MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_008319	CCG	2	6	1750745	1750750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953353
34503	NC_008319	GAA	2	6	1750795	1750800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953353
34504	NC_008319	GGT	2	6	1750861	1750866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953353
34505	NC_008319	CAC	2	6	1750891	1750896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953353
34506	NC_008319	CAC	2	6	1750917	1750922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953353
34507	NC_008319	GCA	2	6	1751013	1751018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953353
34508	NC_008319	CAC	2	6	1751036	1751041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953353
34509	NC_008319	TGA	2	6	1751076	1751081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953353
34510	NC_008319	ATG	2	6	1751090	1751095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953353
34511	NC_008319	CAA	2	6	1751223	1751228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953353
34512	NC_008319	TCG	2	6	1751276	1751281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953353
34513	NC_008319	ACA	2	6	1751321	1751326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953353
34514	NC_008319	AGA	2	6	1751378	1751383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953353
34515	NC_008319	GGC	2	6	1751385	1751390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953353
34516	NC_008319	GCA	2	6	1751443	1751448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953353
34517	NC_008319	AGC	2	6	1751634	1751639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953353
34518	NC_008319	GAG	2	6	1751665	1751670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953353
34519	NC_008319	CA	3	6	1751678	1751683	50 %	0 %	0 %	50 %	113953353
34520	NC_008319	CAG	2	6	1751718	1751723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953353
34521	NC_008319	CTT	3	9	1751730	1751738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953353
34522	NC_008319	CTT	2	6	1751748	1751753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953353
34523	NC_008319	CAG	2	6	1751776	1751781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953353
34524	NC_008319	CGT	2	6	1751844	1751849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953353
34525	NC_008319	CTT	2	6	1751851	1751856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953353
34526	NC_008319	AG	3	6	1751893	1751898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34527	NC_008319	TTGCCG	2	12	1751953	1751964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953954
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34529	NC_008319	CGA	2	6	1752011	1752016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953954
34530	NC_008319	CTGCAC	2	12	1752044	1752055	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113953954
34531	NC_008319	CCG	2	6	1752112	1752117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953954
34532	NC_008319	CAG	2	6	1752146	1752151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953954
34533	NC_008319	GCT	2	6	1752169	1752174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953954
34534	NC_008319	G	6	6	1752257	1752262	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34535	NC_008319	ACT	2	6	1752359	1752364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34536	NC_008319	AGT	2	6	1752429	1752434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34537	NC_008319	CGA	2	6	1752463	1752468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34538	NC_008319	T	6	6	1752476	1752481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34539	NC_008319	CA	3	6	1752557	1752562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34540	NC_008319	GT	3	6	1752708	1752713	0 %	50 %	50 %	0 %	113954098
34541	NC_008319	CTG	2	6	1752744	1752749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954098
34542	NC_008319	TGA	2	6	1752781	1752786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954098
34543	NC_008319	CTG	2	6	1752875	1752880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954098
34544	NC_008319	CGAT	2	8	1752881	1752888	25 %	25 %	25 %	25 %	113954098
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34549	NC_008319	TGA	2	6	1753214	1753219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954676
34550	NC_008319	CGCA	2	8	1753244	1753251	25 %	0 %	25 %	50 %	113954676
34551	NC_008319	GCCGCA	2	12	1753254	1753265	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	113954676
34552	NC_008319	TC	3	6	1753284	1753289	0 %	50 %	0 %	50 %	113954676
34553	NC_008319	GTC	2	6	1753303	1753308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954676
34554	NC_008319	CCA	2	6	1753333	1753338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954676
34555	NC_008319	GCA	2	6	1753371	1753376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954676
34556	NC_008319	CAG	2	6	1753390	1753395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954676
34557	NC_008319	ATC	2	6	1753434	1753439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954676
34558	NC_008319	CAG	2	6	1753519	1753524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954676
34559	NC_008319	TCG	2	6	1753529	1753534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954676
34560	NC_008319	GC	3	6	1753626	1753631	0 %	0 %	50 %	50 %	113954676
34561	NC_008319	TCCA	2	8	1753716	1753723	25 %	25 %	0 %	50 %	113954676
34562	NC_008319	AG	3	6	1753797	1753802	50 %	0 %	50 %	0 %	113954676
34563	NC_008319	AAGA	2	8	1753805	1753812	75 %	0 %	25 %	0 %	113954676
34564	NC_008319	GTCG	2	8	1753877	1753884	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34565	NC_008319	ACA	2	6	1753887	1753892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34566	NC_008319	GCTC	2	8	1753895	1753902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34567	NC_008319	CGC	2	6	1753956	1753961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952812
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34577	NC_008319	TCAA	2	8	1754446	1754453	50 %	25 %	0 %	25 %	113952812
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34587	NC_008319	ATTC	2	8	1754753	1754760	25 %	50 %	0 %	25 %	113953476
34588	NC_008319	T	6	6	1754811	1754816	0 %	100 %	0 %	0 %	113953476
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34592	NC_008319	ACTG	2	8	1754971	1754978	25 %	25 %	25 %	25 %	113953476
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34599	NC_008319	TGA	2	6	1755342	1755347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955454
34600	NC_008319	TGG	2	6	1755483	1755488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955454
34601	NC_008319	ATT	2	6	1755579	1755584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955454
34602	NC_008319	CACC	2	8	1755721	1755728	25 %	0 %	0 %	75 %	113955454
34603	NC_008319	ACA	2	6	1755842	1755847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955454
34604	NC_008319	GCTT	2	8	1755852	1755859	0 %	50 %	25 %	25 %	113955454
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34606	NC_008319	TGGA	2	8	1755923	1755930	25 %	25 %	50 %	0 %	113955454
34607	NC_008319	GCA	2	6	1755935	1755940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955454
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34609	NC_008319	TGG	2	6	1756122	1756127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955454
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34612	NC_008319	AATTG	2	10	1756324	1756333	40 %	40 %	20 %	0 %	113955454
34613	NC_008319	GTT	2	6	1756381	1756386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955454
34614	NC_008319	CCCG	2	8	1756389	1756396	0 %	0 %	25 %	75 %	113955454
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34726	NC_008319	CA	3	6	1762062	1762067	50 %	0 %	0 %	50 %	113954135
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34967	NC_008319	CTG	2	6	1775020	1775025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955523
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