MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008322	TCCAT	2	10	564711	564720	20 %	40 %	0 %	40 %	114046003
10002	NC_008322	AGTT	2	8	564730	564737	25 %	50 %	25 %	0 %	114046003
10003	NC_008322	CCA	2	6	564774	564779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046003
10004	NC_008322	GAA	2	6	564815	564820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046003
10005	NC_008322	GTA	2	6	564966	564971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046003
10006	NC_008322	TCG	3	9	565063	565071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046003
10007	NC_008322	CT	3	6	565245	565250	0 %	50 %	0 %	50 %	114046003
10008	NC_008322	GCGCTG	2	12	565251	565262	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114046003
10009	NC_008322	CCG	2	6	565281	565286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046003
10010	NC_008322	TGC	2	6	565317	565322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046003
10011	NC_008322	GGCT	2	8	565325	565332	0 %	25 %	50 %	25 %	114046003
10012	NC_008322	TGA	2	6	565367	565372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046003
10013	NC_008322	TTGG	2	8	565412	565419	0 %	50 %	50 %	0 %	114046003
10014	NC_008322	CGA	2	6	565516	565521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046003
10015	NC_008322	CGCT	2	8	565533	565540	0 %	25 %	25 %	50 %	114046003
10016	NC_008322	CGT	2	6	565592	565597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046003
10017	NC_008322	ATT	2	6	565619	565624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046003
10018	NC_008322	GATG	2	8	565652	565659	25 %	25 %	50 %	0 %	114046003
10019	NC_008322	GCC	2	6	565730	565735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046003
10020	NC_008322	TTCC	2	8	565789	565796	0 %	50 %	0 %	50 %	114046003
10021	NC_008322	CTG	2	6	565803	565808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046003
10022	NC_008322	GCT	3	9	565877	565885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046003
10023	NC_008322	TCA	2	6	566100	566105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046003
10024	NC_008322	GATG	2	8	566165	566172	25 %	25 %	50 %	0 %	114046003
10025	NC_008322	GTG	2	6	566247	566252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046003
10026	NC_008322	AAC	2	6	566303	566308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046003
10027	NC_008322	GGTC	2	8	566359	566366	0 %	25 %	50 %	25 %	114046003
10028	NC_008322	CT	3	6	566377	566382	0 %	50 %	0 %	50 %	114046003
10029	NC_008322	TTG	2	6	566651	566656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_008322	TGA	2	6	566711	566716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046004
10031	NC_008322	TCTG	2	8	566776	566783	0 %	50 %	25 %	25 %	114046004
10032	NC_008322	GTT	3	9	566885	566893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046004
10033	NC_008322	AGCG	2	8	566909	566916	25 %	0 %	50 %	25 %	114046004
10034	NC_008322	AT	3	6	566961	566966	50 %	50 %	0 %	0 %	114046004
10035	NC_008322	GGC	2	6	566974	566979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046004
10036	NC_008322	AGC	2	6	567104	567109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046004
10037	NC_008322	GTT	2	6	567166	567171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046004
10038	NC_008322	CAA	2	6	567190	567195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046004
10039	NC_008322	TAA	3	9	567232	567240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_008322	GC	3	6	567303	567308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10041	NC_008322	AATA	2	8	567309	567316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_008322	GCC	2	6	567468	567473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046005
10043	NC_008322	ACA	2	6	567491	567496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114046005
10044	NC_008322	AAG	2	6	567523	567528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046005
10045	NC_008322	TAA	2	6	567545	567550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046005
10046	NC_008322	GCG	2	6	567648	567653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046005
10047	NC_008322	TAT	2	6	567744	567749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046005
10048	NC_008322	CGA	2	6	567767	567772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046005
10049	NC_008322	CTT	2	6	567896	567901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046005
10050	NC_008322	GCA	2	6	567964	567969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046005
10051	NC_008322	GATTAC	2	12	567978	567989	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	114046005
10052	NC_008322	GGT	2	6	568164	568169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046005
10053	NC_008322	GAA	2	6	568242	568247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046005
10054	NC_008322	CTG	2	6	568257	568262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046005
10055	NC_008322	GC	3	6	568264	568269	0 %	0 %	50 %	50 %	114046005
10056	NC_008322	CAT	2	6	568319	568324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046005
10057	NC_008322	CTG	2	6	568350	568355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046005
10058	NC_008322	GC	3	6	568368	568373	0 %	0 %	50 %	50 %	114046005
10059	NC_008322	ATT	2	6	568528	568533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046005
10060	NC_008322	CGG	2	6	568679	568684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046005
10061	NC_008322	TTA	2	6	568689	568694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046005
10062	NC_008322	TAAC	2	8	568715	568722	50 %	25 %	0 %	25 %	114046005
10063	NC_008322	TAGC	2	8	568821	568828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_008322	TAGC	2	8	568840	568847	25 %	25 %	25 %	25 %	114046006
10065	NC_008322	CCA	2	6	568891	568896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046006
10066	NC_008322	ACC	2	6	568929	568934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046006
10067	NC_008322	GTA	2	6	568947	568952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046006
