MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 83403

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008321	GTT	2	6	251913	251918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968581
4502	NC_008321	CAA	2	6	251930	251935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968581
4503	NC_008321	CAAAAC	2	12	252034	252045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968581
4504	NC_008321	GAT	2	6	252121	252126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968581
4505	NC_008321	ATC	2	6	252130	252135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968581
4506	NC_008321	TGC	2	6	252230	252235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968581
4507	NC_008321	GCAA	2	8	252266	252273	50 %	0 %	25 %	25 %	113968581
4508	NC_008321	ATA	2	6	252347	252352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968581
4509	NC_008321	GTCT	2	8	252388	252395	0 %	50 %	25 %	25 %	113968582
4510	NC_008321	TGG	2	6	252407	252412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968582
4511	NC_008321	GCA	2	6	252434	252439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968582
4512	NC_008321	TCC	2	6	252599	252604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968582
4513	NC_008321	AG	3	6	252612	252617	50 %	0 %	50 %	0 %	113968582
4514	NC_008321	CAG	2	6	252702	252707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968582
4515	NC_008321	CTA	2	6	252752	252757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968582
4516	NC_008321	AGC	2	6	252935	252940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968582
4517	NC_008321	T	6	6	252990	252995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_008321	GCC	2	6	253026	253031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_008321	AAGC	2	8	253066	253073	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4520	NC_008321	AAG	2	6	253125	253130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_008321	TG	3	6	253247	253252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_008321	AATG	2	8	253319	253326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_008321	TACA	2	8	253345	253352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_008321	CTT	2	6	253378	253383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_008321	A	6	6	253442	253447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_008321	GGC	2	6	253489	253494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_008321	GCA	2	6	253520	253525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_008321	GCG	2	6	253553	253558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_008321	CGA	2	6	253728	253733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_008321	GAT	2	6	253753	253758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_008321	GCA	2	6	253802	253807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_008321	GT	3	6	253855	253860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_008321	GAA	2	6	253861	253866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_008321	GGA	2	6	253897	253902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_008321	AGA	2	6	253944	253949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_008321	CAG	2	6	253970	253975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_008321	G	6	6	254117	254122	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_008321	GGA	2	6	254161	254166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_008321	GGC	2	6	254181	254186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_008321	GAA	2	6	254424	254429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_008321	TGC	2	6	254500	254505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_008321	GTC	2	6	254512	254517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_008321	GGA	2	6	254626	254631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_008321	GAC	2	6	254639	254644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_008321	TCA	2	6	254651	254656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_008321	AC	3	6	254677	254682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4547	NC_008321	TCG	2	6	254744	254749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_008321	AC	3	6	254846	254851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_008321	AAG	2	6	254882	254887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_008321	CAC	2	6	254916	254921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4551	NC_008321	CCT	2	6	254987	254992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_008321	TGTT	2	8	255013	255020	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_008321	CA	3	6	255028	255033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_008321	TTG	2	6	255040	255045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_008321	AGG	2	6	255059	255064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_008321	TAAT	2	8	255126	255133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_008321	ATG	2	6	255137	255142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_008321	A	6	6	255163	255168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_008321	TCT	2	6	255226	255231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_008321	ACG	2	6	255269	255274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_008321	GTA	2	6	255362	255367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_008321	CAG	2	6	255434	255439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_008321	TAGTG	2	10	255468	255477	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_008321	TAG	2	6	255542	255547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_008321	GCGA	2	8	255550	255557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4566	NC_008321	TGA	2	6	255653	255658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_008321	G	6	6	255699	255704	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_008321	TCC	2	6	255709	255714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4569	NC_008321	CTGA	2	8	255729	255736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4570	NC_008321	GGA	2	6	256019	256024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_008321	CGG	2	6	256241	256246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_008321	CGTC	2	8	256254	256261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_008321	AAC	2	6	256273	256278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_008321	