MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_008322	CAAAAC	2	12	3277108	3277119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048260
58002	NC_008322	CTT	2	6	3277141	3277146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048260
58003	NC_008322	GCT	2	6	3277175	3277180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048260
58004	NC_008322	T	6	6	3277388	3277393	0 %	100 %	0 %	0 %	114048260
58005	NC_008322	TCA	2	6	3277422	3277427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048260
58006	NC_008322	AGCCT	2	10	3277464	3277473	20 %	20 %	20 %	40 %	114048260
58007	NC_008322	AAC	2	6	3277557	3277562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114048260
58008	NC_008322	GCC	2	6	3277577	3277582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048260
58009	NC_008322	GAA	2	6	3277642	3277647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114048260
58010	NC_008322	GCA	2	6	3277660	3277665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048260
58011	NC_008322	AGC	2	6	3277669	3277674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048260
58012	NC_008322	ATA	2	6	3277683	3277688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048260
58013	NC_008322	CGGG	2	8	3277695	3277702	0 %	0 %	75 %	25 %	114048260
58014	NC_008322	TCA	2	6	3277714	3277719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048260
58015	NC_008322	AAT	2	6	3277778	3277783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048260
58016	NC_008322	AAG	2	6	3277890	3277895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114048260
58017	NC_008322	A	6	6	3277934	3277939	100 %	0 %	0 %	0 %	114048260
58018	NC_008322	GAT	2	6	3277942	3277947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048260
58019	NC_008322	TGA	2	6	3277959	3277964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048260
58020	NC_008322	ACC	2	6	3278006	3278011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048260
58021	NC_008322	A	6	6	3278096	3278101	100 %	0 %	0 %	0 %	114048260
58022	NC_008322	TCC	2	6	3278105	3278110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114048260
58023	NC_008322	CTT	2	6	3278161	3278166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048260
58024	NC_008322	GCT	2	6	3278207	3278212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048260
58025	NC_008322	AAT	2	6	3278230	3278235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048260
58026	NC_008322	AAT	2	6	3278344	3278349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048260
58027	NC_008322	CCA	2	6	3278380	3278385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048260
58028	NC_008322	AAT	2	6	3278431	3278436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048260
58029	NC_008322	GTT	2	6	3278518	3278523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048260
58030	NC_008322	AATA	2	8	3278538	3278545	75 %	25 %	0 %	0 %	114048260
58031	NC_008322	AGC	2	6	3278601	3278606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048260
58032	NC_008322	AGTT	2	8	3278629	3278636	25 %	50 %	25 %	0 %	114048260
58033	NC_008322	TA	3	6	3278658	3278663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58034	NC_008322	ATTTT	2	10	3278718	3278727	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58035	NC_008322	T	6	6	3278724	3278729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58036	NC_008322	ATG	2	6	3278770	3278775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58037	NC_008322	CCA	2	6	3278812	3278817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58038	NC_008322	TGA	2	6	3278855	3278860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048261
58039	NC_008322	ATT	2	6	3278874	3278879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048261
58040	NC_008322	TGT	2	6	3278942	3278947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048261
58041	NC_008322	ATT	2	6	3278955	3278960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048261
58042	NC_008322	TTTG	2	8	3278983	3278990	0 %	75 %	25 %	0 %	114048261
58043	NC_008322	TTAAG	2	10	3279008	3279017	40 %	40 %	20 %	0 %	114048261
58044	NC_008322	TTG	2	6	3279049	3279054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048261
58045	NC_008322	CTT	2	6	3279162	3279167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048261
58046	NC_008322	TCG	2	6	3279189	3279194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048261
58047	NC_008322	ATT	2	6	3279208	3279213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048261
58048	NC_008322	AGCC	2	8	3279238	3279245	25 %	0 %	25 %	50 %	114048261
58049	NC_008322	T	6	6	3279277	3279282	0 %	100 %	0 %	0 %	114048261
58050	NC_008322	TCA	2	6	3279485	3279490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048261
58051	NC_008322	GCCA	2	8	3279514	3279521	25 %	0 %	25 %	50 %	114048261
58052	NC_008322	TGGT	2	8	3279567	3279574	0 %	50 %	50 %	0 %	114048261
58053	NC_008322	T	6	6	3279576	3279581	0 %	100 %	0 %	0 %	114048261
58054	NC_008322	GT	3	6	3279604	3279609	0 %	50 %	50 %	0 %	114048261
58055	NC_008322	TCT	2	6	3279629	3279634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048261
58056	NC_008322	CCG	2	6	3279767	3279772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048262
58057	NC_008322	ACC	2	6	3279991	3279996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048262
58058	NC_008322	CAT	2	6	3280023	3280028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048262
58059	NC_008322	ATG	2	6	3280066	3280071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048262
58060	NC_008322	CAT	2	6	3280080	3280085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048262
58061	NC_008322	AATA	2	8	3280131	3280138	75 %	25 %	0 %	0 %	114048262
58062	NC_008322	GTT	2	6	3280201	3280206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048262
58063	NC_008322	AAT	2	6	3280256	3280261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048262
58064	NC_008322	AAT	2	6	3280302	3280307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58065	NC_008322	A	7	7	3280340	3280346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58066	NC_008322	AG	3	6	3280366	3280371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58067	NC_008322	TTTGAA	2	12	3280383	3280394	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58068	NC_008322	A	6	6	3280412	3280417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58069	NC_008322	AAT	2	6	3280570	3280575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048263
58070	NC_008322	GTT	2	6	3280622	3280627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048263
58071	NC_008322	TGG	2	6	3280639	3280644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048263
58072	NC_008322	ATA	2	6	3280648	3280653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048263
58073	NC_008322	CGG	3	9	3280716	3280724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048263
