MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008321	GCG	2	6	84430	84435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968417
1502	NC_008321	GAT	2	6	84462	84467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968417
1503	NC_008321	ATT	2	6	84478	84483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_008321	TG	3	6	84539	84544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_008321	TCA	2	6	84562	84567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968418
1506	NC_008321	GC	3	6	84636	84641	0 %	0 %	50 %	50 %	113968418
1507	NC_008321	CA	3	6	84745	84750	50 %	0 %	0 %	50 %	113968418
1508	NC_008321	GCA	2	6	84786	84791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968418
1509	NC_008321	TCG	2	6	84827	84832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968418
1510	NC_008321	ATA	2	6	84836	84841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968418
1511	NC_008321	GCG	2	6	84913	84918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968418
1512	NC_008321	GCC	2	6	84965	84970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968418
1513	NC_008321	AT	3	6	85016	85021	50 %	50 %	0 %	0 %	113968418
1514	NC_008321	CTG	2	6	85075	85080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968418
1515	NC_008321	GGT	2	6	85174	85179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968418
1516	NC_008321	CTT	2	6	85410	85415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968419
1517	NC_008321	CA	3	6	85669	85674	50 %	0 %	0 %	50 %	113968419
1518	NC_008321	CGC	2	6	85769	85774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968419
1519	NC_008321	GAC	2	6	85776	85781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968419
1520	NC_008321	TGGT	2	8	85845	85852	0 %	50 %	50 %	0 %	113968419
1521	NC_008321	TGA	2	6	85870	85875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968419
1522	NC_008321	GC	3	6	85894	85899	0 %	0 %	50 %	50 %	113968419
1523	NC_008321	ACT	2	6	86029	86034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968419
1524	NC_008321	GGC	2	6	86076	86081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968419
1525	NC_008321	CTG	2	6	86151	86156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968419
1526	NC_008321	TCG	2	6	86395	86400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968419
1527	NC_008321	GCT	2	6	86486	86491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968419
1528	NC_008321	GCC	2	6	86553	86558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968419
1529	NC_008321	TTA	2	6	86647	86652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968419
1530	NC_008321	TCGC	2	8	86749	86756	0 %	25 %	25 %	50 %	113968419
1531	NC_008321	TGA	2	6	86801	86806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968419
1532	NC_008321	CTAT	2	8	86899	86906	25 %	50 %	0 %	25 %	113968419
1533	NC_008321	GT	3	6	86940	86945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_008321	GT	3	6	86988	86993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_008321	CAG	2	6	87028	87033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968420
1536	NC_008321	GGC	2	6	87086	87091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968420
1537	NC_008321	CG	3	6	87170	87175	0 %	0 %	50 %	50 %	113968420
1538	NC_008321	GCC	2	6	87210	87215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968420
1539	NC_008321	GCG	2	6	87236	87241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968420
1540	NC_008321	AGC	2	6	87312	87317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968420
1541	NC_008321	TGG	2	6	87532	87537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968421
1542	NC_008321	TGCGC	2	10	87580	87589	0 %	20 %	40 %	40 %	113968421
1543	NC_008321	AGC	2	6	87646	87651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968421
1544	NC_008321	TCT	2	6	87654	87659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968421
1545	NC_008321	GCA	2	6	87689	87694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968421
1546	NC_008321	GC	3	6	87725	87730	0 %	0 %	50 %	50 %	113968421
1547	NC_008321	GTT	2	6	87992	87997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968421
1548	NC_008321	TGG	2	6	88183	88188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968421
1549	NC_008321	GCG	2	6	88216	88221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968421
1550	NC_008321	GCAGC	2	10	88223	88232	20 %	0 %	40 %	40 %	113968421
1551	NC_008321	AAC	2	6	88249	88254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968421
1552	NC_008321	TGC	2	6	88350	88355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968422
1553	NC_008321	T	6	6	88364	88369	0 %	100 %	0 %	0 %	113968422
1554	NC_008321	TGGCT	2	10	88408	88417	0 %	40 %	40 %	20 %	113968422
1555	NC_008321	GT	3	6	88422	88427	0 %	50 %	50 %	0 %	113968422
1556	NC_008321	TGGCA	2	10	88503	88512	20 %	20 %	40 %	20 %	113968422
1557	NC_008321	GAGT	2	8	88531	88538	25 %	25 %	50 %	0 %	113968422
1558	NC_008321	GT	3	6	88627	88632	0 %	50 %	50 %	0 %	113968422
1559	NC_008321	TGACC	2	10	88639	88648	20 %	20 %	20 %	40 %	113968422
1560	NC_008321	TTG	2	6	88700	88705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968422
1561	NC_008321	CAT	2	6	88804	88809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968422
1562	NC_008321	GT	3	6	88881	88886	0 %	50 %	50 %	0 %	113968422
1563	NC_008321	T	7	7	88981	88987	0 %	100 %	0 %	0 %	113968422
1564	NC_008321	TGC	2	6	89010	89015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968422
1565	NC_008321	TGC	2	6	89166	89171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968422
1566	NC_008321	CAA	2	6	89228	89233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968422
1567	NC_008321	TGC	2	6	89238	89243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968422
1568	NC_008321	CTG	2	6	89315	89320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968422
1569	NC_008321	TGA	2	6	89331	89336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968422
1570	NC_008321	CGC	2	6	89384	89389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968422
1571	NC_008321	TGG	2	6	89415	89420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968422
1572	NC_008321	TC	3	6	89716	89721	0 %	50 %	0 %	50 %	113968423
1573	NC_008321	CAG	2	6	89749	89754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968423
