MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 51224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008319	CAG	2	6	298216	298221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_008319	TGT	2	6	298238	298243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_008319	CGAT	2	8	298306	298313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6004	NC_008319	TCTT	2	8	298388	298395	0 %	75 %	0 %	25 %	113954035
6005	NC_008319	A	6	6	298441	298446	100 %	0 %	0 %	0 %	113954035
6006	NC_008319	GTC	3	9	298460	298468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954035
6007	NC_008319	TCG	2	6	298548	298553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954035
6008	NC_008319	CGC	2	6	298600	298605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113954035
6009	NC_008319	AC	3	6	298611	298616	50 %	0 %	0 %	50 %	113954035
6010	NC_008319	G	6	6	298634	298639	0 %	0 %	100 %	0 %	113954035
6011	NC_008319	TGA	2	6	298758	298763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954035
6012	NC_008319	GGA	2	6	298767	298772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954035
6013	NC_008319	TTCCC	2	10	298806	298815	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6014	NC_008319	CCAG	2	8	298884	298891	25 %	0 %	25 %	50 %	113952833
6015	NC_008319	T	6	6	298903	298908	0 %	100 %	0 %	0 %	113952833
6016	NC_008319	CTT	2	6	298992	298997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952833
6017	NC_008319	ACG	2	6	299024	299029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952833
6018	NC_008319	AGA	2	6	299048	299053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952833
6019	NC_008319	G	6	6	299060	299065	0 %	0 %	100 %	0 %	113952833
6020	NC_008319	GCCATG	2	12	299147	299158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	113952833
6021	NC_008319	CCT	2	6	299162	299167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113952833
6022	NC_008319	T	7	7	299233	299239	0 %	100 %	0 %	0 %	113952833
6023	NC_008319	GCT	2	6	299252	299257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952833
6024	NC_008319	CGG	2	6	299262	299267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952833
6025	NC_008319	GAG	2	6	299325	299330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113952833
6026	NC_008319	CAA	2	6	299340	299345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113952833
6027	NC_008319	GTG	2	6	299352	299357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113952833
6028	NC_008319	GAA	3	9	299424	299432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113952833
6029	NC_008319	CGG	2	6	299475	299480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952833
6030	NC_008319	TGC	2	6	299502	299507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_008319	CTG	2	6	299537	299542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_008319	G	6	6	299582	299587	0 %	0 %	100 %	0 %	113954282
6033	NC_008319	GCT	2	6	299631	299636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954282
6034	NC_008319	CGA	2	6	299776	299781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954282
6035	NC_008319	CAG	2	6	299815	299820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954282
6036	NC_008319	TGG	2	6	299837	299842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954282
6037	NC_008319	ACATCG	2	12	299912	299923	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	113954282
6038	NC_008319	CCA	2	6	299930	299935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954282
6039	NC_008319	GCG	2	6	299947	299952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954282
6040	NC_008319	CAG	2	6	300164	300169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954282
6041	NC_008319	ATGGG	2	10	300262	300271	20 %	20 %	60 %	0 %	113954282
6042	NC_008319	G	9	9	300269	300277	0 %	0 %	100 %	0 %	113954282
6043	NC_008319	AGC	2	6	300281	300286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954282
6044	NC_008319	CAAGG	2	10	300289	300298	40 %	0 %	40 %	20 %	113954282
6045	NC_008319	AAT	2	6	300310	300315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113954282
6046	NC_008319	ATC	2	6	300366	300371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954282
6047	NC_008319	CAG	2	6	300388	300393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954282
6048	NC_008319	GGT	3	9	300402	300410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954282
6049	NC_008319	GGC	2	6	300502	300507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954282
6050	NC_008319	TTG	2	6	300509	300514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954282
6051	NC_008319	GGT	2	6	300525	300530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954282
6052	NC_008319	GT	3	6	300573	300578	0 %	50 %	50 %	0 %	113954282
6053	NC_008319	GGC	2	6	300618	300623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954282
6054	NC_008319	CCT	2	6	300652	300657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954282
6055	NC_008319	TGC	2	6	300669	300674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954282
6056	NC_008319	GCA	2	6	300692	300697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954282
