MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_008321	GCTG	2	8	586030	586037	0 %	25 %	50 %	25 %	113968849
10502	NC_008321	CGC	2	6	586057	586062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968849
10503	NC_008321	AC	3	6	586221	586226	50 %	0 %	0 %	50 %	113968849
10504	NC_008321	CGT	2	6	586288	586293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968849
10505	NC_008321	TCA	2	6	586333	586338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968849
10506	NC_008321	TCA	2	6	586356	586361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_008321	TGT	2	6	586364	586369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_008321	GGC	2	6	586395	586400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_008321	GTC	2	6	586462	586467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968850
10510	NC_008321	GGTT	2	8	586545	586552	0 %	50 %	50 %	0 %	113968850
10511	NC_008321	TGG	2	6	586569	586574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968850
10512	NC_008321	ATC	2	6	586649	586654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968850
10513	NC_008321	GGT	2	6	586681	586686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968850
10514	NC_008321	TCG	3	9	586727	586735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968850
10515	NC_008321	ACC	2	6	586736	586741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968850
10516	NC_008321	AGGA	2	8	586772	586779	50 %	0 %	50 %	0 %	113968850
10517	NC_008321	CAT	2	6	586789	586794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968850
10518	NC_008321	GGC	2	6	586865	586870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968850
10519	NC_008321	AAT	2	6	586882	586887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968850
10520	NC_008321	GTA	2	6	587053	587058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968850
10521	NC_008321	CTT	2	6	587082	587087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968850
10522	NC_008321	TCG	2	6	587096	587101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968850
10523	NC_008321	GAT	2	6	587122	587127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968850
10524	NC_008321	GCT	2	6	587131	587136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968850
10525	NC_008321	CGC	2	6	587187	587192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968850
10526	NC_008321	GCA	2	6	587193	587198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968850
10527	NC_008321	ACC	2	6	587282	587287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968850
10528	NC_008321	CCA	2	6	587342	587347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968850
10529	NC_008321	CAGC	2	8	587356	587363	25 %	0 %	25 %	50 %	113968850
10530	NC_008321	GGC	2	6	587573	587578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968850
10531	NC_008321	GCTT	2	8	587588	587595	0 %	50 %	25 %	25 %	113968850
10532	NC_008321	GTG	2	6	587634	587639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968850
10533	NC_008321	CAG	2	6	587662	587667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968850
10534	NC_008321	TCT	2	6	587696	587701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968850
10535	NC_008321	GAT	2	6	587892	587897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968850
10536	NC_008321	GC	3	6	587962	587967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10537	NC_008321	CT	3	6	588093	588098	0 %	50 %	0 %	50 %	113968851
10538	NC_008321	CTTCAA	2	12	588123	588134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968851
10539	NC_008321	GGC	3	9	588236	588244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968851
10540	NC_008321	GC	3	6	588243	588248	0 %	0 %	50 %	50 %	113968851
10541	NC_008321	AAT	2	6	588303	588308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968851
10542	NC_008321	TAT	2	6	588348	588353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968851
10543	NC_008321	TTA	2	6	588359	588364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968851
10544	NC_008321	ATG	2	6	588529	588534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968851
10545	NC_008321	GC	3	6	588723	588728	0 %	0 %	50 %	50 %	113968851
10546	NC_008321	GT	3	6	588730	588735	0 %	50 %	50 %	0 %	113968851
10547	NC_008321	TGT	2	6	588858	588863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_008321	T	7	7	588902	588908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_008321	AGC	2	6	588982	588987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968852
10550	NC_008321	GC	3	6	588986	588991	0 %	0 %	50 %	50 %	113968852
10551	NC_008321	CAC	2	6	589035	589040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968852
10552	NC_008321	GCC	2	6	589048	589053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968852
10553	NC_008321	GTG	3	9	589138	589146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968852
10554	NC_008321	CAT	2	6	589155	589160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968852
10555	NC_008321	GCG	2	6	589185	589190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968852
10556	NC_008321	GCC	2	6	589210	589215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968852
10557	NC_008321	ATG	2	6	589216	589221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968852
10558	NC_008321	TTGG	2	8	589263	589270	0 %	50 %	50 %	0 %	113968852
10559	NC_008321	GGC	2	6	589332	589337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968852
10560	NC_008321	C	6	6	589348	589353	0 %	0 %	0 %	100 %	113968852
10561	NC_008321	ATT	2	6	589480	589485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968852
10562	NC_008321	GCC	2	6	589486	589491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968852
10563	NC_008321	CTG	2	6	589496	589501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968852
10564	NC_008321	A	6	6	589555	589560	100 %	0 %	0 %	0 %	113968852
10565	NC_008321	GAA	2	6	589575	589580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968852
10566	NC_008321	TG	3	6	589636	589641	0 %	50 %	50 %	0 %	113968852
10567	NC_008321	TGA	2	6	589703	589708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968852
