MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008319	CAAG	2	8	324871	324878	50 %	0 %	25 %	25 %	113953301
6502	NC_008319	GAA	2	6	324987	324992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_008319	CGAT	2	8	325083	325090	25 %	25 %	25 %	25 %	113953828
6504	NC_008319	GAC	2	6	325104	325109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953828
6505	NC_008319	CAG	2	6	325241	325246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953828
6506	NC_008319	GAC	2	6	325263	325268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953828
6507	NC_008319	ATC	2	6	325293	325298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953828
6508	NC_008319	GAA	2	6	325309	325314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953828
6509	NC_008319	CTG	2	6	325317	325322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953828
6510	NC_008319	GATCG	2	10	325441	325450	20 %	20 %	40 %	20 %	113953828
6511	NC_008319	TTC	2	6	325514	325519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953828
6512	NC_008319	GA	3	6	325539	325544	50 %	0 %	50 %	0 %	113953828
6513	NC_008319	CCA	2	6	325618	325623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953828
6514	NC_008319	CCG	2	6	325708	325713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953828
6515	NC_008319	TTG	2	6	325720	325725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953828
6516	NC_008319	GTG	2	6	325726	325731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953828
6517	NC_008319	CCCA	2	8	325801	325808	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6518	NC_008319	TGC	2	6	325833	325838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_008319	CG	3	6	325875	325880	0 %	0 %	50 %	50 %	113954193
6520	NC_008319	ATC	2	6	325884	325889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954193
6521	NC_008319	T	7	7	325895	325901	0 %	100 %	0 %	0 %	113954193
6522	NC_008319	TCA	2	6	326003	326008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954193
6523	NC_008319	GTCGAG	2	12	326049	326060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	113954193
6524	NC_008319	CGG	2	6	326093	326098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954193
6525	NC_008319	TTG	2	6	326136	326141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954193
6526	NC_008319	ATCAC	2	10	326221	326230	40 %	20 %	0 %	40 %	113954193
6527	NC_008319	GC	3	6	326278	326283	0 %	0 %	50 %	50 %	113954193
6528	NC_008319	CT	3	6	326340	326345	0 %	50 %	0 %	50 %	113954193
6529	NC_008319	CAGG	2	8	326369	326376	25 %	0 %	50 %	25 %	113954193
6530	NC_008319	CCCTT	2	10	326401	326410	0 %	40 %	0 %	60 %	113954193
6531	NC_008319	CTT	2	6	326435	326440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954193
6532	NC_008319	GTG	2	6	326464	326469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954193
6533	NC_008319	GAT	2	6	326481	326486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954193
6534	NC_008319	CGTC	2	8	326554	326561	0 %	25 %	25 %	50 %	113954193
6535	NC_008319	ATGG	2	8	326633	326640	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_008319	TGA	2	6	326715	326720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955124
6537	NC_008319	TCAGCC	2	12	326724	326735	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	113955124
6538	NC_008319	CAT	2	6	326741	326746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955124
6539	NC_008319	AGCA	2	8	326784	326791	50 %	0 %	25 %	25 %	113955124
6540	NC_008319	AGC	2	6	326990	326995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955124
6541	NC_008319	TGC	2	6	327055	327060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955124
6542	NC_008319	AGG	2	6	327096	327101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955124
6543	NC_008319	TTGGC	2	10	327165	327174	0 %	40 %	40 %	20 %	113955124
6544	NC_008319	GATG	2	8	327238	327245	25 %	25 %	50 %	0 %	113955124
6545	NC_008319	GAT	2	6	327277	327282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955124
6546	NC_008319	TCA	2	6	327570	327575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953966
6547	NC_008319	TGA	2	6	327576	327581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953966
6548	NC_008319	TCCT	2	8	327599	327606	0 %	50 %	0 %	50 %	113953966
6549	NC_008319	GCC	2	6	327651	327656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953966
6550	NC_008319	CAT	2	6	327705	327710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953966
6551	NC_008319	CAG	2	6	327725	327730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953966
6552	NC_008319	GGCT	2	8	327732	327739	0 %	25 %	50 %	25 %	113953966
6553	NC_008319	GTT	3	9	327819	327827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953966
6554	NC_008319	ACC	2	6	327850	327855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953966
