MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008319	GAG	2	6	122988	122993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954007
2502	NC_008319	TCG	2	6	123028	123033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954007
2503	NC_008319	ATGG	2	8	123057	123064	25 %	25 %	50 %	0 %	113954007
2504	NC_008319	ATT	2	6	123108	123113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113954007
2505	NC_008319	TTTC	2	8	123114	123121	0 %	75 %	0 %	25 %	113954007
2506	NC_008319	TGGC	2	8	123148	123155	0 %	25 %	50 %	25 %	113954007
2507	NC_008319	GAC	2	6	123171	123176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954007
2508	NC_008319	GAACG	2	10	123349	123358	40 %	0 %	40 %	20 %	113954007
2509	NC_008319	CTT	2	6	123387	123392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954007
2510	NC_008319	AGC	2	6	123445	123450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954007
2511	NC_008319	GTT	2	6	123489	123494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954007
2512	NC_008319	GCA	2	6	123618	123623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954007
2513	NC_008319	TGA	2	6	123627	123632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954007
2514	NC_008319	TCGCT	2	10	123644	123653	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2515	NC_008319	CGC	2	6	123662	123667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2516	NC_008319	CTT	2	6	123690	123695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_008319	CT	3	6	123696	123701	0 %	50 %	0 %	50 %	113955017
2518	NC_008319	CGAG	2	8	123841	123848	25 %	0 %	50 %	25 %	113955017
2519	NC_008319	TGA	2	6	123876	123881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955017
2520	NC_008319	GTT	2	6	123943	123948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955017
2521	NC_008319	GCTCA	2	10	123980	123989	20 %	20 %	20 %	40 %	113955017
2522	NC_008319	TGG	2	6	123996	124001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955017
2523	NC_008319	CGC	2	6	124182	124187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955017
2524	NC_008319	CCG	2	6	124234	124239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955017
2525	NC_008319	TTGG	2	8	124240	124247	0 %	50 %	50 %	0 %	113955017
2526	NC_008319	TCA	2	6	124320	124325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955017
2527	NC_008319	CT	3	6	124350	124355	0 %	50 %	0 %	50 %	113955017
2528	NC_008319	GTG	2	6	124394	124399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955017
2529	NC_008319	ATG	2	6	124520	124525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955017
2530	NC_008319	AGG	2	6	124653	124658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955017
2531	NC_008319	CCT	2	6	124677	124682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955017
2532	NC_008319	GCA	2	6	124866	124871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955017
2533	NC_008319	CAG	2	6	124979	124984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955017
2534	NC_008319	CGT	2	6	124988	124993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955017
2535	NC_008319	C	6	6	125060	125065	0 %	0 %	0 %	100 %	113955017
2536	NC_008319	TGC	2	6	125103	125108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955017
2537	NC_008319	GTG	2	6	125220	125225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954179
2538	NC_008319	GGT	2	6	125260	125265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954179
2539	NC_008319	ACCCC	2	10	125424	125433	20 %	0 %	0 %	80 %	113954179
2540	NC_008319	TTC	2	6	125529	125534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953152
2541	NC_008319	TTG	2	6	125541	125546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953152
2542	NC_008319	TCA	2	6	125569	125574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953152
2543	NC_008319	GCT	2	6	125624	125629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953152
2544	NC_008319	CTC	2	6	125667	125672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953152
2545	NC_008319	TGC	2	6	125689	125694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953152
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2547	NC_008319	AGC	2	6	125803	125808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953152
2548	NC_008319	TGC	2	6	125918	125923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953152
2549	NC_008319	TCC	2	6	125944	125949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953152
2550	NC_008319	GGT	2	6	125963	125968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953152
2551	NC_008319	CCAG	2	8	125969	125976	25 %	0 %	25 %	50 %	113953152
2552	NC_008319	TCCC	2	8	126098	126105	0 %	25 %	0 %	75 %	113952852
2553	NC_008319	TCG	2	6	126204	126209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952852
2554	NC_008319	GA	3	6	126273	126278	50 %	0 %	50 %	0 %	113952850
2555	NC_008319	GCG	2	6	126299	126304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952850
2556	NC_008319	GAC	2	6	126425	126430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952850
