MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008321	CGG	2	6	198128	198133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968522
3502	NC_008321	GCG	2	6	198146	198151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968522
3503	NC_008321	ATGA	2	8	198257	198264	50 %	25 %	25 %	0 %	113968522
3504	NC_008321	CGA	2	6	198283	198288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968522
3505	NC_008321	GAT	2	6	198310	198315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968522
3506	NC_008321	GGC	2	6	198324	198329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968522
3507	NC_008321	TTA	2	6	198419	198424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968522
3508	NC_008321	CG	3	6	198455	198460	0 %	0 %	50 %	50 %	113968522
3509	NC_008321	CGG	2	6	198519	198524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968522
3510	NC_008321	GC	3	6	198610	198615	0 %	0 %	50 %	50 %	113968522
3511	NC_008321	TGG	2	6	198660	198665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968522
3512	NC_008321	ACA	2	6	198685	198690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968522
3513	NC_008321	ACG	2	6	198782	198787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968523
3514	NC_008321	TGC	2	6	198876	198881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968523
3515	NC_008321	GTG	2	6	198976	198981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968523
3516	NC_008321	CATCG	2	10	199058	199067	20 %	20 %	20 %	40 %	113968523
3517	NC_008321	TTC	2	6	199073	199078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968523
3518	NC_008321	TTG	2	6	199113	199118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968523
3519	NC_008321	AGC	2	6	199136	199141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968523
3520	NC_008321	TTTG	2	8	199330	199337	0 %	75 %	25 %	0 %	113968523
3521	NC_008321	GC	3	6	199409	199414	0 %	0 %	50 %	50 %	113968523
3522	NC_008321	GCT	2	6	199442	199447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968523
3523	NC_008321	GCG	2	6	199464	199469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968523
3524	NC_008321	ATC	2	6	199487	199492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968523
3525	NC_008321	CTGT	2	8	199496	199503	0 %	50 %	25 %	25 %	113968523
3526	NC_008321	ACA	2	6	199507	199512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968523
3527	NC_008321	CAC	2	6	199528	199533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968523
3528	NC_008321	A	6	6	199545	199550	100 %	0 %	0 %	0 %	113968523
3529	NC_008321	GCC	2	6	199608	199613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968523
3530	NC_008321	ATC	2	6	199614	199619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968523
3531	NC_008321	TGAT	2	8	199620	199627	25 %	50 %	25 %	0 %	113968523
3532	NC_008321	TCG	2	6	199704	199709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968523
3533	NC_008321	GC	3	6	199734	199739	0 %	0 %	50 %	50 %	113968523
3534	NC_008321	CAT	2	6	199840	199845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968523
3535	NC_008321	TGC	2	6	199862	199867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968523
3536	NC_008321	CCGC	2	8	199979	199986	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3537	NC_008321	CGG	2	6	200053	200058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968524
3538	NC_008321	TATT	2	8	200111	200118	25 %	75 %	0 %	0 %	113968524
3539	NC_008321	TTG	2	6	200220	200225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968524
3540	NC_008321	TGT	2	6	200251	200256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968524
3541	NC_008321	CTAT	2	8	200279	200286	25 %	50 %	0 %	25 %	113968524
3542	NC_008321	TGG	2	6	200292	200297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968524
3543	NC_008321	TCA	2	6	200400	200405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968524
3544	NC_008321	GAT	2	6	200417	200422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968524
3545	NC_008321	AGA	2	6	200472	200477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968524
3546	NC_008321	TGC	2	6	200580	200585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968524
3547	NC_008321	TGA	2	6	200587	200592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968524
3548	NC_008321	TTG	2	6	200666	200671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968524
3549	NC_008321	AGC	2	6	200688	200693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968524
3550	NC_008321	AAG	2	6	200700	200705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968524
3551	NC_008321	CAC	2	6	200812	200817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968524
3552	NC_008321	ATT	2	6	200847	200852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968525
3553	NC_008321	TTCT	2	8	200916	200923	0 %	75 %	0 %	25 %	113968525
3554	NC_008321	ACG	2	6	201001	201006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968525
3555	NC_008321	AGT	2	6	201193	201198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968525
3556	NC_008321	CAA	2	6	201213	201218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968525
3557	NC_008321	CT	3	6	201320	201325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_008321	ATAA	2	8	201343	201350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_008321	ATT	2	6	201379	201384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_008321	A	6	6	201482	201487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_008321	ATG	2	6	201493	201498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_008321	GAA	2	6	201522	201527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_008321	A	6	6	201531	201536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_008321	CTG	2	6	201555	201560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_008321	CCT	2	6	201633	201638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_008321	AAAG	2	8	201649	201656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_008321	ACT	2	6	201665	201670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_008321	TG	3	6	201773	201778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_008321	AATG	2	8	201845	201852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_008321	TACA	2	8	201871	201878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_008321	CTT	2	6	201904	201909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_008321	A	7	7	201968	201974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_008321	GGC	2	6	202016	202021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_008321	GCA	2	6	202047	202052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_008321	GCG	2	6	202080	202085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_008321	AGG	2	6	202175	202180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_008321	CGA	2	6	202255	202260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_008321	GAT	2	6	202280	202285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_008321	GCA	2	6	202329	202334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_008321	GT	3	6	202382	202387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_008321	GAA	2	6	202388	202393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_008321	GGA	2	6	