MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008322	TCG	2	6	29558	29563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045537
502	NC_008322	TTC	2	6	29602	29607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045537
503	NC_008322	CAC	2	6	29634	29639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045537
504	NC_008322	AG	3	6	29668	29673	50 %	0 %	50 %	0 %	114045537
505	NC_008322	ACC	2	6	29758	29763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045537
506	NC_008322	TCA	2	6	29814	29819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045537
507	NC_008322	CG	3	6	29821	29826	0 %	0 %	50 %	50 %	114045537
508	NC_008322	ATA	2	6	29873	29878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045537
509	NC_008322	CGC	2	6	29920	29925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045537
510	NC_008322	ACC	2	6	30133	30138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045537
511	NC_008322	ATAA	2	8	30176	30183	75 %	25 %	0 %	0 %	114045537
512	NC_008322	GGCA	2	8	30264	30271	25 %	0 %	50 %	25 %	114045537
513	NC_008322	ACG	2	6	30371	30376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045537
514	NC_008322	GTT	2	6	30442	30447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045537
515	NC_008322	CACC	2	8	30450	30457	25 %	0 %	0 %	75 %	114045537
516	NC_008322	TAA	2	6	30557	30562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045538
517	NC_008322	TGT	2	6	30573	30578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045538
518	NC_008322	CTG	2	6	30622	30627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045538
519	NC_008322	GT	3	6	30633	30638	0 %	50 %	50 %	0 %	114045538
520	NC_008322	TTC	2	6	30790	30795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045538
521	NC_008322	CGG	2	6	30836	30841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045538
522	NC_008322	CCA	2	6	30901	30906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045538
523	NC_008322	GCC	2	6	31057	31062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045538
524	NC_008322	GGC	2	6	31129	31134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045538
525	NC_008322	CAT	2	6	31212	31217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045538
526	NC_008322	TTAA	2	8	31379	31386	50 %	50 %	0 %	0 %	114045538
527	NC_008322	GCG	2	6	31431	31436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045538
528	NC_008322	GCA	2	6	31458	31463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045538
529	NC_008322	GAC	2	6	31471	31476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045538
530	NC_008322	CGG	2	6	31515	31520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045538
531	NC_008322	GGC	2	6	31531	31536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045538
532	NC_008322	CAA	2	6	31575	31580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045538
533	NC_008322	TGG	2	6	31589	31594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045538
534	NC_008322	GCC	2	6	31793	31798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045538
535	NC_008322	TCA	2	6	31812	31817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045538
536	NC_008322	CGC	2	6	31862	31867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045539
537	NC_008322	T	6	6	31899	31904	0 %	100 %	0 %	0 %	114045539
538	NC_008322	AC	3	6	31934	31939	50 %	0 %	0 %	50 %	114045539
539	NC_008322	T	6	6	31965	31970	0 %	100 %	0 %	0 %	114045539
540	NC_008322	ATA	2	6	31981	31986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045539
541	NC_008322	TGC	2	6	32003	32008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045539
542	NC_008322	TGG	2	6	32009	32014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045539
543	NC_008322	CTT	2	6	32096	32101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045539
544	NC_008322	CTT	3	9	32141	32149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045539
545	NC_008322	ATC	3	9	32289	32297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045539
546	NC_008322	CAG	2	6	32319	32324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045539
547	NC_008322	CG	3	6	32397	32402	0 %	0 %	50 %	50 %	114045539
548	NC_008322	GTG	2	6	32468	32473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045539
549	NC_008322	ACT	2	6	32482	32487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045539
550	NC_008322	ACC	3	9	32512	32520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045539
551	NC_008322	ATA	2	6	32521	32526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045539
552	NC_008322	GCA	2	6	32539	32544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045539
553	NC_008322	TGC	2	6	32551	32556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045539
554	NC_008322	T	6	6	32640	32645	0 %	100 %	0 %	0 %	114045539
555	NC_008322	TGTGA	2	10	32693	32702	20 %	40 %	40 %	0 %	114045539
556	NC_008322	GAT	2	6	32754	32759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045539
557	NC_008322	GACA	2	8	33019	33026	50 %	0 %	25 %	25 %	114045540
558	NC_008322	AAT	2	6	33060	33065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045540
559	NC_008322	GTT	2	6	33125	33130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045540
560	NC_008322	TGC	2	6	33150	33155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045540
561	NC_008322	ATC	2	6	33195	33200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045540
562	NC_008322	CAG	2	6	33218	33223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045540
563	NC_008322	ACTG	2	8	33342	33349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_008322	ACA	2	6	33417	33422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045541
565	NC_008322	AAG	2	6	33536	33541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045541
566	NC_008322	ATTTA	2	10	33636	33645	40 %	60 %	0 %	0 %	114045541