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58075	NC_008322	CGC	2	6	3280784	3280789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048263
58076	NC_008322	CAAC	2	8	3280978	3280985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58077	NC_008322	TCG	2	6	3281006	3281011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048264
58078	NC_008322	CAC	2	6	3281037	3281042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048264
58079	NC_008322	ACC	2	6	3281198	3281203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048264
58080	NC_008322	TTC	2	6	3281269	3281274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114048264
58081	NC_008322	ATC	2	6	3281326	3281331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048264
58082	NC_008322	GACT	2	8	3281341	3281348	25 %	25 %	25 %	25 %	114048264
58083	NC_008322	CCA	2	6	3281399	3281404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114048264
58084	NC_008322	CGGCG	2	10	3281483	3281492	0 %	0 %	60 %	40 %	114048264
58085	NC_008322	TGA	2	6	3281504	3281509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048264
58086	NC_008322	GTC	2	6	3281523	3281528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048264
58087	NC_008322	TCA	2	6	3281632	3281637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048264
58088	NC_008322	CGG	2	6	3281678	3281683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048264
58089	NC_008322	CGT	2	6	3281694	3281699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048264
58090	NC_008322	CGA	2	6	3281813	3281818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048264
58091	NC_008322	TGA	2	6	3281908	3281913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048264
58092	NC_008322	CGGT	2	8	3282001	3282008	0 %	25 %	50 %	25 %	114048264
58093	NC_008322	CACTC	2	10	3282029	3282038	20 %	20 %	0 %	60 %	114048264
58094	NC_008322	CAG	2	6	3282069	3282074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114048264
58095	NC_008322	GC	3	6	3282124	3282129	0 %	0 %	50 %	50 %	114048264
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58098	NC_008322	TG	3	6	3282325	3282330	0 %	50 %	50 %	0 %	114048264
58099	NC_008322	CTG	2	6	3282375	3282380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58100	NC_008322	TATTGA	2	12	3282402	3282413	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58101	NC_008322	AGA	2	6	3282414	3282419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58102	NC_008322	AAAT	2	8	3282434	3282441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58103	NC_008322	AAC	2	6	3282461	3282466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58104	NC_008322	TAT	2	6	3282472	3282477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58105	NC_008322	CAC	2	6	3282488	3282493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58106	NC_008322	AGG	2	6	3282499	3282504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58107	NC_008322	ATG	2	6	3282507	3282512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048265
58108	NC_008322	CTAT	2	8	3282520	3282527	25 %	50 %	0 %	25 %	114048265
58109	NC_008322	AGTG	2	8	3282612	3282619	25 %	25 %	50 %	0 %	114048265
58110	NC_008322	TGG	2	6	3282682	3282687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114048265
58111	NC_008322	AC	3	6	3282815	3282820	50 %	0 %	0 %	50 %	114048265
58112	NC_008322	A	6	6	3282843	3282848	100 %	0 %	0 %	0 %	114048265
58113	NC_008322	GCG	2	6	3282849	3282854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114048265
58114	NC_008322	TTAA	2	8	3282903	3282910	50 %	50 %	0 %	0 %	114048265
58115	NC_008322	TCGC	2	8	3282928	3282935	0 %	25 %	25 %	50 %	114048265
58116	NC_008322	AAT	2	6	3282991	3282996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048265
58117	NC_008322	TAT	2	6	3283021	3283026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58119	NC_008322	A	6	6	3283032	3283037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58241	NC_008322	CAGT	2	8	3290192	3290199	25 %	25 %	25 %	25 %	114048270
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58359	NC_008322	CCTG	2	8	3297306	3297313	0 %	25 %	25 %	50 %	114048274
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58474	NC_008322	CAA	2	6	3304028	3304033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58475	NC_008322	T	6	6	3304043	3304048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58476	NC_008322	GTTG	2	8	3304065	3304072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58477	NC_008322	AAT	2	6	3304111	3304116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58478	NC_008322	ATT	2	6	3304349	3304354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048281
58479	NC_008322	CTTC	2	8	3304382	3304389	0 %	50 %	0 %	50 %	114048281
58480	NC_008322	AG	3	6	3304436	3304441	50 %	0 %	50 %	0 %	114048281
58481	NC_008322	ATG	2	6	3304671	3304676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048281
58482	NC_008322	GCT	2	6	3304795	3304800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114048281
58483	NC_008322	GTT	2	6	3304801	3304806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048281
58484	NC_008322	CCG	2	6	3304835	3304840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114048281
58485	NC_008322	ATCC	2	8	3304850	3304857	25 %	25 %	0 %	50 %	114048281
58486	NC_008322	TGT	2	6	3304888	3304893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114048281
58487	NC_008322	ATA	2	6	3304984	3304989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114048281
58488	NC_008322	AT	3	6	3305071	3305076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58489	NC_008322	TGG	2	6	3305165	3305170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58490	NC_008322	AGT	2	6	3305178	3305183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58491	NC_008322	C	7	7	3305204	3305210	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58492	NC_008322	CAG	2	6	3305242	3305247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58493	NC_008322	TCC	2	6	3305256	3305261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58494	NC_008322	TAAACC	2	12	3305304	3305315	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58495	NC_008322	AG	3	6	3305316	3305321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58496	NC_008322	TCA	2	6	3305326	3305331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048282
58497	NC_008322	CAT	2	6	3305415	3305420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048282
58498	NC_008322	TTA	2	6	3305440	3305445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114048282
58499	NC_008322	GAT	2	6	3305459	3305464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114048282
58500	NC_008322	ATC	2	6	3305578	3305583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114048282

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