MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 94497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008345	AACA	2	8	25087	25094	75 %	0 %	0 %	25 %	114561208
502	NC_008345	GCC	2	6	25160	25165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561208
503	NC_008345	CATGG	2	10	25210	25219	20 %	20 %	40 %	20 %	114561208
504	NC_008345	ATGC	2	8	25237	25244	25 %	25 %	25 %	25 %	114561208
505	NC_008345	AGT	2	6	25271	25276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561208
506	NC_008345	AAAT	2	8	25297	25304	75 %	25 %	0 %	0 %	114561208
507	NC_008345	TGA	2	6	25351	25356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561208
508	NC_008345	C	6	6	25379	25384	0 %	0 %	0 %	100 %	114561208
509	NC_008345	GCC	2	6	25432	25437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561208
510	NC_008345	AAT	2	6	25448	25453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561208
511	NC_008345	ATA	2	6	25497	25502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561208
512	NC_008345	A	7	7	25540	25546	100 %	0 %	0 %	0 %	114561208
513	NC_008345	TAAT	2	8	25556	25563	50 %	50 %	0 %	0 %	114561208
514	NC_008345	GCG	2	6	25589	25594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561208
515	NC_008345	AACATA	2	12	25628	25639	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	114561208
516	NC_008345	ATG	2	6	25660	25665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561208
517	NC_008345	TAAA	2	8	25707	25714	75 %	25 %	0 %	0 %	114561208
518	NC_008345	TTC	2	6	25741	25746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561208
519	NC_008345	GA	3	6	25799	25804	50 %	0 %	50 %	0 %	114561208
520	NC_008345	TTTG	2	8	25827	25834	0 %	75 %	25 %	0 %	114561208
521	NC_008345	A	6	6	25859	25864	100 %	0 %	0 %	0 %	114561209
522	NC_008345	CTT	2	6	25903	25908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561209
523	NC_008345	AATAA	2	10	25919	25928	80 %	20 %	0 %	0 %	114561209
524	NC_008345	TCA	2	6	25976	25981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561209
525	NC_008345	CTG	2	6	26094	26099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561209
526	NC_008345	CAC	2	6	26100	26105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561209
527	NC_008345	AT	3	6	26127	26132	50 %	50 %	0 %	0 %	114561209
528	NC_008345	TGG	2	6	26166	26171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561209
529	NC_008345	GAG	2	6	26178	26183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114561209
530	NC_008345	CTT	2	6	26205	26210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561209
531	NC_008345	ATA	2	6	26291	26296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561209
532	NC_008345	TCA	2	6	26306	26311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561209
533	NC_008345	TTC	2	6	26350	26355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561209
534	NC_008345	GGT	2	6	26395	26400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561209
535	NC_008345	T	6	6	26400	26405	0 %	100 %	0 %	0 %	114561209
536	NC_008345	CG	3	6	26428	26433	0 %	0 %	50 %	50 %	114561209
537	NC_008345	TTAAC	2	10	26451	26460	40 %	40 %	0 %	20 %	114561209
538	NC_008345	GAC	2	6	26580	26585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561209
539	NC_008345	CGA	2	6	26592	26597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561209
540	NC_008345	TCA	2	6	26606	26611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561209
541	NC_008345	AAT	2	6	26620	26625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561209
542	NC_008345	CG	3	6	26634	26639	0 %	0 %	50 %	50 %	114561209
543	NC_008345	GGCC	2	8	26648	26655	0 %	0 %	50 %	50 %	114561209
544	NC_008345	GCC	2	6	26737	26742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561209
545	NC_008345	ATA	2	6	26743	26748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561209
546	NC_008345	CAA	2	6	26760	26765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561209
547	NC_008345	CTA	2	6	26817	26822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561209
548	NC_008345	TGTA	2	8	26828	26835	25 %	50 %	25 %	0 %	114561209
549	NC_008345	TCA	2	6	26867	26872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561209
550	NC_008345	ATA	2	6	26873	26878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561209
551	NC_008345	TCT	2	6	27068	27073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561209
552	NC_008345	CTT	2	6	27081	27086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561209
553	NC_008345	ACA	3	9	27116	27124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561209
554	NC_008345	CTTGT	2	10	27136	27145	0 %	60 %	20 %	20 %	114561209
555	NC_008345	CGA	2	6	27174	27179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561209
556	NC_008345	GCC	2	6	27223	27228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561209
557	NC_008345	ATA	2	6	27248	27253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561209
558	NC_008345	GC	3	6	27296	27301	0 %	0 %	50 %	50 %	114561210
559	NC_008345	TAA	2	6	27303	27308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561210
560	NC_008345	TTGTC	2	10	27321	27330	0 %	60 %	20 %	20 %	114561210
561	NC_008345	TTG	2	6	27368	27373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561210
562	NC_008345	TTG	2	6	27425	27430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561210
563	NC_008345	ATA	2	6	27466	27471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561210
564	NC_008345	CAA	2	6	27498	27503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561210
565	NC_008345	CAAG	2	8	27616	27623	50 %	0 %	25 %	25 %	114561210