10068	NC_008322	GTT	2	6	568965	568970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046006
10069	NC_008322	TGC	3	9	569006	569014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046006
10070	NC_008322	GCG	2	6	569055	569060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046006
10071	NC_008322	ATC	2	6	569061	569066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046006
10072	NC_008322	TTTGA	2	10	569157	569166	20 %	60 %	20 %	0 %	114046006
10073	NC_008322	TCGC	2	8	569190	569197	0 %	25 %	25 %	50 %	114046006
10074	NC_008322	GC	3	6	569579	569584	0 %	0 %	50 %	50 %	114046006
10075	NC_008322	TTG	2	6	569613	569618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046006
10076	NC_008322	CAT	2	6	569733	569738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046006
10077	NC_008322	ACC	2	6	569810	569815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114046006
10078	NC_008322	TGC	2	6	569833	569838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046006
10079	NC_008322	GCG	2	6	569854	569859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046006
10080	NC_008322	CGG	2	6	569860	569865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046006
10081	NC_008322	CGT	2	6	569873	569878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046006
10082	NC_008322	TGATAT	2	12	569879	569890	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	114046006
10083	NC_008322	CAT	2	6	569904	569909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046006
10084	NC_008322	ATC	2	6	569934	569939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046006
10085	NC_008322	T	6	6	570059	570064	0 %	100 %	0 %	0 %	114046006
10086	NC_008322	GAA	2	6	570072	570077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046006
10087	NC_008322	CGT	2	6	570128	570133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046006
10088	NC_008322	GTT	3	9	570251	570259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114046006
10089	NC_008322	AAG	2	6	570421	570426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114046006
10090	NC_008322	TGC	2	6	570437	570442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046006
10091	NC_008322	CGC	2	6	570461	570466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046006
10092	NC_008322	TGTCGC	2	12	570482	570493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046006
10093	NC_008322	CGC	2	6	570542	570547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046006
10094	NC_008322	TGATT	2	10	570590	570599	20 %	60 %	20 %	0 %	114046006
10095	NC_008322	GTG	2	6	570617	570622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046006
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10099	NC_008322	TCG	2	6	570847	570852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046006
10100	NC_008322	GC	3	6	570896	570901	0 %	0 %	50 %	50 %	114046006
10101	NC_008322	ATC	2	6	571003	571008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_008322	GCG	2	6	571106	571111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_008322	GGC	2	6	571183	571188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046007
10104	NC_008322	GGC	2	6	571302	571307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046007
10105	NC_008322	T	7	7	571308	571314	0 %	100 %	0 %	0 %	114046007
10106	NC_008322	GCT	2	6	571341	571346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046007
10107	NC_008322	GCA	2	6	571348	571353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046007
10108	NC_008322	GCT	2	6	571386	571391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046007
10109	NC_008322	GTA	2	6	571396	571401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046007
10110	NC_008322	TGG	2	6	571407	571412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046007
10111	NC_008322	A	7	7	571426	571432	100 %	0 %	0 %	0 %	114046007
10112	NC_008322	TGGC	2	8	571439	571446	0 %	25 %	50 %	25 %	114046007
10113	NC_008322	AACG	2	8	571580	571587	50 %	0 %	25 %	25 %	114046007
10114	NC_008322	CGG	2	6	571593	571598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046007
10115	NC_008322	GC	3	6	571622	571627	0 %	0 %	50 %	50 %	114046007
10116	NC_008322	A	6	6	571648	571653	100 %	0 %	0 %	0 %	114046007
10117	NC_008322	GC	3	6	571664	571669	0 %	0 %	50 %	50 %	114046007
10118	NC_008322	CGG	3	9	571779	571787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046007
10119	NC_008322	GATA	2	8	571791	571798	50 %	25 %	25 %	0 %	114046007
10120	NC_008322	AAGG	2	8	571839	571846	50 %	0 %	50 %	0 %	114046007
10121	NC_008322	ATG	2	6	571874	571879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046007
10122	NC_008322	TAAG	2	8	571944	571951	50 %	25 %	25 %	0 %	114046007
10123	NC_008322	ATAA	2	8	571957	571964	75 %	25 %	0 %	0 %	114046007
10124	NC_008322	GCC	2	6	572016	572021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10125	NC_008322	TAT	2	6	572071	572076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_008322	ATA	2	6	572107	572112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_008322	ACT	2	6	572131	572136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_008322	CGC	2	6	572177	572182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10129	NC_008322	ATGAA	2	10	572210	572219	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_008322	GAG	2	6	572222	572227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_008322	GTG	2	6	572311	572316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046008
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10134	NC_008322	A	6	6	572645	572650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10135	NC_008322	CGAAT	2	10	572711	572720	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10136	NC_008322	ATC	2	6	572774	572779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046009
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10143	NC_008322	TCT	3	9	573174	573182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046009
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10152	NC_008322	TCT	2	6	573900	573905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046009