1574	NC_008321	GGCA	2	8	89828	89835	25 %	0 %	50 %	25 %	113968423
1575	NC_008321	TTGA	2	8	89869	89876	25 %	50 %	25 %	0 %	113968423
1576	NC_008321	GCG	2	6	90031	90036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968423
1577	NC_008321	CGA	2	6	90054	90059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968423
1578	NC_008321	AGC	2	6	90221	90226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968423
1579	NC_008321	CGA	2	6	90246	90251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968423
1580	NC_008321	TGTGC	2	10	90432	90441	0 %	40 %	40 %	20 %	113968423
1581	NC_008321	GGC	2	6	90445	90450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968423
1582	NC_008321	GTG	2	6	90523	90528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968423
1583	NC_008321	CCG	2	6	90581	90586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968423
1584	NC_008321	A	6	6	90595	90600	100 %	0 %	0 %	0 %	113968423
1585	NC_008321	GCC	2	6	90769	90774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968423
1586	NC_008321	TCTT	2	8	90793	90800	0 %	75 %	0 %	25 %	113968423
1587	NC_008321	AACG	2	8	90846	90853	50 %	0 %	25 %	25 %	113968423
1588	NC_008321	TTA	2	6	90981	90986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968423
1589	NC_008321	GAC	2	6	91049	91054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968423
1590	NC_008321	ATTT	2	8	91070	91077	25 %	75 %	0 %	0 %	113968423
1591	NC_008321	ACCG	2	8	91081	91088	25 %	0 %	25 %	50 %	113968423
1592	NC_008321	GTC	2	6	91281	91286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968423
1593	NC_008321	GCT	2	6	91293	91298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968423
1594	NC_008321	AGC	2	6	91328	91333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968423
1595	NC_008321	GCA	2	6	91347	91352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968423
1596	NC_008321	AAT	2	6	91498	91503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968423
1597	NC_008321	T	6	6	91545	91550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_008321	TCG	2	6	91661	91666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968424
1599	NC_008321	CT	3	6	91695	91700	0 %	50 %	0 %	50 %	113968424
1600	NC_008321	CTG	2	6	91717	91722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968424
1601	NC_008321	GCG	2	6	91728	91733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968424
1602	NC_008321	GGC	2	6	91911	91916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968424
1603	NC_008321	AAG	2	6	91921	91926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968424
1604	NC_008321	GAG	2	6	91986	91991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968424
1605	NC_008321	CACC	2	8	92035	92042	25 %	0 %	0 %	75 %	113968424
1606	NC_008321	CGG	2	6	92060	92065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968424
1607	NC_008321	ACC	2	6	92090	92095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968424
1608	NC_008321	CAG	2	6	92097	92102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968424
1609	NC_008321	TGG	2	6	92311	92316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968424
1610	NC_008321	GAA	2	6	92343	92348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968424
1611	NC_008321	AGC	2	6	92352	92357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968424
1612	NC_008321	TGG	2	6	92365	92370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968424
1613	NC_008321	GGC	2	6	92412	92417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968424
1614	NC_008321	GCC	2	6	92529	92534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968424
1615	NC_008321	ATG	2	6	92685	92690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968424
1616	NC_008321	GAT	2	6	92691	92696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968424
1617	NC_008321	ACA	2	6	92722	92727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968424
1618	NC_008321	GAA	2	6	92792	92797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968424
1619	NC_008321	GCA	2	6	92860	92865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968424
1620	NC_008321	GCC	2	6	93148	93153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968424
1621	NC_008321	ATG	2	6	93330	93335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968424
1622	NC_008321	A	6	6	93380	93385	100 %	0 %	0 %	0 %	113968424
1623	NC_008321	CGG	2	6	93431	93436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968424
1624	NC_008321	TCGAT	2	10	93488	93497	20 %	40 %	20 %	20 %	113968424
1625	NC_008321	CGG	2	6	93575	93580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968424
1626	NC_008321	AAG	2	6	93688	93693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968424
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1662	NC_008321	TAGA	2	8	95381	95388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1751	NC_008321	GAAAG	2	10	101235	101244	60 %	0 %	40 %	0 %	113968437
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1754	NC_008321	ACA	2	6	101457	101462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968437
1755	NC_008321	GA	3	6	101493	101498	50 %	0 %	50 %	0 %	113968437
1756	NC_008321	A	6	6	101584	101589	100 %	0 %	0 %	0 %	113968437
1757	NC_008321	GTT	2	6	101652	101657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968437
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1760	NC_008321	TGA	2	6	101709	101714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968437
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1847	NC_008321	AATT	2	8	106892	106899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1848	NC_008321	TAA	2	6	106952	106957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1870	NC_008321	TA	3	6	108295	108300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1871	NC_008321	GT	3	6	108355	108360	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1872	NC_008321	TACC	2	8	108364	108371	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1873	NC_008321	AT	3	6	108442	108447	50 %	50 %	0 %	0 %	113968443
1874	NC_008321	GAA	2	6	108476	108481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968443
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2000	NC_008321	AC	3	6	115785	115790	50 %	0 %	0 %	50 %	113968447

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