10568	NC_008321	GCG	2	6	589759	589764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968852
10569	NC_008321	GGC	3	9	589779	589787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968852
10570	NC_008321	CGC	2	6	590043	590048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968852
10571	NC_008321	GGT	2	6	590080	590085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968852
10572	NC_008321	TGG	2	6	590095	590100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968852
10573	NC_008321	CGC	2	6	590119	590124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968852
10574	NC_008321	GCC	2	6	590192	590197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10575	NC_008321	CTT	2	6	590208	590213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968853
10576	NC_008321	CGG	2	6	590295	590300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968853
10577	NC_008321	ACT	2	6	590332	590337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968853
10578	NC_008321	CCG	2	6	590360	590365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968853
10579	NC_008321	GGC	2	6	590446	590451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968853
10580	NC_008321	GGC	2	6	590476	590481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968853
10581	NC_008321	GCG	2	6	590486	590491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968853
10582	NC_008321	TTG	2	6	590521	590526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968853
10583	NC_008321	CAG	2	6	590554	590559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968853
10584	NC_008321	CAG	2	6	590584	590589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968853
10585	NC_008321	GGC	2	6	590839	590844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968853
10586	NC_008321	ATC	2	6	590885	590890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968853
10587	NC_008321	GT	3	6	591051	591056	0 %	50 %	50 %	0 %	113968854
10588	NC_008321	CGC	2	6	591057	591062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968854
10589	NC_008321	CCA	2	6	591129	591134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968854
10590	NC_008321	CAGG	2	8	591165	591172	25 %	0 %	50 %	25 %	113968854
10591	NC_008321	AGA	2	6	591208	591213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968854
10592	NC_008321	GAT	2	6	591222	591227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968854
10593	NC_008321	GC	3	6	591228	591233	0 %	0 %	50 %	50 %	113968854
10594	NC_008321	T	6	6	591343	591348	0 %	100 %	0 %	0 %	113968854
10595	NC_008321	CGC	3	9	591428	591436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968855
10596	NC_008321	GTG	2	6	591506	591511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968855
10597	NC_008321	AAG	2	6	591555	591560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968855
10598	NC_008321	ATC	2	6	591633	591638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968855
10599	NC_008321	GTTCAA	2	12	591697	591708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113968855
10600	NC_008321	CTG	2	6	591712	591717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968855
10601	NC_008321	TGA	2	6	591762	591767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968855
10602	NC_008321	CGG	2	6	591786	591791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968855
10603	NC_008321	AGG	2	6	591795	591800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968855
10604	NC_008321	TGA	2	6	591817	591822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968855
10605	NC_008321	TTAAC	2	10	591884	591893	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10606	NC_008321	GTT	2	6	591984	591989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968856
10607	NC_008321	T	6	6	591988	591993	0 %	100 %	0 %	0 %	113968856
10608	NC_008321	GTTTG	2	10	592005	592014	0 %	60 %	40 %	0 %	113968856
10609	NC_008321	GCT	2	6	592015	592020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968856
10610	NC_008321	CG	3	6	592027	592032	0 %	0 %	50 %	50 %	113968856
10611	NC_008321	T	6	6	592045	592050	0 %	100 %	0 %	0 %	113968856
10612	NC_008321	GAT	2	6	592170	592175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968856
10613	NC_008321	GCA	2	6	592185	592190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968856
10614	NC_008321	GCT	2	6	592194	592199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968856
10615	NC_008321	GCG	2	6	592247	592252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968856
10616	NC_008321	ATC	2	6	592431	592436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10617	NC_008321	TTATG	2	10	592503	592512	20 %	60 %	20 %	0 %	113968857
10618	NC_008321	TCA	2	6	592568	592573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968857
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10620	NC_008321	TGG	2	6	592741	592746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968857
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10984	NC_008321	GAT	2	6	612849	612854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10985	NC_008321	ATC	2	6	612890	612895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10986	NC_008321	TTAA	2	8	612939	612946	50 %	50 %	0 %	0 %	113968874
10987	NC_008321	CAG	2	6	613241	613246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968874
10988	NC_008321	AAT	2	6	613269	613274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968874
10989	NC_008321	AGC	2	6	613285	613290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968874
10990	NC_008321	CTG	2	6	613320	613325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968874
10991	NC_008321	GTG	2	6	613342	613347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968874
10992	NC_008321	GGC	2	6	613400	613405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968874
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10994	NC_008321	CG	3	6	613419	613424	0 %	0 %	50 %	50 %	113968874
10995	NC_008321	TGA	2	6	613444	613449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968874
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