567	NC_008322	GTAT	2	8	33948	33955	25 %	50 %	25 %	0 %	114045541
568	NC_008322	CTT	2	6	33970	33975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045541
569	NC_008322	CAA	2	6	33976	33981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045541
570	NC_008322	AAG	2	6	34005	34010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045541
571	NC_008322	CGG	2	6	34176	34181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045541
572	NC_008322	TAA	2	6	34315	34320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045541
573	NC_008322	TGG	2	6	34368	34373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045541
574	NC_008322	GTC	2	6	34381	34386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045541
575	NC_008322	CGA	2	6	34498	34503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045541
576	NC_008322	AATT	2	8	34506	34513	50 %	50 %	0 %	0 %	114045541
577	NC_008322	AAT	2	6	34542	34547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045541
578	NC_008322	ACA	2	6	34611	34616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008322	ATT	2	6	34617	34622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008322	GAC	2	6	34639	34644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045542
581	NC_008322	TGC	2	6	34734	34739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045542
582	NC_008322	CAG	2	6	34753	34758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045542
583	NC_008322	ACC	2	6	34769	34774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045542
584	NC_008322	GTTT	2	8	34777	34784	0 %	75 %	25 %	0 %	114045542
585	NC_008322	TCC	2	6	34800	34805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045542
586	NC_008322	TCC	2	6	34827	34832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045542
587	NC_008322	TTAT	2	8	34840	34847	25 %	75 %	0 %	0 %	114045542
588	NC_008322	TGT	2	6	34868	34873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045542
589	NC_008322	GA	3	6	34946	34951	50 %	0 %	50 %	0 %	114045542
590	NC_008322	ATT	2	6	35071	35076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045542
591	NC_008322	AGC	2	6	35093	35098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045542
592	NC_008322	TAA	2	6	35129	35134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045542
593	NC_008322	CGAAA	2	10	35177	35186	60 %	0 %	20 %	20 %	114045542
594	NC_008322	ATT	2	6	35191	35196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045542
595	NC_008322	TCTT	2	8	35202	35209	0 %	75 %	0 %	25 %	114045542
596	NC_008322	TGG	2	6	35219	35224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045542
597	NC_008322	TCA	2	6	35252	35257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045542
598	NC_008322	GGC	2	6	35317	35322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045542
599	NC_008322	TCA	2	6	35325	35330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045542
600	NC_008322	TTA	2	6	35344	35349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045542
601	NC_008322	GAA	2	6	35425	35430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045542
602	NC_008322	CCA	2	6	35442	35447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045542
603	NC_008322	ACA	2	6	35515	35520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045542
604	NC_008322	GGTTG	2	10	35596	35605	0 %	40 %	60 %	0 %	114045542
605	NC_008322	GGT	2	6	35617	35622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045542
606	NC_008322	ACTC	2	8	35735	35742	25 %	25 %	0 %	50 %	114045543
607	NC_008322	TTGG	2	8	35783	35790	0 %	50 %	50 %	0 %	114045543
608	NC_008322	CATT	2	8	35847	35854	25 %	50 %	0 %	25 %	114045543
609	NC_008322	AGA	2	6	35870	35875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045543
610	NC_008322	GCCT	2	8	35990	35997	0 %	25 %	25 %	50 %	114045543
611	NC_008322	AGC	2	6	36094	36099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045543
612	NC_008322	GAA	2	6	36102	36107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045543
613	NC_008322	TGA	2	6	36137	36142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_008322	AGG	2	6	36153	36158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_008322	T	6	6	36169	36174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_008322	TG	3	6	36198	36203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_008322	TGG	2	6	36234	36239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_008322	AAC	2	6	36264	36269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045544
619	NC_008322	GCAC	2	8	36286	36293	25 %	0 %	25 %	50 %	114045544
620	NC_008322	AAC	2	6	36377	36382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045544
621	NC_008322	GCA	2	6	36415	36420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045544
622	NC_008322	A	6	6	36780	36785	100 %	0 %	0 %	0 %	114045544
623	NC_008322	CG	3	6	36800	36805	0 %	0 %	50 %	50 %	114045544
624	NC_008322	A	6	6	36895	36900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008322	ATTCA	2	10	36925	36934	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
626	NC_008322	CGG	2	6	36994	36999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045545
627	NC_008322	GCGA	2	8	37121	37128	25 %	0 %	50 %	25 %	114045545
628	NC_008322	CGTG	2	8	37282	37289	0 %	25 %	50 %	25 %	114045545
629	NC_008322	TGA	2	6	37390	37395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045545
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632	NC_008322	GCAA	2	8	37632	37639	50 %	0 %	25 %	25 %	114045546
633	NC_008322	GGCGGT	2	12	37672	37683	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114045546
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650	NC_008322	TTC	2	6	38574	38579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045547
