MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_008322	CAG	2	6	592575	592580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046025
10502	NC_008322	CG	3	6	592624	592629	0 %	0 %	50 %	50 %	114046025
10503	NC_008322	TCT	2	6	592698	592703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_008322	TAC	2	6	592733	592738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_008322	T	7	7	592785	592791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_008322	CTAA	2	8	592815	592822	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10507	NC_008322	ATG	2	6	592858	592863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046026
10508	NC_008322	AGAA	2	8	592865	592872	75 %	0 %	25 %	0 %	114046026
10509	NC_008322	CTT	2	6	593066	593071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046026
10510	NC_008322	GAG	2	6	593095	593100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046026
10511	NC_008322	CTG	2	6	593121	593126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046026
10512	NC_008322	GC	3	6	593139	593144	0 %	0 %	50 %	50 %	114046026
10513	NC_008322	ATT	2	6	593203	593208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046026
10514	NC_008322	GC	3	6	593214	593219	0 %	0 %	50 %	50 %	114046026
10515	NC_008322	GTT	2	6	593223	593228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046026
10516	NC_008322	CAT	2	6	593268	593273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046026
10517	NC_008322	TGAG	2	8	593328	593335	25 %	25 %	50 %	0 %	114046026
10518	NC_008322	CAA	2	6	593355	593360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046027
10519	NC_008322	ATG	2	6	593433	593438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046027
10520	NC_008322	GTG	2	6	593469	593474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046027
10521	NC_008322	GAA	2	6	593522	593527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046027
10522	NC_008322	GTT	2	6	593654	593659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046027
10523	NC_008322	GGC	2	6	593660	593665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046027
10524	NC_008322	CAA	2	6	593700	593705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046027
10525	NC_008322	CAG	2	6	593760	593765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046027
10526	NC_008322	GCC	3	9	593793	593801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046027
10527	NC_008322	GCC	2	6	593817	593822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046027
10528	NC_008322	CAAG	2	8	593889	593896	50 %	0 %	25 %	25 %	114046027
10529	NC_008322	ATT	2	6	594045	594050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046027
10530	NC_008322	A	6	6	594064	594069	100 %	0 %	0 %	0 %	114046027
10531	NC_008322	G	6	6	594076	594081	0 %	0 %	100 %	0 %	114046027
10532	NC_008322	GCG	2	6	594204	594209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046027
10533	NC_008322	CAG	2	6	594295	594300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046027
10534	NC_008322	TGT	2	6	594419	594424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046028
10535	NC_008322	ACC	2	6	594442	594447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046028
10536	NC_008322	GGC	2	6	594481	594486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046028
10537	NC_008322	T	6	6	594535	594540	0 %	100 %	0 %	0 %	114046028
10538	NC_008322	TTA	2	6	594556	594561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046028
10539	NC_008322	TGA	2	6	594578	594583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046028
10540	NC_008322	ATGCG	2	10	594590	594599	20 %	20 %	40 %	20 %	114046028
10541	NC_008322	TTC	2	6	594655	594660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046028
10542	NC_008322	TGA	2	6	594677	594682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046028
10543	NC_008322	CTGTTT	2	12	594739	594750	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	114046028
10544	NC_008322	TGC	2	6	594782	594787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046028
10545	NC_008322	TGA	2	6	594875	594880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046028
10546	NC_008322	GCACC	2	10	594934	594943	20 %	0 %	20 %	60 %	114046028
10547	NC_008322	CT	3	6	594985	594990	0 %	50 %	0 %	50 %	114046028
10548	NC_008322	ACC	2	6	595042	595047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046028
10549	NC_008322	CG	3	6	595102	595107	0 %	0 %	50 %	50 %	114046028
10550	NC_008322	TTG	2	6	595174	595179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046028
10551	NC_008322	GCT	2	6	595194	595199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046028
10552	NC_008322	TGT	2	6	595214	595219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046028
10553	NC_008322	AGG	2	6	595238	595243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046028
10554	NC_008322	ACC	2	6	595276	595281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046028
10555	NC_008322	AGT	2	6	595351	595356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046028
10556	NC_008322	TTA	2	6	595440	595445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046028
