MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008321	AAAT	2	8	280970	280977	75 %	25 %	0 %	0 %	113968607
5002	NC_008321	T	6	6	280984	280989	0 %	100 %	0 %	0 %	113968607
5003	NC_008321	TCAAT	2	10	281075	281084	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5004	NC_008321	CTG	2	6	281106	281111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_008321	CTG	2	6	281199	281204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_008321	TTAA	2	8	281208	281215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_008321	TTG	2	6	281231	281236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_008321	TTC	2	6	281245	281250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_008321	TG	3	6	281298	281303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_008321	TCA	2	6	281344	281349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_008321	TGG	2	6	281443	281448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_008321	AGC	2	6	281464	281469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_008321	GCC	2	6	281536	281541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_008321	CAA	2	6	281587	281592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_008321	GCT	2	6	281593	281598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_008321	CGA	2	6	281626	281631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_008321	T	6	6	281640	281645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_008321	TCC	2	6	281771	281776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_008321	GGC	2	6	281797	281802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_008321	GGC	2	6	281851	281856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_008321	AT	3	6	282083	282088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_008321	TGT	2	6	282127	282132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_008321	GCCT	2	8	282190	282197	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_008321	ATG	2	6	282203	282208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_008321	GT	3	6	282224	282229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_008321	TC	3	6	282361	282366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_008321	ATT	2	6	282431	282436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_008321	TGG	2	6	282444	282449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_008321	GCA	2	6	282473	282478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_008321	GCA	2	6	282513	282518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_008321	AGAC	2	8	282537	282544	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5032	NC_008321	GCC	3	9	282578	282586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_008321	TCC	2	6	282611	282616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_008321	GCC	2	6	282710	282715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_008321	TCA	2	6	282718	282723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_008321	GT	3	6	282765	282770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_008321	GCG	2	6	282821	282826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_008321	GGT	2	6	282868	282873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_008321	CAG	2	6	282950	282955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_008321	GCA	2	6	282973	282978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_008321	GCG	2	6	283037	283042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_008321	GAT	2	6	283046	283051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_008321	AACGGC	2	12	283093	283104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_008321	CGA	2	6	283131	283136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_008321	GCG	3	9	283163	283171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_008321	AAC	2	6	283249	283254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_008321	TAAG	2	8	283290	283297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_008321	TAT	2	6	283335	283340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_008321	TGC	2	6	283341	283346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_008321	T	6	6	283388	283393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_008321	CGA	2	6	283402	283407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_008321	TTTC	2	8	283499	283506	0 %	75 %	0 %	25 %	113968608
5053	NC_008321	AGT	2	6	283557	283562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968608
5054	NC_008321	C	6	6	283587	283592	0 %	0 %	0 %	100 %	113968608
5055	NC_008321	GGCGA	2	10	283636	283645	20 %	0 %	60 %	20 %	113968608
5056	NC_008321	TCC	2	6	283656	283661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968608
5057	NC_008321	TTGA	2	8	283662	283669	25 %	50 %	25 %	0 %	113968608
5058	NC_008321	T	6	6	283800	283805	0 %	100 %	0 %	0 %	113968608
5059	NC_008321	CTG	2	6	283917	283922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968608
5060	NC_008321	GC	3	6	283929	283934	0 %	0 %	50 %	50 %	113968608
5061	NC_008321	TGG	2	6	284021	284026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968608
5062	NC_008321	TTG	2	6	284055	284060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968608
5063	NC_008321	GCC	2	6	284283	284288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968608
5064	NC_008321	ATC	2	6	284331	284336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968608
5065	NC_008321	TAA	2	6	284461	284466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968608
5066	NC_008321	GC	3	6	284580	284585	0 %	0 %	50 %	50 %	113968608
5067	NC_008321	TTGA	2	8	284616	284623	25 %	50 %	25 %	0 %	113968608
5068	NC_008321	CCA	2	6	284676	284681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968608
5069	NC_008321	ATC	2	6	284685	284690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968608
5070	NC_008321	GCG	3	9	284691	284699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968608
5071	NC_008321	GCCA	2	8	284731	284738	25 %	0 %	25 %	50 %	113968608
5072	NC_008321	TCCT	2	8	284745	284752	0 %	50 %	0 %	50 %	113968608
5073	NC_008321	T	6	6	284904	284909	0 %	100 %	0 %	0 %	113968608
5074	NC_008321	T	8	8	284921	284928	0 %	100 %	0 %	0 %	113968608
