MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008321	CAA	2	6	29182	29187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968371
502	NC_008321	CAG	2	6	29201	29206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968371
503	NC_008321	GTT	2	6	29252	29257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968371
504	NC_008321	TGC	2	6	29292	29297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968371
505	NC_008321	AGC	2	6	29371	29376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968371
506	NC_008321	TGG	2	6	29455	29460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968371
507	NC_008321	AAG	2	6	29574	29579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968371
508	NC_008321	ATC	2	6	29625	29630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968371
509	NC_008321	CAG	2	6	29642	29647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968371
510	NC_008321	CGC	2	6	29660	29665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968371
511	NC_008321	CGC	2	6	29705	29710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968371
512	NC_008321	C	6	6	29736	29741	0 %	0 %	0 %	100 %	113968371
513	NC_008321	GCA	2	6	29810	29815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968371
514	NC_008321	A	6	6	29840	29845	100 %	0 %	0 %	0 %	113968371
515	NC_008321	TG	3	6	29865	29870	0 %	50 %	50 %	0 %	113968371
516	NC_008321	ACC	2	6	29924	29929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968371
517	NC_008321	AAG	2	6	29937	29942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968371
518	NC_008321	CCG	2	6	29979	29984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968371
519	NC_008321	CAA	2	6	29993	29998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968371
520	NC_008321	TGG	2	6	30061	30066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968371
521	NC_008321	GAA	2	6	30086	30091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968371
522	NC_008321	GGC	2	6	30134	30139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968371
523	NC_008321	GAT	2	6	30394	30399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008321	AGA	3	9	30405	30413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968372
525	NC_008321	CTT	2	6	30525	30530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968372
526	NC_008321	TGG	2	6	30552	30557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968372
527	NC_008321	CGG	2	6	30562	30567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968372
528	NC_008321	CAA	2	6	30594	30599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968372
529	NC_008321	CGG	2	6	30645	30650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968372
530	NC_008321	CGC	2	6	30651	30656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968372
531	NC_008321	TCG	2	6	30717	30722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968372
532	NC_008321	CTG	2	6	30724	30729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968372
533	NC_008321	CGATAT	2	12	30741	30752	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	113968372
534	NC_008321	ATG	2	6	30842	30847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968372
535	NC_008321	TCG	2	6	30857	30862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968372
536	NC_008321	TTC	2	6	30901	30906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968372
537	NC_008321	AGC	2	6	30908	30913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968372
538	NC_008321	CAC	2	6	30933	30938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968372
539	NC_008321	AG	3	6	30967	30972	50 %	0 %	50 %	0 %	113968372
540	NC_008321	ACC	2	6	31057	31062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968372
541	NC_008321	TCA	2	6	31113	31118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968372
542	NC_008321	CG	3	6	31120	31125	0 %	0 %	50 %	50 %	113968372
543	NC_008321	ATA	2	6	31172	31177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968372
544	NC_008321	CGC	2	6	31219	31224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968372
545	NC_008321	GCC	2	6	31288	31293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968372
546	NC_008321	ACC	2	6	31432	31437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968372
547	NC_008321	ATAA	2	8	31475	31482	75 %	25 %	0 %	0 %	113968372
548	NC_008321	GGCA	2	8	31563	31570	25 %	0 %	50 %	25 %	113968372
549	NC_008321	ACG	2	6	31670	31675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968372
550	NC_008321	GTT	2	6	31741	31746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968372
551	NC_008321	CACC	2	8	31749	31756	25 %	0 %	0 %	75 %	113968372
552	NC_008321	TAA	2	6	31856	31861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968373
553	NC_008321	TGT	2	6	31872	31877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968373
554	NC_008321	CTG	2	6	31921	31926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968373
555	NC_008321	GT	3	6	31932	31937	0 %	50 %	50 %	0 %	113968373
556	NC_008321	CAG	2	6	32051	32056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968373
557	NC_008321	TTC	2	6	32089	32094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968373
558	NC_008321	CGG	2	6	32135	32140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968373
559	NC_008321	CCA	2	6	32200	32205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968373
560	NC_008321	TGC	2	6	32428	32433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968373
561	NC_008321	GTC	2	6	32477	32482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968373
562	NC_008321	CAT	2	6	32511	32516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968373
563	NC_008321	CTCA	2	8	32548	32555	25 %	25 %	0 %	50 %	113968373
564	NC_008321	GGC	2	6	32557	32562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968373
565	NC_008321	TTG	2	6	32594	32599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968373
566	NC_008321	TTAA	2	8	32678	32685	50 %	50 %	0 %	0 %	113968373
567	NC_008321	GCG	2	6	32730	32735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968373
568	NC_008321	GCA	2	6	32757	32762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968373