2557	NC_008319	GCT	2	6	126440	126445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952850
2558	NC_008319	GCA	2	6	126547	126552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952850
2559	NC_008319	TGCG	2	8	126556	126563	0 %	25 %	50 %	25 %	113952850
2560	NC_008319	GCG	2	6	126582	126587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952850
2561	NC_008319	AAG	2	6	126638	126643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952850
2562	NC_008319	CGAG	2	8	126715	126722	25 %	0 %	50 %	25 %	113952850
2563	NC_008319	GAAA	2	8	126730	126737	75 %	0 %	25 %	0 %	113952850
2564	NC_008319	CGT	2	6	126744	126749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952850
2565	NC_008319	TC	3	6	126753	126758	0 %	50 %	0 %	50 %	113952850
2566	NC_008319	GCA	2	6	126800	126805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952850
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2569	NC_008319	GGC	2	6	126896	126901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952850
2570	NC_008319	GGAC	2	8	126903	126910	25 %	0 %	50 %	25 %	113952850
2571	NC_008319	AAT	2	6	126959	126964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113952850
2572	NC_008319	GAGCA	2	10	127010	127019	40 %	0 %	40 %	20 %	113952850
2573	NC_008319	GTT	2	6	127048	127053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952850
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2576	NC_008319	GTT	2	6	127191	127196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_008319	GCC	2	6	127244	127249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955527
2578	NC_008319	A	6	6	127270	127275	100 %	0 %	0 %	0 %	113955527
2579	NC_008319	CTG	2	6	127319	127324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955527
2580	NC_008319	CCAGC	2	10	127517	127526	20 %	0 %	20 %	60 %	113955527
2581	NC_008319	CGGC	2	8	127592	127599	0 %	0 %	50 %	50 %	113955527
2582	NC_008319	GCT	2	6	127629	127634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955527
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2586	NC_008319	CCA	2	6	127896	127901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955527
2587	NC_008319	CGT	2	6	127938	127943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955527
2588	NC_008319	AGGC	2	8	127980	127987	25 %	0 %	50 %	25 %	113955527
2589	NC_008319	CATCAA	2	12	128023	128034	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	113955527
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2591	NC_008319	CTG	2	6	128171	128176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955527
2592	NC_008319	CGT	2	6	128217	128222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955527
2593	NC_008319	GGT	2	6	128311	128316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955527
2594	NC_008319	TGG	2	6	128335	128340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955527
2595	NC_008319	TCAA	2	8	128390	128397	50 %	25 %	0 %	25 %	113955527
2596	NC_008319	GCG	2	6	128410	128415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955527
2597	NC_008319	AGC	2	6	128435	128440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955527
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2600	NC_008319	CCAC	2	8	128745	128752	25 %	0 %	0 %	75 %	113953386
2601	NC_008319	CTG	2	6	128773	128778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953386
2602	NC_008319	CTGG	2	8	128796	128803	0 %	25 %	50 %	25 %	113953386
2603	NC_008319	AAG	2	6	128816	128821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953386
2604	NC_008319	CAG	3	9	128842	128850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953386
2605	NC_008319	GGC	2	6	128878	128883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953386
2606	NC_008319	GTT	4	12	128889	128900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953386
2607	NC_008319	GCT	2	6	128907	128912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953386
2608	NC_008319	CTT	2	6	128974	128979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953386
2609	NC_008319	GCTA	2	8	129064	129071	25 %	25 %	25 %	25 %	113953386
2610	NC_008319	ATGG	2	8	129111	129118	25 %	25 %	50 %	0 %	113953386
2611	NC_008319	TGC	2	6	129179	129184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953386
2612	NC_008319	C	6	6	129210	129215	0 %	0 %	0 %	100 %	113953386
2613	NC_008319	TGCT	2	8	129377	129384	0 %	50 %	25 %	25 %	113953386
2614	NC_008319	GC	3	6	129468	129473	0 %	0 %	50 %	50 %	113953386
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2617	NC_008319	GTG	2	6	129514	129519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953386
2618	NC_008319	TGT	2	6	129530	129535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953386
2619	NC_008319	TGG	2	6	129620	129625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953386
2620	NC_008319	CCG	2	6	129649	129654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953386
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2622	NC_008319	CTT	2	6	129679	129684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953386
