MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008321	GGA	2	6	309983	309988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_008321	GCG	2	6	309995	310000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_008321	TTG	2	6	310041	310046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968635
5504	NC_008321	ACT	2	6	310065	310070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968635
5505	NC_008321	GTCT	2	8	310081	310088	0 %	50 %	25 %	25 %	113968635
5506	NC_008321	CCA	2	6	310106	310111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968635
5507	NC_008321	TTGA	2	8	310115	310122	25 %	50 %	25 %	0 %	113968635
5508	NC_008321	CAG	2	6	310178	310183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968635
5509	NC_008321	CGC	3	9	310202	310210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968635
5510	NC_008321	CTG	2	6	310260	310265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968635
5511	NC_008321	TGT	2	6	310533	310538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968635
5512	NC_008321	TGGCG	2	10	310541	310550	0 %	20 %	60 %	20 %	113968635
5513	NC_008321	TGCC	2	8	310577	310584	0 %	25 %	25 %	50 %	113968635
5514	NC_008321	T	6	6	310603	310608	0 %	100 %	0 %	0 %	113968635
5515	NC_008321	GTGC	2	8	310671	310678	0 %	25 %	50 %	25 %	113968635
5516	NC_008321	AGCG	2	8	310679	310686	25 %	0 %	50 %	25 %	113968635
5517	NC_008321	AGCG	2	8	310742	310749	25 %	0 %	50 %	25 %	113968635
5518	NC_008321	GC	3	6	310818	310823	0 %	0 %	50 %	50 %	113968635
5519	NC_008321	CCG	2	6	310915	310920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968635
5520	NC_008321	GCTTG	2	10	310953	310962	0 %	40 %	40 %	20 %	113968635
5521	NC_008321	CAC	2	6	311023	311028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968635
5522	NC_008321	ATA	2	6	311106	311111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968635
5523	NC_008321	AAG	2	6	311430	311435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968636
5524	NC_008321	GC	3	6	311468	311473	0 %	0 %	50 %	50 %	113968636
5525	NC_008321	GCT	2	6	311547	311552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968636
5526	NC_008321	AAG	2	6	311661	311666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968636
5527	NC_008321	ATA	2	6	311721	311726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968636
5528	NC_008321	GGC	2	6	311734	311739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968636
5529	NC_008321	AGC	2	6	311811	311816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968636
5530	NC_008321	GGT	2	6	311960	311965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968637
5531	NC_008321	CAG	2	6	311969	311974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968637
5532	NC_008321	GAT	2	6	312017	312022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968637
5533	NC_008321	ATG	2	6	312036	312041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968637
5534	NC_008321	TGG	2	6	312055	312060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968637
5535	NC_008321	GTAG	2	8	312105	312112	25 %	25 %	50 %	0 %	113968637
5536	NC_008321	CAA	2	6	312149	312154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968637
5537	NC_008321	GGTT	2	8	312264	312271	0 %	50 %	50 %	0 %	113968637
5538	NC_008321	CAC	2	6	312275	312280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968637
5539	NC_008321	AGTA	2	8	312322	312329	50 %	25 %	25 %	0 %	113968637
5540	NC_008321	CAT	3	9	312455	312463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968637
5541	NC_008321	GCG	2	6	312487	312492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968637
5542	NC_008321	CGG	2	6	312553	312558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968637
5543	NC_008321	GAA	2	6	312569	312574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968637
5544	NC_008321	CAG	2	6	312617	312622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968637
5545	NC_008321	ACG	2	6	312710	312715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968637
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5547	NC_008321	CGC	2	6	312742	312747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968637
5548	NC_008321	TGC	2	6	312810	312815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968637
5549	NC_008321	GCC	2	6	312816	312821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968637
5550	NC_008321	TTC	2	6	312927	312932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968637
5551	NC_008321	GAT	2	6	312947	312952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968637
5552	NC_008321	GGT	2	6	313007	313012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968637
5553	NC_008321	GCG	2	6	313015	313020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968637
5554	NC_008321	GGC	2	6	313045	313050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968637
5555	NC_008321	CAT	2	6	313073	313078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968637
5556	NC_008321	ACC	2	6	313088	313093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968637
