MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008322	CGG	2	6	145419	145424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045641
2502	NC_008322	TCA	2	6	145514	145519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045641
2503	NC_008322	ACC	2	6	145560	145565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045641
2504	NC_008322	CTG	2	6	145574	145579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045641
2505	NC_008322	GGC	2	6	145612	145617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045641
2506	NC_008322	CTG	2	6	145687	145692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045641
2507	NC_008322	AAT	2	6	145807	145812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045641
2508	NC_008322	ACC	2	6	145888	145893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045641
2509	NC_008322	TTG	2	6	145942	145947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045641
2510	NC_008322	ACA	3	9	146121	146129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045641
2511	NC_008322	AGC	2	6	146348	146353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045641
2512	NC_008322	CGG	2	6	146385	146390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045641
2513	NC_008322	TGC	2	6	146477	146482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045641
2514	NC_008322	AGG	2	6	146486	146491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045641
2515	NC_008322	TCT	2	6	146498	146503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045641
2516	NC_008322	GAG	2	6	146505	146510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045641
2517	NC_008322	TACA	2	8	146638	146645	50 %	25 %	0 %	25 %	114045641
2518	NC_008322	TCA	3	9	146667	146675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045641
2519	NC_008322	ATGG	2	8	146732	146739	25 %	25 %	50 %	0 %	114045641
2520	NC_008322	A	6	6	146779	146784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_008322	TGA	2	6	146799	146804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_008322	ATCTA	2	10	146884	146893	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2523	NC_008322	TTAT	2	8	146909	146916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_008322	TA	3	6	146917	146922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_008322	TAT	2	6	146932	146937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_008322	TTA	2	6	146940	146945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_008322	CAAA	2	8	146964	146971	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2528	NC_008322	AAC	2	6	147137	147142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045642
2529	NC_008322	GAT	2	6	147191	147196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045642
2530	NC_008322	GGCC	2	8	147262	147269	0 %	0 %	50 %	50 %	114045642
2531	NC_008322	CGC	2	6	147319	147324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045642
2532	NC_008322	GC	3	6	147333	147338	0 %	0 %	50 %	50 %	114045642
2533	NC_008322	TGG	2	6	147406	147411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045642
2534	NC_008322	GTT	2	6	147497	147502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045642
2535	NC_008322	AC	3	6	147557	147562	50 %	0 %	0 %	50 %	114045642
2536	NC_008322	CGG	2	6	147616	147621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045642
2537	NC_008322	AC	3	6	147670	147675	50 %	0 %	0 %	50 %	114045642
2538	NC_008322	CTTGGC	2	12	147676	147687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045642
2539	NC_008322	TGT	2	6	147963	147968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_008322	TAG	2	6	148042	148047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_008322	CTG	2	6	148094	148099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_008322	CCG	2	6	148167	148172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2543	NC_008322	TTG	2	6	148200	148205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_008322	GCC	2	6	148308	148313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2545	NC_008322	CAT	2	6	148327	148332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_008322	CAA	2	6	148347	148352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_008322	CGT	2	6	148401	148406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_008322	CTG	2	6	148454	148459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045643
2549	NC_008322	GCTAT	2	10	148475	148484	20 %	40 %	20 %	20 %	114045643
2550	NC_008322	CTCCA	2	10	148495	148504	20 %	20 %	0 %	60 %	114045643
2551	NC_008322	A	6	6	148533	148538	100 %	0 %	0 %	0 %	114045643
2552	NC_008322	TGA	2	6	148548	148553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045643
2553	NC_008322	CGA	2	6	148576	148581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045643
2554	NC_008322	TAC	2	6	148583	148588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045643
2555	NC_008322	CGA	2	6	148729	148734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045643
2556	NC_008322	CCG	2	6	148774	148779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045643
2557	NC_008322	GCG	2	6	148791	148796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045643
2558	NC_008322	ATG	2	6	148841	148846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045643
2559	NC_008322	GC	3	6	148861	148866	0 %	0 %	50 %	50 %	114045643
2560	NC_008322	GCGTCA	2	12	148896	148907	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114045643