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693	NC_008322	A	6	6	40967	40972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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707	NC_008322	GAA	2	6	41808	41813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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723	NC_008322	AAG	2	6	42829	42834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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727	NC_008322	CA	3	6	42975	42980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
728	NC_008322	TTG	2	6	42987	42992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
729	NC_008322	AGG	2	6	43006	43011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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732	NC_008322	A	7	7	43110	43116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
733	NC_008322	TCT	2	6	43174	43179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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740	NC_008322	G	6	6	43642	43647	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
741	NC_008322	TCC	2	6	43652	43657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
742	NC_008322	CTGA	2	8	43672	43679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
743	NC_008322	GGA	2	6	43962	43967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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749	NC_008322	AAAG	2	8	44320	44327	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
750	NC_008322	AGTCG	2	10	44342	44351	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
751	NC_008322	ACC	2	6	44384	44389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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753	NC_008322	GA	3	6	44659	44664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
754	NC_008322	AGGCT	2	10	44671	44680	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
755	NC_008322	GCG	2	6	44684	44689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
756	NC_008322	GGT	2	6	44708	44713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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758	NC_008322	TGA	2	6	44758	44763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
759	NC_008322	AGT	2	6	44783	44788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
760	NC_008322	TCT	2	6	44811	44816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
761	NC_008322	GGT	2	6	44857	44862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
762	NC_008322	GA	3	6	44887	44892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
763	NC_008322	GCT	2	6	44945	44950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
764	NC_008322	ATTG	2	8	45090	45097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
765	NC_008322	CGG	2	6	45138	45143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
766	NC_008322	ATG	2	6	45214	45219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
767	NC_008322	GTC	2	6	45395	45400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
768	NC_008322	ACC	2	6	45409	45414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
769	NC_008322	TGG	2	6	45469	45474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
770	NC_008322	TCC	2	6	45495	45500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
771	NC_008322	GGA	2	6	45512	45517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
772	NC_008322	GACA	2	8	45589	45596	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
773	NC_008322	GGT	2	6	45632	45637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
774	NC_008322	CGG	2	6	45719	45724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
775	NC_008322	TCA	2	6	45747	45752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
776	NC_008322	CGT	2	6	45827	45832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
777	NC_008322	GAT	2	6	45867	45872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
778	NC_008322	GAAC	2	8	45909	45916	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
779	NC_008322	GT	3	6	46080	46085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
780	NC_008322	AGT	2	6	46163	46168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
781	NC_008322	AAG	2	6	46191	46196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
782	NC_008322	GTA	2	6	46296	46301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
783	NC_008322	ATCCC	2	10	46393	46402	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
784	NC_008322	TCCGC	2	10	46579	46588	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
785	NC_008322	GCA	2	6	46611	46616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
786	NC_008322	T	6	6	46627	46632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
787	NC_008322	TAA	2	6	46899	46904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
788	NC_008322	TTG	2	6	46932	46937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045551
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794	NC_008322	GGC	2	6	47371	47376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045552
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798	NC_008322	GT	3	6	47504	47509	0 %	50 %	50 %	0 %	114045552
799	NC_008322	CTG	2	6	47596	47601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045552
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802	NC_008322	GTTT	2	8	47720	47727	0 %	75 %	25 %	0 %	114045553
803	NC_008322	AAG	2	6	47730	47735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045553
804	NC_008322	ATC	2	6	47799	47804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045553
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886	NC_008322	CTG	2	6	52512	52517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
887	NC_008322	AT	3	6	52596	52601	50 %	50 %	0 %	0 %	114045557
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