MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008321	GCC	2	6	142150	142155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968470
2502	NC_008321	GGA	2	6	142268	142273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968471
2503	NC_008321	TCC	2	6	142294	142299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968471
2504	NC_008321	GAGC	2	8	142364	142371	25 %	0 %	50 %	25 %	113968471
2505	NC_008321	GGCGA	2	10	142374	142383	20 %	0 %	60 %	20 %	113968471
2506	NC_008321	GGT	2	6	142389	142394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968471
2507	NC_008321	AAT	2	6	142444	142449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968471
2508	NC_008321	A	6	6	142477	142482	100 %	0 %	0 %	0 %	113968471
2509	NC_008321	ATA	2	6	142499	142504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968471
2510	NC_008321	AGAT	2	8	142841	142848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_008321	TTC	2	6	142857	142862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_008321	ATT	2	6	142871	142876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_008321	A	6	6	142904	142909	100 %	0 %	0 %	0 %	113968472
2514	NC_008321	TTA	2	6	142910	142915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968472
2515	NC_008321	GCCT	2	8	142919	142926	0 %	25 %	25 %	50 %	113968472
2516	NC_008321	CGA	2	6	142963	142968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968472
2517	NC_008321	GCT	2	6	142976	142981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968472
2518	NC_008321	TAC	2	6	143000	143005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968472
2519	NC_008321	ACTA	2	8	143027	143034	50 %	25 %	0 %	25 %	113968472
2520	NC_008321	AAG	2	6	143048	143053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968472
2521	NC_008321	GAT	2	6	143099	143104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968472
2522	NC_008321	GCT	2	6	143131	143136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968472
2523	NC_008321	GC	3	6	143137	143142	0 %	0 %	50 %	50 %	113968472
2524	NC_008321	GAA	2	6	143174	143179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968472
2525	NC_008321	GAA	2	6	143204	143209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968472
2526	NC_008321	CCG	2	6	143212	143217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968472
2527	NC_008321	AAT	2	6	143237	143242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968472
2528	NC_008321	CTG	2	6	143243	143248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968472
2529	NC_008321	AAG	2	6	143253	143258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968472
2530	NC_008321	CTG	2	6	143282	143287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968472
2531	NC_008321	CCT	2	6	143292	143297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968472
2532	NC_008321	CTA	2	6	143317	143322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_008321	GCCC	2	8	143347	143354	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2534	NC_008321	GAA	2	6	143517	143522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968473
2535	NC_008321	CGG	2	6	143654	143659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968473
2536	NC_008321	CT	3	6	143678	143683	0 %	50 %	0 %	50 %	113968473
2537	NC_008321	CAT	2	6	143689	143694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968473
2538	NC_008321	GC	3	6	143726	143731	0 %	0 %	50 %	50 %	113968473
2539	NC_008321	CCA	2	6	143737	143742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968473
2540	NC_008321	ACT	2	6	143768	143773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968473
2541	NC_008321	GGC	2	6	143794	143799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968473
2542	NC_008321	GC	3	6	143808	143813	0 %	0 %	50 %	50 %	113968473
2543	NC_008321	GGC	2	6	143987	143992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968473
2544	NC_008321	ATT	2	6	144022	144027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968473
2545	NC_008321	TCC	2	6	144063	144068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968473
2546	NC_008321	AAG	2	6	144086	144091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968473
2547	NC_008321	AGC	2	6	144143	144148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968473
2548	NC_008321	GGC	2	6	144186	144191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968473
2549	NC_008321	G	7	7	144208	144214	0 %	0 %	100 %	0 %	113968473
2550	NC_008321	GCA	2	6	144369	144374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968473
2551	NC_008321	TCA	2	6	144554	144559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968474
2552	NC_008321	T	6	6	144561	144566	0 %	100 %	0 %	0 %	113968474
2553	NC_008321	CAG	2	6	144603	144608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968474
2554	NC_008321	GCC	2	6	144628	144633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968474
2555	NC_008321	CGG	2	6	144651	144656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968474
2556	NC_008321	TGC	2	6	144682	144687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968474
2557	NC_008321	CGC	2	6	144741	144746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968474
2558	NC_008321	GTG	2	6	144786	144791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968474
2559	NC_008321	TGA	2	6	144871	144876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968475
2560	NC_008321	CGG	2	6	144892	144897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968475
2561	NC_008321	CG	3	6	144938	144943	0 %	0 %	50 %	50 %	113968475
2562	NC_008321	CAA	2	6	145078	145083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968475
2563	NC_008321	T	6	6	145084	145089	0 %	100 %	0 %	0 %	113968475
2564	NC_008321	GAA	2	6	145091	145096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968475
2565	NC_008321	CAT	2	6	145121	145126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968475
2566	NC_008321	GAC	2	6	145190	145195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968475
2567	NC_008321	GAA	2	6	145289	145294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968475
2568	NC_008321	AGG	2	6	145297	145302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968475
2569	NC_008321	CAT	2	6	145370	145375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968475
2570	NC_008321	GCG	2	6	145460	145465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968475
2571	NC_008321	GTT	2	6	145511	145516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_008321	ACTG	2	8	145532	145539	25 %	25 %	25 %	25 %	113968476