10557	NC_008322	AATAT	2	10	595448	595457	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_008322	T	7	7	595462	595468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_008322	TGT	2	6	595499	595504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_008322	CAC	2	6	595540	595545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10561	NC_008322	TAGCCA	2	12	595704	595715	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114046029
10562	NC_008322	CAC	2	6	595828	595833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046029
10563	NC_008322	ACA	2	6	595840	595845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046029
10564	NC_008322	ATG	2	6	595877	595882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046029
10565	NC_008322	GTG	2	6	595977	595982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046029
10566	NC_008322	CGA	2	6	595999	596004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046029
10567	NC_008322	GC	3	6	596009	596014	0 %	0 %	50 %	50 %	114046029
10568	NC_008322	GGC	2	6	596087	596092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046029
10569	NC_008322	CAG	2	6	596114	596119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046029
10570	NC_008322	ATG	2	6	596186	596191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046029
10571	NC_008322	CCG	3	9	596214	596222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046029
10572	NC_008322	ACT	2	6	596241	596246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046029
10573	NC_008322	TCT	2	6	596280	596285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046030
10574	NC_008322	CAG	2	6	596487	596492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046030
10575	NC_008322	GA	3	6	596495	596500	50 %	0 %	50 %	0 %	114046030
10576	NC_008322	A	6	6	596610	596615	100 %	0 %	0 %	0 %	114046030
10577	NC_008322	CT	3	6	597023	597028	0 %	50 %	0 %	50 %	114046030
10578	NC_008322	GCC	2	6	597029	597034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046030
10579	NC_008322	TTC	2	6	597096	597101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046030
10580	NC_008322	ACT	2	6	597256	597261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046030
10581	NC_008322	A	6	6	597318	597323	100 %	0 %	0 %	0 %	114046030
10582	NC_008322	AGC	2	6	597333	597338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10583	NC_008322	AGG	2	6	597489	597494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_008322	TCC	2	6	597508	597513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10585	NC_008322	C	6	6	597611	597616	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10586	NC_008322	TTC	2	6	597654	597659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10587	NC_008322	GTC	2	6	597740	597745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10588	NC_008322	ATT	2	6	597834	597839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_008322	ATT	2	6	597860	597865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_008322	CTGATG	2	12	597934	597945	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10591	NC_008322	ATT	2	6	597967	597972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_008322	GGTT	2	8	598005	598012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_008322	AGA	2	6	598019	598024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_008322	TATTT	2	10	598070	598079	20 %	80 %	0 %	0 %	114046031
10595	NC_008322	TGC	2	6	598081	598086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046031
10596	NC_008322	AAG	2	6	598145	598150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046031
10597	NC_008322	CTCCA	2	10	598188	598197	20 %	20 %	0 %	60 %	114046031
10598	NC_008322	TGT	2	6	598272	598277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046031
10599	NC_008322	AT	3	6	598316	598321	50 %	50 %	0 %	0 %	114046031
10600	NC_008322	TTG	2	6	598352	598357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046031
10601	NC_008322	CTGG	2	8	598386	598393	0 %	25 %	50 %	25 %	114046031
10602	NC_008322	ATA	2	6	598500	598505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_008322	GTT	2	6	598562	598567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_008322	AAT	2	6	598609	598614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_008322	AATG	2	8	598654	598661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_008322	TAAA	2	8	598749	598756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_008322	AT	3	6	598803	598808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_008322	TTAG	2	8	598881	598888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_008322	TGA	2	6	598897	598902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_008322	TGA	2	6	598970	598975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046032
10611	NC_008322	ATT	2	6	598983	598988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046032
10612	NC_008322	A	6	6	599001	599006	100 %	0 %	0 %	0 %	114046032
10613	NC_008322	ATT	3	9	599009	599017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046032
10614	NC_008322	GGC	2	6	599213	599218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046032
