MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008322	ACT	2	6	308904	308909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045790
5502	NC_008322	ATA	2	6	308952	308957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045790
5503	NC_008322	GTT	2	6	308974	308979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045790
5504	NC_008322	TAAA	2	8	309089	309096	75 %	25 %	0 %	0 %	114045790
5505	NC_008322	TGG	2	6	309129	309134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045790
5506	NC_008322	GTT	2	6	309146	309151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045790
5507	NC_008322	AAT	2	6	309159	309164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045790
5508	NC_008322	CAG	2	6	309182	309187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045790
5509	NC_008322	GAA	3	9	309210	309218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045790
5510	NC_008322	GC	3	6	309289	309294	0 %	0 %	50 %	50 %	114045790
5511	NC_008322	ACC	2	6	309413	309418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045790
5512	NC_008322	T	6	6	309464	309469	0 %	100 %	0 %	0 %	114045790
5513	NC_008322	CGG	2	6	309485	309490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045790
5514	NC_008322	ATC	2	6	309596	309601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045790
5515	NC_008322	TTC	2	6	309611	309616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045790
5516	NC_008322	T	6	6	309664	309669	0 %	100 %	0 %	0 %	114045790
5517	NC_008322	CAA	2	6	309670	309675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045790
5518	NC_008322	CAT	2	6	309688	309693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045790
5519	NC_008322	CT	3	6	309752	309757	0 %	50 %	0 %	50 %	114045790
5520	NC_008322	GGC	2	6	309791	309796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045790
5521	NC_008322	A	6	6	309872	309877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_008322	ATG	2	6	309921	309926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_008322	ATAG	2	8	309952	309959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_008322	GA	3	6	309969	309974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_008322	ATT	2	6	309975	309980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_008322	ATA	2	6	310032	310037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_008322	CTA	2	6	310108	310113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_008322	GAAG	2	8	310131	310138	50 %	0 %	50 %	0 %	114045791
5529	NC_008322	CAT	2	6	310174	310179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045791
5530	NC_008322	TGAT	2	8	310260	310267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_008322	TTA	2	6	310273	310278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_008322	ATT	2	6	310346	310351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_008322	ATC	2	6	310386	310391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_008322	AAT	2	6	310423	310428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_008322	TTTAA	2	10	310441	310450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_008322	TAA	2	6	310464	310469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_008322	ATA	2	6	310470	310475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_008322	TTTG	2	8	310508	310515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_008322	TGA	2	6	310713	310718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045792
5540	NC_008322	CGG	2	6	310758	310763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045792
5541	NC_008322	TGGT	2	8	310960	310967	0 %	50 %	50 %	0 %	114045792
5542	NC_008322	CAAC	2	8	311082	311089	50 %	0 %	0 %	50 %	114045792
5543	NC_008322	TGG	2	6	311092	311097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045792
5544	NC_008322	CCG	2	6	311105	311110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045792
5545	NC_008322	GCATG	2	10	311116	311125	20 %	20 %	40 %	20 %	114045792
5546	NC_008322	GCT	2	6	311383	311388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045793
5547	NC_008322	AGC	2	6	311421	311426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045793
5548	NC_008322	TAT	2	6	311427	311432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045793
5549	NC_008322	CTC	2	6	311501	311506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045793
5550	NC_008322	GCG	2	6	311540	311545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045793
5551	NC_008322	ACAG	2	8	311546	311553	50 %	0 %	25 %	25 %	114045793
5552	NC_008322	TGC	2	6	311673	311678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045793
5553	NC_008322	GCA	2	6	311689	311694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045793
5554	NC_008322	ACA	2	6	311764	311769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045793
5555	NC_008322	GCA	2	6	311785	311790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045793
5556	NC_008322	GCT	2	6	311908	311913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045793
5557	NC_008322	TGC	2	6	311934	311939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045793
5558	NC_008322	GC	3	6	311984	311989	0 %	0 %	50 %	50 %	114045793
5559	NC_008322	CGC	2	6	312016	312021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045793
5560	NC_008322	ATG	2	6	312037	312042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045793
5561	NC_008322	TGCA	2	8	312180	312187	25 %	25 %	25 %	25 %	114045794
5562	NC_008322	TCG	2	6	312268	312273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045794
5563	NC_008322	CT	3	6	312348	312353	0 %	50 %	0 %	50 %	114045794
5564	NC_008322	TTGA	2	8	312363	312370	25 %	50 %	25 %	0 %	114045794
5565	NC_008322	AGT	2	6	312444	312449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045794
5566	NC_008322	GCT	2	6	312592	312597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045794
5567	NC_008322	A	7	7	312651	312657	100 %	0 %	0 %	0 %	114045794
5568	NC_008322	ATT	2	6	312693	312698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045794
5569	NC_008322	CAG	2	6	312855	312860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045794
5570	NC_008322	GTC	2	6	312930	312935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045794
5571	NC_008322	ACT	2	6	312942	312947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045794
5572	NC_008322	AGTTG	2	10	313006	313015	20 %	40 %	40 %	0 %	114045794
5573	NC_008322	TTG	2	6	313017	313022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045794