6555	NC_008319	AATC	2	8	327918	327925	50 %	25 %	0 %	25 %	113953966
6556	NC_008319	TTG	2	6	327948	327953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_008319	AAC	2	6	327962	327967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_008319	AATT	2	8	327990	327997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_008319	T	6	6	328039	328044	0 %	100 %	0 %	0 %	113953720
6560	NC_008319	CTG	2	6	328118	328123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953720
6561	NC_008319	CAC	2	6	328181	328186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953720
6562	NC_008319	GGA	2	6	328210	328215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953720
6563	NC_008319	CTG	2	6	328402	328407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953720
6564	NC_008319	CGG	2	6	328627	328632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953720
6565	NC_008319	GCG	2	6	328698	328703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953720
6566	NC_008319	GTC	2	6	328737	328742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_008319	GCT	2	6	328818	328823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955585
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6569	NC_008319	CGAT	2	8	328984	328991	25 %	25 %	25 %	25 %	113955585
6570	NC_008319	TGG	2	6	329126	329131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955585
6571	NC_008319	TTG	2	6	329140	329145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955585
6572	NC_008319	GCA	2	6	329216	329221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955585
6573	NC_008319	CAG	2	6	329231	329236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955585
6574	NC_008319	AGC	2	6	329247	329252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955585
6575	NC_008319	CAG	2	6	329256	329261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955585
6576	NC_008319	GGA	2	6	329295	329300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_008319	GT	3	6	329354	329359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_008319	GTT	2	6	329387	329392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_008319	TCA	2	6	329415	329420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_008319	GCT	2	6	329432	329437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953535
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6582	NC_008319	C	6	6	329480	329485	0 %	0 %	0 %	100 %	113953535
6583	NC_008319	TGC	2	6	329486	329491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953535
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6585	NC_008319	TCGT	2	8	329608	329615	0 %	50 %	25 %	25 %	113953535
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6590	NC_008319	TTG	2	6	329752	329757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953535
6591	NC_008319	GGT	2	6	329820	329825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953535
6592	NC_008319	TGG	2	6	329870	329875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953535
6593	NC_008319	T	7	7	329971	329977	0 %	100 %	0 %	0 %	113953118
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6596	NC_008319	GC	3	6	330142	330147	0 %	0 %	50 %	50 %	113953118
6597	NC_008319	TTGCG	2	10	330156	330165	0 %	40 %	40 %	20 %	113953118
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6600	NC_008319	CTTG	2	8	330291	330298	0 %	50 %	25 %	25 %	113953118
6601	NC_008319	CAG	2	6	330310	330315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953118
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6605	NC_008319	GATT	2	8	330413	330420	25 %	50 %	25 %	0 %	113953118
6606	NC_008319	GC	3	6	330437	330442	0 %	0 %	50 %	50 %	113953118
6607	NC_008319	GAC	2	6	330447	330452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953118
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6613	NC_008319	GC	3	6	330725	330730	0 %	0 %	50 %	50 %	113953118
6614	NC_008319	TAA	2	6	330737	330742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113953118
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6993	NC_008319	GTC	2	6	349377	349382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954497
6994	NC_008319	GTA	2	6	349431	349436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955113
6995	NC_008319	GCT	2	6	349444	349449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955113
6996	NC_008319	AGC	2	6	349555	349560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955113
6997	NC_008319	TGA	2	6	349563	349568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955113
6998	NC_008319	TGC	2	6	349573	349578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955113
6999	NC_008319	GCG	2	6	349651	349656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955113
7000	NC_008319	CA	3	6	349660	349665	50 %	0 %	0 %	50 %	113955113

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