10615	NC_008322	ATT	2	6	599270	599275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046032
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10617	NC_008322	TTC	2	6	599500	599505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046033
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10621	NC_008322	ACC	2	6	599834	599839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046033
10622	NC_008322	TCA	2	6	599864	599869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046033
10623	NC_008322	CTT	2	6	599987	599992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046033
10624	NC_008322	CGG	2	6	600123	600128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046033
10625	NC_008322	TGC	2	6	600133	600138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046033
10626	NC_008322	CTT	2	6	600168	600173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046033
10627	NC_008322	TCT	2	6	600248	600253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046033
10628	NC_008322	AAG	2	6	600830	600835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046034
10629	NC_008322	ACCA	2	8	600839	600846	50 %	0 %	0 %	50 %	114046034
10630	NC_008322	CTTG	2	8	600905	600912	0 %	50 %	25 %	25 %	114046034
10631	NC_008322	TTGA	2	8	600997	601004	25 %	50 %	25 %	0 %	114046034
10632	NC_008322	AGC	2	6	601099	601104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046034
10633	NC_008322	GTG	2	6	601137	601142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046034
10634	NC_008322	CGG	2	6	601221	601226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046034
10635	NC_008322	CAT	2	6	601239	601244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046034
10636	NC_008322	GATA	2	8	601248	601255	50 %	25 %	25 %	0 %	114046034
10637	NC_008322	T	6	6	601269	601274	0 %	100 %	0 %	0 %	114046034
10638	NC_008322	CTG	2	6	601330	601335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046034
10639	NC_008322	CTG	2	6	601345	601350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046034
10640	NC_008322	CTT	2	6	601389	601394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046034
10641	NC_008322	TGC	3	9	601444	601452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046034
10642	NC_008322	GTCT	2	8	601480	601487	0 %	50 %	25 %	25 %	114046034
10643	NC_008322	TGC	2	6	601632	601637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10644	NC_008322	GATT	2	8	601690	601697	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10645	NC_008322	GC	3	6	601759	601764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10646	NC_008322	TAC	2	6	601796	601801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10647	NC_008322	TTG	2	6	601865	601870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046035
10648	NC_008322	GTT	2	6	601888	601893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046035
10649	NC_008322	TGACTT	2	12	601947	601958	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	114046035
10650	NC_008322	T	6	6	601966	601971	0 %	100 %	0 %	0 %	114046035
10651	NC_008322	CTC	2	6	601979	601984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114046035
10652	NC_008322	GCG	2	6	602135	602140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046035
10653	NC_008322	GGC	2	6	602180	602185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046035
10654	NC_008322	T	6	6	602192	602197	0 %	100 %	0 %	0 %	114046035
10655	NC_008322	GTT	2	6	602226	602231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046035
10656	NC_008322	GATGTT	2	12	602251	602262	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	114046035
10657	NC_008322	TGA	2	6	602319	602324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046035
10658	NC_008322	GCT	2	6	602362	602367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046035
10659	NC_008322	GCC	2	6	602513	602518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046035
10660	NC_008322	GCT	2	6	602538	602543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046035
10661	NC_008322	TTTAGC	2	12	602609	602620	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	114046035
10662	NC_008322	TGG	2	6	602648	602653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046035
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10664	NC_008322	TGG	2	6	602727	602732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046035
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10675	NC_008322	TTG	2	6	603617	603622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046037
10676	NC_008322	CGG	2	6	603631	603636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046037
10677	NC_008322	GAG	2	6	603716	603721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114046037
10678	NC_008322	T	6	6	603839	603844	0 %	100 %	0 %	0 %	114046037
