MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008322	AAT	2	6	58482	58487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045561
1002	NC_008322	GT	3	6	58579	58584	0 %	50 %	50 %	0 %	114045561
1003	NC_008322	CAA	2	6	58588	58593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045561
1004	NC_008322	TTC	2	6	58625	58630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045561
1005	NC_008322	CTT	2	6	58767	58772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045561
1006	NC_008322	AT	3	6	58812	58817	50 %	50 %	0 %	0 %	114045561
1007	NC_008322	TTCA	2	8	58994	59001	25 %	50 %	0 %	25 %	114045561
1008	NC_008322	TAT	2	6	59071	59076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045561
1009	NC_008322	CT	3	6	59077	59082	0 %	50 %	0 %	50 %	114045561
1010	NC_008322	TCG	2	6	59087	59092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045561
1011	NC_008322	AT	3	6	59094	59099	50 %	50 %	0 %	0 %	114045561
1012	NC_008322	CGT	2	6	59116	59121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045561
1013	NC_008322	CCAT	2	8	59135	59142	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_008322	AATT	2	8	59178	59185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008322	ACA	2	6	59196	59201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_008322	TAATC	2	10	59313	59322	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1017	NC_008322	T	6	6	59358	59363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008322	AGTC	2	8	59379	59386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_008322	CAAT	2	8	59411	59418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_008322	T	6	6	59458	59463	0 %	100 %	0 %	0 %	114045562
1021	NC_008322	CAT	2	6	59520	59525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045562
1022	NC_008322	ATA	2	6	59530	59535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045562
1023	NC_008322	GCCA	2	8	59665	59672	25 %	0 %	25 %	50 %	114045562
1024	NC_008322	ATC	2	6	59689	59694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045562
1025	NC_008322	GCC	3	9	59841	59849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045562
1026	NC_008322	GTT	2	6	60000	60005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045562
1027	NC_008322	ATC	2	6	60064	60069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045562
1028	NC_008322	GCC	2	6	60141	60146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045562
1029	NC_008322	AATA	2	8	60150	60157	75 %	25 %	0 %	0 %	114045562
1030	NC_008322	TTA	2	6	60235	60240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045562
1031	NC_008322	CGC	2	6	60296	60301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045562
1032	NC_008322	CTT	2	6	60410	60415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045562
1033	NC_008322	TGC	2	6	60427	60432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045562
1034	NC_008322	TCA	2	6	60482	60487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045562
1035	NC_008322	GCC	2	6	60495	60500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045562
1036	NC_008322	AC	3	6	60545	60550	50 %	0 %	0 %	50 %	114045562
1037	NC_008322	CGA	2	6	60560	60565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045562
1038	NC_008322	CCG	2	6	60587	60592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045562
1039	NC_008322	AAGC	2	8	60654	60661	50 %	0 %	25 %	25 %	114045562
1040	NC_008322	CAG	2	6	60678	60683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045562
1041	NC_008322	GGC	2	6	60709	60714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045562
1042	NC_008322	GC	3	6	60713	60718	0 %	0 %	50 %	50 %	114045562
1043	NC_008322	T	6	6	60726	60731	0 %	100 %	0 %	0 %	114045562
1044	NC_008322	GT	3	6	60743	60748	0 %	50 %	50 %	0 %	114045562
1045	NC_008322	TG	3	6	60850	60855	0 %	50 %	50 %	0 %	114045563
1046	NC_008322	GTG	2	6	61001	61006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045563
1047	NC_008322	CAA	2	6	61035	61040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045563
1048	NC_008322	TTC	2	6	61117	61122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045563
1049	NC_008322	AAT	2	6	61132	61137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045563
1050	NC_008322	GGGC	2	8	61530	61537	0 %	0 %	75 %	25 %	114045564
1051	NC_008322	GCT	2	6	61583	61588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045564
1052	NC_008322	TCG	2	6	61591	61596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045564
1053	NC_008322	TGA	2	6	61657	61662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045564
1054	NC_008322	GCA	2	6	61682	61687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045564
1055	NC_008322	AGTG	2	8	61755	61762	25 %	25 %	50 %	0 %	114045564
1056	NC_008322	CAGC	2	8	61779	61786	25 %	0 %	25 %	50 %	114045564
1057	NC_008322	GCT	2	6	61794	61799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045564
1058	NC_008322	GCA	2	6	61826	61831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045564
1059	NC_008322	T	6	6	61952	61957	0 %	100 %	0 %	0 %	114045564
1060	NC_008322	TCC	2	6	61960	61965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045564
