MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008322	AGT	2	6	336818	336823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045820
6002	NC_008322	TGC	2	6	336880	336885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045820
6003	NC_008322	GTGG	2	8	336913	336920	0 %	25 %	75 %	0 %	114045820
6004	NC_008322	GAA	2	6	336938	336943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045820
6005	NC_008322	GGCT	2	8	336962	336969	0 %	25 %	50 %	25 %	114045820
6006	NC_008322	GCA	2	6	336976	336981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045820
6007	NC_008322	GTT	2	6	337039	337044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_008322	GGT	2	6	337149	337154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_008322	AAATA	2	10	337164	337173	80 %	20 %	0 %	0 %	114045821
6010	NC_008322	GTCA	2	8	337359	337366	25 %	25 %	25 %	25 %	114045821
6011	NC_008322	CAA	2	6	337426	337431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045821
6012	NC_008322	AAG	2	6	337551	337556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045821
6013	NC_008322	GTCT	2	8	337602	337609	0 %	50 %	25 %	25 %	114045821
6014	NC_008322	GTG	2	6	337640	337645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045821
6015	NC_008322	GTG	2	6	337656	337661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045821
6016	NC_008322	TAC	2	6	337664	337669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045821
6017	NC_008322	GCG	2	6	337670	337675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045821
6018	NC_008322	CTG	2	6	337697	337702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045821
6019	NC_008322	GGT	2	6	337733	337738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045821
6020	NC_008322	GCG	2	6	337754	337759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045821
6021	NC_008322	TGC	2	6	337768	337773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045821
6022	NC_008322	AAC	2	6	337838	337843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045821
6023	NC_008322	GAA	2	6	337853	337858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045821
6024	NC_008322	ATC	2	6	337904	337909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045821
6025	NC_008322	GGT	2	6	338057	338062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045821
6026	NC_008322	GCT	2	6	338072	338077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045821
6027	NC_008322	CTG	2	6	338085	338090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045821
6028	NC_008322	GTG	2	6	338120	338125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045821
6029	NC_008322	T	7	7	338296	338302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_008322	TTTTA	2	10	338309	338318	20 %	80 %	0 %	0 %	114045822
6031	NC_008322	GTT	2	6	338322	338327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045822
6032	NC_008322	CAG	2	6	338368	338373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045822
6033	NC_008322	AAG	2	6	338408	338413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045822
6034	NC_008322	CCA	2	6	338445	338450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045822
6035	NC_008322	GGGCGA	2	12	338469	338480	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	114045822
6036	NC_008322	TCG	2	6	338504	338509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045822
6037	NC_008322	GTTA	2	8	338515	338522	25 %	50 %	25 %	0 %	114045822
6038	NC_008322	ATC	2	6	338608	338613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045822
6039	NC_008322	AG	3	6	338647	338652	50 %	0 %	50 %	0 %	114045822
6040	NC_008322	ATC	2	6	338684	338689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045822
6041	NC_008322	ATA	2	6	338762	338767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045822
6042	NC_008322	ATG	2	6	338888	338893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045822
6043	NC_008322	TCC	2	6	338900	338905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045822
6044	NC_008322	CGG	2	6	338922	338927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045822
6045	NC_008322	ATG	2	6	338950	338955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045822
6046	NC_008322	GCA	2	6	338961	338966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045822
6047	NC_008322	AGTG	2	8	338980	338987	25 %	25 %	50 %	0 %	114045822
6048	NC_008322	CCGA	2	8	339127	339134	25 %	0 %	25 %	50 %	114045822
6049	NC_008322	CAT	2	6	339195	339200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045822
6050	NC_008322	ATC	2	6	339247	339252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045822
6051	NC_008322	AAG	2	6	339257	339262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045822
6052	NC_008322	CGC	2	6	339304	339309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045822
6053	NC_008322	AAT	2	6	339334	339339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045822
6054	NC_008322	CGC	2	6	339351	339356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045822
6055	NC_008322	AGC	2	6	339419	339424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045822
6056	NC_008322	CAG	2	6	339487	339492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045822
6057	NC_008322	CGA	2	6	339495	339500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045822
6058	NC_008322	TAT	2	6	339501	339506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045822
6059	NC_008322	GC	3	6	339721	339726	0 %	0 %	50 %	50 %	114045822
6060	NC_008322	TTG	2	6	339728	339733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045822
6061	NC_008322	GCA	2	6	339768	339773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045822
6062	NC_008322	TGT	2	6	339806	339811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045822
6063	NC_008322	CCA	2	6	339921	339926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045822
6064	NC_008322	GAGAG	2	10	339957	339966	40 %	0 %	60 %	0 %	114045822
6065	NC_008322	GTG	2	6	340010	340015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045822
6066	NC_008322	CGATA	2	10	340104	340113	40 %	20 %	20 %	20 %	114045822
6067	NC_008322	AAAG	2	8	340123	340130	75 %	0 %	25 %	0 %	114045822
