MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008321	ATG	2	6	338140	338145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968655
6002	NC_008321	ACTA	2	8	338221	338228	50 %	25 %	0 %	25 %	113968655
6003	NC_008321	GGC	2	6	338230	338235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968655
6004	NC_008321	GT	3	6	338246	338251	0 %	50 %	50 %	0 %	113968655
6005	NC_008321	GT	3	6	338267	338272	0 %	50 %	50 %	0 %	113968655
6006	NC_008321	GCA	2	6	338330	338335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968655
6007	NC_008321	GAT	2	6	338452	338457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968655
6008	NC_008321	TGA	2	6	338504	338509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968655
6009	NC_008321	AAT	2	6	338732	338737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968656
6010	NC_008321	GCC	2	6	338798	338803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968656
6011	NC_008321	GGC	2	6	338815	338820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968656
6012	NC_008321	TCG	2	6	338846	338851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968656
6013	NC_008321	ATG	2	6	338879	338884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968656
6014	NC_008321	GCG	2	6	338956	338961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968656
6015	NC_008321	TGA	2	6	339084	339089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968656
6016	NC_008321	A	6	6	339103	339108	100 %	0 %	0 %	0 %	113968656
6017	NC_008321	ATA	2	6	339154	339159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968656
6018	NC_008321	CAG	2	6	339205	339210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968656
6019	NC_008321	GCGG	2	8	339251	339258	0 %	0 %	75 %	25 %	113968656
6020	NC_008321	CGG	2	6	339375	339380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968656
6021	NC_008321	GCG	2	6	339395	339400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968656
6022	NC_008321	AAG	2	6	339467	339472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968656
6023	NC_008321	CGA	2	6	339477	339482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968656
6024	NC_008321	CGA	2	6	339552	339557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968656
6025	NC_008321	TTG	2	6	339644	339649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968656
6026	NC_008321	GGCAA	2	10	339665	339674	40 %	0 %	40 %	20 %	113968656
6027	NC_008321	T	6	6	339757	339762	0 %	100 %	0 %	0 %	113968656
6028	NC_008321	CTT	2	6	340213	340218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968657
6029	NC_008321	CGG	2	6	340249	340254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968657
6030	NC_008321	GCA	2	6	340303	340308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968657
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6032	NC_008321	TTC	2	6	340319	340324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968657
6033	NC_008321	ACC	2	6	340325	340330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968657
6034	NC_008321	GTG	2	6	340374	340379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968657
6035	NC_008321	GAT	2	6	340457	340462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968657
6036	NC_008321	TGT	2	6	340476	340481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968657
6037	NC_008321	CTT	2	6	340513	340518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968657
6038	NC_008321	CGC	2	6	340562	340567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968657
6039	NC_008321	TCC	2	6	340581	340586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968657
6040	NC_008321	TTC	2	6	340601	340606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968657
6041	NC_008321	GAT	2	6	340628	340633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968657
6042	NC_008321	ATAA	2	8	340687	340694	75 %	25 %	0 %	0 %	113968657
6043	NC_008321	CGA	2	6	340744	340749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968657
6044	NC_008321	GAG	2	6	340763	340768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968657
6045	NC_008321	CAT	2	6	340832	340837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968657
6046	NC_008321	GGC	2	6	340841	340846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968657
6047	NC_008321	GCT	2	6	340850	340855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968657
6048	NC_008321	GC	3	6	340867	340872	0 %	0 %	50 %	50 %	113968657
6049	NC_008321	CAT	2	6	340979	340984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968657
6050	NC_008321	TCA	2	6	341011	341016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968657
6051	NC_008321	CCCG	2	8	341099	341106	0 %	0 %	25 %	75 %	113968657
6052	NC_008321	ATAA	2	8	341154	341161	75 %	25 %	0 %	0 %	113968657
6053	NC_008321	AGC	2	6	341229	341234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968657
6054	NC_008321	TGT	2	6	341254	341259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968657
6055	NC_008321	TGC	2	6	341322	341327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968657
6056	NC_008321	CGC	2	6	341406	341411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968657
6057	NC_008321	TAT	2	6	341668	341673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968657
