MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008321	TA	3	6	57519	57524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008321	ATT	2	6	57544	57549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008321	GTT	2	6	57553	57558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008321	CAA	2	6	57614	57619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_008321	AGTTG	2	10	57639	57648	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008321	TTC	2	6	57719	57724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_008321	AAC	2	6	57766	57771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_008321	ACT	2	6	57796	57801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_008321	GAAAG	2	10	57857	57866	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008321	GGC	2	6	57872	57877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_008321	TTC	2	6	57887	57892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_008321	TGA	2	6	57896	57901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008321	CTT	2	6	57937	57942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_008321	ATA	2	6	57972	57977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008321	AGG	2	6	58007	58012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008321	ATTGA	2	10	58047	58056	40 %	40 %	20 %	0 %	113968395
1017	NC_008321	T	6	6	58077	58082	0 %	100 %	0 %	0 %	113968395
1018	NC_008321	TCT	2	6	58089	58094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968395
1019	NC_008321	T	6	6	58169	58174	0 %	100 %	0 %	0 %	113968395
1020	NC_008321	A	7	7	58181	58187	100 %	0 %	0 %	0 %	113968395
1021	NC_008321	T	8	8	58292	58299	0 %	100 %	0 %	0 %	113968395
1022	NC_008321	CTA	2	6	58300	58305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968395
1023	NC_008321	AG	3	6	58317	58322	50 %	0 %	50 %	0 %	113968395
1024	NC_008321	TTGT	2	8	58323	58330	0 %	75 %	25 %	0 %	113968395
1025	NC_008321	TGA	2	6	58361	58366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968395
1026	NC_008321	GTT	2	6	58395	58400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968395
1027	NC_008321	TATG	2	8	58497	58504	25 %	50 %	25 %	0 %	113968395
1028	NC_008321	TGGCA	2	10	58540	58549	20 %	20 %	40 %	20 %	113968395
1029	NC_008321	GCA	3	9	58547	58555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968395
1030	NC_008321	CTC	2	6	58607	58612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968395
1031	NC_008321	AATG	2	8	58620	58627	50 %	25 %	25 %	0 %	113968395
1032	NC_008321	CAA	2	6	58639	58644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968395
1033	NC_008321	TTC	2	6	58670	58675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968395
1034	NC_008321	ACA	2	6	58730	58735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968395
1035	NC_008321	ATT	2	6	58740	58745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968395
1036	NC_008321	TAC	2	6	58799	58804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968395
1037	NC_008321	GCA	2	6	58827	58832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968395
1038	NC_008321	ATGGTG	2	12	58873	58884	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	113968395
1039	NC_008321	CTC	2	6	58930	58935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968395
1040	NC_008321	AGG	2	6	58940	58945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968395
1041	NC_008321	GAT	2	6	58971	58976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968395
1042	NC_008321	GAT	2	6	59001	59006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968395
1043	NC_008321	CA	3	6	59039	59044	50 %	0 %	0 %	50 %	113968395
1044	NC_008321	ATA	2	6	59140	59145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968395
1045	NC_008321	CAA	2	6	59146	59151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968395
1046	NC_008321	ATT	2	6	59166	59171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968395
1047	NC_008321	GCT	2	6	59172	59177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968395
1048	NC_008321	T	7	7	59210	59216	0 %	100 %	0 %	0 %	113968395
1049	NC_008321	GGAA	2	8	59270	59277	50 %	0 %	50 %	0 %	113968395
1050	NC_008321	GAGC	2	8	59366	59373	25 %	0 %	50 %	25 %	113968395
1051	NC_008321	TAT	2	6	59380	59385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968395
1052	NC_008321	TGTTT	2	10	59483	59492	0 %	80 %	20 %	0 %	113968395
1053	NC_008321	ACA	2	6	59496	59501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968395
1054	NC_008321	T	6	6	59524	59529	0 %	100 %	0 %	0 %	113968395
1055	NC_008321	TGT	2	6	59534	59539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968395
1056	NC_008321	TAC	2	6	59572	59577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968395
1057	NC_008321	ATAA	2	8	59623	59630	75 %	25 %	0 %	0 %	113968395
1058	NC_008321	AG	3	6	59665	59670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008321	TA	3	6	59683	59688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008321	ATT	3	9	59739	59747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008321	T	6	6	59875	59880	0 %	100 %	0 %	0 %	113968396
1062	NC_008321	CAT	2	6	59937	59942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968396
1063	NC_008321	GAT	3	9	59946	59954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968396
1064	NC_008321	AGTTA	2	10	59970	59979	40 %	40 %	20 %	0 %	113968396
1065	NC_008321	GCCA	2	8	60082	60089	25 %	0 %	25 %	50 %	113968396
1066	NC_008321	GAT	2	6	60105	60110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968396