2561	NC_008322	GCC	2	6	148950	148955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045643
2562	NC_008322	CTG	2	6	149090	149095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045643
2563	NC_008322	GAG	2	6	149156	149161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045643
2564	NC_008322	TAC	2	6	149174	149179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045643
2565	NC_008322	GAA	2	6	149306	149311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045643
2566	NC_008322	GGCA	2	8	149367	149374	25 %	0 %	50 %	25 %	114045643
2567	NC_008322	TGA	2	6	149388	149393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045643
2568	NC_008322	GTG	2	6	149396	149401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045643
2569	NC_008322	GCC	2	6	149411	149416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045643
2570	NC_008322	GC	3	6	149459	149464	0 %	0 %	50 %	50 %	114045643
2571	NC_008322	ATT	2	6	149490	149495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045643
2572	NC_008322	GGC	2	6	149738	149743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045643
2573	NC_008322	GCCA	2	8	149750	149757	25 %	0 %	25 %	50 %	114045643
2574	NC_008322	CCGC	2	8	149784	149791	0 %	0 %	25 %	75 %	114045643
2575	NC_008322	AAGA	2	8	149840	149847	75 %	0 %	25 %	0 %	114045643
2576	NC_008322	ATGGTT	2	12	149871	149882	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	114045643
2577	NC_008322	TCG	3	9	149912	149920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045643
2578	NC_008322	CAC	2	6	150055	150060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045643
2579	NC_008322	GTG	2	6	150098	150103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045643
2580	NC_008322	GGC	2	6	150110	150115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045643
2581	NC_008322	CAC	2	6	150238	150243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045643
2582	NC_008322	CAC	2	6	150355	150360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045643
2583	NC_008322	AAAT	2	8	150430	150437	75 %	25 %	0 %	0 %	114045643
2584	NC_008322	GGT	2	6	150494	150499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045643
2585	NC_008322	CTT	3	9	150547	150555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045643
2586	NC_008322	C	6	6	150638	150643	0 %	0 %	0 %	100 %	114045644
2587	NC_008322	CAC	2	6	150821	150826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045644
2588	NC_008322	CGCC	2	8	150833	150840	0 %	0 %	25 %	75 %	114045644
2589	NC_008322	ATCA	2	8	150853	150860	50 %	25 %	0 %	25 %	114045644
2590	NC_008322	AGC	2	6	150861	150866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045644
2591	NC_008322	GCA	2	6	150873	150878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045644
2592	NC_008322	GTG	2	6	150937	150942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045644
2593	NC_008322	TTGA	2	8	150999	151006	25 %	50 %	25 %	0 %	114045644
2594	NC_008322	T	6	6	151036	151041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_008322	GCA	2	6	151124	151129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_008322	ACGG	2	8	151167	151174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2597	NC_008322	CTG	2	6	151294	151299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_008322	A	6	6	151409	151414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_008322	A	6	6	151499	151504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_008322	TTA	2	6	151590	151595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_008322	GTA	2	6	151617	151622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_008322	TGGA	2	8	151837	151844	25 %	25 %	50 %	0 %	114045645
2603	NC_008322	CTC	2	6	151929	151934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045645
2604	NC_008322	GCA	2	6	152036	152041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045645
2605	NC_008322	ATG	2	6	152070	152075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045645
2606	NC_008322	ATTT	2	8	152120	152127	25 %	75 %	0 %	0 %	114045645
2607	NC_008322	TCC	2	6	152154	152159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045645
2608	NC_008322	TGTT	2	8	152191	152198	0 %	75 %	25 %	0 %	114045645
2609	NC_008322	AGAAA	2	10	152209	152218	80 %	0 %	20 %	0 %	114045645
2610	NC_008322	TGT	2	6	152228	152233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045645
2611	NC_008322	TGT	2	6	152257	152262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_008322	GAA	2	6	152380	152385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045646
2613	NC_008322	TCA	2	6	152572	152577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045646
2614	NC_008322	AAG	2	6	152594	152599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045646
2615	NC_008322	GTA	2	6	152680	152685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045646
2616	NC_008322	AT	3	6	152716	152721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_008322	ATT	2	6	152782	152787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_008322	TTG	2	6	152856	152861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_008322	T	6	6	152887	152892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_008322	GGCA	2	8	152978	152985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2621	NC_008322	AGCC	2	8	153008	153015	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2622	NC_008322	GCT	2	6	153077	153082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_008322	GAT	2	6	153176	153181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045647
