MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 85011

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008322	GTG	2	6	282365	282370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045770
5002	NC_008322	ATC	2	6	282482	282487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045770
5003	NC_008322	GTTT	2	8	282524	282531	0 %	75 %	25 %	0 %	114045770
5004	NC_008322	TCG	2	6	282587	282592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045770
5005	NC_008322	CAT	2	6	282625	282630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045770
5006	NC_008322	CAC	2	6	282633	282638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045770
5007	NC_008322	CACC	2	8	282645	282652	25 %	0 %	0 %	75 %	114045770
5008	NC_008322	GCA	3	9	282675	282683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045770
5009	NC_008322	GCA	2	6	282704	282709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045770
5010	NC_008322	CTT	2	6	282788	282793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045771
5011	NC_008322	GGC	2	6	282912	282917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045771
5012	NC_008322	TGG	2	6	282953	282958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045771
5013	NC_008322	TCA	2	6	283018	283023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045771
5014	NC_008322	TGG	2	6	283089	283094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045771
5015	NC_008322	GCC	2	6	283185	283190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045771
5016	NC_008322	CAT	2	6	283206	283211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045771
5017	NC_008322	ATG	2	6	283338	283343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_008322	ATT	2	6	283383	283388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_008322	CGGCA	2	10	283472	283481	20 %	0 %	40 %	40 %	114045772
5020	NC_008322	TGGC	2	8	283508	283515	0 %	25 %	50 %	25 %	114045772
5021	NC_008322	GCC	2	6	283564	283569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045772
5022	NC_008322	CAA	2	6	283599	283604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045772
5023	NC_008322	T	6	6	283615	283620	0 %	100 %	0 %	0 %	114045772
5024	NC_008322	TTG	2	6	283687	283692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045772
5025	NC_008322	GCGA	2	8	283709	283716	25 %	0 %	50 %	25 %	114045772
5026	NC_008322	CTGC	2	8	283719	283726	0 %	25 %	25 %	50 %	114045772
5027	NC_008322	CT	3	6	283757	283762	0 %	50 %	0 %	50 %	114045773
5028	NC_008322	CGC	2	6	283820	283825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045773
5029	NC_008322	CAT	2	6	283892	283897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045773
5030	NC_008322	TTC	2	6	283965	283970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045773
5031	NC_008322	TGCGGC	2	12	284051	284062	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114045773
5032	NC_008322	GCG	2	6	284141	284146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045773
5033	NC_008322	GCGA	2	8	284180	284187	25 %	0 %	50 %	25 %	114045773
5034	NC_008322	CCA	2	6	284293	284298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045773
5035	NC_008322	GTA	2	6	284301	284306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045773
5036	NC_008322	CTTTT	2	10	284329	284338	0 %	80 %	0 %	20 %	114045773
5037	NC_008322	CGG	2	6	284444	284449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045773
5038	NC_008322	CTT	2	6	284450	284455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045773
5039	NC_008322	TGC	2	6	284547	284552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045773
5040	NC_008322	TGT	2	6	284603	284608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045773
5041	NC_008322	AAT	2	6	284652	284657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045773
5042	NC_008322	TTG	2	6	284682	284687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045773
5043	NC_008322	GGC	2	6	284691	284696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045773
5044	NC_008322	GGC	2	6	284790	284795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045773
5045	NC_008322	CG	3	6	284799	284804	0 %	0 %	50 %	50 %	114045773
5046	NC_008322	TTC	2	6	284836	284841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045773
5047	NC_008322	TCGG	2	8	284878	284885	0 %	25 %	50 %	25 %	114045773
5048	NC_008322	GCC	2	6	284893	284898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045773
5049	NC_008322	GAT	2	6	284903	284908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045773
5050	NC_008322	CAAC	2	8	284994	285001	50 %	0 %	0 %	50 %	114045773
5051	NC_008322	GTT	2	6	285015	285020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045773
5052	NC_008322	CGG	2	6	285104	285109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045773
5053	NC_008322	GGT	2	6	285120	285125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045773
5054	NC_008322	TGA	2	6	285193	285198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045773
5055	NC_008322	CCA	2	6	285317	285322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045773
5056	NC_008322	CAG	2	6	285360	285365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045773
5057	NC_008322	GCC	2	6	285373	285378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045773
5058	NC_008322	GCC	2	6	285409	285414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045773
5059	NC_008322	AGC	2	6	285415	285420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045773
5060	NC_008322	GCT	2	6	285434	285439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045773
5061	NC_008322	TGC	2	6	285644	285649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_008322	TA	3	6	285707	285712	50 %	50 %	0 %	0 %	114045774
