MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 94497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008345	GCCA	2	8	230374	230381	25 %	0 %	25 %	50 %	114561396
4502	NC_008345	GGC	2	6	230465	230470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561396
4503	NC_008345	GCCAA	2	10	230584	230593	40 %	0 %	20 %	40 %	114561396
4504	NC_008345	CAA	2	6	230605	230610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561396
4505	NC_008345	AGCC	2	8	230719	230726	25 %	0 %	25 %	50 %	114561396
4506	NC_008345	GGT	2	6	230789	230794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561396
4507	NC_008345	GTCA	2	8	230892	230899	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4508	NC_008345	ATT	2	6	230913	230918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_008345	AT	3	6	230925	230930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_008345	GTT	2	6	230931	230936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_008345	ATG	2	6	230985	230990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_008345	ATGC	2	8	231031	231038	25 %	25 %	25 %	25 %	114561397
4513	NC_008345	GAT	2	6	231050	231055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561397
4514	NC_008345	AT	3	6	231060	231065	50 %	50 %	0 %	0 %	114561397
4515	NC_008345	TGG	2	6	231072	231077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561397
4516	NC_008345	GCG	2	6	231084	231089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561397
4517	NC_008345	CG	3	6	231140	231145	0 %	0 %	50 %	50 %	114561397
4518	NC_008345	GTAA	2	8	231146	231153	50 %	25 %	25 %	0 %	114561397
4519	NC_008345	CAC	2	6	231190	231195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561397
4520	NC_008345	GCC	2	6	231222	231227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561397
4521	NC_008345	TTG	2	6	231231	231236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561397
4522	NC_008345	ACA	2	6	231256	231261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561397
4523	NC_008345	AGA	2	6	231274	231279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561397
4524	NC_008345	CGT	2	6	231290	231295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561397
4525	NC_008345	TCA	2	6	231349	231354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561397
4526	NC_008345	TGA	2	6	231366	231371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561397
4527	NC_008345	CGC	2	6	231382	231387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561397
4528	NC_008345	TTG	2	6	231531	231536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561397
4529	NC_008345	TTA	2	6	231660	231665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561397
4530	NC_008345	ATG	2	6	231756	231761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561397
4531	NC_008345	CGG	2	6	231768	231773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561397
4532	NC_008345	GT	3	6	231936	231941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_008345	TGT	2	6	231993	231998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_008345	CAC	2	6	232231	232236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561398
4535	NC_008345	TGA	2	6	232351	232356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561398
4536	NC_008345	AAG	2	6	232392	232397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561398
4537	NC_008345	AAT	2	6	232529	232534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561398
4538	NC_008345	CAG	2	6	232553	232558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561398
4539	NC_008345	TGA	2	6	232612	232617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561398
4540	NC_008345	GGC	2	6	232780	232785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561398
4541	NC_008345	ATC	2	6	232806	232811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561398
4542	NC_008345	AAT	2	6	232848	232853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561398
4543	NC_008345	GAT	2	6	232924	232929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_008345	T	6	6	232974	232979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_008345	GCT	2	6	232996	233001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_008345	ATTT	2	8	233051	233058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_008345	GTT	2	6	233083	233088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_008345	CAA	2	6	233187	233192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561399
4549	NC_008345	AAG	2	6	233229	233234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561399
4550	NC_008345	TAT	2	6	233251	233256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561399
4551	NC_008345	T	6	6	233301	233306	0 %	100 %	0 %	0 %	114561399
4552	NC_008345	AGC	2	6	233346	233351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561399
4553	NC_008345	TTA	2	6	233352	233357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561399
4554	NC_008345	TAA	2	6	233410	233415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561399
4555	NC_008345	AGTG	2	8	233432	233439	25 %	25 %	50 %	0 %	114561399
4556	NC_008345	TTGA	2	8	233486	233493	25 %	50 %	25 %	0 %	114561399
4557	NC_008345	TGA	2	6	233549	233554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561399
4558	NC_008345	ACA	3	9	233563	233571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561400
4559	NC_008345	ATT	2	6	233574	233579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561400
4560	NC_008345	GGT	2	6	233770	233775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561400
4561	NC_008345	TGA	2	6	233787	233792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561400
4562	NC_008345	TGC	2	6	233808	233813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561400
4563	NC_008345	CTA	2	6	233814	233819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561400
4564	NC_008345	AC	3	6	233835	233840	50 %	0 %	0 %	50 %	114561400
4565	NC_008345	TGA	2	6	233870	233875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561400
4566	NC_008345	ATTG	2	8	233886	233893	25 %	50 %	25 %	0 %	114561400
4567	NC_008345	TTA	2	6	234011	234016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561400
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4569	NC_008345	GC	3	6	234118	234123	0 %	0 %	50 %	50 %	114561400
4570	NC_008345	GAT	2	6	234147	234152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561400
4571	NC_008345	GC	3	6	234193	234198	0 %	0 %	50 %	50 %	114561400
4572	NC_008345	TCGATA	2	12	234278	234289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	114561400
