MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008321	CGC	2	6	556260	556265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968829
10002	NC_008321	TGC	2	6	556271	556276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968829
10003	NC_008321	GGGAT	2	10	556310	556319	20 %	20 %	60 %	0 %	113968829
10004	NC_008321	GTTT	2	8	556335	556342	0 %	75 %	25 %	0 %	113968829
10005	NC_008321	CAG	2	6	556372	556377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968829
10006	NC_008321	GAGC	2	8	556395	556402	25 %	0 %	50 %	25 %	113968829
10007	NC_008321	GCAGC	2	10	556749	556758	20 %	0 %	40 %	40 %	113968830
10008	NC_008321	AGG	2	6	556790	556795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968830
10009	NC_008321	CCT	2	6	556811	556816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968830
10010	NC_008321	CGC	2	6	556838	556843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968830
10011	NC_008321	TTTG	2	8	556956	556963	0 %	75 %	25 %	0 %	113968831
10012	NC_008321	TTTG	2	8	556978	556985	0 %	75 %	25 %	0 %	113968831
10013	NC_008321	CAT	2	6	557015	557020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968831
10014	NC_008321	TGGA	2	8	557192	557199	25 %	25 %	50 %	0 %	113968831
10015	NC_008321	TAC	2	6	557276	557281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968831
10016	NC_008321	GCA	2	6	557347	557352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968831
10017	NC_008321	GC	3	6	557439	557444	0 %	0 %	50 %	50 %	113968831
10018	NC_008321	TGT	2	6	557450	557455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968831
10019	NC_008321	CAG	2	6	557517	557522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968831
10020	NC_008321	AAC	2	6	557529	557534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968831
10021	NC_008321	AG	3	6	557560	557565	50 %	0 %	50 %	0 %	113968831
10022	NC_008321	GGTTTG	2	12	557573	557584	0 %	50 %	50 %	0 %	113968831
10023	NC_008321	AAGGC	2	10	557623	557632	40 %	0 %	40 %	20 %	113968831
10024	NC_008321	CG	3	6	557653	557658	0 %	0 %	50 %	50 %	113968831
10025	NC_008321	CCGA	2	8	557748	557755	25 %	0 %	25 %	50 %	113968831
10026	NC_008321	CAG	2	6	557804	557809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968831
10027	NC_008321	ATG	2	6	557838	557843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968831
10028	NC_008321	CAG	2	6	557924	557929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968831
10029	NC_008321	TGG	2	6	557977	557982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968831
10030	NC_008321	GTG	2	6	558081	558086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968831
10031	NC_008321	AAG	2	6	558160	558165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968831
10032	NC_008321	ACC	2	6	558187	558192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968831
10033	NC_008321	CCCAA	2	10	558199	558208	40 %	0 %	0 %	60 %	113968831
10034	NC_008321	CCA	2	6	558221	558226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968831
10035	NC_008321	CAG	2	6	558320	558325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968831
10036	NC_008321	GCA	2	6	558339	558344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968831
10037	NC_008321	GGTG	2	8	558384	558391	0 %	25 %	75 %	0 %	113968831
10038	NC_008321	CGA	2	6	558583	558588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968831
10039	NC_008321	GGC	2	6	558601	558606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968831
10040	NC_008321	TGA	2	6	558610	558615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968831
10041	NC_008321	TAA	2	6	558754	558759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968831
10042	NC_008321	ATAA	2	8	558764	558771	75 %	25 %	0 %	0 %	113968831
10043	NC_008321	AAT	2	6	558813	558818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968831
10044	NC_008321	TAAA	2	8	558836	558843	75 %	25 %	0 %	0 %	113968831
10045	NC_008321	TGA	2	6	558852	558857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968831
10046	NC_008321	AAT	2	6	558885	558890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968831
10047	NC_008321	ATG	2	6	558906	558911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968831
10048	NC_008321	ATT	2	6	559064	559069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_008321	T	6	6	559068	559073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_008321	GACT	2	8	559133	559140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10051	NC_008321	T	6	6	559235	559240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_008321	A	6	6	559258	559263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_008321	TTAA	2	8	559297	559304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_008321	GTTTT	2	10	559312	559321	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_008321	GCT	2	6	559396	559401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_008321	TCA	2	6	559402	559407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_008321	GCC	2	6	559409	559414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10058	NC_008321	ATG	2	6	559493	559498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968832
10059	NC_008321	TAA	2	6	559615	559620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968832
10060	NC_008321	ACG	2	6	559776	559781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968832
10061	NC_008321	GTG	2	6	559821	559826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968832
10062	NC_008321	GGT	2	6	559841	559846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968832
10063	NC_008321	AAG	2	6	559875	559880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968832
10064	NC_008321	GAA	2	6	560113	560118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968832
10065	NC_008321	CCG	2	6	560166	560171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968832