6057	NC_008319	TGG	2	6	300702	300707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954282
6058	NC_008319	CGA	2	6	300726	300731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954282
6059	NC_008319	CGAT	2	8	300737	300744	25 %	25 %	25 %	25 %	113954282
6060	NC_008319	CAC	2	6	300780	300785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954282
6061	NC_008319	GCT	2	6	300931	300936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954282
6062	NC_008319	AGCA	2	8	300941	300948	50 %	0 %	25 %	25 %	113954282
6063	NC_008319	TTC	2	6	300976	300981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954282
6064	NC_008319	TGA	2	6	300987	300992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954282
6065	NC_008319	ATCC	2	8	301033	301040	25 %	25 %	0 %	50 %	113954282
6066	NC_008319	GGC	2	6	301042	301047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954282
6067	NC_008319	GCC	2	6	301209	301214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955210
6068	NC_008319	TGA	2	6	301231	301236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955210
6069	NC_008319	GGT	2	6	301257	301262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955210
6070	NC_008319	AAG	2	6	301290	301295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955210
6071	NC_008319	AGC	2	6	301315	301320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955210
6072	NC_008319	GGTGAT	2	12	301385	301396	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	113955210
6073	NC_008319	CAA	2	6	301430	301435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955210
6074	NC_008319	GTT	2	6	301442	301447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955210
6075	NC_008319	GCA	2	6	301523	301528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955210
6076	NC_008319	CGG	2	6	301686	301691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113952949
6077	NC_008319	TGGC	2	8	301705	301712	0 %	25 %	50 %	25 %	113952949
6078	NC_008319	TCT	2	6	301720	301725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952949
6079	NC_008319	CGC	2	6	301784	301789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113952949
6080	NC_008319	ATC	2	6	301822	301827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952949
6081	NC_008319	TTC	2	6	301881	301886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113952949
6082	NC_008319	TGT	2	6	301904	301909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952949
6083	NC_008319	TTG	2	6	301972	301977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113952949
6084	NC_008319	TCG	2	6	302133	302138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952949
6085	NC_008319	AGC	2	6	302225	302230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952949
6086	NC_008319	AGC	2	6	302284	302289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113952949
6087	NC_008319	CAT	2	6	302321	302326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_008319	TCGA	2	8	302500	302507	25 %	25 %	25 %	25 %	113953201
6089	NC_008319	GGAA	2	8	302543	302550	50 %	0 %	50 %	0 %	113953201
6090	NC_008319	GTG	2	6	302587	302592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953201
6091	NC_008319	GGA	2	6	302595	302600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953201
6092	NC_008319	CAC	2	6	302616	302621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953201
6093	NC_008319	CGAG	2	8	302645	302652	25 %	0 %	50 %	25 %	113953201
6094	NC_008319	A	6	6	302704	302709	100 %	0 %	0 %	0 %	113953201
6095	NC_008319	TTC	2	6	302772	302777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953201
6096	NC_008319	TGG	2	6	302795	302800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953201
6097	NC_008319	TTGG	2	8	302802	302809	0 %	50 %	50 %	0 %	113953201
6098	NC_008319	ACG	2	6	302947	302952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953201
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6100	NC_008319	CGT	2	6	303051	303056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953201
6101	NC_008319	GGT	2	6	303081	303086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953201
6102	NC_008319	CAA	2	6	303089	303094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953201
6103	NC_008319	CAC	2	6	303159	303164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953201
6104	NC_008319	AAC	2	6	303217	303222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113953201
6105	NC_008319	GGT	2	6	303239	303244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953201
6106	NC_008319	GAT	2	6	303264	303269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953201
6107	NC_008319	GCT	2	6	303435	303440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953201
6108	NC_008319	GCCA	2	8	303462	303469	25 %	0 %	25 %	50 %	113953201
6109	NC_008319	TGA	2	6	303514	303519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953201
6110	NC_008319	A	6	6	303615	303620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_008319	TGA	2	6	303687	303692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955348
6112	NC_008319	CTT	2	6	303746	303751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113955348
6113	NC_008319	ACC	2	6	303783	303788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955348