2623	NC_008319	TTG	2	6	129745	129750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953386
2624	NC_008319	TCG	2	6	129932	129937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953386
2625	NC_008319	GTG	2	6	129958	129963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953386
2626	NC_008319	GGC	2	6	129981	129986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953386
2627	NC_008319	GCC	2	6	130023	130028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953386
2628	NC_008319	GC	4	8	130151	130158	0 %	0 %	50 %	50 %	113953386
2629	NC_008319	TCG	2	6	130185	130190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953386
2630	NC_008319	CGC	2	6	130239	130244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953386
2631	NC_008319	GGC	2	6	130293	130298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953386
2632	NC_008319	CAG	2	6	130514	130519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953386
2633	NC_008319	AGG	2	6	130526	130531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953386
2634	NC_008319	AGC	2	6	130596	130601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953386
2635	NC_008319	GTC	2	6	130619	130624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953386
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2637	NC_008319	GGC	3	9	130674	130682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953141
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2640	NC_008319	AGCC	2	8	131040	131047	25 %	0 %	25 %	50 %	113953141
2641	NC_008319	CAG	2	6	131058	131063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953141
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2643	NC_008319	TGC	3	9	131082	131090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953141
2644	NC_008319	CTT	2	6	131094	131099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953141
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2651	NC_008319	CGA	2	6	131325	131330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954123
2652	NC_008319	CAAG	2	8	131352	131359	50 %	0 %	25 %	25 %	113954123
2653	NC_008319	GCG	2	6	131380	131385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954123
2654	NC_008319	ACC	2	6	131446	131451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954123
2655	NC_008319	TTG	2	6	131531	131536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954123
2656	NC_008319	TGA	2	6	131577	131582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954123
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2659	NC_008319	GCC	2	6	131697	131702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954123
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2664	NC_008319	TGG	2	6	131981	131986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954123
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2669	NC_008319	C	6	6	132185	132190	0 %	0 %	0 %	100 %	113954123
2670	NC_008319	GTG	2	6	132199	132204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954123
2671	NC_008319	GTTG	2	8	132277	132284	0 %	50 %	50 %	0 %	113954451
2672	NC_008319	GTG	2	6	132312	132317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954451
2673	NC_008319	GCC	2	6	132400	132405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954451
2674	NC_008319	GGGAT	2	10	132431	132440	20 %	20 %	60 %	0 %	113954451
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2679	NC_008319	GCA	2	6	132611	132616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954451
2680	NC_008319	GGAA	2	8	132619	132626	50 %	0 %	50 %	0 %	113954451
2681	NC_008319	GC	3	6	132780	132785	0 %	0 %	50 %	50 %	113954451
2682	NC_008319	CAG	2	6	132788	132793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954451
2683	NC_008319	CGT	2	6	132858	132863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954451
2684	NC_008319	GGCT	2	8	132887	132894	0 %	25 %	50 %	25 %	113954451
2685	NC_008319	GCG	2	6	132948	132953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954451
2686	NC_008319	GCC	2	6	133013	133018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954451
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2688	NC_008319	TGGC	2	8	133213	133220	0 %	25 %	50 %	25 %	113955421
2689	NC_008319	CCT	2	6	133347	133352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955421
2690	NC_008319	ATGC	2	8	133367	133374	25 %	25 %	25 %	25 %	113955421
2691	NC_008319	TTG	2	6	133421	133426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955421
2692	NC_008319	AGG	2	6	133431	133436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955421
2693	NC_008319	CTG	2	6	133473	133478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955421
2694	NC_008319	GC	3	6	133507	133512	0 %	0 %	50 %	50 %	113955421
2695	NC_008319	GTT	2	6	133540	133545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955421
2696	NC_008319	GCT	2	6	133610	133615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955421
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2699	NC_008319	AGG	2	6	133722	133727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955421