AGC	2	6	256363	256368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_008321	CAT	2	6	256369	256374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_008321	AAAG	2	8	256377	256384	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_008321	AGTCG	2	10	256399	256408	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4578	NC_008321	ACC	2	6	256441	256446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_008321	TGAAGG	2	12	256504	256515	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_008321	GA	3	6	256716	256721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_008321	AGGCT	2	10	256728	256737	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4582	NC_008321	GCG	2	6	256741	256746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_008321	GGT	2	6	256765	256770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_008321	GGTG	2	8	256772	256779	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_008321	TGA	2	6	256815	256820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_008321	AGT	2	6	256840	256845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_008321	TCT	2	6	256868	256873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_008321	GGT	2	6	256914	256919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_008321	GA	3	6	256944	256949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_008321	GCT	2	6	257002	257007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_008321	ATTG	2	8	257147	257154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_008321	CGG	2	6	257195	257200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_008321	ATG	2	6	257271	257276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_008321	GTC	2	6	257452	257457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_008321	ACC	2	6	257466	257471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_008321	TGG	2	6	257526	257531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_008321	TCC	2	6	257552	257557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_008321	GGA	2	6	257569	257574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_008321	GACA	2	8	257646	257653	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4600	NC_008321	GGT	2	6	257689	257694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_008321	CGG	2	6	257776	257781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_008321	TCA	2	6	257804	257809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_008321	CGT	2	6	257884	257889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_008321	GAT	2	6	257924	257929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_008321	GAAC	2	8	257966	257973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4606	NC_008321	GT	3	6	258137	258142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_008321	AGT	2	6	258220	258225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_008321	AAG	2	6	258248	258253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_008321	GTA	2	6	258353	258358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_008321	ATCCC	2	10	258450	258459	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4611	NC_008321	GTTAA	2	10	258560	258569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_008321	TCCGC	2	10	258636	258645	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4613	NC_008321	GCA	2	6	258668	258673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_008321	T	6	6	258684	258689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_008321	T	6	6	258706	258711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_008321	AAAT	2	8	258757	258764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_008321	CTG	2	6	258774	258779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_008321	TGC	2	6	258816	258821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_008321	TGG	2	6	258826	258831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_008321	GAA	2	6	258944	258949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968583
4621	NC_008321	TAT	2	6	258964	258969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968583
4622	NC_008321	CG	3	6	259049	259054	0 %	0 %	50 %	50 %	113968583
4623	NC_008321	ATG	2	6	259087	259092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968583
4624	NC_008321	GCG	2	6	259182	259187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968583
4625	NC_008321	GAC	2	6	259283	259288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968583
4626	NC_008321	AAGA	2	8	259329	259336	75 %	0 %	25 %	0 %	113968583
4627	NC_008321	GT	3	6	259457	259462	0 %	50 %	50 %	0 %	113968584
4628	NC_008321	TCG	2	6	259602	259607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968584
4629	NC_008321	GTC	2	6	259724	259729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968584
4630	NC_008321	GGC	2	6	259815	259820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968584
4631	NC_008321	CGA	2	6	259864	259869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968584
4632	NC_008321	AAT	2	6	259895	259900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968584
4633	NC_008321	TCAA	2	8	260076	260083	50 %	25 %	0 %	25 %	113968584
4634	NC_008321	GT	3	6	260101	260106	0 %	50 %	50 %	0 %	113968584
4635	NC_008321	AGT	2	6	260229	260234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968584
4636	NC_008321	CTGA	2	8	260339	260346	25 %	25 %	25 %	25 %	113968584
4637	NC_008321	ATG	2	6	260357	260362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968584
4638	NC_008321	GTT	3	9	260386	260394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968584
4639	NC_008321	TGC	2	6	260454	260459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968584
4640	NC_008321	AGT	2	6	260479	260484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968584
4641	NC_008321	TGC	2	6	260589	260594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968584
4642	NC_008321	ACA	2	6	260650	260655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968584
4643	NC_008321	GCCGC	2	10	260752	260761	0 %	0 %	40 %	60 %	113968585
4644	NC_008321	CTCA	2	8	260857	260864	25 %	25 %	0 %	50 %	113968585
4645	NC_008321	GCA	2	6	260910	260915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968585
4646	NC_008321	GCA	2	6	261006	261011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968585
4647	NC_008321	GGC	2	6	261033	261038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968585