1061	NC_008322	CTG	2	6	62004	62009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045564
1062	NC_008322	CCATCG	2	12	62035	62046	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114045564
1063	NC_008322	TGG	2	6	62080	62085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045564
1064	NC_008322	TGG	2	6	62117	62122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045564
1065	NC_008322	TCA	2	6	62185	62190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045564
1066	NC_008322	CCA	2	6	62192	62197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045564
1067	NC_008322	GCC	2	6	62221	62226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045565
1068	NC_008322	TGC	2	6	62288	62293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045565
1069	NC_008322	TAA	2	6	62306	62311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045565
1070	NC_008322	GCA	2	6	62441	62446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045565
1071	NC_008322	TGG	2	6	62452	62457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045565
1072	NC_008322	AG	3	6	62542	62547	50 %	0 %	50 %	0 %	114045565
1073	NC_008322	TGT	2	6	62683	62688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045565
1074	NC_008322	AT	3	6	62716	62721	50 %	50 %	0 %	0 %	114045565
1075	NC_008322	CGG	3	9	62741	62749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045565
1076	NC_008322	CTC	2	6	62763	62768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045565
1077	NC_008322	GCG	2	6	62837	62842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045565
1078	NC_008322	AG	3	6	62862	62867	50 %	0 %	50 %	0 %	114045565
1079	NC_008322	CTG	3	9	62904	62912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045565
1080	NC_008322	GCG	2	6	62913	62918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045565
1081	NC_008322	TGC	2	6	62936	62941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045565
1082	NC_008322	GCG	2	6	63014	63019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045565
1083	NC_008322	A	6	6	63028	63033	100 %	0 %	0 %	0 %	114045565
1084	NC_008322	AGT	2	6	63124	63129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045565
1085	NC_008322	AATC	2	8	63155	63162	50 %	25 %	0 %	25 %	114045565
1086	NC_008322	GAGCA	2	10	63174	63183	40 %	0 %	40 %	20 %	114045565
1087	NC_008322	TGCG	2	8	63217	63224	0 %	25 %	50 %	25 %	114045565
1088	NC_008322	A	6	6	63325	63330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008322	TGT	2	6	63363	63368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_008322	CAGG	2	8	63382	63389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_008322	GCG	2	6	63505	63510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045566
1092	NC_008322	CCA	2	6	63620	63625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045566
1093	NC_008322	GC	3	6	63649	63654	0 %	0 %	50 %	50 %	114045566
1094	NC_008322	CAG	2	6	63662	63667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045566
1095	NC_008322	GCA	2	6	63709	63714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045566
1096	NC_008322	TCG	3	9	63750	63758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045566
1097	NC_008322	GCG	2	6	63837	63842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045566
1098	NC_008322	CGA	2	6	63856	63861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045566
1099	NC_008322	CAAT	2	8	63907	63914	50 %	25 %	0 %	25 %	114045566
1100	NC_008322	CGCC	2	8	63928	63935	0 %	0 %	25 %	75 %	114045566
1101	NC_008322	GCAT	2	8	64023	64030	25 %	25 %	25 %	25 %	114045566
1102	NC_008322	TCA	2	6	64084	64089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045566
1103	NC_008322	CATT	2	8	64204	64211	25 %	50 %	0 %	25 %	114045566
1104	NC_008322	GCC	2	6	64382	64387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045566
1105	NC_008322	AC	3	6	64440	64445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_008322	TTAG	2	8	64446	64453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008322	TAGA	2	8	64550	64557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008322	CTTTA	2	10	64623	64632	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1109	NC_008322	GGC	2	6	64782	64787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_008322	TAACAC	2	12	64829	64840	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_008322	ATG	2	6	64914	64919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045567
1112	NC_008322	TGA	2	6	64954	64959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045567
1113	NC_008322	GGC	2	6	65042	65047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045567
1114	NC_008322	GC	3	6	65101	65106	0 %	0 %	50 %	50 %	114045567
1115	NC_008322	ATT	2	6	65130	65135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045567
1116	NC_008322	CGG	2	6	65138	65143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045567
1117	NC_008322	TGAT	2	8	65206	65213	25 %	50 %	25 %	0 %	114045567
1118	NC_008322	ATGG	2	8	65214	65221	25 %	25 %	50 %	0 %	114045567
1119	NC_008322	ATT	2	6	65253	65258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045567