2573	NC_008321	GTT	2	6	145556	145561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968476
2574	NC_008321	ATC	2	6	145603	145608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968476
2575	NC_008321	AGC	2	6	145673	145678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968476
2576	NC_008321	CAC	2	6	145689	145694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968476
2577	NC_008321	GTT	2	6	145727	145732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968476
2578	NC_008321	CGG	2	6	145820	145825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968476
2579	NC_008321	TGGC	2	8	145915	145922	0 %	25 %	50 %	25 %	113968476
2580	NC_008321	GCA	2	6	146051	146056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968476
2581	NC_008321	AG	3	6	146073	146078	50 %	0 %	50 %	0 %	113968476
2582	NC_008321	CGC	2	6	146142	146147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968476
2583	NC_008321	CCG	2	6	146158	146163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968476
2584	NC_008321	ATC	2	6	146170	146175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968476
2585	NC_008321	GGC	2	6	146237	146242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968476
2586	NC_008321	GTT	2	6	146279	146284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968476
2587	NC_008321	CAG	2	6	146375	146380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968477
2588	NC_008321	CTT	2	6	146725	146730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968477
2589	NC_008321	TTTG	2	8	146740	146747	0 %	75 %	25 %	0 %	113968477
2590	NC_008321	ACCG	2	8	146762	146769	25 %	0 %	25 %	50 %	113968477
2591	NC_008321	CGC	2	6	146773	146778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968477
2592	NC_008321	GCTTG	2	10	146799	146808	0 %	40 %	40 %	20 %	113968477
2593	NC_008321	GTC	2	6	146843	146848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968477
2594	NC_008321	TGGA	2	8	146901	146908	25 %	25 %	50 %	0 %	113968477
2595	NC_008321	TCA	2	6	146967	146972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968477
2596	NC_008321	TGG	2	6	147031	147036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968477
2597	NC_008321	GCA	2	6	147097	147102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968477
2598	NC_008321	CAC	2	6	147109	147114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968477
2599	NC_008321	TGAT	2	8	147147	147154	25 %	50 %	25 %	0 %	113968477
2600	NC_008321	GC	3	6	147223	147228	0 %	0 %	50 %	50 %	113968477
2601	NC_008321	TCAGTG	2	12	147301	147312	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113968477
2602	NC_008321	GGC	2	6	147384	147389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968477
2603	NC_008321	TAT	2	6	147599	147604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968477
2604	NC_008321	TGCT	2	8	147614	147621	0 %	50 %	25 %	25 %	113968477
2605	NC_008321	TGC	2	6	147677	147682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_008321	GGC	2	6	147726	147731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_008321	TAAA	2	8	147792	147799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_008321	TTG	2	6	147812	147817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_008321	TGAA	2	8	147913	147920	50 %	25 %	25 %	0 %	113968478
2610	NC_008321	TTC	2	6	147936	147941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968478
2611	NC_008321	GCA	2	6	147999	148004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968478
2612	NC_008321	CGT	2	6	148047	148052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968478
2613	NC_008321	CGG	2	6	148076	148081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968478
2614	NC_008321	CGCAGT	2	12	148111	148122	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113968478
2615	NC_008321	CT	3	6	148127	148132	0 %	50 %	0 %	50 %	113968478
2616	NC_008321	AGC	2	6	148165	148170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968478
2617	NC_008321	ATT	2	6	148222	148227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968478
2618	NC_008321	AGC	2	6	148261	148266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968478
2619	NC_008321	GAA	3	9	148269	148277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968478
2620	NC_008321	AGCC	2	8	148404	148411	25 %	0 %	25 %	50 %	113968478
2621	NC_008321	AGC	2	6	148442	148447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_008321	GCT	2	6	148452	148457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_008321	T	6	6	148457	148462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_008321	CAT	2	6	148494	148499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968479
2625	NC_008321	CTCTT	2	10	148512	148521	0 %	60 %	0 %	40 %	113968479
2626	NC_008321	TCA	2	6	148575	148580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968479
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2628	NC_008321	CAT	2	6	148703	148708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968479
2629	NC_008321	TTC	2	6	148800	148805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968479
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2631	NC_008321	TTC	2	6	149138	149143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968479
2632	NC_008321	CACGG	2	10	149282	149291	20 %	0 %	40 %	40 %	113968479
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2637	NC_008321	AT	3	6	149697	149702	50 %	50 %	0 %	0 %	113968479
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2672	NC_008321	TTAT	2	8	151899	151906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2673	NC_008321	TA	3	6	151907	151912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2674	NC_008321	TAT	2	6	151922	151927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2993	NC_008321	AGC	2	6	170518	170523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968495
2994	NC_008321	GAT	2	6	170531	170536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968495
2995	NC_008321	ACG	2	6	170555	170560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968495
2996	NC_008321	TGC	2	6	170602	170607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968495
2997	NC_008321	CAG	2	6	170615	170620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968495
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2999	NC_008321	ATC	2	6	170679	170684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968495
3000	NC_008321	GTC	2	6	170758	170763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968495

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