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10160	NC_008322	CGC	2	6	574347	574352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10162	NC_008322	A	6	6	574419	574424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_008322	A	7	7	574430	574436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10164	NC_008322	ATG	2	6	574480	574485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10200	NC_008322	TGT	2	6	576930	576935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10201	NC_008322	TAG	2	6	576943	576948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10230	NC_008322	CTG	2	6	577962	577967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046012
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10232	NC_008322	AT	3	6	578057	578062	50 %	50 %	0 %	0 %	114046012
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10235	NC_008322	A	7	7	578173	578179	100 %	0 %	0 %	0 %	114046012
10236	NC_008322	TATAGA	2	12	578234	578245	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	114046012
10237	NC_008322	TAC	2	6	578252	578257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046012
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10239	NC_008322	CTTG	2	8	578397	578404	0 %	50 %	25 %	25 %	114046013
10240	NC_008322	ACT	2	6	578418	578423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046013
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10242	NC_008322	TTA	2	6	578459	578464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046013
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10244	NC_008322	T	6	6	578515	578520	0 %	100 %	0 %	0 %	114046013
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10363	NC_008322	CCGA	2	8	585133	585140	25 %	0 %	25 %	50 %	114046018
10364	NC_008322	G	6	6	585271	585276	0 %	0 %	100 %	0 %	114046018
10365	NC_008322	ATC	2	6	585339	585344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046019
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10367	NC_008322	ATTGGC	2	12	585390	585401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114046019
10368	NC_008322	TAA	2	6	585413	585418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114046019
10369	NC_008322	GCT	2	6	585456	585461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046019
10370	NC_008322	ATT	2	6	585462	585467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114046019
10371	NC_008322	ACT	2	6	585590	585595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046019
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10373	NC_008322	GCT	2	6	585689	585694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046019
10374	NC_008322	TGC	2	6	585721	585726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046019
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10387	NC_008322	T	7	7	586303	586309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10402	NC_008322	CGG	2	6	587241	587246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046021
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10405	NC_008322	TCG	2	6	587343	587348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046021
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10411	NC_008322	CTA	2	6	587572	587577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10465	NC_008322	CAAA	2	8	590554	590561	75 %	0 %	0 %	25 %	114046023
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10470	NC_008322	GCT	2	6	590870	590875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046023
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10472	NC_008322	GCA	2	6	591008	591013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046023
10473	NC_008322	GCG	2	6	591027	591032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046023
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10476	NC_008322	ATC	2	6	591124	591129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046023
10477	NC_008322	CGG	2	6	591241	591246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046023
10478	NC_008322	CTG	2	6	591279	591284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114046023
10479	NC_008322	TAA	2	6	591294	591299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10480	NC_008322	C	6	6	591300	591305	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10481	NC_008322	GAA	2	6	591313	591318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10482	NC_008322	T	7	7	591384	591390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10483	NC_008322	GGT	2	6	591418	591423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10484	NC_008322	T	6	6	591457	591462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10485	NC_008322	TCA	2	6	591605	591610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046024
10486	NC_008322	ACATTC	2	12	591617	591628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114046024
10487	NC_008322	CCG	2	6	591731	591736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114046024
10488	NC_008322	GTTT	2	8	591758	591765	0 %	75 %	25 %	0 %	114046024
10489	NC_008322	GCGT	2	8	591790	591797	0 %	25 %	50 %	25 %	114046024
10490	NC_008322	GCCGC	2	10	591849	591858	0 %	0 %	40 %	60 %	114046024
10491	NC_008322	CGA	2	6	591881	591886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114046024
10492	NC_008322	GCG	2	6	591990	591995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046024
10493	NC_008322	TTC	2	6	592149	592154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114046024
10494	NC_008322	GCG	2	6	592194	592199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114046024
10495	NC_008322	ATG	2	6	592327	592332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114046024
10496	NC_008322	TGG	2	6	592348	592353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114046024
10497	NC_008322	CGAT	2	8	592366	592373	25 %	25 %	25 %	25 %	114046024
10498	NC_008322	A	6	6	592507	592512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10499	NC_008322	CGC	2	6	592513	592518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10500	NC_008322	GCG	2	6	592525	592530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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