MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008319	TGT	2	6	172744	172749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954459
3502	NC_008319	A	6	6	173001	173006	100 %	0 %	0 %	0 %	113954459
3503	NC_008319	CAC	2	6	173011	173016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954459
3504	NC_008319	GA	3	6	173036	173041	50 %	0 %	50 %	0 %	113954459
3505	NC_008319	AGATG	2	10	173073	173082	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_008319	GGCT	2	8	173099	173106	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3507	NC_008319	CACT	2	8	173112	173119	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_008319	A	6	6	173137	173142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_008319	TCT	2	6	173174	173179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_008319	AAG	2	6	173186	173191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_008319	GTC	2	6	173252	173257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955562
3512	NC_008319	CAC	2	6	173272	173277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955562
3513	NC_008319	CGA	2	6	173395	173400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955562
3514	NC_008319	CAC	3	9	173414	173422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955562
3515	NC_008319	TTCC	2	8	173506	173513	0 %	50 %	0 %	50 %	113955562
3516	NC_008319	GCT	2	6	173590	173595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955562
3517	NC_008319	CAC	2	6	173597	173602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955562
3518	NC_008319	CGA	2	6	173659	173664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955562
3519	NC_008319	TGC	2	6	173728	173733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955562
3520	NC_008319	GCA	2	6	173969	173974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955562
3521	NC_008319	ACT	2	6	173979	173984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955562
3522	NC_008319	CT	3	6	173997	174002	0 %	50 %	0 %	50 %	113955562
3523	NC_008319	AGCA	2	8	174008	174015	50 %	0 %	25 %	25 %	113955562
3524	NC_008319	CGG	2	6	174157	174162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955562
3525	NC_008319	CCA	2	6	174214	174219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955562
3526	NC_008319	GGC	2	6	174220	174225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955562
3527	NC_008319	CTT	2	6	174235	174240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955562
3528	NC_008319	GCA	2	6	174249	174254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955562
3529	NC_008319	GGC	2	6	174257	174262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955562
3530	NC_008319	CTG	2	6	174295	174300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955562
3531	NC_008319	AGG	2	6	174312	174317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955562
3532	NC_008319	GTC	2	6	174320	174325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955562
3533	NC_008319	TGC	2	6	174347	174352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955562
3534	NC_008319	CAG	2	6	174470	174475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955562
3535	NC_008319	TTG	2	6	174518	174523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955562
3536	NC_008319	CGC	2	6	174538	174543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955562
3537	NC_008319	TAGC	2	8	174573	174580	25 %	25 %	25 %	25 %	113955562
3538	NC_008319	GTGCCA	2	12	174603	174614	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113955562
3539	NC_008319	TCGA	2	8	174663	174670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3540	NC_008319	T	8	8	174796	174803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_008319	GTT	2	6	174815	174820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_008319	ACAA	2	8	174891	174898	75 %	0 %	0 %	25 %	113954369
3543	NC_008319	CT	3	6	174916	174921	0 %	50 %	0 %	50 %	113954369
3544	NC_008319	GGA	2	6	174993	174998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954369
3545	NC_008319	GCG	2	6	175017	175022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954369
3546	NC_008319	CCT	2	6	175041	175046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954369
3547	NC_008319	CTA	2	6	175054	175059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954369
3548	NC_008319	TGG	2	6	175072	175077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954369
3549	NC_008319	GTT	2	6	175143	175148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954369
3550	NC_008319	CTA	2	6	175204	175209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954369
3551	NC_008319	TGA	2	6	175223	175228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954369
3552	NC_008319	GCT	2	6	175310	175315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954369
3553	NC_008319	TAA	2	6	175469	175474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954369
3554	NC_008319	AGG	2	6	175520	175525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954369
3555	NC_008319	TGC	2	6	175544	175549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954369
3556	NC_008319	CT	3	6	175703	175708	0 %	50 %	0 %	50 %	113954369
3557	NC_008319	AATG	2	8	175820	175827	50 %	25 %	25 %	0 %	113954369
3558	NC_008319	ATC	2	6	175830	175835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954369
3559	NC_008319	CTC	2	6	175895	175900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954369
3560	NC_008319	TG	3	6	175944	175949	0 %	50 %	50 %	0 %	113954369
3561	NC_008319	TCA	2	6	176016	176021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954369
3562	NC_008319	TTG	2	6	176107	176112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_008319	CATG	2	8	176142	176149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3564	NC_008319	TGC	2	6	176307	176312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953097
