MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 94497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_008345	GTG	2	6	612379	612384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561720
12003	NC_008345	AGTG	2	8	612385	612392	25 %	25 %	50 %	0 %	114561720
12004	NC_008345	AAT	2	6	612420	612425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561720
12005	NC_008345	AGA	2	6	612451	612456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_008345	TAT	2	6	612467	612472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12007	NC_008345	CAAT	2	8	612480	612487	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12008	NC_008345	ATA	2	6	612516	612521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_008345	T	6	6	612522	612527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_008345	AT	4	8	612530	612537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12011	NC_008345	T	6	6	612543	612548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12012	NC_008345	ATTA	2	8	612566	612573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12013	NC_008345	CAACG	2	10	612597	612606	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12014	NC_008345	T	6	6	612610	612615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_008345	GCA	2	6	612619	612624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12016	NC_008345	TTG	2	6	612666	612671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_008345	AGA	2	6	612702	612707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_008345	GTA	2	6	612722	612727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_008345	ATG	2	6	612758	612763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_008345	GTTT	2	8	612785	612792	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12021	NC_008345	T	7	7	612844	612850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12022	NC_008345	TGA	2	6	612867	612872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12023	NC_008345	GT	3	6	612929	612934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12024	NC_008345	T	6	6	612970	612975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12025	NC_008345	GGC	2	6	613059	613064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561721
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12049	NC_008345	T	6	6	614535	614540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12050	NC_008345	A	7	7	614545	614551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12053	NC_008345	TTGAA	2	10	614691	614700	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_008345	GA	3	6	614707	614712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12057	NC_008345	TCAT	2	8	614829	614836	25 %	50 %	0 %	25 %	114561722
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12095	NC_008345	AGGT	2	8	617242	617249	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12103	NC_008345	CCAA	2	8	617574	617581	50 %	0 %	0 %	50 %	114561724
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12122	NC_008345	CAA	2	6	618431	618436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561725
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12124	NC_008345	GCA	2	6	618557	618562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561725
12125	NC_008345	TTG	2	6	618693	618698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561725
12126	NC_008345	TAA	2	6	618840	618845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561725
12127	NC_008345	GAT	2	6	618918	618923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561725
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12129	NC_008345	ATTTTT	2	12	619000	619011	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	114561725
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12134	NC_008345	CTG	2	6	619280	619285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561725
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12137	NC_008345	CAG	2	6	619494	619499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12138	NC_008345	AGCT	2	8	619502	619509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12139	NC_008345	GTT	2	6	619538	619543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12140	NC_008345	CAT	2	6	619739	619744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561726
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12143	NC_008345	TTGC	2	8	619817	619824	0 %	50 %	25 %	25 %	114561726
12144	NC_008345	GCT	2	6	619834	619839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561726
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12152	NC_008345	TGA	2	6	620377	620382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561726
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12155	NC_008345	GATAA	2	10	620608	620617	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12156	NC_008345	AC	3	6	620618	620623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12157	NC_008345	GGA	2	6	620655	620660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12158	NC_008345	GTCA	2	8	620678	620685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12200	NC_008345	TAA	2	6	623032	623037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12230	NC_008345	TGTT	2	8	624731	624738	0 %	75 %	25 %	0 %	114561731
12231	NC_008345	TGT	2	6	624781	624786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561731
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12240	NC_008345	TGG	2	6	625215	625220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561731
12241	NC_008345	GC	4	8	625282	625289	0 %	0 %	50 %	50 %	114561731
12242	NC_008345	CTTG	2	8	625333	625340	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12243	NC_008345	AAGTA	2	10	625364	625373	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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