569	NC_008321	GAC	2	6	32770	32775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968373
570	NC_008321	GAC	2	6	32802	32807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968373
571	NC_008321	CGG	2	6	32814	32819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968373
572	NC_008321	GGC	2	6	32830	32835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968373
573	NC_008321	CAA	2	6	32874	32879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968373
574	NC_008321	TGG	2	6	32888	32893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968373
575	NC_008321	AC	3	6	33057	33062	50 %	0 %	0 %	50 %	113968373
576	NC_008321	GCC	2	6	33092	33097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968373
577	NC_008321	TCA	2	6	33111	33116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968373
578	NC_008321	CGC	2	6	33161	33166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968374
579	NC_008321	T	6	6	33198	33203	0 %	100 %	0 %	0 %	113968374
580	NC_008321	AC	3	6	33233	33238	50 %	0 %	0 %	50 %	113968374
581	NC_008321	T	6	6	33264	33269	0 %	100 %	0 %	0 %	113968374
582	NC_008321	ATA	2	6	33280	33285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968374
583	NC_008321	TGC	2	6	33302	33307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968374
584	NC_008321	TGG	2	6	33308	33313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968374
585	NC_008321	CTT	2	6	33395	33400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968374
586	NC_008321	CTT	3	9	33440	33448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968374
587	NC_008321	ATC	3	9	33588	33596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968374
588	NC_008321	CAG	2	6	33618	33623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968374
589	NC_008321	CG	3	6	33696	33701	0 %	0 %	50 %	50 %	113968374
590	NC_008321	CAC	2	6	33780	33785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968374
591	NC_008321	ATA	2	6	33820	33825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968374
592	NC_008321	GGC	2	6	33837	33842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968374
593	NC_008321	TGT	2	6	33896	33901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968374
594	NC_008321	T	6	6	33939	33944	0 %	100 %	0 %	0 %	113968374
595	NC_008321	TGTGA	2	10	33992	34001	20 %	40 %	40 %	0 %	113968374
596	NC_008321	GAT	2	6	34053	34058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968374
597	NC_008321	ACAA	2	8	34319	34326	75 %	0 %	0 %	25 %	113968375
598	NC_008321	AAT	2	6	34359	34364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968375
599	NC_008321	GTT	2	6	34424	34429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968375
600	NC_008321	TGC	2	6	34449	34454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968375
601	NC_008321	ATC	2	6	34494	34499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968375
602	NC_008321	CAG	2	6	34517	34522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968375
603	NC_008321	ACTG	2	8	34641	34648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_008321	ACA	2	6	34716	34721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968376
605	NC_008321	AAG	2	6	34835	34840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968376
606	NC_008321	ATTTA	2	10	34935	34944	40 %	60 %	0 %	0 %	113968376
607	NC_008321	GTAT	2	8	35247	35254	25 %	50 %	25 %	0 %	113968376
608	NC_008321	CTT	2	6	35269	35274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968376
609	NC_008321	CAA	2	6	35275	35280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968376
610	NC_008321	AAG	2	6	35304	35309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968376
611	NC_008321	CTG	2	6	35457	35462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968376
612	NC_008321	TAA	2	6	35614	35619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968376
613	NC_008321	TGG	2	6	35667	35672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968376
614	NC_008321	GTC	2	6	35680	35685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968376
615	NC_008321	CGA	2	6	35797	35802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968376
616	NC_008321	AATT	2	8	35805	35812	50 %	50 %	0 %	0 %	113968376
617	NC_008321	AAT	2	6	35841	35846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968376
618	NC_008321	ACA	2	6	35910	35915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_008321	ATT	2	6	35916	35921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_008321	GAC	2	6	35938	35943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968377
621	NC_008321	TGC	2	6	36033	36038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968377
622	NC_008321	CAG	2	6	36052	36057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968377
623	NC_008321	ACC	2	6	36068	36073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968377
624	NC_008321	GTTT	2	8	36076	36083	0 %	75 %	25 %	0 %	113968377
625	NC_008321	TCC	2	6	36099	36104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968377
626	NC_008321	TCC	2	6	36126	36131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968377
627	NC_008321	TTAT	2	8	36139	36146	25 %	75 %	0 %	0 %	113968377
628	NC_008321	TGT	2	6	36167	36172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968377
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751	NC_008321	CAG	2	6	43206	43211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
752	NC_008321	G	6	6	43353	43358	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
753	NC_008321	GGA	2	6	43397	43402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
754	NC_008321	GGC	2	6	43417	43422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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756	NC_008321	AGA	2	6	43689	43694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
757	NC_008321	TGC	2	6	43736	43741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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759	NC_008321	GGA	2	6	43862	43867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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