA	2	8	51649	51656	25 %	25 %	25 %	25 %	114561228
1026	NC_008345	CGA	2	6	51666	51671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561228
1027	NC_008345	AAT	2	6	51942	51947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561228
1028	NC_008345	TCG	2	6	51956	51961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561228
1029	NC_008345	CAG	2	6	52011	52016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561228
1030	NC_008345	T	6	6	52084	52089	0 %	100 %	0 %	0 %	114561228
1031	NC_008345	TGC	2	6	52099	52104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561228
1032	NC_008345	TCA	2	6	52118	52123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561228
1033	NC_008345	A	6	6	52166	52171	100 %	0 %	0 %	0 %	114561228
1034	NC_008345	CTT	2	6	52239	52244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561228
1035	NC_008345	GTG	2	6	52286	52291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561228
1036	NC_008345	CGC	2	6	52318	52323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561228
1037	NC_008345	AAGCCG	2	12	52335	52346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561228
1038	NC_008345	AT	3	6	52370	52375	50 %	50 %	0 %	0 %	114561228
1039	NC_008345	GTT	2	6	52433	52438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561228
1040	NC_008345	TTG	2	6	52444	52449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561228
1041	NC_008345	T	7	7	52460	52466	0 %	100 %	0 %	0 %	114561228
1042	NC_008345	GCT	2	6	52516	52521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561228
1043	NC_008345	TGTT	2	8	52621	52628	0 %	75 %	25 %	0 %	114561228
1044	NC_008345	TGA	2	6	52821	52826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561228
1045	NC_008345	GCT	2	6	52857	52862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561228
1046	NC_008345	ATC	2	6	52924	52929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561228
1047	NC_008345	GGC	2	6	52963	52968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561228
1048	NC_008345	TATC	2	8	53031	53038	25 %	50 %	0 %	25 %	114561228
1049	NC_008345	GTGA	2	8	53050	53057	25 %	25 %	50 %	0 %	114561228
1050	NC_008345	TGTT	2	8	53169	53176	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008345	A	6	6	53205	53210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008345	A	7	7	53255	53261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008345	CAT	2	6	53303	53308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_008345	GATA	2	8	53364	53371	50 %	25 %	25 %	0 %	114561229
1055	NC_008345	TAATGT	2	12	53412	53423	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	114561229
1056	NC_008345	CCA	2	6	53445	53450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561229
1057	NC_008345	AGA	2	6	53481	53486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561229
1058	NC_008345	AAC	2	6	53521	53526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561229
1059	NC_008345	T	6	6	53535	53540	0 %	100 %	0 %	0 %	114561229
1060	NC_008345	GAA	2	6	53541	53546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561229
1061	NC_008345	GCA	2	6	53620	53625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561229
1062	NC_008345	TTA	2	6	53664	53669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561229
1063	NC_008345	TAT	2	6	53775	53780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561229
1064	NC_008345	GCAA	2	8	53985	53992	50 %	0 %	25 %	25 %	114561229
1065	NC_008345	ATG	2	6	54134	54139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561229
1066	NC_008345	ATTG	2	8	54174	54181	25 %	50 %	25 %	0 %	114561229
1067	NC_008345	A	6	6	54346	54351	100 %	0 %	0 %	0 %	114561229
1068	NC_008345	GTAA	2	8	54370	54377	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008345	A	7	7	54376	54382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_008345	CTG	3	9	54452	54460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561230
1071	NC_008345	ATA	2	6	54476	54481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561230
1072	NC_008345	GAC	2	6	54517	54522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561230
1073	NC_008345	TCA	2	6	54615	54620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561230
1074	NC_008345	CG	3	6	54692	54697	0 %	0 %	50 %	50 %	114561230
1075	NC_008345	TCA	2	6	54705	54710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561230
1076	NC_008345	GTA	2	6	54767	54772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561230
1077	NC_008345	GAT	2	6	54825	54830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561230
1078	NC_008345	CAAG	2	8	54841	54848	50 %	0 %	25 %	25 %	114561230
1079	NC_008345	TTC	2	6	54854	54859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561230
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1081	NC_008345	TCA	2	6	54921	54926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561230
1082	NC_008345	TGT	2	6	55014	55019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561230
1083	NC_008345	GCA	2	6	55056	55061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561230
1084	NC_008345	AAT	2	6	55118	55123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561230
1085	NC_008345	GC	3	6	55124	55129	0 %	0 %	50 %	50 %	114561230
1086	NC_008345	TAAAT	2	10	55173	55182	60 %	40 %	0 %	0 %	114561230
1087	NC_008345	CGTT	2	8	55186	55193	0 %	50 %	25 %	25 %	114561230
1088	NC_008345	AAAT	2	8	55234	55241	75 %	25 %	0 %	0 %	114561230
1089	NC_008345	CTT	2	6	55276	55281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561230
1090	NC_008345	CTT	2	6	55324	55329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561230
1091	NC_008345	GTT	2	6	55411	55416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561230
1092	NC_008345	TAAT	2	8	55417	55424	50 %	50 %	0 %	0 %	114561230
1093	NC_008345	AAT	2	6	55509	55514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561230
1094	NC_008345	TAA	2	6	55525	55530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561230
1095	NC_008345	TAA	2	6	55582	55587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561230
1096	NC_008345	TTA	2	6	55590	55595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561230
1097	NC_008345	AGT	2	6	55603	55608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561230
1098	NC_008345	AAG	2	6	55732	55737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561230
1099	NC_008345	ATC	2	6	55770	55775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561230
1100	NC_008345	GCT	2	6	55801	55806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_008345	TCC	2	6	55817	55822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_008345	AATG	2	8	55891	55898	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_008345	AAT	2	6	55941	55946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_008345	GCA	2	6	55958	55963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_008345	ATT	2	6	55985	55990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_008345	GGCT	2	8	55998	56005	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_008345	CAACA	2	10	56097	56106	60 %	0 %	0 %	40 %	114561231
1108	NC_008345	TTC	2	6	56127	56132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561231
1109	NC_008345	GAT	2	6	56149	56154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561231
1110	NC_008345	TTTG	2	8	56264	56271	0 %	75 %	25 %	0 %	114561231
1111	NC_008345	AT	3	6	56315	56320	50 %	50 %	0 %	0 %	114561231
1112	NC_008345	AGT	2	6	56367	56372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561231
1113	NC_008345	TGT	2	6	56479	56484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561231
1114	NC_008345	TTAG	2	8	56554	56561	25 %	50 %	25 %	0 %	114561231
1115	NC_008345	ACC	2	6	56601	56606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561231
1116	NC_008345	GTT	2	6	56641	56646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561231
1117	NC_008345	TGA	2	6	56677	56682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561231
1118	NC_008345	AATA	2	8	56739	56746	75 %	25 %	0 %	0 %	114561231
1119	NC_008345	CAT	2	6	56785	56790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_008345	TAA	2	6	56795	56800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008345	ATG	3	9	56815	56823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561232
1122	NC_008345	TGA	2	6	56846	56851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561232
1123	NC_008345	ATG	2	6	56872	56877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561232
1124	NC_008345	ATC	2	6	56915	56920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561232
1125	NC_008345	CTA	2	6	56985	56990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561232
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