5574	NC_008322	GGC	2	6	313040	313045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045794
5575	NC_008322	GTT	2	6	313052	313057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045794
5576	NC_008322	AGTAGC	2	12	313108	313119	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114045794
5577	NC_008322	T	6	6	313163	313168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_008322	C	6	6	313221	313226	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5579	NC_008322	G	6	6	313231	313236	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_008322	GTT	2	6	313331	313336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045795
5581	NC_008322	GCAT	2	8	313367	313374	25 %	25 %	25 %	25 %	114045795
5582	NC_008322	ACC	2	6	313380	313385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045795
5583	NC_008322	ATC	2	6	313531	313536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045795
5584	NC_008322	GCC	2	6	313638	313643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045795
5585	NC_008322	ACC	2	6	313655	313660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045795
5586	NC_008322	GTT	2	6	313682	313687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045795
5587	NC_008322	AACC	2	8	313714	313721	50 %	0 %	0 %	50 %	114045795
5588	NC_008322	ATC	2	6	313828	313833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045795
5589	NC_008322	TAG	2	6	313854	313859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045795
5590	NC_008322	TTGCC	2	10	313946	313955	0 %	40 %	20 %	40 %	114045795
5591	NC_008322	AAAC	2	8	313964	313971	75 %	0 %	0 %	25 %	114045795
5592	NC_008322	GAA	2	6	313983	313988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045795
5593	NC_008322	CCA	2	6	314022	314027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045795
5594	NC_008322	TTGA	2	8	314058	314065	25 %	50 %	25 %	0 %	114045795
5595	NC_008322	TTG	2	6	314160	314165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045795
5596	NC_008322	TCGC	2	8	314185	314192	0 %	25 %	25 %	50 %	114045795
5597	NC_008322	GTA	2	6	314218	314223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045795
5598	NC_008322	TCGAG	2	10	314272	314281	20 %	20 %	40 %	20 %	114045796
5599	NC_008322	TGAGC	2	10	314369	314378	20 %	20 %	40 %	20 %	114045796
5600	NC_008322	A	6	6	314434	314439	100 %	0 %	0 %	0 %	114045796
5601	NC_008322	TGG	3	9	314491	314499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045796
5602	NC_008322	CAG	2	6	314549	314554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045796
5603	NC_008322	GGT	2	6	314613	314618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045796
5604	NC_008322	TCC	2	6	314640	314645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045796
5605	NC_008322	G	6	6	314668	314673	0 %	0 %	100 %	0 %	114045796
5606	NC_008322	AAC	2	6	314677	314682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045796
5607	NC_008322	TTG	2	6	314775	314780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045796
5608	NC_008322	CAG	2	6	314802	314807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045796
5609	NC_008322	CTG	2	6	314885	314890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045796
5610	NC_008322	CGGT	2	8	315000	315007	0 %	25 %	50 %	25 %	114045797
5611	NC_008322	AC	3	6	315036	315041	50 %	0 %	0 %	50 %	114045797
5612	NC_008322	GAC	2	6	315116	315121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045797
5613	NC_008322	AC	3	6	315144	315149	50 %	0 %	0 %	50 %	114045797
5614	NC_008322	ACG	2	6	315183	315188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045797
5615	NC_008322	TGGGC	2	10	315216	315225	0 %	20 %	60 %	20 %	114045797
5616	NC_008322	GGCA	2	8	315364	315371	25 %	0 %	50 %	25 %	114045797
5617	NC_008322	ACC	2	6	315499	315504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045798
5618	NC_008322	CTGT	2	8	315518	315525	0 %	50 %	25 %	25 %	114045798
5619	NC_008322	GTT	2	6	315676	315681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045798
5620	NC_008322	GTA	2	6	315724	315729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045798
5621	NC_008322	GGAAG	2	10	315807	315816	40 %	0 %	60 %	0 %	114045798
5622	NC_008322	TCT	2	6	315842	315847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045798
5623	NC_008322	CGTAT	2	10	315925	315934	20 %	40 %	20 %	20 %	114045798
5624	NC_008322	TGT	2	6	316030	316035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045798
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5750	NC_008322	TAT	2	6	323137	323142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045803
5751	NC_008322	GCA	2	6	323191	323196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045803
5752	NC_008322	TG	3	6	323225	323230	0 %	50 %	50 %	0 %	114045803
5753	NC_008322	GTG	2	6	323282	323287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045803
5754	NC_008322	GCA	2	6	323422	323427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045803
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5762	NC_008322	TAT	2	6	323725	323730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045803
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5764	NC_008322	TCG	2	6	323911	323916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045804
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5770	NC_008322	GCA	2	6	324268	324273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045804
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5772	NC_008322	CTG	2	6	324393	324398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045804
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5778	NC_008322	GAC	2	6	324543	324548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5791	NC_008322	TTC	2	6	325285	325290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045806
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5859	NC_008322	ACTTT	2	10	329430	329439	20 %	60 %	0 %	20 %	114045811
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5868	NC_008322	TGATGC	2	12	329814	329825	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114045811
5869	NC_008322	GC	3	6	329824	329829	0 %	0 %	50 %	50 %	114045811
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5997	NC_008322	GACC	2	8	336373	336380	25 %	0 %	25 %	50 %	114045820
5998	NC_008322	GTGG	2	8	336552	336559	0 %	25 %	75 %	0 %	114045820
5999	NC_008322	GGTG	2	8	336604	336611	0 %	25 %	75 %	0 %	114045820
6000	NC_008322	CAG	2	6	336635	336640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045820

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