5063	NC_008322	CTCA	2	8	285793	285800	25 %	25 %	0 %	50 %	114045774
5064	NC_008322	ATTG	2	8	285807	285814	25 %	50 %	25 %	0 %	114045774
5065	NC_008322	CCA	2	6	285866	285871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045774
5066	NC_008322	GC	3	6	285900	285905	0 %	0 %	50 %	50 %	114045774
5067	NC_008322	CGC	2	6	285974	285979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045774
5068	NC_008322	GC	4	8	286141	286148	0 %	0 %	50 %	50 %	114045774
5069	NC_008322	T	6	6	286190	286195	0 %	100 %	0 %	0 %	114045774
5070	NC_008322	CACCG	2	10	286202	286211	20 %	0 %	20 %	60 %	114045774
5071	NC_008322	GAC	2	6	286227	286232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045774
5072	NC_008322	CT	3	6	286306	286311	0 %	50 %	0 %	50 %	114045774
5073	NC_008322	GAT	2	6	286408	286413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045774
5074	NC_008322	GAA	2	6	286459	286464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045774
5075	NC_008322	GCC	3	9	286480	286488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045774
5076	NC_008322	GTG	2	6	286597	286602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_008322	GGA	2	6	286670	286675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_008322	CGA	2	6	286728	286733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_008322	AG	3	6	286744	286749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_008322	CAT	2	6	286758	286763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_008322	GGT	2	6	286776	286781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_008322	GCGA	2	8	286919	286926	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_008322	ATGA	2	8	286939	286946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_008322	GCAA	2	8	287045	287052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5085	NC_008322	GGC	2	6	287084	287089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045775
5086	NC_008322	TATGA	2	10	287133	287142	40 %	40 %	20 %	0 %	114045775
5087	NC_008322	CTG	2	6	287187	287192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045775
5088	NC_008322	AGC	2	6	287269	287274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045775
5089	NC_008322	A	6	6	287275	287280	100 %	0 %	0 %	0 %	114045775
5090	NC_008322	AGC	2	6	287299	287304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045775
5091	NC_008322	CGC	2	6	287361	287366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045775
5092	NC_008322	TCGCA	2	10	287412	287421	20 %	20 %	20 %	40 %	114045775
5093	NC_008322	TGT	2	6	287507	287512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045775
5094	NC_008322	TCA	2	6	287517	287522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_008322	GTT	2	6	287534	287539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045776
5096	NC_008322	GTTTG	2	10	287549	287558	0 %	60 %	40 %	0 %	114045776
5097	NC_008322	GTT	2	6	287576	287581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045776
5098	NC_008322	CTG	2	6	287605	287610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045776
5099	NC_008322	TAAA	2	8	287759	287766	75 %	25 %	0 %	0 %	114045776
5100	NC_008322	CAG	2	6	287778	287783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045776
5101	NC_008322	TC	3	6	287814	287819	0 %	50 %	0 %	50 %	114045776
5102	NC_008322	TTC	2	6	287892	287897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045776
5103	NC_008322	A	6	6	287946	287951	100 %	0 %	0 %	0 %	114045776
5104	NC_008322	CAA	2	6	288059	288064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045776
5105	NC_008322	TTC	2	6	288087	288092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045776
5106	NC_008322	TA	3	6	288131	288136	50 %	50 %	0 %	0 %	114045776
5107	NC_008322	ATC	2	6	288180	288185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045776
5108	NC_008322	CTCTT	2	10	288206	288215	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5109	NC_008322	GCG	2	6	288361	288366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045777
5110	NC_008322	T	6	6	288461	288466	0 %	100 %	0 %	0 %	114045777
5111	NC_008322	AAC	2	6	288487	288492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045777
5112	NC_008322	GATG	2	8	288581	288588	25 %	25 %	50 %	0 %	114045777
5113	NC_008322	CACTAA	2	12	288593	288604	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	114045777
5114	NC_008322	CCA	2	6	288747	288752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114045777
5115	NC_008322	CAT	2	6	288811	288816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114045777
5116	NC_008322	TGC	2	6	288883	288888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045777
5117	NC_008322	GT	3	6	288967	288972	0 %	50 %	50 %	0 %	114045778
5118	NC_008322	GGC	2	6	288987	288992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045778
5119	NC_008322	ATCA	2	8	289038	289045	50 %	25 %	0 %	25 %	114045778
5120	NC_008322	CG	3	6	289205	289210	0 %	0 %	50 %	50 %	114045778
5121	NC_008322	AGCCA	2	10	289261	289270	40 %	0 %	20 %	40 %	114045778
5122	NC_008322	GAGT	2	8	289285	289292	25 %	25 %	50 %	0 %	114045778
5123	NC_008322	GTTG	2	8	289369	289376	0 %	50 %	50 %	0 %	114045778
5124	NC_008322	CCG	2	6	289433	289438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045778
5125	NC_008322	GAGT	2	8	289455	289462	25 %	25 %	50 %	0 %	114045778
5126	NC_008322	CTT	2	6	289574	289579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045778
5127	NC_008322	T	6	6	289703	289708	0 %	100 %	0 %	0 %	114045778
5128	NC_008322	CCG	2	6	289763	289768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114045778
5129	NC_008322	AGG	2	6	289855	289860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114045778
