MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 94497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008345	ATT	2	6	282342	282347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561443
5502	NC_008345	ATA	2	6	282371	282376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561443
5503	NC_008345	TGT	2	6	282389	282394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561443
5504	NC_008345	AG	4	8	282457	282464	50 %	0 %	50 %	0 %	114561444
5505	NC_008345	A	6	6	282504	282509	100 %	0 %	0 %	0 %	114561444
5506	NC_008345	CTG	2	6	282522	282527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561444
5507	NC_008345	TGC	3	9	282529	282537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561444
5508	NC_008345	GTT	2	6	282546	282551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561444
5509	NC_008345	TTA	2	6	282575	282580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561444
5510	NC_008345	GTGA	2	8	282670	282677	25 %	25 %	50 %	0 %	114561444
5511	NC_008345	CTGA	2	8	282735	282742	25 %	25 %	25 %	25 %	114561444
5512	NC_008345	ACC	3	9	282785	282793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561444
5513	NC_008345	ACT	2	6	282802	282807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561444
5514	NC_008345	CCAAAC	2	12	282881	282892	50 %	0 %	0 %	50 %	114561444
5515	NC_008345	GAT	2	6	282916	282921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561444
5516	NC_008345	GATTT	2	10	282933	282942	20 %	60 %	20 %	0 %	114561444
5517	NC_008345	CAA	2	6	283090	283095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561445
5518	NC_008345	CCA	2	6	283128	283133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561445
5519	NC_008345	ACA	2	6	283228	283233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561445
5520	NC_008345	AAT	2	6	283315	283320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561445
5521	NC_008345	GCC	3	9	283323	283331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561445
5522	NC_008345	AAGT	2	8	283386	283393	50 %	25 %	25 %	0 %	114561445
5523	NC_008345	CCA	2	6	283446	283451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561445
5524	NC_008345	AATG	2	8	283466	283473	50 %	25 %	25 %	0 %	114561445
5525	NC_008345	ATGTG	2	10	283626	283635	20 %	40 %	40 %	0 %	114561445
5526	NC_008345	ATA	2	6	283737	283742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561445
5527	NC_008345	ATG	2	6	283761	283766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561445
5528	NC_008345	CCA	2	6	283821	283826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561445
5529	NC_008345	CTG	2	6	283828	283833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561445
5530	NC_008345	A	6	6	283838	283843	100 %	0 %	0 %	0 %	114561445
5531	NC_008345	A	6	6	283853	283858	100 %	0 %	0 %	0 %	114561445
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5533	NC_008345	CA	3	6	283941	283946	50 %	0 %	0 %	50 %	114561445
5534	NC_008345	ATG	2	6	284040	284045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561445
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5537	NC_008345	CCG	2	6	284130	284135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561445
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5539	NC_008345	GTT	2	6	284198	284203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561445
5540	NC_008345	ATC	2	6	284235	284240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561445
5541	NC_008345	ATG	2	6	284298	284303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561445
5542	NC_008345	A	6	6	284330	284335	100 %	0 %	0 %	0 %	114561445
5543	NC_008345	CTA	2	6	284344	284349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561445
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5545	NC_008345	GTG	2	6	284463	284468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561445
5546	NC_008345	TGA	3	9	284502	284510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561445
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5551	NC_008345	CGATAT	2	12	284719	284730	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	114561446
5552	NC_008345	CCGGT	2	10	284740	284749	0 %	20 %	40 %	40 %	114561446
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5555	NC_008345	ACA	2	6	284895	284900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561446
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5557	NC_008345	TAT	2	6	285076	285081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561446
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5569	NC_008345	ATGA	2	8	285586	285593	50 %	25 %	25 %	0 %	114561446
5570	NC_008345	CAT	2	6	285598	285603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561446
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5578	NC_008345	CA	3	6	286197	286202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_008345	A	6	6	286239	286244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_008345	TGA	2	6	286248	286253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_008345	TGG	2	6	286267	286272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_008345	CAC	2	6	286311	286316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5585	NC_008345	A	6	6	286487	286492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_008345	A	8	8	286497	286504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5590	NC_008345	GTGGC	2	10	287020	287029	0 %	20 %	60 %	20 %	114561447
5591	NC_008345	TCA	3	9	287203	287211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561448
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5593	NC_008345	TGCT	2	8	287241	287248	0 %	50 %	25 %	25 %	114561448
5594	NC_008345	CAC	2	6	287306	287311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561448
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5603	NC_008345	TTAA	2	8	287617	287624	50 %	50 %	0 %	0 %	114561448
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5606	NC_008345	TA	3	6	287698	287703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_008345	T	6	6	287738	287743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_008345	TTG	2	6	287749	287754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_008345	CAA	2	6	287768	287773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_008345	AGAT	2	8	287842	287849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5622	NC_008345	A	6	6	288615	288620	100 %	0 %	0 %	0 %	114561449
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5994	NC_008345	TGC	2	6	306180	306185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561465
5995	NC_008345	TCG	2	6	306246	306251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561465
5996	NC_008345	TGA	2	6	306266	306271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561465
5997	NC_008345	TGGCT	2	10	306353	306362	0 %	40 %	40 %	20 %	114561465
5998	NC_008345	ATT	2	6	306364	306369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561465
5999	NC_008345	CAT	2	6	306485	306490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561465
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