5075	NC_008321	AGT	2	6	284941	284946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968608
5076	NC_008321	AC	3	6	285000	285005	50 %	0 %	0 %	50 %	113968608
5077	NC_008321	AAT	2	6	285027	285032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968608
5078	NC_008321	ATCA	2	8	285132	285139	50 %	25 %	0 %	25 %	113968608
5079	NC_008321	TTGA	2	8	285141	285148	25 %	50 %	25 %	0 %	113968608
5080	NC_008321	TCG	2	6	285214	285219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968608
5081	NC_008321	A	6	6	285347	285352	100 %	0 %	0 %	0 %	113968608
5082	NC_008321	TAA	2	6	285385	285390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968608
5083	NC_008321	CAA	2	6	285614	285619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_008321	T	7	7	285641	285647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_008321	CTG	2	6	285760	285765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_008321	ATT	2	6	285775	285780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_008321	ATT	2	6	285839	285844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_008321	A	8	8	285990	285997	100 %	0 %	0 %	0 %	113968609
5089	NC_008321	TCA	2	6	286035	286040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968609
5090	NC_008321	GTC	2	6	286109	286114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968609
5091	NC_008321	TTG	2	6	286117	286122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968609
5092	NC_008321	GGA	3	9	286131	286139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968609
5093	NC_008321	TGA	2	6	286164	286169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968609
5094	NC_008321	CTC	2	6	286308	286313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968610
5095	NC_008321	AAC	2	6	286491	286496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_008321	TGA	2	6	286535	286540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_008321	TAA	2	6	286550	286555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_008321	TAT	2	6	286588	286593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_008321	TTTA	2	8	286614	286621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_008321	TGGG	2	8	286635	286642	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_008321	TAT	2	6	286814	286819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_008321	TGG	2	6	286847	286852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968611
5103	NC_008321	CGG	2	6	286941	286946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968611
5104	NC_008321	GGC	2	6	286948	286953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968611
5105	NC_008321	GGGC	2	8	286979	286986	0 %	0 %	75 %	25 %	113968611
5106	NC_008321	CGGG	2	8	287013	287020	0 %	0 %	75 %	25 %	113968611
5107	NC_008321	CG	3	6	287089	287094	0 %	0 %	50 %	50 %	113968611
5108	NC_008321	TGA	2	6	287120	287125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968611
5109	NC_008321	CAT	2	6	287145	287150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968611
5110	NC_008321	GCC	2	6	287184	287189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968611
5111	NC_008321	TTGTC	2	10	287271	287280	0 %	60 %	20 %	20 %	113968611
5112	NC_008321	TTGC	2	8	287326	287333	0 %	50 %	25 %	25 %	113968611
5113	NC_008321	AGTG	2	8	287337	287344	25 %	25 %	50 %	0 %	113968611
5114	NC_008321	GGT	2	6	287395	287400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968611
5115	NC_008321	CGCTA	2	10	287405	287414	20 %	20 %	20 %	40 %	113968611
5116	NC_008321	ATG	2	6	287462	287467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968611
5117	NC_008321	GCA	2	6	287602	287607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968611
5118	NC_008321	TGA	2	6	287677	287682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_008321	GT	3	6	287737	287742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_008321	TTG	2	6	287796	287801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_008321	T	7	7	287836	287842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_008321	AAT	2	6	287849	287854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_008321	AAATA	2	10	287942	287951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_008321	AAG	2	6	288006	288011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968612
5125	NC_008321	GTT	2	6	288020	288025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968612
5126	NC_008321	TGG	2	6	288040	288045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968612
5127	NC_008321	CAG	2	6	288099	288104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968612
5128	NC_008321	CAG	2	6	288156	288161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968612
5129	NC_008321	T	6	6	288306	288311	0 %	100 %	0 %	0 %	113968612
5130	NC_008321	ATT	2	6	288331	288336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968612
5131	NC_008321	AAAT	2	8	288433	288440	75 %	25 %	0 %	0 %	113968612
5132	NC_008321	AAC	2	6	288470	288475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968612
5133	NC_008321	AGC	2	6	288688	288693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968612
5134	NC_008321	CTG	2	6	288837	288842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968612
5135	NC_008321	GAA	2	6	288993	288998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968612
5136	NC_008321	A	6	6	289077	289082	100 %	0 %	0 %	0 %	113968612
5137	NC_008321	TGC	2	6	289232	289237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968612
5138	NC_008321	CTG	2	6	289351	289356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968612
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5140	NC_008321	GGT	2	6	289418	289423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968612
5141	NC_008321	CTG	2	6	289438	289443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5142	NC_008321	GCAAAG	2	12	289461	289472	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5143	NC_008321	TAA	2	6	289534	289539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_008321	TTG	2	6	289549	289554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968613
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5151	NC_008321	GCA	2	6	289959	289964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968613
