MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008319	TGA	2	6	98811	98816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954544
2002	NC_008319	GCTTG	2	10	98862	98871	0 %	40 %	40 %	20 %	113954544
2003	NC_008319	ATC	2	6	98912	98917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954544
2004	NC_008319	TGGA	2	8	98945	98952	25 %	25 %	50 %	0 %	113954544
2005	NC_008319	CA	3	6	98954	98959	50 %	0 %	0 %	50 %	113954544
2006	NC_008319	T	6	6	98979	98984	0 %	100 %	0 %	0 %	113954544
2007	NC_008319	CCG	2	6	99037	99042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954544
2008	NC_008319	AGC	2	6	99089	99094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954544
2009	NC_008319	CTGG	2	8	99109	99116	0 %	25 %	50 %	25 %	113954544
2010	NC_008319	ACA	2	6	99137	99142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954544
2011	NC_008319	ATG	2	6	99169	99174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954544
2012	NC_008319	ATG	2	6	99217	99222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954544
2013	NC_008319	GCGCC	2	10	99292	99301	0 %	0 %	40 %	60 %	113954544
2014	NC_008319	CTG	2	6	99433	99438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954021
2015	NC_008319	AGG	2	6	99450	99455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954021
2016	NC_008319	CT	3	6	99460	99465	0 %	50 %	0 %	50 %	113954021
2017	NC_008319	GTG	2	6	99499	99504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954021
2018	NC_008319	TG	3	6	99510	99515	0 %	50 %	50 %	0 %	113954021
2019	NC_008319	CCCTG	2	10	99542	99551	0 %	20 %	20 %	60 %	113954021
2020	NC_008319	CGC	2	6	99571	99576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954021
2021	NC_008319	GAC	2	6	99603	99608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954021
2022	NC_008319	TCAGG	2	10	99639	99648	20 %	20 %	40 %	20 %	113954021
2023	NC_008319	TGG	2	6	99722	99727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955029
2024	NC_008319	AGC	2	6	99831	99836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955029
2025	NC_008319	TGG	2	6	99917	99922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955029
2026	NC_008319	GCT	2	6	100011	100016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955029
2027	NC_008319	TCT	2	6	100107	100112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954786
2028	NC_008319	GTTG	2	8	100270	100277	0 %	50 %	50 %	0 %	113954786
2029	NC_008319	GTT	2	6	100307	100312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954786
2030	NC_008319	CTGGGG	2	12	100428	100439	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	113954786
2031	NC_008319	TTG	2	6	100628	100633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954274
2032	NC_008319	GTG	2	6	100637	100642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954274
2033	NC_008319	GTG	2	6	100652	100657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954274
2034	NC_008319	GTG	2	6	100706	100711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954274
2035	NC_008319	GCG	2	6	100799	100804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954274
2036	NC_008319	TTG	2	6	100910	100915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954274
2037	NC_008319	CGA	2	6	100987	100992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2038	NC_008319	GAA	2	6	101043	101048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954143
2039	NC_008319	TGG	2	6	101086	101091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954143
2040	NC_008319	TGT	2	6	101122	101127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954143
2041	NC_008319	ACG	2	6	101140	101145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954143
2042	NC_008319	AGCC	2	8	101281	101288	25 %	0 %	25 %	50 %	113954143
2043	NC_008319	TTG	2	6	101301	101306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954143
2044	NC_008319	TGA	2	6	101378	101383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954143
2045	NC_008319	GTG	2	6	101397	101402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954143
2046	NC_008319	TGG	2	6	101413	101418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954143
2047	NC_008319	GCG	2	6	101435	101440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954143
2048	NC_008319	TGA	2	6	101488	101493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954143
2049	NC_008319	TGC	2	6	101528	101533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954143
2050	NC_008319	CGC	2	6	101553	101558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954143
2051	NC_008319	GAAACG	2	12	101568	101579	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	113954143
2052	NC_008319	GTGAT	2	10	101674	101683	20 %	40 %	40 %	0 %	113954143
2053	NC_008319	ACCGAT	2	12	101709	101720	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113954143
2054	NC_008319	AGG	3	9	101722	101730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954143
2055	NC_008319	TGT	2	6	101771	101776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954143
2056	NC_008319	CGT	2	6	101787	101792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954143
2057	NC_008319	AGG	2	6	101839	101844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954143
2058	NC_008319	TGA	2	6	101885	101890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954143
2059	NC_008319	ACT	2	6	101896	101901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954143
2060	NC_008319	GGCGC	2	10	101924	101933	0 %	0 %	60 %	40 %	113954143
2061	NC_008319	TGT	2	6	101938	101943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954143
2062	NC_008319	TGC	2	6	102007	102012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954143
2063	NC_008319	CATT	2	8	102034	102041	25 %	50 %	0 %	25 %	113954143
2064	NC_008319	ATTG	2	8	102047	102054	25 %	50 %	25 %	0 %	113954143
2065	NC_008319	TGG	2	6	102059	102064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954143
2066	NC_008319	GTC	2	6	102147	102152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954143
2067	NC_008319	AG	3	6	102153	102158	50 %	0 %	50 %	0 %	113954143
2068	NC_008319	CTG	2	6	102183	102188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954143
2069	NC_008319	GTG	2	6	102201	102206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954143
2070	NC_008319	TGG	2	6	102216	102221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954143
2071	NC_008319	TTGC	2	8	102264	102271	0 %	50 %	25 %	25 %	113954143
2072	NC_008319	ACC	2	6	102276	102281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954143
2073	NC_008319	GCC	2	6	102285	102290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954143
2074	NC_008319	TGC	2	6	102299	102304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954143