6068	NC_008322	CAG	2	6	340141	340146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045822
6069	NC_008322	AG	3	6	340208	340213	50 %	0 %	50 %	0 %	114045822
6070	NC_008322	CTG	2	6	340261	340266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045822
6071	NC_008322	TTG	2	6	340360	340365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045822
6072	NC_008322	AAC	2	6	340396	340401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045822
6073	NC_008322	CAA	2	6	340405	340410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045822
6074	NC_008322	TAG	2	6	340420	340425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045822
6075	NC_008322	CAG	2	6	340486	340491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045822
6076	NC_008322	GTT	2	6	340507	340512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045822
6077	NC_008322	ATTTC	2	10	340574	340583	20 %	60 %	0 %	20 %	114045822
6078	NC_008322	TCA	2	6	340704	340709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045822
6079	NC_008322	T	6	6	340747	340752	0 %	100 %	0 %	0 %	114045822
6080	NC_008322	CTC	2	6	340793	340798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045822
6081	NC_008322	TGA	2	6	340932	340937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045822
6082	NC_008322	TGC	2	6	340977	340982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045822
6083	NC_008322	ATG	2	6	340993	340998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045822
6084	NC_008322	ATAG	2	8	341020	341027	50 %	25 %	25 %	0 %	114045822
6085	NC_008322	GAGC	2	8	341251	341258	25 %	0 %	50 %	25 %	114045822
6086	NC_008322	TAG	2	6	341482	341487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045822
6087	NC_008322	GGC	2	6	341511	341516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045822
6088	NC_008322	ATT	2	6	341734	341739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045822
6089	NC_008322	AAAT	2	8	341770	341777	75 %	25 %	0 %	0 %	114045822
6090	NC_008322	T	7	7	342035	342041	0 %	100 %	0 %	0 %	114045822
6091	NC_008322	TGT	2	6	342065	342070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045822
6092	NC_008322	TGCC	2	8	342222	342229	0 %	25 %	25 %	50 %	114045822
6093	NC_008322	AATA	2	8	342230	342237	75 %	25 %	0 %	0 %	114045822
6094	NC_008322	GGCTA	2	10	342253	342262	20 %	20 %	40 %	20 %	114045822
6095	NC_008322	AAT	2	6	342332	342337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045822
6096	NC_008322	CAA	2	6	342369	342374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045822
6097	NC_008322	GGTC	2	8	342396	342403	0 %	25 %	50 %	25 %	114045822
6098	NC_008322	AAT	2	6	342508	342513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045822
6099	NC_008322	CTT	2	6	342675	342680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045822
6100	NC_008322	TG	3	6	342707	342712	0 %	50 %	50 %	0 %	114045822
6101	NC_008322	TAA	2	6	342762	342767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045822
6102	NC_008322	CAA	2	6	342887	342892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_008322	TAA	2	6	342920	342925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_008322	TAA	2	6	343033	343038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_008322	A	7	7	343045	343051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_008322	GAC	2	6	343171	343176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045823
6107	NC_008322	GTTT	2	8	343189	343196	0 %	75 %	25 %	0 %	114045823
6108	NC_008322	CTTC	2	8	343251	343258	0 %	50 %	0 %	50 %	114045823
6109	NC_008322	ACC	2	6	343261	343266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045823
6110	NC_008322	CGC	3	9	343300	343308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045823
6111	NC_008322	CGG	2	6	343323	343328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045823
6112	NC_008322	CAT	2	6	343336	343341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045823
6113	NC_008322	CAG	2	6	343378	343383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045823
6114	NC_008322	CAA	2	6	343443	343448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045823
6115	NC_008322	GCT	2	6	343478	343483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045823
6116	NC_008322	TCA	2	6	343484	343489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045823
6117	NC_008322	TGA	2	6	343617	343622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045823
6118	NC_008322	CCA	2	6	343692	343697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045823
6119	NC_008322	CCA	2	6	343721	343726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045823
6120	NC_008322	GCG	2	6	343742	343747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045823
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6122	NC_008322	AAT	2	6	343852	343857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045823
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6124	NC_008322	CGG	3	9	343959	343967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045823
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6232	NC_008322	TGG	2	6	350355	350360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6241	NC_008322	GC	3	6	350871	350876	0 %	0 %	50 %	50 %	114045828
6242	NC_008322	TCCT	2	8	350879	350886	0 %	50 %	0 %	50 %	114045828
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6244	NC_008322	CGG	2	6	350950	350955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045828
6245	NC_008322	GGC	2	6	350966	350971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045828
6246	NC_008322	GT	3	6	350980	350985	0 %	50 %	50 %	0 %	114045828
6247	NC_008322	TG	4	8	351095	351102	0 %	50 %	50 %	0 %	114045829
6248	NC_008322	CTGT	2	8	351116	351123	0 %	50 %	25 %	25 %	114045829
6249	NC_008322	CAC	2	6	351274	351279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045829
6250	NC_008322	TCA	2	6	351300	351305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045829
6251	NC_008322	CAT	2	6	351318	351323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045829
6252	NC_008322	CCGC	2	8	351404	351411	0 %	0 %	25 %	75 %	114045829