5557	NC_008321	CG	3	6	313319	313324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_008321	TAAA	2	8	313402	313409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_008321	CG	3	6	313453	313458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_008321	AACTC	2	10	313639	313648	40 %	20 %	0 %	40 %	113968638
5561	NC_008321	CAG	2	6	313671	313676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968638
5562	NC_008321	ACCG	2	8	313677	313684	25 %	0 %	25 %	50 %	113968638
5563	NC_008321	GCT	2	6	313757	313762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968638
5564	NC_008321	CTA	2	6	313806	313811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968638
5565	NC_008321	GCC	2	6	313833	313838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968638
5566	NC_008321	GTC	2	6	313840	313845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968638
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5570	NC_008321	TTA	2	6	314085	314090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968638
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5572	NC_008321	ATT	2	6	314186	314191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968638
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5574	NC_008321	CTT	2	6	314213	314218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968638
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5579	NC_008321	ATGC	2	8	314417	314424	25 %	25 %	25 %	25 %	113968638
5580	NC_008321	GATG	2	8	314438	314445	25 %	25 %	50 %	0 %	113968638
5581	NC_008321	GCA	2	6	314471	314476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968638
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5591	NC_008321	GGC	2	6	315052	315057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968639
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5593	NC_008321	TGA	2	6	315068	315073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968639
5594	NC_008321	GATT	2	8	315078	315085	25 %	50 %	25 %	0 %	113968639
5595	NC_008321	TG	3	6	315177	315182	0 %	50 %	50 %	0 %	113968639
5596	NC_008321	CAG	2	6	315247	315252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968639
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5599	NC_008321	CTGCG	2	10	315530	315539	0 %	20 %	40 %	40 %	113968639
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5601	NC_008321	GCGA	2	8	315737	315744	25 %	0 %	50 %	25 %	113968639
5602	NC_008321	CAT	2	6	315753	315758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968639
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5607	NC_008321	GCGGA	2	10	316116	316125	20 %	0 %	60 %	20 %	113968640
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5609	NC_008321	AC	3	6	316142	316147	50 %	0 %	0 %	50 %	113968640
5610	NC_008321	CCAA	2	8	316269	316276	50 %	0 %	0 %	50 %	113968640
5611	NC_008321	A	6	6	316305	316310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_008321	ATT	2	6	316446	316451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_008321	CAA	2	6	316498	316503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968641
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5615	NC_008321	GAC	2	6	316526	316531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968641
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5621	NC_008321	AG	3	6	316734	316739	50 %	0 %	50 %	0 %	113968641
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5748	NC_008321	CGA	2	6	322524	322529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968645
5749	NC_008321	CAA	2	6	322530	322535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968645
5750	NC_008321	GGT	2	6	322548	322553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968645
5751	NC_008321	GCA	2	6	322631	322636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968645
5752	NC_008321	TGA	2	6	322677	322682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968645
5753	NC_008321	ACA	2	6	322694	322699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968645
5754	NC_008321	CTG	2	6	322730	322735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968645
5755	NC_008321	TAC	2	6	322864	322869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968645
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5757	NC_008321	T	10	10	322951	322960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5758	NC_008321	TTTAT	2	10	323015	323024	20 %	80 %	0 %	0 %	113968646
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5777	NC_008321	ATG	2	6	324237	324242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968647
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5785	NC_008321	TTGA	2	8	325092	325099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5786	NC_008321	T	7	7	325133	325139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5787	NC_008321	CGT	2	6	325409	325414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968648
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5863	NC_008321	CAA	2	6	329408	329413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5996	NC_008321	A	6	6	337921	337926	100 %	0 %	0 %	0 %	113968655
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