2075	NC_008319	TCA	2	6	102361	102366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954143
2076	NC_008319	GGCG	2	8	102383	102390	0 %	0 %	75 %	25 %	113954143
2077	NC_008319	TGC	3	9	102421	102429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954143
2078	NC_008319	GCTT	2	8	102482	102489	0 %	50 %	25 %	25 %	113954143
2079	NC_008319	CTG	4	12	102554	102565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954561
2080	NC_008319	CCCGC	2	10	102572	102581	0 %	0 %	20 %	80 %	113954561
2081	NC_008319	GTTC	2	8	102625	102632	0 %	50 %	25 %	25 %	113954561
2082	NC_008319	GTT	2	6	102660	102665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954561
2083	NC_008319	CAG	2	6	102673	102678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954561
2084	NC_008319	GTG	3	9	102752	102760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954561
2085	NC_008319	AGG	2	6	102761	102766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954561
2086	NC_008319	GA	3	6	102771	102776	50 %	0 %	50 %	0 %	113954561
2087	NC_008319	GCT	2	6	102790	102795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954561
2088	NC_008319	GCG	2	6	102805	102810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954561
2089	NC_008319	TGG	2	6	102857	102862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954561
2090	NC_008319	TGG	2	6	102878	102883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954561
2091	NC_008319	GAA	2	6	102894	102899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954561
2092	NC_008319	CTG	2	6	102922	102927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954561
2093	NC_008319	AGG	2	6	102938	102943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954561
2094	NC_008319	TTGGT	2	10	102950	102959	0 %	60 %	40 %	0 %	113954561
2095	NC_008319	GTGGA	2	10	102962	102971	20 %	20 %	60 %	0 %	113954561
2096	NC_008319	TGG	2	6	103018	103023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954561
2097	NC_008319	CG	3	6	103042	103047	0 %	0 %	50 %	50 %	113954561
2098	NC_008319	GAA	2	6	103110	103115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954561
2099	NC_008319	AGG	2	6	103193	103198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954561
2100	NC_008319	CGA	2	6	103263	103268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954561
2101	NC_008319	CTG	2	6	103276	103281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954561
2102	NC_008319	ATGGA	2	10	103406	103415	40 %	20 %	40 %	0 %	113954561
2103	NC_008319	CAT	2	6	103452	103457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954561
2104	NC_008319	CTG	2	6	103548	103553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954561
2105	NC_008319	AGC	2	6	103564	103569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953151
2106	NC_008319	TTGT	2	8	103572	103579	0 %	75 %	25 %	0 %	113953151
2107	NC_008319	TTCC	2	8	103659	103666	0 %	50 %	0 %	50 %	113953151
2108	NC_008319	CTT	2	6	103676	103681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953151
2109	NC_008319	AGA	2	6	103831	103836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953151
2110	NC_008319	TCA	2	6	103846	103851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953151
2111	NC_008319	GGGC	2	8	103906	103913	0 %	0 %	75 %	25 %	113953151
2112	NC_008319	CAGC	2	8	103938	103945	25 %	0 %	25 %	50 %	113953151
2113	NC_008319	AGG	2	6	103966	103971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953151
2114	NC_008319	CATC	2	8	104018	104025	25 %	25 %	0 %	50 %	113953151
2115	NC_008319	CTT	2	6	104054	104059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953151
2116	NC_008319	AAG	2	6	104076	104081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953151
2117	NC_008319	AGC	2	6	104085	104090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953151
2118	NC_008319	ACA	2	6	104101	104106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953151
2119	NC_008319	CGAT	2	8	104140	104147	25 %	25 %	25 %	25 %	113953151
2120	NC_008319	CTTG	2	8	104294	104301	0 %	50 %	25 %	25 %	113953151
2121	NC_008319	TGGT	2	8	104310	104317	0 %	50 %	50 %	0 %	113953151
2122	NC_008319	CCA	2	6	104390	104395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953151
2123	NC_008319	TGA	2	6	104410	104415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953151
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2125	NC_008319	TTG	2	6	104582	104587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954483
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2222	NC_008319	GTTG	2	8	110219	110226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2243	NC_008319	TGA	2	6	111368	111373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2366	NC_008319	CAA	2	6	117097	117102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953317
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2369	NC_008319	TGA	2	6	117168	117173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953317
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2373	NC_008319	TTG	2	6	117460	117465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2374	NC_008319	TTTGA	2	10	117498	117507	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2375	NC_008319	CTG	2	6	117524	117529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2378	NC_008319	GCTT	2	8	117667	117674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2379	NC_008319	GAG	2	6	117689	117694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2382	NC_008319	ATA	2	6	117828	117833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2488	NC_008319	GC	3	6	122415	122420	0 %	0 %	50 %	50 %	113953371
2489	NC_008319	GC	3	6	122424	122429	0 %	0 %	50 %	50 %	113953371
2490	NC_008319	CTC	2	6	122447	122452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953371
2491	NC_008319	CAGG	2	8	122465	122472	25 %	0 %	50 %	25 %	113953371
2492	NC_008319	TC	3	6	122540	122545	0 %	50 %	0 %	50 %	113953371
2493	NC_008319	CAG	2	6	122654	122659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953371
2494	NC_008319	GAG	2	6	122661	122666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953371
2495	NC_008319	GCT	2	6	122679	122684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953371
2496	NC_008319	TTGAA	2	10	122754	122763	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2497	NC_008319	GTT	2	6	122836	122841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2498	NC_008319	GAC	2	6	122907	122912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954007
2499	NC_008319	TTG	2	6	122934	122939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954007
2500	NC_008319	CGT	2	6	122966	122971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954007

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