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5156	NC_008321	ATA	2	6	290253	290258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_008321	TGA	2	6	290387	290392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968614
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5161	NC_008321	GA	3	6	290664	290669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5162	NC_008321	GTT	3	9	290681	290689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5163	NC_008321	TCT	2	6	290850	290855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968615
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5229	NC_008321	GTTT	2	8	294628	294635	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5230	NC_008321	TAAT	2	8	294716	294723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5231	NC_008321	CCTA	2	8	294855	294862	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5232	NC_008321	TTAC	2	8	294991	294998	25 %	50 %	0 %	25 %	113968617
5233	NC_008321	GTCA	2	8	295003	295010	25 %	25 %	25 %	25 %	113968617
5234	NC_008321	ATC	2	6	295056	295061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968617
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5237	NC_008321	A	6	6	295137	295142	100 %	0 %	0 %	0 %	113968617
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5245	NC_008321	CG	3	6	296219	296224	0 %	0 %	50 %	50 %	113968618
5246	NC_008321	GCG	2	6	296241	296246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968618
5247	NC_008321	CCAT	2	8	296276	296283	25 %	25 %	0 %	50 %	113968618
5248	NC_008321	CGG	2	6	296398	296403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968618
5249	NC_008321	TGT	2	6	296555	296560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968619
5250	NC_008321	T	6	6	296560	296565	0 %	100 %	0 %	0 %	113968619
5251	NC_008321	AGCG	2	8	296610	296617	25 %	0 %	50 %	25 %	113968619
5252	NC_008321	CGA	2	6	296664	296669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968619
5253	NC_008321	TGG	2	6	296705	296710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968619
5254	NC_008321	TGA	2	6	296757	296762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968619
5255	NC_008321	CTT	2	6	296769	296774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968619
5256	NC_008321	CGA	2	6	296848	296853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968620
5257	NC_008321	ACC	2	6	296856	296861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968620
5258	NC_008321	TTG	2	6	296901	296906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968620
5259	NC_008321	ACG	2	6	296925	296930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968620
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5261	NC_008321	GACCT	2	10	296945	296954	20 %	20 %	20 %	40 %	113968620
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5263	NC_008321	TGC	2	6	297124	297129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968620
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5265	NC_008321	AGTC	2	8	297276	297283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5266	NC_008321	TGCC	2	8	297384	297391	0 %	25 %	25 %	50 %	113968621
5267	NC_008321	GCC	3	9	297425	297433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968621
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5271	NC_008321	CGC	2	6	297721	297726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968621
5272	NC_008321	GC	3	6	297781	297786	0 %	0 %	50 %	50 %	113968621
5273	NC_008321	GCG	2	6	297863	297868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968621
5274	NC_008321	ATT	2	6	297902	297907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968621
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5276	NC_008321	GAA	2	6	297968	297973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968621
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5354	NC_008321	TAT	2	6	301736	301741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5355	NC_008321	CAG	2	6	301812	301817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968626
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5361	NC_008321	TGC	2	6	301999	302004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968626
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5368	NC_008321	TGAC	2	8	302389	302396	25 %	25 %	25 %	25 %	113968626
5369	NC_008321	GAG	2	6	302448	302453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113968626
5370	NC_008321	GCA	2	6	302570	302575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968626
5371	NC_008321	GAGCT	2	10	302592	302601	20 %	20 %	40 %	20 %	113968626
5372	NC_008321	CTG	2	6	302622	302627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968626
5373	NC_008321	CGAAT	2	10	302648	302657	40 %	20 %	20 %	20 %	113968626
5374	NC_008321	TGT	2	6	302716	302721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968626
5375	NC_008321	TA	3	6	302731	302736	50 %	50 %	0 %	0 %	113968626
5376	NC_008321	ATT	2	6	302787	302792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968626
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5378	NC_008321	ATC	2	6	302977	302982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968626
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5387	NC_008321	GTT	2	6	303555	303560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968627
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5415	NC_008321	T	6	6	304939	304944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5491	NC_008321	GTTT	2	8	309163	309170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5495	NC_008321	GCA	2	6	309526	309531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968634
5496	NC_008321	GAA	2	6	309539	309544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968634
5497	NC_008321	CGC	2	6	309685	309690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968634
5498	NC_008321	TAA	2	6	309696	309701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968634
5499	NC_008321	TGAG	2	8	309715	309722	25 %	25 %	50 %	0 %	113968634
5500	NC_008321	CAG	2	6	309882	309887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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