6253	NC_008322	TGA	2	6	351492	351497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045829
6254	NC_008322	GCG	2	6	351532	351537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045829
6255	NC_008322	GTG	2	6	351539	351544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045829
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6258	NC_008322	GCA	2	6	351702	351707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045829
6259	NC_008322	GGT	2	6	351741	351746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045829
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6261	NC_008322	TCA	2	6	351870	351875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045829
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6266	NC_008322	GTTC	2	8	352099	352106	0 %	50 %	25 %	25 %	114045830
6267	NC_008322	GTA	2	6	352253	352258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045830
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6270	NC_008322	T	6	6	352364	352369	0 %	100 %	0 %	0 %	114045830
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6274	NC_008322	CAC	2	6	352542	352547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045830
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6280	NC_008322	CCT	2	6	352942	352947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6281	NC_008322	TGAA	2	8	353258	353265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6282	NC_008322	CTG	2	6	353308	353313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045831
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6312	NC_008322	GCT	2	6	354529	354534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045831
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6317	NC_008322	CTT	2	6	354696	354701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045831
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6323	NC_008322	GAG	2	6	355272	355277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045832
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6329	NC_008322	TAT	2	6	355548	355553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045832
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6334	NC_008322	AATGAA	2	12	355847	355858	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	114045832
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6343	NC_008322	CGG	2	6	356323	356328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045833
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6347	NC_008322	CCAC	2	8	356499	356506	25 %	0 %	0 %	75 %	114045833
6348	NC_008322	GGT	2	6	356549	356554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045833
6349	NC_008322	TTC	2	6	356617	356622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045833
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6351	NC_008322	TTG	2	6	356660	356665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045833
6352	NC_008322	CAG	2	6	356669	356674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045833
6353	NC_008322	TGC	2	6	356738	356743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045833
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6357	NC_008322	CGA	2	6	356949	356954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045834
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6359	NC_008322	GCT	2	6	357001	357006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045834
6360	NC_008322	ATT	2	6	357019	357024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045834
6361	NC_008322	CT	3	6	357056	357061	0 %	50 %	0 %	50 %	114045834
6362	NC_008322	AGC	2	6	357092	357097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045834
6363	NC_008322	CGAT	2	8	357300	357307	25 %	25 %	25 %	25 %	114045834
6364	NC_008322	GC	3	6	357390	357395	0 %	0 %	50 %	50 %	114045834
6365	NC_008322	TTG	2	6	357497	357502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045834
6366	NC_008322	AGA	2	6	357579	357584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045834
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6368	NC_008322	AG	3	6	357612	357617	50 %	0 %	50 %	0 %	114045834
6369	NC_008322	TAAA	2	8	357725	357732	75 %	25 %	0 %	0 %	114045834
6370	NC_008322	ACAA	2	8	357785	357792	75 %	0 %	0 %	25 %	114045834
6371	NC_008322	T	6	6	357837	357842	0 %	100 %	0 %	0 %	114045834
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6373	NC_008322	TGC	2	6	358184	358189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045835
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6379	NC_008322	T	6	6	358445	358450	0 %	100 %	0 %	0 %	114045835
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6424	NC_008322	ATGAA	2	10	361743	361752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6425	NC_008322	A	6	6	361803	361808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6440	NC_008322	CGG	2	6	363129	363134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045839
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6488	NC_008322	TGA	2	6	366524	366529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045842
6489	NC_008322	GAA	2	6	366591	366596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045842
6490	NC_008322	CGT	2	6	366600	366605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045842
6491	NC_008322	CGC	2	6	366606	366611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045842
6492	NC_008322	T	6	6	366666	366671	0 %	100 %	0 %	0 %	114045842
6493	NC_008322	TTA	2	6	366688	366693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045842
6494	NC_008322	CGG	2	6	366740	366745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045842
6495	NC_008322	TGT	2	6	366760	366765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045842
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6497	NC_008322	GCT	2	6	366822	366827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045842
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6499	NC_008322	GC	3	6	367000	367005	0 %	0 %	50 %	50 %	114045842
6500	NC_008322	TAA	2	6	367013	367018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045842

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