10679	NC_008322	TAA	2	6	603984	603989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10680	NC_008322	TAGC	2	8	604013	604020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10681	NC_008322	TGA	2	6	604029	604034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10682	NC_008322	A	6	6	604060	604065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10683	NC_008322	A	6	6	604166	604171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10684	NC_008322	T	6	6	604186	604191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10685	NC_008322	GTTT	2	8	604197	604204	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10686	NC_008322	CTG	2	6	604274	604279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046038
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10689	NC_008322	TTC	2	6	604462	604467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046038
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10691	NC_008322	CTT	2	6	604481	604486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046038
10692	NC_008322	ATAAC	2	10	604630	604639	60 %	20 %	0 %	20 %	114046038
10693	NC_008322	GGCT	2	8	604688	604695	0 %	25 %	50 %	25 %	114046038
10694	NC_008322	CAC	2	6	604748	604753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046038
10695	NC_008322	GCA	2	6	604835	604840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046038
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10698	NC_008322	GAC	2	6	604961	604966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046038
10699	NC_008322	GTTG	2	8	605016	605023	0 %	50 %	50 %	0 %	114046038
10700	NC_008322	GCA	2	6	605039	605044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046038
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10702	NC_008322	GTT	2	6	605240	605245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046038
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10711	NC_008322	TCG	2	6	605605	605610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046038
10712	NC_008322	TCG	2	6	605632	605637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046038
10713	NC_008322	TCG	2	6	605641	605646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046038
10714	NC_008322	ATGC	2	8	605763	605770	25 %	25 %	25 %	25 %	114046038
10715	NC_008322	GCT	2	6	605823	605828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046038
10716	NC_008322	TTG	2	6	605908	605913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046038
10717	NC_008322	TACCTG	2	12	605942	605953	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114046038
10718	NC_008322	GCCA	2	8	605979	605986	25 %	0 %	25 %	50 %	114046038
10719	NC_008322	GATTG	2	10	606007	606016	20 %	40 %	40 %	0 %	114046038
10720	NC_008322	CAA	2	6	606054	606059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046038
10721	NC_008322	CAGA	2	8	606154	606161	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10722	NC_008322	AGC	2	6	606207	606212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10723	NC_008322	TG	3	6	606214	606219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10724	NC_008322	CTGA	2	8	606233	606240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10725	NC_008322	T	6	6	606266	606271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10726	NC_008322	CCG	2	6	606360	606365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046039
10727	NC_008322	GGTAT	2	10	606406	606415	20 %	40 %	40 %	0 %	114046039
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10729	NC_008322	GGGTC	2	10	606631	606640	0 %	20 %	60 %	20 %	114046039
10730	NC_008322	GCT	2	6	606696	606701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046039
10731	NC_008322	CGA	2	6	606711	606716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046039
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10734	NC_008322	GGC	2	6	606841	606846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046039
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10739	NC_008322	CCA	2	6	606966	606971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046039
10740	NC_008322	GTT	2	6	607053	607058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046039
10741	NC_008322	GGC	2	6	607090	607095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046039
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10743	NC_008322	AATCG	2	10	607184	607193	40 %	20 %	20 %	20 %	114046039
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10988	NC_008322	CAG	2	6	622919	622924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046048
10989	NC_008322	TAA	2	6	622971	622976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046048
10990	NC_008322	GC	3	6	623041	623046	0 %	0 %	50 %	50 %	114046048
10991	NC_008322	ATC	2	6	623076	623081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046048
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10993	NC_008322	CA	3	6	623155	623160	50 %	0 %	0 %	50 %	114046048
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10996	NC_008322	ACC	2	6	623459	623464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10997	NC_008322	ATTTAG	2	12	623473	623484	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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10999	NC_008322	AG	3	6	623530	623535	50 %	0 %	50 %	0 %	114046049
11000	NC_008322	TGC	2	6	623752	623757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046049

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