2700	NC_008319	GTC	2	6	133734	133739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955421
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2702	NC_008319	CCT	2	6	133825	133830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955421
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2705	NC_008319	AAC	2	6	134010	134015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955421
2706	NC_008319	CCCT	2	8	134048	134055	0 %	25 %	0 %	75 %	113955421
2707	NC_008319	GCA	2	6	134097	134102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955421
2708	NC_008319	GATG	2	8	134129	134136	25 %	25 %	50 %	0 %	113955421
2709	NC_008319	GCA	2	6	134281	134286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954946
2710	NC_008319	TGA	2	6	134291	134296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954946
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2712	NC_008319	GTG	2	6	134395	134400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954946
2713	NC_008319	CGT	2	6	134404	134409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954946
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2718	NC_008319	GC	3	6	134512	134517	0 %	0 %	50 %	50 %	113954126
2719	NC_008319	AAC	2	6	134631	134636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954126
2720	NC_008319	TGC	2	6	134718	134723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954126
2721	NC_008319	TGA	2	6	134728	134733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954126
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2723	NC_008319	GCT	2	6	134756	134761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954126
2724	NC_008319	TTGG	2	8	134833	134840	0 %	50 %	50 %	0 %	113954126
2725	NC_008319	GCA	2	6	134847	134852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954126
2726	NC_008319	AGC	2	6	134871	134876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954126
2727	NC_008319	GCAA	2	8	134910	134917	50 %	0 %	25 %	25 %	113954126
2728	NC_008319	GGTT	2	8	134973	134980	0 %	50 %	50 %	0 %	113954126
2729	NC_008319	GCT	2	6	135022	135027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954126
2730	NC_008319	GCA	2	6	135037	135042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954126
2731	NC_008319	GTG	2	6	135059	135064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954126
2732	NC_008319	GCT	3	9	135065	135073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954126
2733	NC_008319	CTAA	2	8	135091	135098	50 %	25 %	0 %	25 %	113954126
2734	NC_008319	GCT	2	6	135274	135279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2735	NC_008319	GGCCA	2	10	135319	135328	20 %	0 %	40 %	40 %	113955068
2736	NC_008319	GTG	2	6	135361	135366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955068
2737	NC_008319	GAT	2	6	135444	135449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955068
2738	NC_008319	GCA	2	6	135556	135561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955068
2739	NC_008319	GAG	2	6	135562	135567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955068
2740	NC_008319	ATT	2	6	135661	135666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113955068
2741	NC_008319	TCGA	2	8	135730	135737	25 %	25 %	25 %	25 %	113955068
2742	NC_008319	GAT	2	6	135751	135756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955068
2743	NC_008319	CAT	2	6	135765	135770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955068
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2758	NC_008319	TGC	2	6	136647	136652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955068
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2762	NC_008319	GTG	2	6	136776	136781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2841	NC_008319	T	7	7	140856	140862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2842	NC_008319	TCG	2	6	140875	140880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953254
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2855	NC_008319	ACGGC	2	10	141681	141690	20 %	0 %	40 %	40 %	113953254
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2862	NC_008319	GGC	2	6	141968	141973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953254
2863	NC_008319	AGC	2	6	142030	142035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953254
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2865	NC_008319	CCTT	2	8	142135	142142	0 %	50 %	0 %	50 %	113953254
2866	NC_008319	CTGAAA	2	12	142204	142215	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	113953254
2867	NC_008319	GAA	2	6	142230	142235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953254
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2872	NC_008319	GGT	2	6	142475	142480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953254
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2988	NC_008319	AAG	2	6	147525	147530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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