10066	NC_008321	CCTA	2	8	560226	560233	25 %	25 %	0 %	50 %	113968832
10067	NC_008321	TGG	2	6	560296	560301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968832
10068	NC_008321	CAA	2	6	560359	560364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968832
10069	NC_008321	AC	3	6	560575	560580	50 %	0 %	0 %	50 %	113968832
10070	NC_008321	GGT	2	6	560621	560626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968832
10071	NC_008321	GGT	2	6	560636	560641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968832
10072	NC_008321	TGG	3	9	560644	560652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968832
10073	NC_008321	TTG	2	6	560694	560699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968832
10074	NC_008321	TCT	2	6	560765	560770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968832
10075	NC_008321	GTT	2	6	560835	560840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968832
10076	NC_008321	ATC	2	6	560906	560911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968832
10077	NC_008321	ACTG	2	8	560921	560928	25 %	25 %	25 %	25 %	113968832
10078	NC_008321	CA	3	6	561078	561083	50 %	0 %	0 %	50 %	113968832
10079	NC_008321	ATG	2	6	561243	561248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968832
10080	NC_008321	TGG	2	6	561249	561254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968832
10081	NC_008321	AGA	2	6	561436	561441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968832
10082	NC_008321	GTT	2	6	561482	561487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968832
10083	NC_008321	CAAGCC	2	12	561575	561586	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	113968832
10084	NC_008321	ATG	2	6	561684	561689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968833
10085	NC_008321	GGC	2	6	561717	561722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968833
10086	NC_008321	CGT	2	6	561758	561763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968833
10087	NC_008321	TGG	3	9	561767	561775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968833
10088	NC_008321	T	6	6	561869	561874	0 %	100 %	0 %	0 %	113968833
10089	NC_008321	AAC	2	6	562109	562114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968833
10090	NC_008321	AAAT	2	8	562133	562140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_008321	CTT	2	6	562240	562245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968834
10092	NC_008321	A	6	6	562253	562258	100 %	0 %	0 %	0 %	113968834
10093	NC_008321	TTGT	2	8	562284	562291	0 %	75 %	25 %	0 %	113968834
10094	NC_008321	TGC	2	6	562307	562312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968834
10095	NC_008321	GTG	2	6	562434	562439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968834
10096	NC_008321	A	6	6	562461	562466	100 %	0 %	0 %	0 %	113968834
10097	NC_008321	CAG	2	6	562467	562472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968834
10098	NC_008321	GAA	2	6	562485	562490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968834
10099	NC_008321	AAG	2	6	562605	562610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968834
10100	NC_008321	AACCC	2	10	562678	562687	40 %	0 %	0 %	60 %	113968834
10101	NC_008321	TGA	2	6	562783	562788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968834
10102	NC_008321	A	6	6	562959	562964	100 %	0 %	0 %	0 %	113968834
10103	NC_008321	ATG	2	6	562974	562979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968834
10104	NC_008321	ATG	2	6	562983	562988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968834
10105	NC_008321	AGTG	2	8	563024	563031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_008321	GCA	2	6	563127	563132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968835
10107	NC_008321	CG	3	6	563133	563138	0 %	0 %	50 %	50 %	113968835
10108	NC_008321	TGG	2	6	563159	563164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968835
10109	NC_008321	CTGTG	2	10	563192	563201	0 %	40 %	40 %	20 %	113968835
10110	NC_008321	GCT	2	6	563208	563213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968835
10111	NC_008321	AAC	2	6	563342	563347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968835
10112	NC_008321	TGG	2	6	563444	563449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968835
10113	NC_008321	GGA	2	6	563451	563456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968835
10114	NC_008321	GCC	2	6	563504	563509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968835
10115	NC_008321	TGAA	2	8	563720	563727	50 %	25 %	25 %	0 %	113968835
10116	NC_008321	AACGAT	2	12	563771	563782	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10117	NC_008321	ATAA	2	8	563783	563790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_008321	GGA	2	6	563816	563821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_008321	TGT	2	6	563822	563827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968836
10120	NC_008321	AG	3	6	563840	563845	50 %	0 %	50 %	0 %	113968836
10121	NC_008321	AGA	2	6	563915	563920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968836
10122	NC_008321	GT	3	6	563972	563977	0 %	50 %	50 %	0 %	113968836
10123	NC_008321	AGC	2	6	564052	564057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968836
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10126	NC_008321	GCG	2	6	564189	564194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968836
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10128	NC_008321	CCGAG	2	10	564487	564496	20 %	0 %	40 %	40 %	113968836
10129	NC_008321	CTTGGC	2	12	564582	564593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968837
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10132	NC_008321	GCGCTG	2	12	564647	564658	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	113968837