3565	NC_008319	AGC	2	6	176349	176354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953097
3566	NC_008319	AG	3	6	176359	176364	50 %	0 %	50 %	0 %	113953097
3567	NC_008319	GGT	2	6	176381	176386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953097
3568	NC_008319	TTG	2	6	176396	176401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_008319	ATGC	2	8	176410	176417	25 %	25 %	25 %	25 %	113954973
3570	NC_008319	GCA	2	6	176449	176454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954973
3571	NC_008319	AAC	2	6	176484	176489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954973
3572	NC_008319	T	7	7	176497	176503	0 %	100 %	0 %	0 %	113954973
3573	NC_008319	GCC	2	6	176506	176511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954973
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3576	NC_008319	TGA	2	6	176694	176699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952738
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3580	NC_008319	GATG	2	8	176841	176848	25 %	25 %	50 %	0 %	113952738
3581	NC_008319	GTT	2	6	176913	176918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953350
3582	NC_008319	GTT	2	6	176958	176963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953350
3583	NC_008319	TGC	2	6	177021	177026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953350
3584	NC_008319	GCC	2	6	177120	177125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953350
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3589	NC_008319	AGC	2	6	177382	177387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953990
3590	NC_008319	TTGA	2	8	177416	177423	25 %	50 %	25 %	0 %	113953990
3591	NC_008319	ACT	2	6	177582	177587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954371
3592	NC_008319	TTC	2	6	177701	177706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954371
3593	NC_008319	TTG	2	6	177744	177749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954371
3594	NC_008319	TTC	2	6	177800	177805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_008319	TTG	2	6	177816	177821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_008319	AGGC	2	8	177918	177925	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3597	NC_008319	GCC	2	6	177930	177935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_008319	ACT	2	6	178054	178059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_008319	AGGA	2	8	178065	178072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_008319	CTT	2	6	178079	178084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_008319	TACC	2	8	178182	178189	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_008319	AGC	2	6	178230	178235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_008319	CT	3	6	178266	178271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_008319	CTG	2	6	178335	178340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_008319	AGC	2	6	178373	178378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_008319	CAG	2	6	178416	178421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_008319	TAA	2	6	178447	178452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_008319	TGT	2	6	178472	178477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_008319	CTG	3	9	178490	178498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_008319	CAA	2	6	178648	178653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955173
3611	NC_008319	CAAT	2	8	178758	178765	50 %	25 %	0 %	25 %	113955173
3612	NC_008319	GATTG	2	10	178786	178795	20 %	40 %	40 %	0 %	113955173
3613	NC_008319	ATT	2	6	178842	178847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955173
3614	NC_008319	TAA	2	6	178867	178872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113955173
3615	NC_008319	TTTC	2	8	179022	179029	0 %	75 %	0 %	25 %	113955173
3616	NC_008319	AAC	2	6	179084	179089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955173
3617	NC_008319	AG	3	6	179104	179109	50 %	0 %	50 %	0 %	113955173
3618	NC_008319	TTA	2	6	179115	179120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955173
3619	NC_008319	AT	5	10	179211	179220	50 %	50 %	0 %	0 %	113955173
3620	NC_008319	CTT	2	6	179240	179245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955173
3621	NC_008319	TCT	2	6	179262	179267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955173
3622	NC_008319	AAAATG	2	12	179276	179287	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	113955173
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3624	NC_008319	ATGT	2	8	179348	179355	25 %	50 %	25 %	0 %	113955173
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3665	NC_008319	GA	3	6	181654	181659	50 %	0 %	50 %	0 %	113953906
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3723	NC_008319	ATCG	2	8	185471	185478	25 %	25 %	25 %	25 %	113952808
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3992	NC_008319	GCC	2	6	198993	198998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953043
3993	NC_008319	GCC	2	6	199038	199043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953043
3994	NC_008319	GCC	2	6	199083	199088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3995	NC_008319	CTT	2	6	199149	199154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3996	NC_008319	TTC	2	6	199212	199217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3997	NC_008319	GCA	2	6	199324	199329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3998	NC_008319	ACCT	2	8	199343	199350	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3999	NC_008319	TCT	2	6	199387	199392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4000	NC_008319	TCA	2	6	199414	199419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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