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5132	NC_008322	GTTG	2	8	289967	289974	0 %	50 %	50 %	0 %	114045778
5133	NC_008322	GAGTTA	2	12	289981	289992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045778
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5141	NC_008322	ATG	2	6	290296	290301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114045778
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5145	NC_008322	T	6	6	290513	290518	0 %	100 %	0 %	0 %	114045778
5146	NC_008322	AAG	2	6	290557	290562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114045778
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5150	NC_008322	GTTG	2	8	290847	290854	0 %	50 %	50 %	0 %	114045778
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5159	NC_008322	TGG	2	6	291199	291204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045778
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5165	NC_008322	GCA	2	6	291480	291485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045779
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5192	NC_008322	CTG	2	6	292886	292891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045779
5193	NC_008322	CGA	2	6	292892	292897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045779
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5195	NC_008322	TTGGGT	2	12	293062	293073	0 %	50 %	50 %	0 %	114045779
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5200	NC_008322	GCTT	2	8	293393	293400	0 %	50 %	25 %	25 %	114045779
5201	NC_008322	CTG	2	6	293412	293417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045779
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5210	NC_008322	ATGG	2	8	293870	293877	25 %	25 %	50 %	0 %	114045780
5211	NC_008322	TTG	2	6	293940	293945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045780
5212	NC_008322	TGG	2	6	293980	293985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045780
5213	NC_008322	TCC	2	6	294004	294009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114045780
5214	NC_008322	TAT	2	6	294023	294028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045780
5215	NC_008322	TGG	2	6	294052	294057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114045780
5216	NC_008322	AC	3	6	294066	294071	50 %	0 %	0 %	50 %	114045780
5217	NC_008322	ATA	2	6	294380	294385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045780
5218	NC_008322	TAT	2	6	294405	294410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114045780
5219	NC_008322	TTTTA	2	10	294417	294426	20 %	80 %	0 %	0 %	114045780
5220	NC_008322	GTAT	2	8	294459	294466	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5221	NC_008322	ATT	2	6	294474	294479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5222	NC_008322	A	6	6	294559	294564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5223	NC_008322	TGAG	2	8	294614	294621	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5224	NC_008322	ATT	2	6	294622	294627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5225	NC_008322	TTG	2	6	294646	294651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5226	NC_008322	ATC	2	6	294654	294659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5227	NC_008322	ATTG	2	8	294665	294672	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5228	NC_008322	TAAA	2	8	294683	294690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5229	NC_008322	TGG	2	6	294696	294701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5230	NC_008322	TTATT	2	10	294704	294713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_008322	A	6	6	294757	294762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5232	NC_008322	GT	3	6	294769	294774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5233	NC_008322	T	6	6	294803	294808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_008322	CTGATA	2	12	294859	294870	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5235	NC_008322	TCA	2	6	294909	294914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5236	NC_008322	GCT	2	6	294964	294969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045781
5237	NC_008322	TGCT	2	8	295041	295048	0 %	50 %	25 %	25 %	114045781
5238	NC_008322	GCTT	2	8	295108	295115	0 %	50 %	25 %	25 %	114045781
5239	NC_008322	CTGT	2	8	295130	295137	0 %	50 %	25 %	25 %	114045781
5240	NC_008322	AAC	2	6	295180	295185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114045781
5241	NC_008322	T	6	6	295192	295197	0 %	100 %	0 %	0 %	114045781
5242	NC_008322	CGT	2	6	295232	295237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114045781
5243	NC_008322	ATTA	2	8	295299	295306	50 %	50 %	0 %	0 %	114045781
5244	NC_008322	GGC	2	6	295317	295322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114045781
5245	NC_008322	TCT	2	6	295324	295329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114045781
5246	NC_008322	CGA	2	6	295373	295378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045781
5247	NC_008322	GCA	2	6	295388	295393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045781
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5494	NC_008322	GTT	2	6	308654	308659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114045790
5495	NC_008322	T	6	6	308708	308713	0 %	100 %	0 %	0 %	114045790
5496	NC_008322	AGCC	2	8	308737	308744	25 %	0 %	25 %	50 %	114045790
5497	NC_008322	ACTG	2	8	308757	308764	25 %	25 %	25 %	25 %	114045790
5498	NC_008322	ATA	2	6	308772	308777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114045790
5499	NC_008322	AGC	2	6	308802	308807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114045790
5500	NC_008322	TCAT	2	8	308820	308827	25 %	50 %	0 %	25 %	114045790

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