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10234	NC_008321	CAT	2	6	570222	570227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968842
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10239	NC_008321	AT	4	8	570386	570393	50 %	50 %	0 %	0 %	113968842
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10241	NC_008321	GCT	2	6	570411	570416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968842
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10245	NC_008321	CGG	2	6	570731	570736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968842
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10363	NC_008321	GCGGGT	2	12	578085	578096	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	113968845
10364	NC_008321	GATG	2	8	578135	578142	25 %	25 %	50 %	0 %	113968845
10365	NC_008321	GGT	2	6	578181	578186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968845
10366	NC_008321	A	6	6	578233	578238	100 %	0 %	0 %	0 %	113968845
10367	NC_008321	AGA	2	6	578306	578311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968845
10368	NC_008321	CTTC	2	8	578338	578345	0 %	50 %	0 %	50 %	113968845
10369	NC_008321	ATT	2	6	578373	578378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968845
10370	NC_008321	AGTGC	2	10	578445	578454	20 %	20 %	40 %	20 %	113968845
10371	NC_008321	TTC	2	6	578469	578474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968845
10372	NC_008321	AAG	2	6	578494	578499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968845
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10375	NC_008321	TGG	2	6	578611	578616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968845
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10379	NC_008321	ACT	2	6	578992	578997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968845
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10382	NC_008321	TCG	2	6	579290	579295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968845
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10385	NC_008321	TAACT	2	10	579572	579581	40 %	40 %	0 %	20 %	113968845
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10390	NC_008321	CAAC	2	8	579758	579765	50 %	0 %	0 %	50 %	113968845
10391	NC_008321	TCG	2	6	579908	579913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968845
10392	NC_008321	CTT	2	6	579919	579924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968845
10393	NC_008321	TGC	2	6	579956	579961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968845
10394	NC_008321	TCT	2	6	579983	579988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968845
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10423	NC_008321	ATT	2	6	581922	581927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10424	NC_008321	GTT	2	6	581933	581938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10425	NC_008321	AAG	2	6	581955	581960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10426	NC_008321	TGT	2	6	581992	581997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10463	NC_008321	ATA	2	6	583989	583994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10464	NC_008321	TTTA	2	8	584001	584008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10465	NC_008321	CAT	2	6	584024	584029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10466	NC_008321	TG	3	6	584034	584039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10467	NC_008321	A	6	6	584045	584050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10468	NC_008321	GGC	2	6	584109	584114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10469	NC_008321	GCC	2	6	584121	584126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10470	NC_008321	GAT	2	6	584138	584143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10472	NC_008321	A	6	6	584257	584262	100 %	0 %	0 %	0 %	113968848
10473	NC_008321	AG	3	6	584408	584413	50 %	0 %	50 %	0 %	113968848
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10475	NC_008321	ATG	2	6	584496	584501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968848
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10480	NC_008321	CCCT	2	8	584670	584677	0 %	25 %	0 %	75 %	113968848
10481	NC_008321	TGCG	2	8	584784	584791	0 %	25 %	50 %	25 %	113968848
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10484	NC_008321	GCG	2	6	585139	585144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968848
10485	NC_008321	CAAA	2	8	585174	585181	75 %	0 %	0 %	25 %	113968848
10486	NC_008321	GCT	2	6	585202	585207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968848
10487	NC_008321	GA	3	6	585324	585329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10488	NC_008321	CGGA	2	8	585350	585357	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10489	NC_008321	AG	3	6	585393	585398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10490	NC_008321	TACG	2	8	585426	585433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10491	NC_008321	AT	3	6	585484	585489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10492	NC_008321	TG	3	6	585498	585503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10493	NC_008321	AAAAC	2	10	585553	585562	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10494	NC_008321	GCG	2	6	585711	585716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968849
10495	NC_008321	CTTG	2	8	585775	585782	0 %	50 %	25 %	25 %	113968849
10496	NC_008321	CTT	2	6	585829	585834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968849
10497	NC_008321	CGT	2	6	585868	585873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968849
10498	NC_008321	GGCG	2	8	585880	585887	0 %	0 %	75 %	25 %	113968849
10499	NC_008321	GGT	2	6	585935	585940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968849
10500	NC_008321	TTG	2	6	585965	585970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968849

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