566	NC_008345	TTG	2	6	27635	27640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561210
567	NC_008345	CCA	2	6	27647	27652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561210
568	NC_008345	TGT	2	6	27717	27722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561210
569	NC_008345	CCA	2	6	27804	27809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561210
570	NC_008345	GGCGC	2	10	27810	27819	0 %	0 %	60 %	40 %	114561210
571	NC_008345	CTG	2	6	27841	27846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561210
572	NC_008345	TGC	2	6	27896	27901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561210
573	NC_008345	ATT	2	6	28040	28045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561210
574	NC_008345	TGG	2	6	28068	28073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561210
575	NC_008345	AAT	2	6	28082	28087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561210
576	NC_008345	TTG	2	6	28112	28117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561210
577	NC_008345	TAA	2	6	28126	28131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561210
578	NC_008345	AGCGT	2	10	28150	28159	20 %	20 %	40 %	20 %	114561210
579	NC_008345	CGC	2	6	28277	28282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561210
580	NC_008345	GTAAA	2	10	28299	28308	60 %	20 %	20 %	0 %	114561210
581	NC_008345	AAC	2	6	28315	28320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561210
582	NC_008345	CTA	2	6	28321	28326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561210
583	NC_008345	CAG	2	6	28328	28333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561210
584	NC_008345	AC	3	6	28386	28391	50 %	0 %	0 %	50 %	114561210
585	NC_008345	TAA	2	6	28439	28444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561210
586	NC_008345	GCT	2	6	28539	28544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561210
587	NC_008345	AC	4	8	28584	28591	50 %	0 %	0 %	50 %	114561211
588	NC_008345	CAC	2	6	28607	28612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561211
589	NC_008345	TTG	2	6	28648	28653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561211
590	NC_008345	CTTG	2	8	28709	28716	0 %	50 %	25 %	25 %	114561211
591	NC_008345	AAT	2	6	28725	28730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561211
592	NC_008345	TTG	2	6	28794	28799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561211
593	NC_008345	CTT	3	9	28886	28894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561211
594	NC_008345	AGC	2	6	29065	29070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561211
595	NC_008345	CAA	2	6	29258	29263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561211
596	NC_008345	ATA	2	6	29266	29271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561211
597	NC_008345	AGC	2	6	29283	29288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561211
598	NC_008345	ATG	2	6	29318	29323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561211
599	NC_008345	CAG	2	6	29399	29404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561211
600	NC_008345	T	6	6	29521	29526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008345	CTT	2	6	29554	29559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561212
602	NC_008345	ATAA	2	8	29599	29606	75 %	25 %	0 %	0 %	114561212
603	NC_008345	AAC	2	6	29661	29666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561212
604	NC_008345	CTT	2	6	29773	29778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561212
605	NC_008345	CAC	2	6	29791	29796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561212
606	NC_008345	TAA	2	6	29818	29823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561212
607	NC_008345	CAAT	2	8	29863	29870	50 %	25 %	0 %	25 %	114561212
608	NC_008345	TGA	2	6	29874	29879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561212
609	NC_008345	AGC	2	6	29894	29899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561212
610	NC_008345	AT	3	6	30039	30044	50 %	50 %	0 %	0 %	114561212
611	NC_008345	TAA	2	6	30148	30153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008345	ACA	2	6	30162	30167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561213
613	NC_008345	T	6	6	30202	30207	0 %	100 %	0 %	0 %	114561213
614	NC_008345	T	6	6	30316	30321	0 %	100 %	0 %	0 %	114561213
615	NC_008345	ATTTA	2	10	30381	30390	40 %	60 %	0 %	0 %	114561213
616	NC_008345	GTT	2	6	30440	30445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561213
617	NC_008345	AGC	2	6	30447	30452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561213
618	NC_008345	TCC	2	6	30502	30507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114561213
619	NC_008345	TTAA	2	8	30521	30528	50 %	50 %	0 %	0 %	114561213
620	NC_008345	GTG	2	6	30594	30599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561213
621	NC_008345	TCA	2	6	30613	30618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561213
622	NC_008345	T	6	6	30698	30703	0 %	100 %	0 %	0 %	114561213
623	NC_008345	ATT	2	6	30721	30726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561213
624	NC_008345	AT	3	6	30777	30782	50 %	50 %	0 %	0 %	114561213
625	NC_008345	AGA	2	6	30844	30849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561213
626	NC_008345	TTATT	2	10	30868	30877	20 %	80 %	0 %	0 %	114561213
627	NC_008345	TAT	2	6	30910	30915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561213
628	NC_008345	GTG	2	6	30972	30977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561213
629	NC_008345	T	6	6	31005	31010	0 %	100 %	0 %	0 %	114561213
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