6114	NC_008319	CAG	2	6	303808	303813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955348
6115	NC_008319	GCTG	2	8	303866	303873	0 %	25 %	50 %	25 %	113955348
6116	NC_008319	CGA	2	6	303884	303889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955348
6117	NC_008319	ACCA	2	8	303936	303943	50 %	0 %	0 %	50 %	113955348
6118	NC_008319	CA	3	6	303962	303967	50 %	0 %	0 %	50 %	113955348
6119	NC_008319	GAT	2	6	304041	304046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955348
6120	NC_008319	CCG	2	6	304048	304053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955348
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6122	NC_008319	TGA	2	6	304136	304141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955348
6123	NC_008319	GGTCA	2	10	304146	304155	20 %	20 %	40 %	20 %	113955348
6124	NC_008319	CCA	2	6	304201	304206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955348
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6129	NC_008319	TCCAT	2	10	304494	304503	20 %	40 %	0 %	40 %	113955348
6130	NC_008319	CGA	2	6	304586	304591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955348
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6135	NC_008319	AAAC	2	8	304799	304806	75 %	0 %	0 %	25 %	113955348
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6143	NC_008319	AG	3	6	305170	305175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6144	NC_008319	GTT	2	6	305238	305243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6151	NC_008319	TCC	2	6	305500	305505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953390
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6211	NC_008319	TGG	2	6	308655	308660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6213	NC_008319	T	9	9	308767	308775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6232	NC_008319	GGT	2	6	309631	309636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954253
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6237	NC_008319	CTG	2	6	309944	309949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954253
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6240	NC_008319	CCG	2	6	310135	310140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6241	NC_008319	T	6	6	310152	310157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_008319	T	6	6	310209	310214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_008319	CTC	2	6	310231	310236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954117
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6245	NC_008319	GCT	2	6	310266	310271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954117
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6348	NC_008319	A	6	6	316472	316477	100 %	0 %	0 %	0 %	113954181
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6356	NC_008319	GATT	2	8	316854	316861	25 %	50 %	25 %	0 %	113954181
6357	NC_008319	TAG	2	6	316864	316869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954181
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6359	NC_008319	ATC	2	6	316941	316946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954181
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6361	NC_008319	CAG	2	6	317020	317025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954181
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6363	NC_008319	CCT	2	6	317043	317048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113954181
6364	NC_008319	TCT	2	6	317064	317069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954181
6365	NC_008319	TCAGGG	2	12	317112	317123	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	113954181
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6396	NC_008319	AG	3	6	318447	318452	50 %	0 %	50 %	0 %	113954181
6397	NC_008319	CAGCG	2	10	318488	318497	20 %	0 %	40 %	40 %	113954181
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6485	NC_008319	CGT	2	6	324012	324017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953301
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6489	NC_008319	GCT	2	6	324195	324200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953301
6490	NC_008319	CAG	2	6	324275	324280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953301
6491	NC_008319	GCA	2	6	324307	324312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953301
6492	NC_008319	TTG	2	6	324314	324319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953301
6493	NC_008319	GGT	2	6	324401	324406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953301
6494	NC_008319	CTG	2	6	324420	324425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953301
6495	NC_008319	CGC	2	6	324441	324446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953301
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6497	NC_008319	CGCT	2	8	324644	324651	0 %	25 %	25 %	50 %	113953301
6498	NC_008319	TGT	2	6	324659	324664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953301
6499	NC_008319	GCTT	2	8	324678	324685	0 %	50 %	25 %	25 %	113953301
6500	NC_008319	CAC	2	6	324842	324847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953301

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