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4574	NC_008345	GCA	2	6	234368	234373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561400
4575	NC_008345	TGA	2	6	234381	234386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561400
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4577	NC_008345	ATT	2	6	234520	234525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561400
4578	NC_008345	ATG	2	6	234607	234612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561400
4579	NC_008345	ATT	2	6	234613	234618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561400
4580	NC_008345	ATT	2	6	234622	234627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561400
4581	NC_008345	ATC	2	6	234703	234708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561400
4582	NC_008345	TGG	2	6	234752	234757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561400
4583	NC_008345	ACC	2	6	234829	234834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561400
4584	NC_008345	GC	3	6	234869	234874	0 %	0 %	50 %	50 %	114561400
4585	NC_008345	GGC	2	6	234933	234938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561400
4586	NC_008345	ATCA	2	8	235067	235074	50 %	25 %	0 %	25 %	114561400
4587	NC_008345	GTT	2	6	235080	235085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561400
4588	NC_008345	CAA	3	9	235138	235146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561400
4589	NC_008345	AGC	2	6	235158	235163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561400
4590	NC_008345	GCA	2	6	235207	235212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561400
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4592	NC_008345	GCA	2	6	235324	235329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561400
4593	NC_008345	GGC	2	6	235332	235337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561400
4594	NC_008345	TGA	2	6	235350	235355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561400
4595	NC_008345	T	6	6	235357	235362	0 %	100 %	0 %	0 %	114561400
4596	NC_008345	ATG	2	6	235451	235456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561400
4597	NC_008345	TGGT	2	8	235616	235623	0 %	50 %	50 %	0 %	114561400
4598	NC_008345	TTTA	2	8	235627	235634	25 %	75 %	0 %	0 %	114561400
4599	NC_008345	CGCT	2	8	235652	235659	0 %	25 %	25 %	50 %	114561400
4600	NC_008345	AGT	2	6	235701	235706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561400
4601	NC_008345	TGC	2	6	235713	235718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561400
4602	NC_008345	TCA	2	6	235729	235734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561400
4603	NC_008345	GTG	2	6	235741	235746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561400
4604	NC_008345	T	6	6	235768	235773	0 %	100 %	0 %	0 %	114561400
4605	NC_008345	CAA	2	6	235780	235785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561400
4606	NC_008345	ATG	2	6	235798	235803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561401
4607	NC_008345	ATTA	2	8	235806	235813	50 %	50 %	0 %	0 %	114561401
4608	NC_008345	TG	3	6	235822	235827	0 %	50 %	50 %	0 %	114561401
4609	NC_008345	ATTG	2	8	235830	235837	25 %	50 %	25 %	0 %	114561401
4610	NC_008345	TGG	2	6	235849	235854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561401
4611	NC_008345	TA	3	6	235862	235867	50 %	50 %	0 %	0 %	114561401
4612	NC_008345	CCA	2	6	235877	235882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561401
4613	NC_008345	TCA	2	6	235884	235889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561401
4614	NC_008345	CAA	2	6	235892	235897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561401
4615	NC_008345	AGC	2	6	236160	236165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_008345	A	6	6	236223	236228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_008345	CA	3	6	236231	236236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4618	NC_008345	TAC	2	6	236307	236312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_008345	CAT	2	6	236327	236332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561402
4620	NC_008345	ACG	2	6	236336	236341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561402
4621	NC_008345	GTT	2	6	236366	236371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561402
4622	NC_008345	TCA	2	6	236441	236446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561402
4623	NC_008345	AAGCT	2	10	236452	236461	40 %	20 %	20 %	20 %	114561402
4624	NC_008345	T	7	7	236495	236501	0 %	100 %	0 %	0 %	114561402
4625	NC_008345	CAA	2	6	236535	236540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561402
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4628	NC_008345	TGC	2	6	236755	236760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561402
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4633	NC_008345	AT	3	6	236886	236891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4680	NC_008345	GTAA	2	8	239240	239247	50 %	25 %	25 %	0 %	114561404
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4687	NC_008345	GTT	2	6	239536	239541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561405
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4733	NC_008345	TCA	2	6	241569	241574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561406
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4736	NC_008345	CAA	2	6	241742	241747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561407
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4739	NC_008345	AGTG	2	8	241924	241931	25 %	25 %	50 %	0 %	114561407
4740	NC_008345	TTGG	2	8	242057	242064	0 %	50 %	50 %	0 %	114561407
4741	NC_008345	TGT	2	6	242082	242087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561407
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4744	NC_008345	TTG	2	6	242198	242203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561407
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4746	NC_008345	TGTGG	2	10	242283	242292	0 %	40 %	60 %	0 %	114561407
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4856	NC_008345	AATCAA	2	12	247767	247778	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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4858	NC_008345	TTAAA	2	10	247835	247844	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4866	NC_008345	ATT	2	6	248374	248379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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