202424	202429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_008321	AGA	2	6	202471	202476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_008321	CAG	2	6	202497	202502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_008321	G	6	6	202644	202649	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_008321	GGA	2	6	202688	202693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_008321	GGC	2	6	202708	202713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_008321	GAA	2	6	202951	202956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_008321	TGC	2	6	203027	203032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_008321	GTC	2	6	203039	203044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_008321	GGA	2	6	203153	203158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_008321	GAC	2	6	203166	203171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_008321	TCA	2	6	203178	203183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_008321	AC	3	6	203204	203209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_008321	TCG	2	6	203271	203276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_008321	AC	3	6	203373	203378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3597	NC_008321	AAG	2	6	203409	203414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_008321	CAC	2	6	203443	203448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_008321	CCT	2	6	203514	203519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_008321	CA	3	6	203604	203609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_008321	AGA	2	6	203622	203627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_008321	GGT	2	6	203690	203695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_008321	CCA	2	6	203712	203717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_008321	GCCT	2	8	203788	203795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_008321	AGG	2	6	203803	203808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_008321	CCA	2	6	203833	203838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_008321	T	6	6	203893	203898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_008321	TAAT	2	8	203933	203940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_008321	ATG	2	6	203944	203949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_008321	A	6	6	203970	203975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_008321	TCT	2	6	204033	204038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_008321	ACG	2	6	204076	204081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_008321	GTA	2	6	204169	204174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_008321	CAG	2	6	204241	204246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_008321	TAGTG	2	10	204275	204284	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_008321	TAG	2	6	204349	204354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_008321	GCGA	2	8	204357	204364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_008321	TGA	2	6	204460	204465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_008321	G	6	6	204506	204511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_008321	TCC	2	6	204516	204521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_008321	CTGA	2	8	204536	204543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3622	NC_008321	GGA	2	6	204826	204831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_008321	CGG	2	6	205048	205053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_008321	CGTC	2	8	205061	205068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_008321	AAC	2	6	205080	205085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_008321	AGC	2	6	205170	205175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_008321	CAT	2	6	205176	205181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_008321	AAAG	2	8	205184	205191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_008321	AGTCG	2	10	205206	205215	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3633	NC_008321	AGGCT	2	10	205535	205544	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3879	NC_008321	GTC	2	6	219389	219394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968537
3880	NC_008321	ACG	2	6	219446	219451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968537
3881	NC_008321	TGC	3	9	219540	219548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968537
3882	NC_008321	TGC	2	6	219570	219575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968537
3883	NC_008321	CAAG	2	8	219627	219634	50 %	0 %	25 %	25 %	113968537
3884	NC_008321	GCA	2	6	219657	219662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968537
3885	NC_008321	ATTC	2	8	219677	219684	25 %	50 %	0 %	25 %	113968537
3886	NC_008321	AAC	2	6	219712	219717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968537
3887	NC_008321	AAAGAG	2	12	219763	219774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968537
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3889	NC_008321	TACATG	2	12	219877	219888	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113968537
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3892	NC_008321	TCG	2	6	220115	220120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968537
3893	NC_008321	GA	3	6	220296	220301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3894	NC_008321	TTA	2	6	220314	220319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968538
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3897	NC_008321	CTGAT	2	10	220384	220393	20 %	40 %	20 %	20 %	113968538
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3902	NC_008321	TCG	2	6	220735	220740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968538
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3907	NC_008321	ATCA	2	8	220922	220929	50 %	25 %	0 %	25 %	113968538
3908	NC_008321	TCG	2	6	220940	220945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968538
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3973	NC_008321	GCC	2	6	224365	224370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968538
3974	NC_008321	AAGA	2	8	224427	224434	75 %	0 %	25 %	0 %	113968538
3975	NC_008321	TGGC	2	8	224503	224510	0 %	25 %	50 %	25 %	113968538
3976	NC_008321	T	6	6	224559	224564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3977	NC_008321	CCA	2	6	224633	224638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3978	NC_008321	CG	3	6	224735	224740	0 %	0 %	50 %	50 %	113968539
3979	NC_008321	GTG	2	6	224793	224798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968539
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3981	NC_008321	ACT	2	6	224816	224821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968539
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3985	NC_008321	TAAG	2	8	225086	225093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3986	NC_008321	TCA	2	6	225233	225238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968540
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3989	NC_008321	AAAG	2	8	225312	225319	75 %	0 %	25 %	0 %	113968540
3990	NC_008321	AGC	2	6	225345	225350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968540
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