6058	NC_008321	AGC	2	6	341727	341732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968657
6059	NC_008321	TTA	2	6	341788	341793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_008321	A	7	7	341844	341850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_008321	AAGC	2	8	341928	341935	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6062	NC_008321	TGT	2	6	342181	342186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968658
6063	NC_008321	GGC	2	6	342207	342212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968658
6064	NC_008321	CGGCG	2	10	342223	342232	0 %	0 %	60 %	40 %	113968658
6065	NC_008321	TCA	2	6	342241	342246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968658
6066	NC_008321	CGG	2	6	342261	342266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968658
6067	NC_008321	GCG	2	6	342293	342298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968658
6068	NC_008321	GGCT	2	8	342301	342308	0 %	25 %	50 %	25 %	113968658
6069	NC_008321	TTG	2	6	342372	342377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968658
6070	NC_008321	CAT	2	6	342391	342396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968658
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6072	NC_008321	CCA	2	6	342459	342464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968658
6073	NC_008321	CTGAA	2	10	342499	342508	40 %	20 %	20 %	20 %	113968658
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6110	NC_008321	CCA	2	6	344032	344037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6117	NC_008321	GTG	2	6	344273	344278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968661
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6120	NC_008321	ATTGG	2	10	344569	344578	20 %	40 %	40 %	0 %	113968661
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6246	NC_008321	TAAA	2	8	351481	351488	75 %	25 %	0 %	0 %	113968671
6247	NC_008321	TG	3	6	351496	351501	0 %	50 %	50 %	0 %	113968671
6248	NC_008321	GCT	2	6	351561	351566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968671
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6255	NC_008321	GTC	2	6	352054	352059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6275	NC_008321	GAT	2	6	352800	352805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6276	NC_008321	GCAA	2	8	352833	352840	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6277	NC_008321	TTTTA	2	10	352932	352941	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6366	NC_008321	CAT	2	6	357606	357611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968679
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6369	NC_008321	GTC	2	6	357744	357749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968679
6370	NC_008321	T	7	7	357931	357937	0 %	100 %	0 %	0 %	113968679
6371	NC_008321	TGC	2	6	357947	357952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968679
6372	NC_008321	ACG	2	6	358006	358011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968679
6373	NC_008321	GGC	2	6	358089	358094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968680
6374	NC_008321	GGC	2	6	358113	358118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968680
6375	NC_008321	GCT	2	6	358123	358128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968680
6376	NC_008321	GCG	2	6	358149	358154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968680
6377	NC_008321	CAAT	2	8	358286	358293	50 %	25 %	0 %	25 %	113968680
6378	NC_008321	TGACC	2	10	358316	358325	20 %	20 %	20 %	40 %	113968680
6379	NC_008321	TGA	2	6	358361	358366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968680
6380	NC_008321	ATGA	2	8	358410	358417	50 %	25 %	25 %	0 %	113968680
6381	NC_008321	ATA	2	6	358524	358529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968680
6382	NC_008321	GGC	2	6	358560	358565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968680
6383	NC_008321	CGG	2	6	358571	358576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968680
6384	NC_008321	CTG	2	6	358634	358639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968680
6385	NC_008321	TGA	3	9	358794	358802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6386	NC_008321	T	6	6	358804	358809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6387	NC_008321	GTA	2	6	358835	358840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6388	NC_008321	GCTCC	2	10	358981	358990	0 %	20 %	20 %	60 %	113968681
6389	NC_008321	CTT	2	6	359041	359046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968681
6390	NC_008321	CGG	2	6	359076	359081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968681
6391	NC_008321	TG	3	6	359099	359104	0 %	50 %	50 %	0 %	113968681
6392	NC_008321	A	6	6	359130	359135	100 %	0 %	0 %	0 %	113968681
6393	NC_008321	CTG	2	6	359297	359302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968681
6394	NC_008321	AAT	2	6	359309	359314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968681
6395	NC_008321	ATCA	2	8	359318	359325	50 %	25 %	0 %	25 %	113968681
6396	NC_008321	TTG	2	6	359378	359383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968681
6397	NC_008321	TCGGC	2	10	359392	359401	0 %	20 %	40 %	40 %	113968681
6398	NC_008321	A	6	6	359457	359462	100 %	0 %	0 %	0 %	113968682