1120	NC_008322	GCG	2	6	65325	65330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045567
1121	NC_008322	TGT	2	6	65335	65340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045567
1122	NC_008322	TGT	2	6	65356	65361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045567
1123	NC_008322	GCT	2	6	65369	65374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045567
1124	NC_008322	TG	3	6	65441	65446	0 %	50 %	50 %	0 %	114045567
1125	NC_008322	ATC	2	6	65457	65462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045567
1126	NC_008322	CGA	2	6	65480	65485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045567
1127	NC_008322	CAA	2	6	65537	65542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045567
1128	NC_008322	ACCTT	2	10	65544	65553	20 %	40 %	0 %	40 %	114045567
1129	NC_008322	ATGCCG	2	12	65617	65628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114045567
1130	NC_008322	TAC	2	6	65682	65687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045567
1131	NC_008322	TCA	2	6	65699	65704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045567
1132	NC_008322	ATT	2	6	65751	65756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045567
1133	NC_008322	AAC	2	6	65757	65762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045567
1134	NC_008322	TCA	2	6	65800	65805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045567
1135	NC_008322	TAC	2	6	65853	65858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045567
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1137	NC_008322	TCT	2	6	66042	66047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045567
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1140	NC_008322	AAG	3	9	66148	66156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045567
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1142	NC_008322	CGA	2	6	66230	66235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045567
1143	NC_008322	TG	3	6	66246	66251	0 %	50 %	50 %	0 %	114045567
1144	NC_008322	TGG	2	6	66274	66279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045567
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1146	NC_008322	CGTG	2	8	66371	66378	0 %	25 %	50 %	25 %	114045567
1147	NC_008322	CGC	2	6	66419	66424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045567
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1150	NC_008322	CAT	2	6	66577	66582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045568
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1152	NC_008322	ATC	2	6	66890	66895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045568
1153	NC_008322	GCA	2	6	66943	66948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045568
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1155	NC_008322	ACCG	2	8	67073	67080	25 %	0 %	25 %	50 %	114045568
1156	NC_008322	CCG	2	6	67125	67130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045568
1157	NC_008322	CAA	2	6	67171	67176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045568
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1161	NC_008322	TC	3	6	67356	67361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1162	NC_008322	CAT	2	6	67401	67406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045569
1163	NC_008322	TAT	2	6	67452	67457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045569
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1167	NC_008322	TGA	2	6	67697	67702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045569
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1172	NC_008322	TGA	2	6	67955	67960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045569
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1184	NC_008322	GTT	2	6	68792	68797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045570
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1195	NC_008322	ATA	2	6	69430	69435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1200	NC_008322	T	6	6	69649	69654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1246	NC_008322	TGG	2	6	71888	71893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045573
1247	NC_008322	GA	3	6	71904	71909	50 %	0 %	50 %	0 %	114045573
1248	NC_008322	GCC	2	6	71981	71986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045573
1249	NC_008322	GAT	2	6	71998	72003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045573
1250	NC_008322	CTT	2	6	72004	72009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045573
1251	NC_008322	GGTC	2	8	72028	72035	0 %	25 %	50 %	25 %	114045573
1252	NC_008322	TGC	2	6	72063	72068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045573
1253	NC_008322	CCA	2	6	72102	72107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045573
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1255	NC_008322	TGG	2	6	72243	72248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045573
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1259	NC_008322	TTG	2	6	72577	72582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1260	NC_008322	ACG	2	6	72587	72592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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