MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008322	TCT	2	6	87240	87245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045587
1502	NC_008322	GCA	2	6	87275	87280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045587
1503	NC_008322	GC	3	6	87311	87316	0 %	0 %	50 %	50 %	114045587
1504	NC_008322	CGA	2	6	87488	87493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045587
1505	NC_008322	GTT	2	6	87578	87583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045587
1506	NC_008322	TGG	2	6	87769	87774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045587
1507	NC_008322	GCAGC	2	10	87809	87818	20 %	0 %	40 %	40 %	114045587
1508	NC_008322	AAC	2	6	87835	87840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045587
1509	NC_008322	TGC	2	6	87936	87941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045588
1510	NC_008322	T	6	6	87950	87955	0 %	100 %	0 %	0 %	114045588
1511	NC_008322	TGGCT	2	10	87994	88003	0 %	40 %	40 %	20 %	114045588
1512	NC_008322	TGGCA	2	10	88089	88098	20 %	20 %	40 %	20 %	114045588
1513	NC_008322	GAGT	2	8	88117	88124	25 %	25 %	50 %	0 %	114045588
1514	NC_008322	TGACC	2	10	88225	88234	20 %	20 %	20 %	40 %	114045588
1515	NC_008322	TTG	2	6	88286	88291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045588
1516	NC_008322	CAT	2	6	88390	88395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045588
1517	NC_008322	GT	3	6	88467	88472	0 %	50 %	50 %	0 %	114045588
1518	NC_008322	CTT	2	6	88567	88572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045588
1519	NC_008322	TGC	2	6	88596	88601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045588
1520	NC_008322	TGC	2	6	88752	88757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045588
1521	NC_008322	CAA	2	6	88814	88819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045588
1522	NC_008322	TTG	2	6	88823	88828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045588
1523	NC_008322	CTG	2	6	88901	88906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045588
1524	NC_008322	TGA	2	6	88917	88922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045588
1525	NC_008322	GTT	2	6	88959	88964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045588
1526	NC_008322	TGG	2	6	89001	89006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045588
1527	NC_008322	TGC	2	6	89094	89099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045588
1528	NC_008322	CAG	2	6	89335	89340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045589
1529	NC_008322	GGCA	2	8	89414	89421	25 %	0 %	50 %	25 %	114045589
1530	NC_008322	TTGA	2	8	89455	89462	25 %	50 %	25 %	0 %	114045589
1531	NC_008322	GCG	2	6	89617	89622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045589
1532	NC_008322	CGA	2	6	89640	89645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045589
1533	NC_008322	AGC	2	6	89807	89812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045589
1534	NC_008322	CGA	2	6	89832	89837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045589
1535	NC_008322	GGC	2	6	90031	90036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045589
1536	NC_008322	TG	4	8	90104	90111	0 %	50 %	50 %	0 %	114045589
1537	NC_008322	CCG	2	6	90167	90172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045589
1538	NC_008322	A	6	6	90181	90186	100 %	0 %	0 %	0 %	114045589
1539	NC_008322	GCC	2	6	90355	90360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045589
1540	NC_008322	TCTT	2	8	90379	90386	0 %	75 %	0 %	25 %	114045589
1541	NC_008322	AACG	2	8	90432	90439	50 %	0 %	25 %	25 %	114045589
1542	NC_008322	TTA	2	6	90567	90572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045589
1543	NC_008322	GAC	2	6	90635	90640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045589
1544	NC_008322	ATTT	2	8	90656	90663	25 %	75 %	0 %	0 %	114045589
1545	NC_008322	ACCG	2	8	90667	90674	25 %	0 %	25 %	50 %	114045589
1546	NC_008322	GCT	2	6	90879	90884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045589
1547	NC_008322	AGC	2	6	90914	90919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045589
1548	NC_008322	GCA	2	6	90933	90938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045589
1549	NC_008322	AAT	2	6	91084	91089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045589
1550	NC_008322	T	6	6	91131	91136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008322	TCG	2	6	91247	91252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045590
1552	NC_008322	CT	3	6	91281	91286	0 %	50 %	0 %	50 %	114045590
1553	NC_008322	CTG	2	6	91303	91308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045590
1554	NC_008322	GCG	2	6	91314	91319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045590
1555	NC_008322	GGC	2	6	91497	91502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045590
1556	NC_008322	AAG	2	6	91507	91512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045590
1557	NC_008322	GAG	2	6	91572	91577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045590
1558	NC_008322	CACC	2	8	91621	91628	25 %	0 %	0 %	75 %	114045590
1559	NC_008322	GGC	2	6	91647	91652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045590
1560	NC_008322	GCA	2	6	91682	91687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045590
1561	NC_008322	TGG	2	6	91897	91902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045590
1562	NC_008322	GAA	2	6	91929	91934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045590
1563	NC_008322	TGG	2	6	91951	91956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045590
1564	NC_008322	A	6	6	92005	92010	100 %	0 %	0 %	0 %	114045590
1565	NC_008322	GCC	2	6	92115	92120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045590
1566	NC_008322	ATG	2	6	92271	92276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045590
1567	NC_008322	GAT	2	6	92277	92282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045590
1568	NC_008322	ACA	2	6	92308	92313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045590
1569	NC_008322	GAA	2	6	92378	92383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045590
1570	NC_008322	GCA	2	6	92446	92451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045590
1571	NC_008322	GCC	2	6	92734	92739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045590
1572	NC_008322	TCAG	2	8	92860	92867	25 %	25 %	25 %	25 %	114045590
1573	NC_008322	ATG	2	6	92916	92921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045590
1574	NC_008322	A	6	6	92966	92971	100 %	0 %	0 %	0 %	114045590
1575	NC_008322	CGG	2	6	93017	93022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045590
1576	NC_008322	TTA	2	6	93041	93046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045590
1577	NC_008322	CGG	2	6	93161	93166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045590
1578	NC_008322	CT	3	6	93207	93212	0 %	50 %	0 %	50 %	114045590