1067	NC_008321	GCC	3	9	60258	60266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968396
1068	NC_008321	GTT	2	6	60417	60422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968396
1069	NC_008321	CACGGC	2	12	60447	60458	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	113968396
1070	NC_008321	ATC	2	6	60481	60486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968396
1071	NC_008321	GCC	2	6	60558	60563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968396
1072	NC_008321	AATA	2	8	60567	60574	75 %	25 %	0 %	0 %	113968396
1073	NC_008321	TTA	2	6	60652	60657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968396
1074	NC_008321	AAG	2	6	60676	60681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968396
1075	NC_008321	CGC	2	6	60713	60718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968396
1076	NC_008321	CTT	2	6	60827	60832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968396
1077	NC_008321	TGC	2	6	60844	60849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968396
1078	NC_008321	TCA	2	6	60899	60904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968396
1079	NC_008321	GCC	2	6	60912	60917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968396
1080	NC_008321	CGA	2	6	60977	60982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968396
1081	NC_008321	CCG	2	6	61004	61009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968396
1082	NC_008321	AAGC	2	8	61071	61078	50 %	0 %	25 %	25 %	113968396
1083	NC_008321	CAG	2	6	61095	61100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968396
1084	NC_008321	GCG	2	6	61127	61132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968396
1085	NC_008321	T	6	6	61143	61148	0 %	100 %	0 %	0 %	113968396
1086	NC_008321	GT	3	6	61160	61165	0 %	50 %	50 %	0 %	113968396
1087	NC_008321	TG	3	6	61267	61272	0 %	50 %	50 %	0 %	113968397
1088	NC_008321	GTGCT	2	10	61379	61388	0 %	40 %	40 %	20 %	113968397
1089	NC_008321	GTG	2	6	61418	61423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968397
1090	NC_008321	CAA	2	6	61452	61457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968397
1091	NC_008321	TCC	2	6	61535	61540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968397
1092	NC_008321	AAT	2	6	61549	61554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968397
1093	NC_008321	TATGG	2	10	61579	61588	20 %	40 %	40 %	0 %	113968397
1094	NC_008321	CAG	2	6	61654	61659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968397
1095	NC_008321	GGGC	2	8	61947	61954	0 %	0 %	75 %	25 %	113968398
1096	NC_008321	GTT	3	9	62000	62008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968398
1097	NC_008321	GCA	2	6	62099	62104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968398
1098	NC_008321	TGGG	2	8	62130	62137	0 %	25 %	75 %	0 %	113968398
1099	NC_008321	CTT	2	6	62166	62171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968398
1100	NC_008321	CAGC	2	8	62196	62203	25 %	0 %	25 %	50 %	113968398
1101	NC_008321	GCT	2	6	62211	62216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968398
1102	NC_008321	GCA	2	6	62243	62248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968398
1103	NC_008321	T	6	6	62369	62374	0 %	100 %	0 %	0 %	113968398
1104	NC_008321	TCC	2	6	62377	62382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968398
1105	NC_008321	CTG	2	6	62421	62426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968398
1106	NC_008321	CCATCG	2	12	62452	62463	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113968398
1107	NC_008321	TGG	2	6	62497	62502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968398
1108	NC_008321	TGG	2	6	62534	62539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968398
1109	NC_008321	TCA	2	6	62602	62607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968398
1110	NC_008321	CCA	2	6	62609	62614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968398
1111	NC_008321	GCC	2	6	62638	62643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968399
1112	NC_008321	TGC	2	6	62705	62710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968399
1113	NC_008321	TAA	2	6	62723	62728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968399
1114	NC_008321	GCA	2	6	62858	62863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968399
1115	NC_008321	GTT	2	6	62864	62869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968399
1116	NC_008321	TCAA	2	8	62953	62960	50 %	25 %	0 %	25 %	113968399
1117	NC_008321	AT	3	6	63133	63138	50 %	50 %	0 %	0 %	113968399
1118	NC_008321	CGG	3	9	63158	63166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968399
1119	NC_008321	CTC	2	6	63180	63185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968399
1120	NC_008321	GCG	2	6	63254	63259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968399
1121	NC_008321	CTG	3	9	63321	63329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968399
1122	NC_008321	GCG	2	6	63330	63335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968399
1123	NC_008321	TGC	2	6	63353	63358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968399
1124	NC_008321	GCG	2	6	63431	63436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968399
1125	NC_008321	A	6	6	63445	63450	100 %	0 %	0 %	0 %	113968399
1126	NC_008321	ATCA	2	8	63573	63580	50 %	25 %	0 %	25 %	113968399
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1128	NC_008321	TGCG	2	8	63634	63641	0 %	25 %	50 %	25 %	113968399
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