6399	NC_008321	TGC	2	6	359475	359480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968682
6400	NC_008321	TCA	2	6	359502	359507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968682
6401	NC_008321	CAT	2	6	359586	359591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968682
6402	NC_008321	GTG	2	6	359715	359720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968682
6403	NC_008321	CAT	2	6	359763	359768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968682
6404	NC_008321	TA	3	6	359797	359802	50 %	50 %	0 %	0 %	113968682
6405	NC_008321	CAT	2	6	359829	359834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968682
6406	NC_008321	GGC	2	6	359851	359856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968682
6407	NC_008321	GCG	2	6	359880	359885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968682
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6409	NC_008321	CGTTT	2	10	359956	359965	0 %	60 %	20 %	20 %	113968682
6410	NC_008321	GCG	2	6	359990	359995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968682
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6413	NC_008321	TGC	2	6	360252	360257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968682
6414	NC_008321	CGG	2	6	360285	360290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968682
6415	NC_008321	GGC	2	6	360322	360327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968682
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6417	NC_008321	TCG	2	6	360489	360494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968682
6418	NC_008321	CAATC	2	10	360628	360637	40 %	20 %	0 %	40 %	113968682
6419	NC_008321	TGT	2	6	360654	360659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968682
6420	NC_008321	TGC	2	6	360664	360669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6421	NC_008321	TG	3	6	360813	360818	0 %	50 %	50 %	0 %	113968683
6422	NC_008321	AG	3	6	360825	360830	50 %	0 %	50 %	0 %	113968683
6423	NC_008321	TCG	2	6	360833	360838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968683
6424	NC_008321	CA	3	6	360936	360941	50 %	0 %	0 %	50 %	113968683
6425	NC_008321	CAT	2	6	361009	361014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968683
6426	NC_008321	CTG	2	6	361067	361072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968683
6427	NC_008321	TGCC	2	8	361105	361112	0 %	25 %	25 %	50 %	113968683
6428	NC_008321	TTCGAG	2	12	361150	361161	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	113968683
6429	NC_008321	AGC	2	6	361403	361408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968683
6430	NC_008321	AGCA	2	8	361442	361449	50 %	0 %	25 %	25 %	113968683
6431	NC_008321	CTT	2	6	361552	361557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968684
6432	NC_008321	ACC	2	6	361572	361577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968684
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6435	NC_008321	CGG	2	6	361777	361782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968684
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6439	NC_008321	GCT	3	9	362038	362046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968684
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6441	NC_008321	ACG	2	6	362088	362093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968684
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6443	NC_008321	TTA	2	6	362175	362180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968684
6444	NC_008321	TGA	2	6	362246	362251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968684
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6447	NC_008321	TGC	2	6	362429	362434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968684
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6453	NC_008321	GTA	2	6	362632	362637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968684
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6470	NC_008321	TGC	2	6	363723	363728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968685
6471	NC_008321	GGC	2	6	363734	363739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968685
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6474	NC_008321	GCC	2	6	363824	363829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968685
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6487	NC_008321	GGC	2	6	364676	364681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968685
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6490	NC_008321	CAT	2	6	364897	364902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968685
6491	NC_008321	GCT	2	6	365032	365037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968685
6492	NC_008321	GCC	2	6	365052	365057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968685
6493	NC_008321	CTG	2	6	365156	365161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968685
6494	NC_008321	GCC	2	6	365238	365243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968685
6495	NC_008321	TCG	2	6	365278	365283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968685
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6497	NC_008321	CTT	2	6	365540	365545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968686
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