1579	NC_008322	AAG	2	6	93274	93279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045590
1580	NC_008322	GC	3	6	93324	93329	0 %	0 %	50 %	50 %	114045590
1581	NC_008322	TGC	2	6	93448	93453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045590
1582	NC_008322	AGC	2	6	93463	93468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045590
1583	NC_008322	TATC	2	8	93500	93507	25 %	50 %	0 %	25 %	114045590
1584	NC_008322	GT	3	6	93589	93594	0 %	50 %	50 %	0 %	114045590
1585	NC_008322	CAG	2	6	93608	93613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045590
1586	NC_008322	A	6	6	93631	93636	100 %	0 %	0 %	0 %	114045590
1587	NC_008322	GGCT	2	8	93653	93660	0 %	25 %	50 %	25 %	114045590
1588	NC_008322	GCAA	2	8	93685	93692	50 %	0 %	25 %	25 %	114045590
1589	NC_008322	TGG	2	6	93750	93755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_008322	GTCA	2	8	93832	93839	25 %	25 %	25 %	25 %	114045591
1591	NC_008322	CAA	2	6	93898	93903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045591
1592	NC_008322	GTG	2	6	93919	93924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045591
1593	NC_008322	GGC	2	6	93928	93933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045591
1594	NC_008322	GC	3	6	93932	93937	0 %	0 %	50 %	50 %	114045591
1595	NC_008322	TTA	2	6	94030	94035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045591
1596	NC_008322	AGC	2	6	94082	94087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045591
1597	NC_008322	CCG	2	6	94128	94133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045591
1598	NC_008322	ACC	2	6	94142	94147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045591
1599	NC_008322	GTC	2	6	94179	94184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045591
1600	NC_008322	TAGC	2	8	94212	94219	25 %	25 %	25 %	25 %	114045591
1601	NC_008322	GCT	2	6	94232	94237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045591
1602	NC_008322	CAC	2	6	94257	94262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_008322	GTG	2	6	94277	94282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_008322	TC	3	6	94335	94340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_008322	CCGG	2	8	94343	94350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_008322	TATT	2	8	94456	94463	25 %	75 %	0 %	0 %	114045592
1607	NC_008322	CGG	2	6	94539	94544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045592
1608	NC_008322	GGC	2	6	94598	94603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045592
1609	NC_008322	GCG	2	6	94734	94739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045592
1610	NC_008322	TGC	2	6	94827	94832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045592
1611	NC_008322	TGG	2	6	94839	94844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045592
1612	NC_008322	AAT	2	6	94856	94861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045592
1613	NC_008322	GCTG	2	8	94957	94964	0 %	25 %	50 %	25 %	114045593
1614	NC_008322	TCG	2	6	95042	95047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045593
1615	NC_008322	GTT	2	6	95136	95141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045593
1616	NC_008322	CAA	2	6	95157	95162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045593
1617	NC_008322	CCTC	2	8	95195	95202	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1618	NC_008322	GTT	2	6	95264	95269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045594
1619	NC_008322	TGC	2	6	95368	95373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045594
1620	NC_008322	GTT	2	6	95592	95597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045594
1621	NC_008322	GCGA	2	8	95772	95779	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_008322	ATG	2	6	95824	95829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_008322	T	6	6	95831	95836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_008322	ATT	2	6	95839	95844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_008322	GAG	2	6	95922	95927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045595
1626	NC_008322	GGC	2	6	96074	96079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045595
1627	NC_008322	GCA	2	6	96095	96100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045595
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1752	NC_008322	GCA	2	6	103132	103137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045603
1753	NC_008322	CAG	2	6	103268	103273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045603
1754	NC_008322	TGA	2	6	103353	103358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045603
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1756	NC_008322	GCC	2	6	103370	103375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045603
1757	NC_008322	T	6	6	103498	103503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1758	NC_008322	CG	3	6	103531	103536	0 %	0 %	50 %	50 %	114045604
1759	NC_008322	TGC	2	6	103576	103581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045604
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1767	NC_008322	ACCA	2	8	104448	104455	50 %	0 %	0 %	50 %	114045605
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1774	NC_008322	TGA	2	6	104972	104977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045605
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1785	NC_008322	AGCT	2	8	105623	105630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1786	NC_008322	TA	3	6	105643	105648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1862	NC_008322	GT	3	6	109994	109999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1865	NC_008322	ATC	2	6	110098	110103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1867	NC_008322	TA	3	6	110136	110141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1868	NC_008322	TA	3	6	110215	110220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1869	NC_008322	TCA	2	6	110228	110233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1870	NC_008322	TTG	2	6	110236	110241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1871	NC_008322	TGTT	2	8	110285	110292	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1872	NC_008322	GATCTC	2	12	110311	110322	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1873	NC_008322	ATT	2	6	110328	110333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1874	NC_008322	ACTC	2	8	110387	110394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1996	NC_008322	CCG	2	6	116670	116675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045614
1997	NC_008322	CAT	2	6	116677	116682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045614
1998	NC_008322	TCAC	2	8	116801	116808	25 %	25 %	0 %	50 %	114045614
1999	NC_008322	CTC	2	6	116900	116905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045614
2000	NC_008322	GGC	2	6	116906	116911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045614

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