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4650	NC_008321	CTT	2	6	261258	261263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968585
4651	NC_008321	ATT	2	6	261292	261297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968585
4652	NC_008321	ATC	2	6	261361	261366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968585
4653	NC_008321	GAT	2	6	261480	261485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968586
4654	NC_008321	ATG	2	6	261553	261558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968586
4655	NC_008321	CCT	2	6	261581	261586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968586
4656	NC_008321	TTG	2	6	261604	261609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968586
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4659	NC_008321	TGC	2	6	261726	261731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968587
4660	NC_008321	A	6	6	261802	261807	100 %	0 %	0 %	0 %	113968587
4661	NC_008321	TCAA	2	8	261842	261849	50 %	25 %	0 %	25 %	113968587
4662	NC_008321	TCA	2	6	261864	261869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968587
4663	NC_008321	GCA	2	6	261884	261889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968587
4664	NC_008321	CAT	2	6	261942	261947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968587
4665	NC_008321	TGCC	2	8	261979	261986	0 %	25 %	25 %	50 %	113968587
4666	NC_008321	CGG	2	6	261993	261998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968587
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4684	NC_008321	CAG	2	6	263166	263171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968589
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4687	NC_008321	TGC	2	6	263308	263313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968589
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4689	NC_008321	CTA	2	6	263361	263366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4691	NC_008321	TGC	2	6	263593	263598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968590
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4696	NC_008321	GTG	2	6	263715	263720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968590
4697	NC_008321	AATC	3	12	263734	263745	50 %	25 %	0 %	25 %	113968590
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4699	NC_008321	TGC	2	6	263779	263784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968590
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4702	NC_008321	CTCA	2	8	264034	264041	25 %	25 %	0 %	50 %	113968591
4703	NC_008321	CCT	2	6	264152	264157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113968591
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4720	NC_008321	GTA	2	6	265238	265243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968592
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4722	NC_008321	TTGCA	2	10	265383	265392	20 %	40 %	20 %	20 %	113968592
4723	NC_008321	GT	3	6	265429	265434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4724	NC_008321	TAA	2	6	265454	265459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4725	NC_008321	TG	3	6	265462	265467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4726	NC_008321	GCG	2	6	265488	265493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4727	NC_008321	ATGA	2	8	265506	265513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4728	NC_008321	ATT	2	6	265616	265621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968593
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4734	NC_008321	TCT	2	6	265896	265901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968593
4735	NC_008321	TGC	2	6	265914	265919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968593
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4738	NC_008321	ATGA	2	8	266141	266148	50 %	25 %	25 %	0 %	113968593
4739	NC_008321	GCA	2	6	266158	266163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968593
4740	NC_008321	TTG	2	6	266219	266224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968593
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4742	NC_008321	AAAG	2	8	266305	266312	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4743	NC_008321	AGA	2	6	266358	266363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968594
4744	NC_008321	CAT	2	6	266425	266430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968594
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4747	NC_008321	TTA	2	6	266693	266698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968594
4748	NC_008321	CTTTG	2	10	266733	266742	0 %	60 %	20 %	20 %	113968594
4749	NC_008321	GCC	2	6	266767	266772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968594
4750	NC_008321	GC	3	6	266784	266789	0 %	0 %	50 %	50 %	113968594
4751	NC_008321	CTTG	2	8	266886	266893	0 %	50 %	25 %	25 %	113968594
4752	NC_008321	GAA	2	6	266992	266997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968594
4753	NC_008321	CCG	2	6	267083	267088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968594
4754	NC_008321	CGG	2	6	267117	267122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968594
4755	NC_008321	TGG	2	6	267189	267194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968594
4756	NC_008321	GAC	2	6	267229	267234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968594
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4773	NC_008321	AC	3	6	268198	268203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4774	NC_008321	CA	3	6	268272	268277	50 %	0 %	0 %	50 %	113968595
4775	NC_008321	CG	4	8	268358	268365	0 %	0 %	50 %	50 %	113968595
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4874	NC_008321	TTG	2	6	274364	274369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968600
4875	NC_008321	CGT	2	6	274390	274395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968600
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4881	NC_008321	TTA	2	6	274575	274580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4997	NC_008321	GAC	2	6	280903	280908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968607
4998	NC_008321	TGCT	2	8	280919	280926	0 %	50 %	25 %	25 %	113968607
4999	NC_008321	CAT	2	6	280929	280934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968607
5000	NC_008321	GAA	2	6	280936	280941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968607

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