2624	NC_008322	TTG	2	6	153229	153234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045647
2625	NC_008322	CTG	2	6	153280	153285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045647
2626	NC_008322	AAC	2	6	153293	153298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045647
2627	NC_008322	GGT	3	9	153371	153379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045647
2628	NC_008322	TTA	2	6	153383	153388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045647
2629	NC_008322	TTG	2	6	153399	153404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045647
2630	NC_008322	CTG	2	6	153429	153434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045647
2631	NC_008322	ATG	2	6	153438	153443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045647
2632	NC_008322	CAT	2	6	153489	153494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045647
2633	NC_008322	CAT	2	6	153543	153548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045647
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2640	NC_008322	AG	3	6	154058	154063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2641	NC_008322	TTC	2	6	154081	154086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045648
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2648	NC_008322	GAG	2	6	154542	154547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045648
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2650	NC_008322	AGTA	2	8	154599	154606	50 %	25 %	25 %	0 %	114045648
2651	NC_008322	CTGGCA	2	12	154686	154697	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114045648
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2662	NC_008322	TTG	2	6	155689	155694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045650
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2664	NC_008322	AGA	2	6	155918	155923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2665	NC_008322	TTGG	2	8	155931	155938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2666	NC_008322	TGG	2	6	155971	155976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2667	NC_008322	ACTG	2	8	156013	156020	25 %	25 %	25 %	25 %	114045651
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2689	NC_008322	TAAAT	2	10	156905	156914	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2690	NC_008322	GTG	2	6	156971	156976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2707	NC_008322	CTG	2	6	157835	157840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2735	NC_008322	TTA	2	6	159865	159870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2736	NC_008322	GAGT	2	8	159933	159940	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2737	NC_008322	GATA	2	8	160073	160080	50 %	25 %	25 %	0 %	114045654
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2743	NC_008322	CGG	2	6	160274	160279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045654
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2747	NC_008322	TTA	2	6	160372	160377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045654
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2867	NC_008322	GCA	3	9	167034	167042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045658
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2869	NC_008322	AGC	2	6	167290	167295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045659
2870	NC_008322	CGA	2	6	167421	167426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045659
2871	NC_008322	GCCGA	2	10	167527	167536	20 %	0 %	40 %	40 %	114045659
2872	NC_008322	CAACGC	2	12	167610	167621	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114045659
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2929	NC_008322	TTTA	2	8	170617	170624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2930	NC_008322	TATCC	2	10	170663	170672	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2931	NC_008322	A	6	6	170709	170714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2982	NC_008322	AGTT	2	8	173786	173793	25 %	50 %	25 %	0 %	114045664
2983	NC_008322	GTG	2	6	173839	173844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045664
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2985	NC_008322	CGA	2	6	173952	173957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045664
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2991	NC_008322	GGCA	2	8	174434	174441	25 %	0 %	50 %	25 %	114045664
2992	NC_008322	AAG	2	6	174662	174667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045664
2993	NC_008322	TCG	2	6	174677	174682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045664
2994	NC_008322	ACA	2	6	174725	174730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045664
2995	NC_008322	GTG	2	6	174781	174786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045664
2996	NC_008322	AAG	2	6	174830	174835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045664
2997	NC_008322	ACC	2	6	174892	174897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045664
2998	NC_008322	GTG	2	6	174925	174930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045664
2999	NC_008322	GGT	2	6	174934	174939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045664
3000	NC_008322	GAA	2	6	174949	174954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045664

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